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【正文】 轉(zhuǎn)結(jié)構(gòu),直到它成為所期望的結(jié)構(gòu)。1. 使用上節(jié)的技巧畫出雙[2,2,2]環(huán)己烷結(jié)構(gòu),或者使用模型窗口中相應(yīng)的模型或者在上面的模板中選擇雙環(huán)中的合適結(jié)構(gòu)。生成的結(jié)構(gòu)以陰影的形式附著在鼠標(biāo)下:5. 點(diǎn)擊工作區(qū)置入結(jié)構(gòu)。2. 在結(jié)構(gòu)工具欄,選擇畫鏈工具(Draw chains),并在工作區(qū)畫出9個(gè)碳的鏈。 如何畫化學(xué)反應(yīng)式。注意:如果有多個(gè)結(jié)構(gòu)式,不必分別選擇每一個(gè)結(jié)構(gòu)式,再轉(zhuǎn)換成SMILE Notation,只要不選擇任何結(jié)構(gòu)式,點(diǎn)擊SMILES后,所有的結(jié)構(gòu)的SMILE Notation將在一行顯示,中間有一點(diǎn)隔開。6. 如果選項(xiàng)菜單下參數(shù)對(duì)話框中結(jié)構(gòu)標(biāo)簽下的轉(zhuǎn)換到3D旋轉(zhuǎn)結(jié)構(gòu)的復(fù)選框被選中,在3D優(yōu)化后將自動(dòng)轉(zhuǎn)換到3D旋轉(zhuǎn)模式。 創(chuàng)建C20球碳分子在結(jié)構(gòu)模式下進(jìn)行以下操作。5. 點(diǎn)擊OK關(guān)閉對(duì)話框。 如何利用 Instant Template 功能畫含有多個(gè)相同功能團(tuán)的結(jié)構(gòu)。216。5. 通過(guò)拖動(dòng)矩形選擇框選定結(jié)構(gòu)中指定部分,將動(dòng)作中心拖到指定的氧原子上。注意:可以給文件鍵入任意名字(例如:,Sugare:betaDFuranose這樣的名字可能更好一些。默認(rèn)值是分子量。 含有金屬原子的結(jié)構(gòu);216。5. 選擇氯元素鍵 , 在結(jié)構(gòu)附近點(diǎn)擊一次,得到鹽酸結(jié)構(gòu)HCl。這個(gè)功能很容易使用:畫出需要命名的化學(xué)結(jié)構(gòu)式,點(diǎn)擊命名鍵,化學(xué)名稱將以文本形式插入屏幕上的工作區(qū)。對(duì)于含有兩個(gè)或者多個(gè)雙鍵或者三鍵與氧,氮,硫或者其他元素原子相共厄或者相連接的有機(jī)分子結(jié)構(gòu),可能會(huì)有其它的同分異構(gòu)體,但是要很仔細(xì)地考慮它們的可能性。如果現(xiàn)在選擇“選擇性質(zhì)”僅會(huì)計(jì)算被選中的性質(zhì)。 定義用戶模型要將一個(gè)ChemSketch文件保存為模型文件,我們推薦將其保存在模型文件夾中。1. 從化學(xué)基團(tuán)表中選擇苯環(huán),在工作區(qū)的上中部點(diǎn)擊鼠標(biāo),放置苯結(jié)構(gòu)。將模型連接到結(jié)構(gòu)上有以下幾種方法:216。2. 高級(jí)繪制:模型 目標(biāo)講解如何利用模型進(jìn)行畫圖。 標(biāo)記化學(xué)反應(yīng)的條件學(xué)習(xí)如何在化學(xué)反應(yīng)圖形中添加實(shí)驗(yàn)條件:1. 在結(jié)構(gòu)工具欄,點(diǎn)擊反應(yīng)箭頭標(biāo)簽。1. 由基團(tuán)表中選擇環(huán)丁烷,在工作區(qū)點(diǎn)擊兩次,生成上下兩個(gè)正方形。 創(chuàng)建雙[2,2,2]環(huán)己烷結(jié)構(gòu)1. 