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生物化學(xué)——第一章蛋白質(zhì)(完整版)

2025-02-21 12:43上一頁面

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【正文】 金槍魚 21 角餃 23 小蠅 25 蛾 31 小麥 35 粗早鏈孢霉 43 酵母 44 不同生物來源的細(xì)胞色素c中不變的AA殘基 14 10 6 100 1 34 32 30 29 27 18 17 67 59 52 51 48 45 41 38 87 84 82 80 70 68 91 Gly Gly Phe Cys Gly Gly Gly Arg Lys Gly Cys Lys Phe His Pro Leu Gly Arg Tyr Ala Asn Trp Tyr 70 75 80 Lys Lys Lys Pro Pro Tyr Ile Gly Thr Met Asn Leu 血紅素 細(xì)胞色素 c分子的空間結(jié)構(gòu) 不變 的 AA殘基 35個(gè)不變的 AA殘基,是 Cyt C 的生物功能所不可缺少的。 ? 彎曲處的第一個(gè)氨基酸殘基的 C=O 和第四個(gè)殘基的 – NH 之間形成氫鍵,形成一個(gè)不很穩(wěn)定的環(huán)狀結(jié)構(gòu)。 ? AA側(cè)鏈向外,螺旋穩(wěn)定性靠 氫鍵 維系 ? 蛋白質(zhì)中的 ?螺旋幾乎為右手 ?螺旋。 一個(gè)具有生物活性的蛋白質(zhì)多肽鏈在一定條件下往往只有一種或很少的幾種構(gòu)象。 ? 蛋白質(zhì)與多肽并無嚴(yán)格的界線,通常是將分子量在 6000道爾頓以上的多肽稱為 蛋白質(zhì) 。Tyr 二、重要的天然寡肽 ? 參與體內(nèi)氧化還原反應(yīng) ? 保護(hù)巰基酶或含 Cys的蛋白質(zhì)中 SH的還原性 肽類激素 ? 促甲狀腺素釋放因子( TRH3肽) ? 促黃體生成激素釋放抑制因子( LRH10肽) ? 生長激素釋放抑制因子( GRIF14肽) ? 加壓素( ADH9肽) ? 催產(chǎn)素( 9肽) 促甲狀腺素釋放因子 ( TRH) 短桿菌肽 S 干擾素、胸腺肽是治療乙肝、腫瘤的首選藥 機(jī)理: 由受損細(xì)胞分泌促使其他細(xì)胞產(chǎn)生相應(yīng)的抗病毒蛋白質(zhì)。 蛋白質(zhì) +PITC PITC— 蛋白質(zhì) 末端 PTH氨基酸和比原來少一個(gè)氨基酸的多肽鏈 。因?yàn)樗鼈兪莵啺被幔磻?yīng)不釋放 NH3, 而直接生成黃色物質(zhì)。 C O O C HH 2 NR正離子 兩性離子 負(fù)離子 + + — pHpI pH=pI pHpI 氨基酸的等電點(diǎn) ? 當(dāng)溶液濃度為某一 pH值時(shí) , 氨基酸分子中所含的 NH3+和 COO數(shù)目正好相等 , 凈電荷為 0。 ? 構(gòu)成蛋白質(zhì)的 20種氨基酸在可見光區(qū)都沒有光吸收,但在遠(yuǎn)紫外區(qū) (220nm)均有光吸收。 R基團(tuán)疏水性強(qiáng),在蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)中形成疏水鍵,對穩(wěn)定高級結(jié)構(gòu)很重要。第一 章 蛋 白 質(zhì) 7學(xué)時(shí) Protein 第一節(jié) 蛋白質(zhì)的生物學(xué)意義 體現(xiàn)兩點(diǎn): 蛋白質(zhì)是構(gòu)成原生質(zhì)的重要組成之一; 是生物體賴以生存的物質(zhì)基礎(chǔ),是生物體內(nèi)一切生理機(jī)能的體現(xiàn)者。 