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動(dòng)物寄生蟲病pcr診斷技術(shù)doc(完整版)

2025-08-22 18:11上一頁面

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【正文】 ,故PCR產(chǎn)物以指數(shù)方式增加,經(jīng)30個(gè)周期后,特定DNA片段的數(shù)量在理論上可增加109倍。還可引入蛋白質(zhì)結(jié)合DNA序列、引入突變位點(diǎn)、引入翻譯起始密碼子、啟動(dòng)子序列等。這樣二級(jí)結(jié)構(gòu)會(huì)因空間位阻而影響引物與模板的復(fù)性結(jié)合。引物的Tm值是指寡核苷酸的解鏈溫度,即在一定鹽濃度條件下50%寡核苷酸雙鏈的解鏈溫度。l預(yù)熱(60~70℃)的超純水或1TE緩沖液,靜置1 min,10000rpm離心20sec。方法如下:① 取出于恒溫培養(yǎng)箱中作用了約20小時(shí)的離心管,旋渦震蕩器震蕩混勻,10000rpm離心2min,上清即為蟲體DNA溶液。l的SDS裂解緩沖液,輕輕混勻,再加入20181。用雙蒸水反復(fù)吹打沖洗2次后,再用超純水反復(fù)沖洗2~3次。寄生蟲DNA的抽提方法有多種,不同種類的寄生蟲蟲體都有其最適合的抽提方法,但各種方法的基本原理都一樣,即先用機(jī)械的方法將蟲體組織破碎,然后加入DNA裂解液和蛋白酶K,充分作用后,蟲體組織中的細(xì)胞膜破裂,蛋白質(zhì)變性,將蟲體基因組DNA釋放到溶液中。 瓊脂糖;TBE緩沖液;UNIQ10柱式DNA膠回收試劑盒;UNIQ10柱式PCR產(chǎn)物純化試劑盒;異丙醇(80%)等。(2) TBE緩沖液:,充分溶解于800 ml去離子水中,加10ml mol/L EDTA(),用去離子水定容至1000ml。(二)PCR擴(kuò)增及瓊脂糖電泳1.材料。g/181。隨著PCR技術(shù)的不斷完善與發(fā)展,它已廣泛應(yīng)用于分子生物學(xué)、生物技術(shù)、臨床醫(yī)學(xué)等各個(gè)領(lǐng)域,具有廣泛的應(yīng)用前景。一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康囊笳莆誔CR診斷技術(shù)所涉及實(shí)驗(yàn)的基本原理,全面熟悉PCR診斷技術(shù)的操作過程,其中包括寄生蟲DNA的提取、PCR引物的設(shè)計(jì)、PCR條件的優(yōu)化、對(duì)目的片斷的擴(kuò)增、瓊脂糖凝膠電泳及結(jié)果分析、PCR產(chǎn)物的純化等等。l)、異丙醇(80%)、雙蒸水、滅菌超純水等。 提純的蟲體DNA。(三)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的純化1.材料。三、實(shí)驗(yàn)方法、步驟和操作要領(lǐng)(一) 寄生蟲基因組DNA的提取及純化。在裂解過程中,蟲體細(xì)胞碎片及大部分蛋白質(zhì)會(huì)相互纏繞成大型復(fù)合物,后者被DNA裂解液中的SDS包蓋,通過離心沉淀,這些復(fù)合物會(huì)從溶液中沉淀下來,變性劑也同時(shí)被除去,從而就可從上清中回收蟲體基因組DNA溶液。若蟲體較小,取一整條蟲體經(jīng)如上洗滌處理。l(25181。將上清轉(zhuǎn)移至一新的離心管中,加入1ml清洗樹脂(按50~500181。離心管內(nèi)的液體即為DNA溶液。PCR引物應(yīng)保持合理的G+C含量。若引物自身連續(xù)互補(bǔ)堿基達(dá)3個(gè)以上,就容易形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)。所附加的限制性酶切位點(diǎn)應(yīng)是不會(huì)在引物以外的DNA上切割的。在實(shí)際應(yīng)用中,一般多用30~35個(gè)循環(huán)。EB可與DNA分子形成EBDNA復(fù)合物,其發(fā)射的熒光強(qiáng)度較游離狀態(tài)EB發(fā)射的熒光強(qiáng)度大10倍以上,且熒光強(qiáng)度與DNA含量成正比。待膠凝固后,從膠模上除去封帶,拔出梳子放入電泳槽中,加入足夠量的電泳緩沖液(要求緩沖液液面高出凝膠表面約1 mm)。 為驗(yàn)證PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的種或株特異性,往往需對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證。如果PCR擴(kuò)增產(chǎn)物很特異,且引物長度小于60 bp,則兩種方法都可選用,但如果有非特異性條帶或引物長度大于60 bp時(shí),就必須用切膠純化的方法。l的DNA溶液加入400 181。⑧ ml離心管中,在柱膜中央加30 181。適當(dāng)降低離心轉(zhuǎn)速有助于提高DNA結(jié)合率。⑧ 取5~10 181。l) _________________________________________________ 模板(gDNA) 1同時(shí)設(shè)陽性對(duì)照和空白對(duì)照。3.整個(gè)操作過程中,一定要注意不要交叉污染。5.加樣前需趕走點(diǎn)樣孔中的氣泡,點(diǎn)樣時(shí)吸管頭垂直,切勿碰壞凝膠孔壁,以免使帶型不整齊。4. 切膠回收時(shí)的瓊脂糖凝膠電泳,必須將電泳槽用自來水充分沖洗,其電泳緩沖液一定要換新鮮干凈的,以保證不會(huì)有其它DNA污染。6.使用PCR產(chǎn)物純化試劑盒時(shí),模板DNA的存在不影響下游工作,而對(duì)于質(zhì)粒模板則要特別小心。廢棄膠應(yīng)集中處理,切勿亂丟。操作完畢后,臺(tái)面要用酒精擦拭數(shù)次;鑷子和剪刀經(jīng)清洗后先用酒精消毒,再用紫外燈照射1~2小時(shí)以破壞或降解殘余的DNA,以免污染其它實(shí)驗(yàn)。 反應(yīng)條件為:96℃預(yù)變性5 min,然后94℃變性1min、65℃退火2min,共30個(gè)循環(huán),最后72℃后延伸7 min。(六)動(dòng)物寄生蟲病特異PCR診斷技術(shù)實(shí)例以檢測(cè)雞柔嫩艾美爾球蟲感染為例,選用Fernandez等(2003)報(bào)道的柔嫩艾美爾球蟲種特異的引物(Tn01F:5’CCGCCCAAACCAGGTGTCACG3’。l Wash solution,高速離心(10000 rpm)30 sec。(提高洗脫溫度至5580℃有利于提高DNA的洗脫效率)⑨ 10000 rpm高速離心1 mi
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