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正文內(nèi)容

分子生物學(xué)3(完整版)

  

【正文】 ① 阻遏蛋白的調(diào)控作用 無(wú)色氨酸時(shí),阻遏蛋白不能與操縱序列結(jié)合,對(duì)轉(zhuǎn)錄無(wú)抑制作用,有色氨酸時(shí),阻遏蛋白與色氨酸結(jié)合變構(gòu),與操縱序列結(jié)合,抑制轉(zhuǎn)錄。 葡萄糖對(duì) lac 操縱子的阻遏作用稱 分解代謝阻遏 (catabolic repression)。是一段能減弱轉(zhuǎn)錄作用的序列。轉(zhuǎn)錄終止子與、轉(zhuǎn)錄終止子與 ?因子因子⑴ 轉(zhuǎn)錄終止子 (teminater)① 定義: 指基因的 3′ 末端或者操縱子的 3′的一段具有終止轉(zhuǎn)錄功能的核苷酸序列。它主要通過(guò) 改變啟動(dòng)子的起始效率 而控制基因的轉(zhuǎn)錄。它主要通過(guò) 改變啟動(dòng)子的可獲得性 而控制基因轉(zhuǎn)錄。第 二 節(jié) 原核基因表達(dá)調(diào)節(jié)Regulation of gene expression in prokaryotesSection Ⅱ一、轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控一、轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控(一)影響原核基因轉(zhuǎn)錄的因素(一)影響原核基因轉(zhuǎn)錄的因素啟動(dòng)子 啟動(dòng)子是 DNA鏈上能與 RNApol結(jié)合并能有效起始 RNA轉(zhuǎn)錄的 DNA序列。包括轉(zhuǎn)錄提前終止、 mRNA前體的加工、剪接、 RNA編輯等。 如果基因?qū)Νh(huán)境信號(hào)應(yīng)答是被抑制,這種基因是 可阻遏基因 。因此,在多細(xì)胞生物,基因表達(dá)的時(shí)間特異性又稱 階段特異性 。* 基因表達(dá) ( gene expresion)基因表達(dá)是受調(diào)控的 一一 、基因表達(dá)的概念、基因表達(dá)的概念﹡ 基因表達(dá)調(diào)控( gene expression regulation and control) 指通過(guò)生物體內(nèi)的調(diào)控系統(tǒng)來(lái)調(diào)節(jié)和控制體內(nèi)蛋白質(zhì)的含量與活性,使之在特定的時(shí)間、特定的空間、并以一定的強(qiáng)度出現(xiàn),以適應(yīng)機(jī)體生長(zhǎng)、發(fā)育和繁殖的需要。 某些基因在一個(gè)個(gè)體的幾乎所有細(xì)胞中持續(xù)表達(dá) , 通常被稱為 管家基因 。(二)轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控(二)轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控 轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是基因表達(dá)調(diào)控中 最重要的環(huán)節(jié),轉(zhuǎn)錄的起始是 基本的控制點(diǎn) 。 翻譯的起始調(diào)控是翻譯水平調(diào)控的主要階段。如環(huán)境溫度升高或其它應(yīng)激變化引起 ?32與核心酶結(jié)合, RNApol全酶結(jié)合 Hsp基因的啟動(dòng)區(qū),起始 Hsp基因轉(zhuǎn)錄,而原先許多基因的轉(zhuǎn)錄關(guān)閉。⑵ ⑵ 輔阻遏輔阻遏 如 Trp,無(wú)色氨酸時(shí),阻遏蛋白不能與操縱序列結(jié)合, RNApol與啟動(dòng)子結(jié)合啟動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄。倒位蛋白、倒位蛋白 (inversion protein) 是一種位點(diǎn)特異性的 重組酶 ?;匚男蛄邢掠?A/U序列的作用: dA和 rU之間氫鍵力和堿基堆積力很弱,造成 RNA和 DNA雜交部分很容易拆開(kāi),三元復(fù)合物解體, RNApol與RNA解離,轉(zhuǎn)錄終止。