chemsketch使用(編輯修改稿)
2025-09-01 00:38 本頁(yè)面
【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 反應(yīng)。選擇不同的顏色來(lái)區(qū)分自動(dòng)生成和手動(dòng)插入。1. 從選項(xiàng)菜單選擇參數(shù)調(diào)出參數(shù)設(shè)置對(duì)話(huà)框。2. 轉(zhuǎn)到反應(yīng)Reaction標(biāo)簽，將手繪色Manual Mapping Color選為紅色：3. 轉(zhuǎn)換到結(jié)構(gòu)Structure標(biāo)簽，將自動(dòng)/手動(dòng)編號(hào)色Auto/Manual Numbering Color設(shè)置為藍(lán)色：4. 點(diǎn)擊OK，現(xiàn)在我們可以照樣子開(kāi)始繪制了。5. 在結(jié)構(gòu)工具欄，點(diǎn)擊AtomAtom Map來(lái)顯示映射工具面板并選擇映射方式：注意：注意到手動(dòng)映射模式已被自動(dòng)打開(kāi)（相應(yīng)的按鈕被激活）。6. 指向反應(yīng)物的原子拖拽到生成物上的相應(yīng)原子。當(dāng)松開(kāi)鼠標(biāo)，1在反應(yīng)圖中手動(dòng)映射的原子上出現(xiàn)了。7. 指向下以原子再次拖拽到產(chǎn)物中相應(yīng)原子：當(dāng)松開(kāi)鼠標(biāo)，2出現(xiàn)在臨近的反應(yīng)物原子及對(duì)應(yīng)的生成物原子上。8. 現(xiàn)在，在自動(dòng)映射面板，點(diǎn)擊自動(dòng)映射。所有其它原子都被自動(dòng)賦值了。注意：被映射的原子僅在映射工具面板被調(diào)出的時(shí)候可見(jiàn)。2. 高級(jí)繪制：模型 目標(biāo)講解如何利用模型進(jìn)行畫(huà)圖。216。 模型功能如何能幫助畫(huà)圖。216。 如何利用 Instant Template 功能畫(huà)含有多個(gè)相同功能團(tuán)的結(jié)構(gòu)。216。 化學(xué)基團(tuán)表(Table of Radicals)的更多用途。216。 如何利用模型畫(huà) DNA 分子和復(fù)雜的生物分子。216。 如何自創(chuàng)模型。 概述ACD/ChemSketch 包括3種結(jié)構(gòu)模型來(lái)源：216。 化學(xué)基團(tuán)表(Table of Radicals) 216。 模型窗口(Template Window) 216。 插入模型工具(Instant Template tool) 當(dāng)指定化學(xué)基團(tuán)表中的任意模型的連接點(diǎn)后，模型窗口和插入模型工具允許通過(guò)點(diǎn)擊而指定連接的原子或鍵。無(wú)論模型來(lái)自何處，連接的原理是一樣的。將模型連接到結(jié)構(gòu)上有以下幾種方法：216。 通過(guò)連接結(jié)構(gòu)與模型的鍵： 將鼠標(biāo)的指針指向特定的化學(xué)鍵，使結(jié)構(gòu)的化學(xué)鍵和模型在光標(biāo)上的影子結(jié)合，再點(diǎn)擊鼠標(biāo)。216。 通過(guò)模型接近結(jié)構(gòu)：將光標(biāo)指向結(jié)構(gòu)中相應(yīng)的原子，產(chǎn)生連接鍵后，點(diǎn)擊鼠標(biāo)。216。 通過(guò)模型和結(jié)構(gòu)之間的螺旋線(xiàn)連接：將鼠標(biāo)指向要連接的原子，按下SHIFT鍵，點(diǎn)擊鼠標(biāo)。