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正文內(nèi)容

ncbi使用說明word版(編輯修改稿)

2025-05-11 06:13 本頁面
 

【文章內(nèi)容簡介】 )來選擇哪個外部鏈接在他們的搜索中是可見的。 Y1 A, \9 [T 引用匹配 — 允許你找到任何一篇在PubMed數(shù)據(jù)庫中的文章的PubMed ID或MEDLINE UID,給出書目信息(雜志,卷,頁碼等)。 $ S1 H/ y。 S1 ` 單篇文章的引用匹配。 : v4 z5 u/ A+ b. W8 q1 許多文章的批量引用匹配。 7 v3 a6 F: B4 s7 W2 d1 Email引用匹配也是可以的,也可以用于單篇或許多文章。如果要獲得幫助文件,給citation_matcher@。 + Q2 i。 {) d z R @2 C7 c% f4 _39。 Z0 D4 v+ s/ ?Genomes and Maps Overview:) u39。 O j6 |2 JF8 E+ R39。 v2 B9 [ h Entrez基因組:人,小鼠,大鼠,酵母,線蟲,瘧原蟲,細(xì)菌,病毒,viroids,質(zhì)粒,和真核細(xì)胞器。 $ ]3 S5 B5 U3 O|$ [ d8 D Entrez基因組(各種物種) 3 ht! `$ L0 G Entrez基因組 — 超過800種在GenBank中被完整測序的物種,包括大于500種病毒,〉25種細(xì)菌,酵母,和許多viroids,質(zhì)粒,和細(xì)胞器。還包括正在進(jìn)行中的基因組,比如人,小鼠,線蟲,瘧原蟲,果蠅,利什曼原蟲,水稻,和玉米。提供完成的基因組/染色體的圖形概覽,并可以探究那些逐步細(xì)化的區(qū)域。也提供那些已經(jīng)被NCBI工作人員分析過的物種的編碼區(qū)的摘要和TaxTables。另外,Entrez Map Viewer,Entrez基因組的一個軟件組成部分,提供整合的果蠅(細(xì)胞遺傳學(xué)和序列圖譜)和人類(細(xì)胞遺傳學(xué),遺傳連鎖,序列,放射雜交,和其它圖譜)的染色體圖譜的瀏覽。 39。 f/ z2 r8 e。 {。 ]$ l2 W1 v2 ]/ C 通過每個物種的Entrez基因組頁面來下載〈350kb的基因組。 4 aQ, I0 ^$ d。 P Q! } e 通過NCBI ftp站點來下載〉350kb的基因組—參見在genbank/genomes目錄下的readme文件,ftp鏈接在每個物種的Entrez基因組頁面上也有。8 X ^: G( d. r: F0 |]6 W。 yn famp。 t( R/ NNCBI站點地圖其他基因組數(shù)據(jù)介紹:/ u6 H$ A$ Q5 _$ S 小鼠基因組 ) oamp。 C) v6 WR b3 J( R* k9 K. ?1) 小鼠基因組資源向?qū)?:把從各個中心來的各種小鼠相關(guān)的資源整合在一起,包括序列,圖譜,和克隆信息以及指向小鼠種系和突變資源的指針。 + j R8 `1 G。 z* c( ^. C+ I2) 小鼠基因組測序:小鼠基因組計劃的測序進(jìn)展,HTG序列contigs(可以用大小和染色體號來瀏覽)由測序中心的數(shù)據(jù)建立,可以contig或染色體的形式來下載。 。 \ {+ E, [: n6 C A1 E, s39。 C3) 小鼠UniGene :被整理成簇的EST和全長mRNA序列,每一個代表一種特定已知的或假設(shè)的基因,有定位圖和表達(dá)信息以及同其它資源的交叉參考。序列數(shù)據(jù)可以以cluster形式在Unigene網(wǎng)頁下載,完整的數(shù)據(jù)可以從FTP站點repository/UniGene目錄下下載 / g. e$ E% ^。 H. \: r B4) 位點鏈接(LocusLink) :為校正過的序列和遺傳位點的描述信息提供一個單次查詢界面。LocusLink給每個位點發(fā)布一個穩(wěn)定的ID,并提供官方的命名,序列accesssion number, Unigene簇,圖譜信息,和相關(guān)的網(wǎng)址。LocusLink是NCBI,人類基因命名委員會,OMIM和其它組織的合作結(jié)果。LocusLink目前包含人類,小鼠,大鼠,斑馬魚,和果蠅的位點,物種可以被分開或合在一起查詢。 d w1 U E3 t% B* ? u, }5) Entrez :包括了來自〉70000個物種的序列數(shù)據(jù),可以用物種字段來限制記錄只在小鼠搜索。 9 damp。 KXamp。 w6 x i6) 人類/小鼠同源圖 :University of California at Davis的M. F. Seldin建立,一張比較人和老鼠在同源區(qū)段DNA上基因的表,按在每個基因組上的位置排列。 1 }4 V3 c ? Z) G `$ d, ? 大鼠基因組 S! Y Q5 b[39。 J( N1) 大鼠UniGene :被整理成簇的EST和全長mRNA序列,每一個代表一種特定已知的或假設(shè)的基因,有定位圖和表達(dá)信息以及同其它資源的交叉參考。序列數(shù)據(jù)可以以cluster形式在Unigene網(wǎng)頁下載,完整的數(shù)據(jù)可以從FTP站點repository/UniGene目錄下下載 `4 K% G* h6 O L$ z% ?: _2) 位點鏈接(LocusLink):為校正過的序列和遺傳位點的描述信息提供一個單次查詢界面。