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【正文】 的界面中。2. 繪制如下一個(gè)結(jié)構(gòu):3. 選擇并切斷一個(gè)(非環(huán)的)鍵。只有點(diǎn)擊最右邊的狀態(tài)對(duì)話框,并選擇相應(yīng)的性質(zhì)即可。在出現(xiàn)的對(duì)話框中,標(biāo)記性質(zhì)后點(diǎn)擊OK。 計(jì)算宏觀性質(zhì) 菜單命令按照以下步驟計(jì)算所有可用分子性質(zhì):1. 在結(jié)構(gòu)模式下,畫出一個(gè)結(jié)構(gòu),例如苯甲酸:2. 從工具(Tools)菜單中選擇計(jì)算(Calculate), 再選擇所有性質(zhì)(All Properties) 或者某一個(gè)性質(zhì),對(duì)其性質(zhì)進(jìn)行計(jì)算。打開模型管理器對(duì)話框(模型菜單中),點(diǎn)擊新創(chuàng)建(New)鍵,找到需要的文件,為其指定名字即可。3. 在保存用戶模型對(duì)話框中鍵入模型的名字,如“ALKALOIDS”,并注意文件保存的路徑,再點(diǎn)擊OK。同樣的,還可以使用Pseudo Atom工具來實(shí)現(xiàn)。3. 重復(fù)12步驟,選擇D糖表(betaDpyranose) ,選擇βDGlucopyranose..4. 在ChemSketch 窗口中,點(diǎn)擊將其放置在第一個(gè)結(jié)構(gòu)的右邊:5. 選擇ChemSketch碳原子鍵,在αDGlucopyranose 中點(diǎn)擊指定的原子,用CH3集團(tuán)取代它,按下SHIFT 鍵,將CH3集團(tuán)拖動(dòng)到右邊,以形成90度鍵:6. 對(duì)βdglucopyranose結(jié)構(gòu)重復(fù)步驟5,得到如下結(jié)構(gòu):7. 選擇O原子,點(diǎn)擊βDGlucopyranose結(jié)構(gòu)中如下所示的原子(Click 箭頭所指的CH3),用OH替換CH3:8. 選定選擇/移動(dòng)(Select/Move) 鍵,點(diǎn)擊工作區(qū)附近,選定結(jié)構(gòu)。 繪制復(fù)雜的生物化學(xué)結(jié)構(gòu)這里利用ChemSketch的不同工具,畫復(fù)雜的生物化學(xué)結(jié)構(gòu)。3. 按下SHIFT鍵,移動(dòng)鼠標(biāo)到指定原子,點(diǎn)擊以連接下一個(gè)去氧核糖5磷酸鹽圖象:4. 選定選擇/旋轉(zhuǎn)/調(diào)整大小工具(Select/Rotate/Resize) 。 創(chuàng)建環(huán)狀體聚物結(jié)構(gòu)在結(jié)構(gòu)模式下操作。2. 從參考工具欄或原子基團(tuán)表中選擇環(huán)戊烷。 原子團(tuán)表原子基團(tuán)表是用以繪制化學(xué)結(jié)構(gòu)的一系列化學(xué)原子團(tuán)。 通過模型接近結(jié)構(gòu):將光標(biāo)指向結(jié)構(gòu)中相應(yīng)的原子,產(chǎn)生連接鍵后,點(diǎn)擊鼠標(biāo)。無(wú)論模型來自何處,連接的原理是一樣的。 概述ACD/ChemSketch 包括3種結(jié)構(gòu)模型來源:216。216。216。注意:被映射的原子僅在映射工具面板被調(diào)出的時(shí)候可見。當(dāng)松開鼠標(biāo),1在反應(yīng)圖中手動(dòng)映射的原子上出現(xiàn)了。1. 從選項(xiàng)菜單選擇參數(shù)調(diào)出參數(shù)設(shè)置對(duì)話框。4. 在下面的方格中輸入benzene苯。8. 如果要移動(dòng)加號(hào)或者箭頭,可以點(diǎn)擊選擇/移動(dòng)鍵 Select/Move工具, 然后將光標(biāo)指在要移動(dòng)的物體上,拖動(dòng)鼠標(biāo)。 繪制化學(xué)反應(yīng)繪制如下反映圖形:1. 從原子團(tuán)表中Table of Radicals 選擇苯環(huán)Benzene。4. 通過拖動(dòng)鼠標(biāo)將原子a,c,e,g,i移動(dòng)到原子b,d,f,h,j形成如下結(jié)構(gòu)。5. 將鼠標(biāo)放置在任意原子或鍵上,在工作區(qū)拖動(dòng)鼠標(biāo)旋轉(zhuǎn)結(jié)構(gòu),直到它是需要的結(jié)構(gòu)。8. 從工具菜單欄,選擇Show Aromaticity來顯示芳香環(huán): 創(chuàng)建立方烷結(jié)構(gòu)在結(jié)構(gòu)模式下進(jìn)行以下操作。2. 從參考工具欄或原子基團(tuán)表中選擇苯環(huán)??梢愿淖兘徊骀I的位置,具體做法是利用Tools 菜單鍵下的Bring Bond to Front(CTRL+F) 和Send Bond to Back (CTRL+K). 也可以通過激活Change Position 鍵后,單擊即將改變位置的化學(xué)鍵,同時(shí)按住SHIFT 鍵將后面的鍵移到前面來。4. 點(diǎn)擊正常繪圖并按照下面的圖案使用拖拽繪制出烴橋:5. 點(diǎn)擊3D優(yōu)化即獲得所繪結(jié)構(gòu)的3D樣式。3D優(yōu)化和3D旋轉(zhuǎn)使可以很容易完成。 生成國(guó)際化學(xué)標(biāo)識(shí)分子式我們將轉(zhuǎn)換(1S)1(1H咪唑4基)乙醇。這個(gè)結(jié)構(gòu)式與前面得到的相同。創(chuàng)建的簡(jiǎn)化線性分子式出現(xiàn)在結(jié)構(gòu)式的下面:2. 可以按CTRL+C將其復(fù)制到Windows的剪貼板,通過菜單命令或CTRL+V粘貼到其他外部文件中。4. 從原子基團(tuán)表中選擇Alanine丙氨酸和Tryptophan色氨酸,點(diǎn)擊指定的原子,連接上相應(yīng)的官能團(tuán)。3. 在結(jié)構(gòu)工具欄,點(diǎn)擊上下翻轉(zhuǎn)按鈕結(jié)構(gòu)就被顛倒了:4. 點(diǎn)擊鼠標(biāo)右鍵,選擇通用畫圖工具(Draw Normal),由一個(gè)原子拉到另一個(gè)原子,以建立連接的鍵。使用該功能,可以很容易地畫出完美的結(jié)構(gòu)。 如何用3D Optimization 優(yōu)化工具畫[2,2,2]環(huán)己烷, 三蝶烯(triptycene),立方烷(cubane)和C20球碳結(jié)構(gòu)(dodecahedrane)的3D優(yōu)化結(jié)構(gòu);216。1. 超級(jí)結(jié)構(gòu)、簡(jiǎn)化線性分子式和化學(xué)反應(yīng)式 目標(biāo)本章講解如何畫更為復(fù)
點(diǎn)擊復(fù)制文檔內(nèi)容
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