注意：可以通過(guò)點(diǎn)擊TAB鍵使懸在光標(biāo)上的模型影子翻轉(zhuǎn)。 原子團(tuán)表原子基團(tuán)表是用以繪制化學(xué)結(jié)構(gòu)的一系列化學(xué)原子團(tuán)。在一些例子中，它們的名稱(chēng)和所寫(xiě)將幫助快速的利用簡(jiǎn)潔的方式查找化學(xué)原子基團(tuán)的。 創(chuàng)建熒光胺結(jié)構(gòu)我們將利用從原子基團(tuán)表中的模板來(lái)繪制如下結(jié)構(gòu)在結(jié)構(gòu)模式下操作。1. 在常用工具欄上點(diǎn)擊新頁(yè)面來(lái)打開(kāi)一個(gè)空白頁(yè)面。2. 從參考工具欄或原子基團(tuán)表中選擇環(huán)戊烷。3. 點(diǎn)擊ChemSketch的工作區(qū)將環(huán)粘貼進(jìn)來(lái)。4. 按下SHIFT鍵，點(diǎn)擊指定的原子，以螺旋方式連接第二個(gè)環(huán)戊烷：5. 由化學(xué)基團(tuán)表中選擇苯(Benzene) ，首先點(diǎn)擊指定的鍵連接苯環(huán)，再點(diǎn)擊指定的原子，連接苯環(huán)：6. 在左側(cè)原子工具表中選定氧鍵 (注意：此時(shí)通用畫(huà)圖工具自動(dòng)激活)，點(diǎn)擊指定的原子，用氧取代：7. 點(diǎn)擊鼠標(biāo)右鍵，選擇連續(xù)畫(huà)圖工具，雙擊指定的原子，連接OH集團(tuán)：8. 點(diǎn)擊指定的單鍵，使之變?yōu)殡p鍵： 快速模型工具在ACD/ChemSketch 中一個(gè)有用的工具就是快速模型工具，它可以節(jié)省時(shí)間，更快地畫(huà)出圖象?？梢哉J(rèn)為它是“粘貼“命令。 創(chuàng)建環(huán)狀體聚物結(jié)構(gòu)在結(jié)構(gòu)模式下操作。1. 從化學(xué)基團(tuán)表中選擇苯環(huán)，在工作區(qū)的上中部點(diǎn)擊鼠標(biāo)，放置苯結(jié)構(gòu)。2. 從化學(xué)基團(tuán)表中選擇乙炔(Ethynyl) ，點(diǎn)擊箭頭所指的原子，將其連接在苯環(huán)上：3. 選擇快速模型工具，點(diǎn)擊箭頭所指原子，創(chuàng)建一個(gè)快速模型：←4. 點(diǎn)擊箭頭所指原子，接上模型：5. 再次選擇快速模型工具，將整個(gè)圖象創(chuàng)建成模型： ↑6. 像圖示的那樣，點(diǎn)擊指定原子，連接成如圖所示的模型。完成后，點(diǎn)擊鼠標(biāo)右鍵將模型影子隱藏：7. 選擇通用畫(huà)圖工具，點(diǎn)擊指定的原子，完成環(huán)： 模型窗口模板窗口是ChemSketch三大模板中最經(jīng)典的 創(chuàng)建DNA分子片斷 繪制去氧核糖5磷酸鹽鏈的圖象1. 打開(kāi)模型窗口，由DNA/RNA 表中通過(guò)點(diǎn)擊原子選擇2去氧核糖5磷酸鹽((2Deoxyriboso5phosphate)鏈狀結(jié)構(gòu))：2. 點(diǎn)擊工作區(qū)得到選定的模型。3. 按下SHIFT鍵，移動(dòng)鼠標(biāo)到指定原子，點(diǎn)擊以連接下一個(gè)去氧核糖5磷酸鹽圖象：4. 選定選擇/旋轉(zhuǎn)/調(diào)整大小工具(Select/Rotate/Resize) 。5. 通過(guò)拖動(dòng)矩形選擇框選定結(jié)構(gòu)中指定部分，將動(dòng)作中心拖到指定的氧原子上。按下SHIFT鍵，
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