【正文】 界面序列編輯框（右）編輯好序列，然后用鼠標點中左邊相應的該序列ID號，單擊工具菜單，選擇相應工具按鈕，點擊，在彈出的對話框中選擇相應參數(shù)后，最后確定。此序列的參數(shù)設置請參考DAS參數(shù)設置。此序列的參數(shù)設置請參考酶切圖譜參數(shù)設置。在此，以一個序列號為AF121323－1的序列為例，進行等電點分析，其余分析方法與之類似?；謴停? ☉ 單擊“編輯”菜單中的“恢復”命令，恢復上次撤銷所進行的操作。 單擊“關閉”按鈕，關閉數(shù)據(jù)庫查詢窗口。 選擇要顯示的記錄數(shù)。 選擇需要導入的序列文件，并按“確定”，該文件所包含的序列會在主窗口中顯示出來。 o 輸入需要保存的項目的項目名，并按“確定”，項目被保存為指定的名稱（原項目仍存在）。按“否”，則回到當前項目。顯示當前項目中包含的各序列的名稱。 Biolink主界面如下：主界面由“標題欄”，“菜單”、“工具欄”、“序列列表”、“序列顯示窗”及“狀態(tài)條”組成。Biolink軟件使用說明手冊安裝與卸載運行環(huán)境：1. 軟件要求： Windows9Windows9WindowsMe、 Windows20002. 硬件要求最低配置： CPU：賽揚300內(nèi)存：64M顯示卡：標準VGA，256色顯示模式以上硬盤需求：70M以上硬盤空間驅(qū)動器： CDROM其它設備：鼠標器、聲卡（非必備） 56Kmodem、XDSL、有線通等上網(wǎng)設備 建議配置： CPU：奔騰II 450內(nèi)存：128M 顯示卡：SVGA，16K色以上顯示模式其它設備同“最低配置” 安裝biolink:您只須將載有的光盤放入光盤驅(qū)動器，雙擊“setup”項即可自動執(zhí)行安裝程序。是用戶與軟件交互，進行查詢和分析的主要部分。序列顯示框：位于主界面中部右側(cè)。打開已有項目： o 單擊“文件”菜單中的“打開已有項目”命令。刪除當前項目： o 單擊“文件”“刪除當前項目”命令。 167。當選擇的是NCBI數(shù)據(jù)庫時，可以設置符合查詢條件的返回記錄數(shù)，該數(shù)值的大小決定了查詢速度的快慢 167。保存序列： o 單擊“文件”菜單中的“保存序列”命令，保存當前選擇的序列。 剪切： ☉ 選中要編輯的序列的某一段。按“是”，則彈出“分析結(jié)果”窗口，如下圖：按“否”，則不查看結(jié)果。 ORF： e) 選中要進行分析的序列，單擊“功能”菜單中的“ORF”命令，進行ORF分析。 引物設計： i) 選中要進行分析的序列，單擊“功能”菜單中的“引物設計”命令，進行引物設計分析。根據(jù)氨基酸側(cè)鏈的電荷數(shù)，就能夠計算出給定pH值下，蛋白質(zhì)所帶電荷的理論值（將氨基酸側(cè)鏈的電荷與氨基端和羧基端的電荷相加求和）。共有五種ＢＬＡＳＴ：1. ＢＬＡＳＴＮ是核酸序列到核酸庫中的一種查詢。由于這種比對的復雜性，因此ＴＢＬＡＳＴＸ在比對中對缺口不予以考慮。Queryanchored without identities：不按照特征做固定查詢。 a、所有查找到的酶的位置；一個開放閱讀框（ORF）是指一個起始和終止密碼子之間的序列。輸入一條蛋白質(zhì)序列和它的來源（如動物或酵母），PSORT會根據(jù)已知蛋 白信號肽等特征分析出輸入序列在細胞中的定位及相關信息。 Lipop: 脂蛋白分析 Peak Value of UR: Discriminant Score為正值，分值越 Signal Score () 為正值，且分值越高意味著信號肽序列被切 count: 0 value: threshold: pos: 1(23), count: 0 Amino Acid Composition Tendency for Peroxisome: Peroxisomal proteins? Status: notclr AAC score (peroxisome): 識別過氧化物酶體蛋白 普遍存在于真核細胞。 列與膜脂質(zhì)雙層結(jié)合而使蛋白質(zhì)定位于細胞膜上。 列中位置的函數(shù)。 態(tài)，即α螺旋，β折疊，轉(zhuǎn)角和螺旋卷曲，對于每一種結(jié)構(gòu)， 功能：識別跨膜螺旋區(qū)，分析氨基酸的組成。 輸出：1）預測得到的跨膜區(qū)文字說明； 輸入：一條DNA序列，大小寫都可以。 2．簡單描述Sequence Quality: 序列質(zhì)量參數(shù)(為一整數(shù))，高表示可信度高，低表示可信度低。Optimum Primer Size: 引物序列最適當?shù)拈L度。Minimum GC Content: 包含GC的最小百分比。默認值為50nM，這是一個經(jīng)驗值：20ml的反應中包括20mmol/，10微毫克模板，每個dNTP ,引物自身基因工程物間互補之和,要盡量小。若輸入輸出用1堿基索引（類似GenBank和使用者通常所用的），設置參數(shù)為1。 非默認值只作用于目的片段為0Max End Stability: 左右引物3’端五堿基穩(wěn)定性。Internal Oligo Optimum Tm: 內(nèi)部探針最適合Tm值。Internal Oligo Maximum PolyX: 內(nèi)部探針最大多聚核苷酸數(shù)Internal Oligo Maximum 3’Self Complementarity: 內(nèi)部探針最大3’端自身互補度。Internal Oligo Max Mishyb: 內(nèi)部探針最大錯配值。Internal Oligo Maximum Tm: 內(nèi)部探針最大Tm值。推薦值9。若引物跨越目標（target）并覆蓋目標，將此值乘以覆蓋的目標序列核酸數(shù)，作為“位置罰分”。在3W界面，默認值是1。沒有負數(shù)。Maximum Ns Accepted: 任意引物中最大的不確定（N）堿基數(shù)，最好無。GC Content 一般50%較好。Maximum Primer Size: 引物序列最大的長度。該序列必須為輸入序列的子串Right Input: 輸入右引物，使其能檢出相應的左引物。 輸出：目