吲哚 精氨酸 Argini 賴氨酸 Lysine 組氨酸 Histidine 堿性 氨基酸 H2N C H CC H2O HOC H2C H2N HCN H2N H胍基 堿性氨基酸在 pH值 精氨酸 Arginine 賴氨酸 Lysine 組氨酸 Histidine 堿性 氨基酸 H2N C H CC H2O HOC H2C H2C H2N H2堿性氨基酸在 pH值 精氨酸 Arginine 賴氨酸 Lysine 組氨酸 Histidine 堿性 氨基酸 H 2 N C H CC H2O HONN H咪唑基 組氨酸在 pH值 天冬氨酸 Aspartate 谷氨酸 Glutamate 酸性 氨基酸 H 2 N C H CC H 2O HOCO HO酸性氨基酸在 pH值 天冬氨酸 Aspartate 谷氨酸 Glutamate 酸性 氨基酸 H2N C H CC H2O HOC H2CO HO酸性氨基酸在 pH值 絲氨酸 Serine 蘇氨酸 Threonine 天冬酰胺 Asparagine 谷氨酰胺 Glutamine 半胱氨酸 Cysteine 甘氨酸 Glycine 極性不帶電荷氨基酸 H 2 N C H CC H 2O HOO H羥基 比非極性 R基氨基酸易溶于水,側(cè)鏈中含有不 解離的極性基。 ? 在近紫外區(qū) (220300nm)只有 Tyr、 Phe和 Trp有吸收光的能力。 這一 pH值即為氨基酸的等電點(diǎn) ( pI) 。 應(yīng)用: 比色分析(定量氨基酸) 、 顯色劑 、 氣體分析法 與 2, 4二硝基氟苯( DNFB) 反應(yīng) O 2 N FN O 2+ H 2 N C H CR OH N C H CR OO 2 NN O 2H+H 2 OO 2 NN O 2H N C H CR OO H + 氨基酸D N F B N 端氨基酸 DNP 衍生物D N P 氨基酸( 2) Sanger反應(yīng) 應(yīng)用:該反應(yīng)常用于多肽鏈或蛋白質(zhì)的 N端氨基酸的分析。 層析法鑒定 , 確定 N端氨基酸種類 。 腦啡肽 甲硫氨酸型( Met腦啡肽): HGly 第五節(jié) 蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu) 分四層次探討 一級結(jié)構(gòu) 二級結(jié)構(gòu) 三級結(jié)構(gòu) 四級結(jié)構(gòu) 一、一級結(jié)構(gòu)(線性結(jié)構(gòu)) ? 蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu) (primary structure) 指它的蛋白質(zhì)分子中各個(gè)氨基酸殘基的排列順序 。 為什么? 主要是因?yàn)殡逆溄Y(jié)構(gòu)的高度共振穩(wěn)定性。 問: nm含幾個(gè)氨基酸殘基 ,螺旋上升幾圈? 36個(gè), 10圈 ? O …… ( 氫 鍵 ) ……… H ? — C— ( NH— CH— CO) 3— N— ? R ? 氫鍵由同一條肽鏈內(nèi) 每 3個(gè) 氨基酸殘基的 兩個(gè)肽鍵衍生而來,即 每個(gè)氨基酸殘基的NH與前面隔 3個(gè)氨基酸殘基的 C=O形成的。 ? 主要存在于球狀蛋白分子中。其中有的可能參加維持分子構(gòu)象;有的可能參與電子傳遞;有的可能參與“識別”并結(jié)合細(xì)胞色素還原酶和氧化酶。 第七節(jié) 蛋白質(zhì)的重要性質(zhì) 一、 蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量 一般在一萬至一百萬道爾頓之間 ( 1道爾頓 ≈ 1027千克) 常用的測定方法有: 超離心法 、滲透壓法、凝膠過濾法、 SDS聚丙烯凝膠酰胺電泳等。 ? 平板電泳 過甲酸 蛋白質(zhì)是高分子化合物,由于分子量大,在水溶液中形成的顆粒直徑在 1~ 100毫微米( nm) 之間。 有機(jī)溶劑 生物堿試劑 如:苦味酸,三氯乙酸,丹寧酸等生物堿試劑,可與蛋白質(zhì)中帶正電荷的基團(tuán)生成不溶性的鹽而析出。 吳憲提出蛋白質(zhì)變性學(xué)說 蛋白質(zhì)變性的實(shí)質(zhì): 蛋白質(zhì)變性是由于蛋白質(zhì)分子內(nèi)部的結(jié)構(gòu)發(fā)生改變而引起的,變性因素破壞了氫鍵等次級鍵,使蛋白質(zhì)從原來有秩序的卷曲緊密結(jié)構(gòu)變?yōu)闊o序的松散伸展?fàn)畹慕Y(jié)構(gòu),從而導(dǎo)致生物活
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