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正文內(nèi)容

動(dòng)物遺傳學(xué)第九章動(dòng)物基因組學(xué)(更新版)

  

【正文】 高等真核生物子代數(shù)量有限,只有少數(shù)的減數(shù)分裂事件可供研究,連鎖分析的分辨率受很大限制 假設(shè)交換是隨機(jī)發(fā)生的,但由于交換熱點(diǎn)的存在使某一區(qū)段的交換頻率遠(yuǎn)高于其它區(qū)段,無(wú)法繪制精確的遺傳圖。 蛋白質(zhì)組學(xué)的研究?jī)?nèi)容 蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法 1 用于蛋白質(zhì)分離技術(shù)方面的如雙向凝膠電泳,雙向 “ 高效 ” 柱層析等 2 用于蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)如質(zhì)譜技術(shù),凝膠圖像分析,蛋白質(zhì)和多肽的 N端, C端測(cè)序及氨基酸組成分析 3 用于蛋白質(zhì)相互作用及作用方式研究的雙雜交系統(tǒng) 4 用于分析大量數(shù)據(jù)的生物工程信息學(xué)等 第三節(jié) 基因圖譜 ( gene map) 一、遺傳圖譜: 又稱連鎖圖譜 (linkage map), 應(yīng)用遺傳學(xué)技術(shù)構(gòu)建能顯示基因以及其它序列特征在基因組上位置的圖。 蛋白組學(xué)與功能基因組學(xué)息息相關(guān)。 功能基因組學(xué)研究的方法 ? 差異顯示反轉(zhuǎn)錄 PCR ? 基因表達(dá)序列分析( SAGE) ? 基因芯片或微點(diǎn)矩陣 ? RNA干涉技術(shù) ? 遺傳足跡法 ? 發(fā)求遺傳學(xué) ? 蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué)方法 生物芯片 生物芯片 (二)比較基因組學(xué) 利用生物在進(jìn)化上的親緣關(guān)系 ,來(lái)比較它們與人類之間的相似與相異 ,即比較基因組學(xué)。 結(jié)構(gòu)基因組學(xué) 功能基因組學(xué) 結(jié)構(gòu)基因組學(xué) 概念和目的 以全部基因組測(cè)序?yàn)槟繕?biāo)的基因結(jié)構(gòu)研究,弄清基因組中全部基因的位置和結(jié)構(gòu),為基因功能的研究奠定基礎(chǔ)。 序列測(cè)定方法 2 五、人類基因組計(jì)劃的意義 第一:獲得人類全部基因序列將有助于人類認(rèn)識(shí)許多遺傳疾病以及癌癥等疾病的治病機(jī)理,為分子診斷、基因治療等新方法提供理論依據(jù)。 三、人類基因組計(jì)劃的研究進(jìn)展 ?1985年,美國(guó)的杜爾貝克 “ 癌癥研究的轉(zhuǎn)折點(diǎn) 測(cè)定人類基因組序列 ” 。 ? 多國(guó)合作小組 2021年在 Nature上公布結(jié)果 ? Craig Venter博士采用鳥槍法于 Science上發(fā)表結(jié)果。 基因組大小的比較( 1) 基因組大小的比較( 2) 六、其它物種基因組 ? 2021年 3月, “ 全基因組鳥槍法 ” 獲得果蠅全基因組序列,發(fā)表在 Science上。 2 毛細(xì)管電泳: 可用于單核苷酸改變的尋找,短串聯(lián)重復(fù)序列的檢查, DNA測(cè)序,基因及其表達(dá)產(chǎn)物的分析。主要是開展蛋白質(zhì)組的研究??梢岳没蚯贸头戳x技術(shù)分析基因表達(dá)產(chǎn)物 蛋白質(zhì)的功能。當(dāng)兩個(gè)遺傳標(biāo)記之間的重組值為 1%時(shí),圖距即為 1cM。 隨著遺傳圖譜和物理圖譜的完成,測(cè)序就成為重中之重的工作。 生物信息學(xué) 是以生物大分子為研究對(duì)象,以計(jì)算機(jī)為工具,運(yùn)用數(shù)學(xué)和信息科學(xué)的觀點(diǎn)、理論和方法去研究生命現(xiàn)象、組織和分析呈指數(shù)級(jí)增長(zhǎng)的生物信息數(shù)據(jù)的一門科學(xué) . 什么是生物信息學(xué)? 主要研究?jī)?nèi)容 生物信息的收集、存儲(chǔ)、管理與提供 包括建立國(guó)際基本生物信息庫(kù)和生物信息傳輸?shù)膰?guó)際聯(lián)網(wǎng)系統(tǒng);建立生物信息數(shù)據(jù)質(zhì)量的評(píng)估與檢測(cè)系統(tǒng);生物信息的在線服務(wù);生物信息可視化和專家系統(tǒng)。 EMBL是由 European Molecular Biology Laboratory于 1982年創(chuàng)建的,目前由歐洲生物信息學(xué)研究所負(fù)責(zé)管理。 RCSB的 PDB數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)址是: 功能數(shù)據(jù)庫(kù) 1. KEGG 京都基因和基因組百科全書 (KEGG)是系統(tǒng)分析基因功能,聯(lián)系基因組信息和功能信息的知識(shí)庫(kù)。 (一)形態(tài)學(xué)標(biāo)記 (第一代遺傳標(biāo)記): 形態(tài)標(biāo)記 指肉眼可見的或儀器測(cè)量生物的外部特征(如毛色、體型、皮膚結(jié)構(gòu)、生理特征、地理分布等),即個(gè)體的 外部形態(tài)特征 。 缺點(diǎn) 需要花費(fèi)較大的人力和較長(zhǎng)時(shí)間來(lái)培育,難度很大 某些物種對(duì)染色體變異反應(yīng)敏感; 變異難以用細(xì)胞學(xué)方法進(jìn)行檢測(cè)。 優(yōu)點(diǎn): ?直接以 DNA的形式表現(xiàn),在生物體的各個(gè)組織、各個(gè)發(fā)育階段均可檢測(cè)到,不受季節(jié)、環(huán)境限制,不存在表達(dá)與否等問題 ?數(shù)量極多,遍布整個(gè)基因組,可檢測(cè)座位幾乎無(wú)限 ?多態(tài)性高,自然界存在許多等位變異,無(wú)須人為創(chuàng)造 ?表現(xiàn)為中性,不影響目標(biāo)性狀的表達(dá); ?許多標(biāo)記表現(xiàn)為共顯性的特點(diǎn),能區(qū)別純合體和雜合體。 ? 限制性內(nèi)切酶的切點(diǎn)必須不在重復(fù)序列中,以保證小衛(wèi)星序列的完整性。不同遺傳材料重復(fù)次數(shù)的可變性,導(dǎo)致了 SSR長(zhǎng)度的高度變異性,這一變異性正是 SSR標(biāo)記產(chǎn)生的基礎(chǔ)。
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