從選項(xiàng)菜單,選擇參數(shù)設(shè)置,然后在出現(xiàn)的對(duì)話框中切換到結(jié)構(gòu)標(biāo)簽。提示:在固定基團(tuán)到工作區(qū)前,可以按TAB鍵將結(jié)構(gòu)翻轉(zhuǎn)。 216。2. 在模板窗口切換到氨基酸的標(biāo)簽下,可以從打開模板窗口按鈕中找到模板窗口。在出現(xiàn)的對(duì)話框中,如圖設(shè)置選項(xiàng)然后點(diǎn)擊OK:3. 在工具菜單中,指向生成,然后選擇InChI for :4. 用不同的選項(xiàng)來(lái)重復(fù)InChI分子的生成;在InChI Options對(duì)話框中清除Mobile H Perception 選項(xiàng)并選擇Stereo : 3D-優(yōu)化講述如何創(chuàng)建一個(gè)含有非標(biāo)準(zhǔn)角度和鍵長(zhǎng)的結(jié)構(gòu)。6. 點(diǎn)擊3D優(yōu)化將得到所繪結(jié)構(gòu)的3D樣式:7. 如果轉(zhuǎn)換到3D旋轉(zhuǎn)模式的復(fù)選框被選中(結(jié)構(gòu)標(biāo)簽下),3D優(yōu)化后程序?qū)⒆詣?dòng)轉(zhuǎn)換到3D旋轉(zhuǎn)模式,如果沒(méi)有選中,點(diǎn)擊3D旋轉(zhuǎn)。3. 按住 鍵盤上的TAB鍵,將懸在光標(biāo)上的苯環(huán)陰影翻轉(zhuǎn),然后點(diǎn)擊空白處,右擊鼠標(biāo),懸在鼠標(biāo)上的陰影將消失:4. 點(diǎn)擊常規(guī)畫圖工具 ( Draw Normal ),然后在一個(gè)獨(dú)立的苯環(huán)的雙鍵上點(diǎn)擊,得到三鍵:5. 按照 Section :6. 從結(jié)構(gòu)工具欄中,選擇 Reaction Plus鍵,在以下兩個(gè)結(jié)構(gòu)之間點(diǎn)擊,得到加號(hào):7. 點(diǎn)擊反應(yīng)箭頭鍵( Reaction Arrow) , 在反應(yīng)物和生成物之間點(diǎn)擊并拖動(dòng)鼠標(biāo),得到箭頭:注意: 點(diǎn)擊 Reaction Arrow 鍵右下腳的三角,可以得到一系列的不同形狀的箭頭。8. 現(xiàn)在,在自動(dòng)映射面板,點(diǎn)擊自動(dòng)映射。 模型窗口(Template Window) 216。4. 按下SHIFT鍵,點(diǎn)擊指定的原子,以螺旋方式連接第二個(gè)環(huán)戊烷:5. 由化學(xué)基團(tuán)表中選擇苯(Benzene) ,首先點(diǎn)擊指定的鍵連接苯環(huán),再點(diǎn)擊指定的原子,連接苯環(huán):6. 在左側(cè)原子工具表中選定氧鍵 (注意:此時(shí)通用畫圖工具自動(dòng)激活),點(diǎn)擊指定的原子,用氧取代:7. 點(diǎn)擊鼠標(biāo)右鍵,選擇連續(xù)畫圖工具,雙擊指定的原子,連接OH集團(tuán):8. 點(diǎn)擊指定的單鍵,使之變?yōu)殡p鍵: 快速模型工具在ACD/ChemSketch 中一個(gè)有用的工具就是快速模型工具,它可以節(jié)省時(shí)間,更快地畫出圖象。(Select/Move),雙擊需要隱藏的原子。你可以轉(zhuǎn)換到畫圖模式下進(jìn)行必要的文本編輯。ACD/Tautomers(同分異構(gòu)體)和ACD/Name。許多結(jié)構(gòu)式是錯(cuò)誤的或者沒(méi)有清楚地指出同分異構(gòu)體。 普通化學(xué)鍵中只能包括H,C,N,P,O,S,F,Cl,B
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