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正文內(nèi)容

生物化學(xué)名詞解釋總結(jié)(留存版)

  

【正文】 數(shù) RNA外幾乎都是蛋白質(zhì)。 米氏常數(shù)( Michaelis constant,)( Km): 對(duì)于一個(gè)給定反應(yīng),導(dǎo)致酶促反應(yīng)速度的起始速度( v0)達(dá)到最大反應(yīng)速度( Vmax)一半時(shí)的底物濃度。 序變模式( sequential model): 相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的另外一種模式。 尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸和尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸( NADP): 含有尼克酰胺的輔酶,在某些氧化還原反應(yīng)中起著氫原子和電子載體的作用,常常作為脫氫酶的輔酶。 轉(zhuǎn)化(作用)( transformation) : 一個(gè)外源 DNA通過(guò)某種途徑導(dǎo)入一個(gè)宿主菌,引起該細(xì)菌的遺傳特性改變的作用。拓?fù)洚悩?gòu)酶 I 通過(guò)切斷 DNA中的一條鏈減少負(fù)超螺旋,增加一個(gè)連環(huán)數(shù);而拓?fù)洚悩?gòu)酶 II 切斷 DNA 的兩條鏈增加負(fù)超螺旋,減少 2 個(gè)連環(huán)數(shù)。 重組 DNA技術(shù)( rebination DNA technology) : 也稱之基因工程 (genomic engineering)。 無(wú)效循環(huán)( futile cycle): 也稱之底物循環(huán)( substrate cycle)。 暗反應(yīng) (dark reactions): 利用光反應(yīng)生成的 ATP和 NADPH的化學(xué)能使 CO2還原成糖或其它有機(jī)物的一系列酶促過(guò)程。 生物固氮作用 (Biological nitrogen fixation): 大氣中的氮被還原為氨的過(guò)程。第二信使再去調(diào)節(jié)靶酶,引起細(xì)胞內(nèi)各種效應(yīng)。 岡崎片段 (Okazaki fragments): 相對(duì)比較短的 DNA 鏈(大約 1000 核苷酸殘基),是在 DNA的滯后鏈的不連續(xù)合成期間生成的片段,這是 Reiji Okazaki 在 DNA合成實(shí)驗(yàn)中添加放 射性的脫氧核苷酸前 體觀察到的。這種修復(fù)方式的特點(diǎn)是:識(shí)別出正確的鏈,切除掉不正確鏈的部分,然后通過(guò) DNA聚合酶和 DNA連接酶的作用合成正確配對(duì)的雙鏈 DNA。 密碼子 (codon): mRNA(或 DNA)上的三聯(lián)體核苷酸殘基序列,該序列編碼著一個(gè)指定的氨基酸, tRNA的反密碼子與mRNA的密碼子互補(bǔ)。是由一個(gè)含有大約 30個(gè)氨基酸殘基的環(huán)和一個(gè)與環(huán)上的 4個(gè) Cys或 2個(gè) Cys和 2個(gè) His配位的 Zn2+構(gòu)成,形成的結(jié)構(gòu)象個(gè)手指狀。 起始密碼( iniation codon): 指定蛋白質(zhì)合成起始位點(diǎn)的密碼。該修復(fù)方法不用切斷 DNA或切除堿基。 Klenow 片段 (Klenow fragment): DNA聚合酶 I經(jīng)部分水解生成的 C末端 605個(gè)氨基酸殘基片段。例如別嘌呤醇對(duì)黃嘌呤氧化酶的抑制就屬于這種抑制類型。在饑餓期間酮體是包括腦在內(nèi)的許多組織的燃料,酮體過(guò)多將導(dǎo)致中毒。電子從 NADH 傳遞給 O2時(shí), P/O比為 3,而電子從 FADH2傳遞給 O2時(shí), P/O比為 2。是一個(gè)葡萄糖 6磷酸經(jīng)代謝產(chǎn)生 NADPH和核糖 5磷酸的途徑。 I型限制性內(nèi)切酶既催化宿主 DNA的甲基化,又催化非甲基化的 DNA的水解;而 II 型限制性內(nèi)切酶只催化非甲基化的 DNA的水解。維持DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的力主要是堿基堆積力。 協(xié)同運(yùn)送 (cotransport): 兩種不同溶質(zhì)跨膜的耦聯(lián)轉(zhuǎn)運(yùn)。脂溶性維生素包括維生素 A、 D、 E和 K,這類維生素能被動(dòng)物貯存。 別構(gòu)調(diào)節(jié)劑( allosteric modulator) : 結(jié)合在別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)部位調(diào)節(jié)該酶催化活性的生物分子 ,別構(gòu)調(diào)節(jié)劑可以是激活劑,也可以是抑制劑。 共價(jià)催化( covalent catalysis): 一個(gè)底物或底物的一部分與催化劑形成共價(jià)鍵,然后被轉(zhuǎn)移給第二個(gè)底物。 別構(gòu)效應(yīng)( allosteric effect): 又稱之變構(gòu)效應(yīng)。 