ATP cAMP 5′AMPAC PDE cAMP↑ , CAP+cAMP→cAMPCAP→ 與操縱子上 CAP結(jié)合位點(diǎn)結(jié)合,促進(jìn) RNApol與啟動(dòng)子結(jié)合,引起有效轉(zhuǎn)錄。有 Ara, AraC與Ara結(jié)合,激活 RNApol,結(jié)合于 BAD基因的啟動(dòng)子,啟動(dòng) BAD基因轉(zhuǎn)錄。 2)序列 ① 是一個(gè)開(kāi)放閱讀框: 轉(zhuǎn)錄后立即翻譯成 14氨基酸的短肽稱作前導(dǎo)肽, 前導(dǎo)肽第 10, 11位是兩個(gè)連續(xù)的色氨酸。 (二) mRNA壽命對(duì)翻譯的調(diào)控作用不同的 mRNA有不同的降解速度 降解 mRNA的外切酶主要是 3′ 外切核酸酶 mRNA 分子末端的二級(jí)結(jié)構(gòu)能阻止 3′ 外切酶進(jìn)攻,凡降解終止子發(fā)夾結(jié)構(gòu)的突變都造成mRNA穩(wěn)定性降低,終止子除轉(zhuǎn)錄終止功能外,還決定 mRNA的穩(wěn)定性。 mRNA GGG UAU CUU UGAC UAC GAC23 24 25 26 27 28{{RF2 核糖體蛋白質(zhì)合成的自體調(diào)控 70余種蛋白質(zhì),核糖體蛋白質(zhì) 50多種,絕大多數(shù)種類的蛋白質(zhì)在每個(gè)核糖體只有一個(gè)。⑵ SD 序列的位置是影響翻譯效率的重要因素 表達(dá) IL2時(shí), Lac啟動(dòng)子的 SD序列距 AUG為 7個(gè)核苷酸時(shí), IL2表達(dá)效率最高,間隔 8個(gè)核苷酸,表達(dá)水平降低 500倍 隱蔽 SD序列對(duì)翻譯的影響 如 SD序列處于 mRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)中,核糖體不能與之結(jié)合,只有打破這種結(jié)構(gòu),核糖體才能結(jié)合。 難以直接鑒定基因產(chǎn)物和基因控制的生化過(guò)程;難以直接選擇出影響調(diào)節(jié)基因的突變體;難以直接通過(guò)改變外界環(huán)境條件來(lái)研究分析基因表達(dá)變化;難以直接進(jìn)行基因操作等。 這種反應(yīng)主要發(fā)生在 CpG二核苷酸的胞嘧啶上。 特定的非組蛋白可以與組蛋白競(jìng)爭(zhēng)性地與DNA結(jié)合,解除組蛋白對(duì)基因表達(dá)的抑制作用。 ① 典型的啟動(dòng)子 : 含 TATAbox,有時(shí)一個(gè)基因的啟動(dòng)子上有兩個(gè)TATAbox,它們可分別或有側(cè)重地對(duì)不同誘導(dǎo)物作出應(yīng)答,在某些情況下,也參與組織特異性的選擇,如 ?淀粉酶基因在唾液腺和肝臟兩種組織分別選擇了相距 ,轉(zhuǎn)錄效率不同的兩個(gè)轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn),保證唾液中酶的活性遠(yuǎn)高于肝臟。 反式作用因子的特點(diǎn)⑴ 具有三個(gè)功能域: DNA識(shí)別結(jié)合域;轉(zhuǎn)錄活化域(轉(zhuǎn)錄調(diào)控域);結(jié)合其他蛋白結(jié)構(gòu)域(自身活化域) 其中有 DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域( DNA binding domain,簡(jiǎn)稱為 DB)和轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域( activation domain,簡(jiǎn)稱為 AD),它們是轉(zhuǎn)錄激活因子發(fā)揮功能所必需的。 ⑤ 亮氨酸拉鏈 (Leucine zipper) 兩個(gè)具有亮氨酸拉鏈區(qū)的反式作用因子以疏水力相互作用形成的 形同拉鏈的區(qū)域 。 ② 富含谷氨酰胺結(jié)構(gòu) 如 SP1是與啟動(dòng)子 GC box結(jié)合的一種轉(zhuǎn)錄因子,除有結(jié)合 DNA的鋅指結(jié)構(gòu)外, SP1共有 4個(gè)參與轉(zhuǎn)錄活化的區(qū)域,其中最強(qiáng)的轉(zhuǎn)錄活化域之一很少有極性 aa,卻富含谷氨酰胺,達(dá)該區(qū) aa總數(shù)的25%左右。   帶正電荷的組蛋白與 DNA 中帶負(fù)電荷的磷酸基結(jié)合 ,于是組蛋白遮蔽了 DNA 分子 ,降低了 DNA 的模板活性。