LocusLink給每個位點發(fā)布一個穩(wěn)定的ID,并提供官方的命名,序列accesssion number, Unigene簇,圖譜信息,和相關(guān)的網(wǎng)址。LocusLink是NCBI,人類基因命名委員會,OMIM和其它組織的合作結(jié)果。LocusLink目前包含人類,小鼠,大鼠,斑馬魚,和果蠅的位點,物種可以被分開或合在一起查詢。8 N! V2 Q2 j3 ?2 b 斑馬魚基因組Q。 ^* U) s/ k4 {1) 斑馬魚UniGene :被整理成簇的EST和全長mRNA序列,每一個代表一種特定已知的或假設(shè)的基因,有定位圖和表達(dá)信息以及同其它資源的交叉參考。序列數(shù)據(jù)可以以cluster形式在Unigene網(wǎng)頁下載,完整的數(shù)據(jù)可以從FTP站點repository/UniGene目錄下下載 , @ y7 e @2 U3 y+ w0 o$ d39。 u2) 位點鏈接(LocusLink) :為校正過的序列和遺傳位點的描述信息提供一個單次查詢界面。LocusLink給每個位點發(fā)布一個穩(wěn)定的ID,并提供官方的命名,序列accesssion number, Unigene簇,圖譜信息,和相關(guān)的網(wǎng)址。LocusLink是NCBI,人類基因命名委員會,OMIM和其它組織的合作結(jié)果。LocusLink目前包含人類,小鼠,大鼠,斑馬魚,和果蠅的位點,物種可以被分開或合在一起查詢。 ! y! dd }* A/ h R 果蠅基因組 . U* [+ G, x0 l8 N1) 黑腹果蠅主頁 : 提供所有可使用的果蠅資源的概要,用圖形的方式顯示了染色體,允許你通過Entrez基因組瀏覽器的方法來搜索整個基因組的細(xì)胞遺傳和序列信息。Entrez基因組提供了對于一個物種一致的遺傳,物理,和序列數(shù)據(jù)的圖形界面。當(dāng)你用一個基因的代號來搜索時,它給出搜索結(jié)果的一個圖形的基因組視圖,從那你可以放大到你所感興趣的區(qū)域的更詳細(xì)的圖譜視圖,并且鏈接到序列數(shù)據(jù)和包含更多信息的相關(guān)資源。 3 o5 A ^! @}4 D2) 黑腹果蠅基因組測序的狀態(tài) :描述了目前在GenBank,Entrez Genomes,和FTP站點中的數(shù)據(jù)的范圍 0 C) ^% y% _7 |1 {! i8 Q }3) Entrez圖譜瀏覽器 :整合的染色體圖譜—圖譜瀏覽器是Entrez基因組的一個軟件組成部分,用來顯示一個或多個用共同標(biāo)記或基因名字互相align過的圖譜,以及用相同序列進(jìn)行比較過的序列圖譜。在人類基因組數(shù)據(jù)和搜索技巧文件中有關(guān)于目前可以使用的果蠅的序列和細(xì)胞遺傳學(xué)圖譜。Entrez圖譜瀏覽器的幫助文件提供了關(guān)于如何使用這個工具的一般說明。 5 X o! e: ^/ ]/ I5 Z0 r* K: c4) 位點鏈接(LocusLink): 為校正過的序列和遺傳位點的描述信息提供一個單次查詢界面。LocusLink給每個位點發(fā)布一個穩(wěn)定的ID,并提供官方的命名,序列accesssion number, Unigene簇,圖譜信息,和相關(guān)的網(wǎng)址。LocusLink是NCBI,人類基因命名委員會,OMIM和其它組織的合作結(jié)果。LocusLink目前包含人類,小鼠,大鼠,斑馬魚,和果蠅的位點,物種可以被分開或合在一起查詢。 5 s$ A( _: d+ h n 線蟲基因組( P! xamp。 W: }! ^+ U39。 }Entrez基因組:染色體的圖形表示,可以整個的查看,也可以逐步放大的看。鏈接到相關(guān)的序列數(shù)據(jù)。 ! E6 Q8 m39。 h, U0 q 酵母基因組! m, N7 `4 ^I P5 B。 F5 ^1) Entrez基因組 :染色體的圖形表示,可以整個的查看,也可以逐步放大的看。鏈接到相關(guān)的序列數(shù)據(jù)。 / \6 N2 Y9 ~( A0 _! p e! p2) COGs :相鄰類的聚簇 — 來自于完整基因組的基因家族自然系統(tǒng)。COGs用比較21種完整的基因組的編碼的蛋白序列描繪了17個主要的種系發(fā)生系統(tǒng)。每個COG包含至少來自3個世系的獨立蛋白或蛋白家族的相鄰體,所以對應(yīng)了一個古老的保守domain。 _+ v4 L2 G+ N8 l* V, o 瘧原蟲基因組W. \) N?2 R4 B8 i9 X) E1) 瘧原蟲遺傳學(xué)和基因組:提供與瘧原蟲遺傳學(xué)和基因相關(guān)的數(shù)據(jù)和信息。資源包括物種特異的序列BLAST數(shù)據(jù)庫(惡性瘧原蟲,所有瘧原蟲,以及弓形蟲),基因組圖譜,連鎖標(biāo)記,以及遺傳學(xué)研究信息。鏈接到其他的瘧原蟲網(wǎng)站和相關(guān)的寄生蟲遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫包括弓形蟲。 7 V6 _G。 U/ Z$ x. d3 ?2) Entrez基因組 — 惡性瘧原蟲的染色體全長的圖形視圖,完整的染色體序列數(shù)據(jù)(2和3),鏈接到正在進(jìn)行的染色體的分離數(shù)據(jù)表(來自于HB3 X Dd2雜交的染色體),鏈
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