角蛋白( keratins): 由處于 α螺旋或 β折疊構(gòu)象的平行的多肽鏈組成的不溶于水的起著保護(hù)或結(jié)構(gòu)作用的蛋白質(zhì)。 β折疊 (βsheet): 是蛋白質(zhì)中的常見(jiàn)的二級(jí)結(jié)構(gòu),是由伸展的多肽鏈組成的。構(gòu)型的改變往往使分子的光學(xué)活性發(fā)生變化。 透析( dialysis): 通過(guò)小分子經(jīng)半透膜擴(kuò)散到水(或緩沖液)的原理將小分子與生物大分子分開(kāi)的一種分離純化技術(shù)。 等電點(diǎn)( pI, isoelectric point): 使分子處于兼性分子狀態(tài),在電場(chǎng)中不遷移(分子的凈電荷為零)的 pH 值。 雙向電泳( twodimensional electrophoresis): 是等電聚焦電泳和 SDSPAGE的組合,即先進(jìn)行等電聚焦電泳(按照 pI分離),然后再進(jìn)行 SDSPAGE(按照分子大?。?,經(jīng)染色得到的電泳圖是個(gè)二維分布的蛋白質(zhì)圖。三級(jí)結(jié)構(gòu)是在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進(jìn)一步盤(pán)繞、折疊形成的。在蛋白質(zhì)中,特別是球蛋白中,經(jīng)??梢钥吹接扇舾上噜彽亩?jí)結(jié)構(gòu)單元組合在一起,彼此相互作用,形成的有規(guī)則、在空間上能辨認(rèn)的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合體。 蛋白質(zhì)變性( denaturation): 生物大分子的天然構(gòu)象遭到破壞導(dǎo)致其生物活性喪失的現(xiàn)象。 1961年國(guó)際酶學(xué)會(huì)議規(guī)定: 1個(gè)酶活力單位是指在特定條件( 25℃ ,其它為最適條件)下,在 1分鐘內(nèi)能轉(zhuǎn)化 1微摩爾底物的酶量,或是轉(zhuǎn)化底物中 1微摩爾的有關(guān)基團(tuán)的酶量。這種抑制使得 Vmax變小,但 Km 不變。 別構(gòu)調(diào)節(jié)物 (allosteric modulator): 也稱之別構(gòu)效應(yīng)物( allosteric effector)。 轉(zhuǎn)氨酶( transaminases): 也稱之氨基轉(zhuǎn)移酶( aminotransferases),在該酶的催化下一個(gè) α氨基酸的氨基轉(zhuǎn)可移給另一個(gè) α酮酸。另外生長(zhǎng)發(fā)育階段、營(yíng)養(yǎng)狀態(tài)和環(huán)境的改變都不影響 DNA的堿基組成。來(lái)源相同的 DNA單鏈經(jīng)退火后完全恢復(fù)雙鏈結(jié)構(gòu),同源 DNA之間、 DNA和 RNA之間退火后形成雜交分子。 底物水平磷酸化 (substrate phosphorylation): ADP 或某些其它的核苷 5ˊ 二磷酸的磷酸化是通過(guò)來(lái)自一個(gè)非核苷酸底物的磷酰基的轉(zhuǎn)移實(shí)現(xiàn)的。糖異生不是糖酵解的簡(jiǎn)單逆轉(zhuǎn)。在該途徑中,在葉肉細(xì)胞 CO2被整合到 C4酸中,然后 C4酸在維管束鞘細(xì)胞被脫羧,釋放出的 CO2被 Calvin 循環(huán)利用。 氧化脫氨( oxidative deamination): α氨基酸在酶的催化下脫 氨生成相應(yīng) α酮酸的過(guò)程。G蛋白將胞外的第一信使腎上腺素等激素和胞內(nèi)的腺苷酸環(huán)化酶催化的腺苷酸環(huán)化生成的第二信使 cAMP聯(lián)系起來(lái)。 滾環(huán)復(fù)制( rollingcircle replication): 復(fù)制環(huán)狀 DNA的一種模式,在該模式中, DNA聚合酶結(jié)合在一個(gè)缺口鏈的 3ˊ 端,繞環(huán)合成與模板鏈互補(bǔ)的 DNA,每一輪都是新合成的 DNA取代前一輪合成的 DNA。 模板鏈 (template strand): 可作為模板轉(zhuǎn)錄為 RNA 的那條鏈,該鏈與轉(zhuǎn)錄的 RNA 堿基互補(bǔ)( AU, GC)。 TψC臂( TψC arm): tRNA中含有胸腺嘧啶核苷酸 假尿嘧啶核苷酸 胞嘧啶核苷酸殘基序列的莖環(huán)結(jié)構(gòu)。 信號(hào)肽( signal peptide) : 常指新合成多肽鏈中用于指導(dǎo)蛋白質(zhì)跨膜轉(zhuǎn)移(定位)的 N末端的氨基酸序列(有時(shí)不一定在 N端)。 編碼鏈( coding strand): 雙鏈 DNA中,不能進(jìn)行轉(zhuǎn)錄的那條 DNA鏈 ,該鏈的核苷酸序列與轉(zhuǎn)錄生成的 RNA的序列一致(在 RNA中是以 U取代了 DNA中的 T)。 互補(bǔ) DNA (cDNA , plementary DNA): 通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄酶由 mRNA模板合成的雙鏈 DNA。 半保留復(fù)制 (semiconservative replication): DNA 復(fù)制的一種方式。 乒乓反應(yīng)( pi
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