chemsketch使用(編輯修改稿)
2025-09-01 00:38 本頁面
【文章內容簡介】 反應。選擇不同的顏色來區(qū)分自動生成和手動插入。1. 從選項菜單選擇參數(shù)調出參數(shù)設置對話框。2. 轉到反應Reaction標簽，將手繪色Manual Mapping Color選為紅色：3. 轉換到結構Structure標簽，將自動/手動編號色Auto/Manual Numbering Color設置為藍色：4. 點擊OK，現(xiàn)在我們可以照樣子開始繪制了。5. 在結構工具欄，點擊AtomAtom Map來顯示映射工具面板并選擇映射方式：注意：注意到手動映射模式已被自動打開（相應的按鈕被激活）。6. 指向反應物的原子拖拽到生成物上的相應原子。當松開鼠標，1在反應圖中手動映射的原子上出現(xiàn)了。7. 指向下以原子再次拖拽到產物中相應原子：當松開鼠標，2出現(xiàn)在臨近的反應物原子及對應的生成物原子上。8. 現(xiàn)在，在自動映射面板，點擊自動映射。所有其它原子都被自動賦值了。注意：被映射的原子僅在映射工具面板被調出的時候可見。2. 高級繪制：模型 目標講解如何利用模型進行畫圖。216。 模型功能如何能幫助畫圖。216。 如何利用 Instant Template 功能畫含有多個相同功能團的結構。216。 化學基團表(Table of Radicals)的更多用途。216。 如何利用模型畫 DNA 分子和復雜的生物分子。216。 如何自創(chuàng)模型。 概述ACD/ChemSketch 包括3種結構模型來源：216。 化學基團表(Table of Radicals) 216。 模型窗口(Template Window) 216。 插入模型工具(Instant Template tool) 當指定化學基團表中的任意模型的連接點后，模型窗口和插入模型工具允許通過點擊而指定連接的原子或鍵。無論模型來自何處，連接的原理是一樣的。將模型連接到結構上有以下幾種方法：216。 通過連接結構與模型的鍵： 將鼠標的指針指向特定的化學鍵，使結構的化學鍵和模型在光標上的影子結合，再點擊鼠標。216。 通過模型接近結構：將光標指向結構中相應的原子，產生連接鍵后，點擊鼠標。216。 通過模型和結構之間的螺旋線連接：將鼠標指向要連接的原子，按下SHIFT鍵，點擊鼠標。注意：可以通過點擊TAB鍵使懸在光標上的模型影子翻轉。 原子團表原子基團表是用以繪制化學結構的一系列化學原子團。在一些例子中，它們的名稱和所寫將幫助快速的利用簡潔的方式查找化學原子基團的。 創(chuàng)建熒光胺結構我們將利用從原子基團表中的模板來繪制如下結構在結構模式下操作。1. 在常用工具欄上點擊新頁面來打開一個空白頁面。2. 從參考工具欄或原子基團表中選擇環(huán)戊烷。3. 點擊ChemSketch的工作區(qū)將環(huán)粘貼進來。4. 按下SHIFT鍵，點擊指定的原子，以螺旋方式連接第二個環(huán)戊烷：5. 由化學基團表中選擇苯(Benzene) ，首先點擊指定的鍵連接苯環(huán)，再點擊指定的原子，連接苯環(huán)：6. 在左側原子工具表中選定氧鍵 (注意：此時通用畫圖工具自動激活)，點擊指定的原子，用氧取代：7. 點擊鼠標右鍵，選擇連續(xù)畫圖工具，雙擊指定的原子，連接OH集團：8. 點擊指定的單鍵，使之變?yōu)殡p鍵： 快速模型工具在ACD/ChemSketch 中一個有用的工具就是快速模型工具，它可以節(jié)省時間，更快地畫出圖象?？梢哉J為它是“粘貼“命令。 創(chuàng)建環(huán)狀體聚物結構在結構模式下操作。1. 從化學基團表中選擇苯環(huán)，在工作區(qū)的上中部點擊鼠標，放置苯結構。2. 從化學基團表中選擇乙炔(Ethynyl) ，點擊箭頭所指的原子，將其連接在苯環(huán)上：3. 選擇快速模型工具，點擊箭頭所指原子，創(chuàng)建一個快速模型：←4. 點擊箭頭所指原子，接上模型：5. 再次選擇快速模型工具，將整個圖象創(chuàng)建成模型： ↑6. 像圖示的那樣，點擊指定原子，連接成如圖所示的模型。完成后，點擊鼠標右鍵將模型影子隱藏：7. 選擇通用畫圖工具，點擊指定的原子，完成環(huán)： 模型窗口模板窗口是ChemSketch三大模板中最經典的 創(chuàng)建DNA分子片斷 繪制去氧核糖5磷酸鹽鏈的圖象1. 打開模型窗口，由DNA/RNA 表中通過點擊原子選擇2去氧核糖5磷酸鹽((2Deoxyriboso5phosphate)鏈狀結構)：2. 點擊工作區(qū)得到選定的模型。3. 按下SHIFT鍵，移動鼠標到指定原子，點擊以連接下一個去氧核糖5磷酸鹽圖象：4. 選定選擇/旋轉/調整大小工具(Select/Rotate/Resize) 。5. 通過拖動矩形選擇框選定結構中指定部分，將動作中心拖到指定的氧原子上。按下SHIFT鍵，
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