順式作用元件與反應(yīng)作用因子的相互作用 反式作用因子的活性調(diào)節(jié)⑴ 表達(dá)式調(diào)節(jié) 這類反式作用因子合成出來(lái)就有活性,需要時(shí)就合成,不需要時(shí)就降解失活。 ⑷ 蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)的相互作用 有些反式作用因子單獨(dú)不能發(fā)揮作用,需與另一種蛋白結(jié)合成復(fù)合物才能發(fā)揮作用,如 Cmyc蛋白單獨(dú)結(jié)合 DNA的能力很低,與 max蛋白結(jié)合成二聚體就可調(diào)節(jié)基因表達(dá)。在短距離內(nèi),這種機(jī)制是可能的,但遠(yuǎn)距離無(wú)法采用這種機(jī)制。這兩個(gè)因素至少保證 mRNA在轉(zhuǎn)錄過(guò)程中不被降解。核糖體均在核內(nèi)組裝,再運(yùn)輸?shù)桨麧{。有鐵時(shí),該蛋白與鐵結(jié)合,從鐵蛋白 mRNA莖環(huán)結(jié)構(gòu)解離,鐵蛋白的翻譯效率提高 100多倍。 3′UTR 富含 AU序列對(duì) mRNA穩(wěn)定性的影響 如生長(zhǎng)因子 mRNA不穩(wěn)定,半衰期僅 30分鐘,其 3′UTR 存在 AU豐富區(qū),它常由幾個(gè)相同分布的 UUAUUUAU8核苷酸序列組成。其抑制作用依賴 Lin14 mRNA終止密碼子與 poly(A)尾之間的 3′ 端非編碼區(qū)的一段序列,去除這個(gè)特殊序列, lin4 RNA則失去抑制作用。 又如轉(zhuǎn)鐵蛋白 mRNA3′UTR 的 AU豐富區(qū),可形成 5個(gè)發(fā)夾結(jié)構(gòu),有鐵時(shí),鐵調(diào)節(jié)蛋白與鐵結(jié)合,而與 RNA解離, mRNA降解;無(wú)鐵時(shí),調(diào)節(jié)蛋白與mRNA的莖環(huán)結(jié)構(gòu)結(jié)合,保護(hù) mRNA不被降解。 elF4F? PKC elF4F?p ?亞基磷酸化可促使 4F的三個(gè)亞單位復(fù)合物形成,這類復(fù)合物是起始因子識(shí)別 mRNA的活性形式,?亞基磷酸化的意義有待研究。四、翻譯水平的調(diào)控四、翻譯水平的調(diào)控 (一)翻譯起始的調(diào)控 5′ 帽子結(jié)構(gòu)( m7GpppN)對(duì)翻譯的調(diào)控作用①m 7G帽有增強(qiáng)翻譯效率的作用② 5′ 帽子結(jié)構(gòu)有利于 mRNA從細(xì)胞核向細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)和增加其穩(wěn)定性③ 5′ 帽子結(jié)構(gòu)與 3′poly(A) 尾對(duì) mRNA的翻譯效率的調(diào)節(jié)有協(xié)同作用 5′AUG 對(duì)翻譯的調(diào)控作用 翻譯時(shí), 90~ 95%的真核 mRNA符合第一 AUG規(guī)律 。tRNA在合成后,形成特殊的空間結(jié)構(gòu)可抵抗降解。如有 A、 B、 C三種反式因子結(jié)合 A基因的調(diào)控區(qū),其中 A、 C兩種因子起正調(diào)控, B因子起負(fù)調(diào)控,其綜合效應(yīng)則是激活轉(zhuǎn)錄,又如有A、 B、 D三種因子結(jié)合 B基因的調(diào)控區(qū),其中 A起正調(diào)控, B、 D起負(fù)調(diào)控,其綜合效應(yīng)則抑制 B基因的轉(zhuǎn)錄。 反式作用因子有激活基因表達(dá)的反式作用因子和阻遏表達(dá)的反式作用因子,值得一提的是:有些反式因子先激活,再與 DNA結(jié)合, 少數(shù)反式作用因子先與 DNA結(jié)合 , 再被激活 。這類家族的蛋白既參與細(xì)胞跨膜信息向細(xì)胞核內(nèi)傳遞,也參與基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)。已證明高乙?;M蛋白特異地聚集于活性染色質(zhì)功能區(qū) ,低乙酰化組蛋白聚集于無(wú)轉(zhuǎn)錄活性的非功能區(qū) ,這一結(jié)果表明組蛋白乙?;杉せ钷D(zhuǎn)錄。 ③ 富含脯氨酸結(jié)構(gòu)
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