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正文內(nèi)容

過(guò)程分子生物學(xué)(2)(完整版)

  

【正文】 它們分別稱為 順式終止 和 反式終止 。 快速進(jìn)入停頓位點(diǎn) 慢速逃離停頓位點(diǎn) RNA聚合酶 II 在近啟動(dòng)子處暫停介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄延伸調(diào)控機(jī)制 RNA聚合酶 II 從停頓位點(diǎn)逃離的先決條件是一些能促進(jìn)其逃離的蛋白因子的出現(xiàn) 。少數(shù)不含 TATA BOX 特征結(jié)構(gòu)的 啟動(dòng)子成為 TATAless 啟動(dòng)子。 與原核生物不同,哺乳動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)共有三大類 RNA聚合酶 系統(tǒng),它們均由多 轉(zhuǎn)錄因子 構(gòu)成,識(shí)別三大類真核生物的啟動(dòng)子,分別承擔(dān) rRNA、 mRNA、 tRNA的轉(zhuǎn)錄。 枯草桿菌孢子 子交叉激活 形成過(guò)程中兩 種途徑的 s因 sF sE sG sK 激活 表達(dá) 前孢區(qū) 母細(xì)胞 SpoOA SpoOA s43 s43 sF sproE sE sG sK 隔膜 1A 原核生物基因表達(dá)的啟動(dòng)開(kāi)關(guān) 鏈霉菌啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)具有很大的離散性,通過(guò)對(duì) 100多個(gè)啟動(dòng)子序列的比較,可將鏈霉菌啟動(dòng)子分成三大類: c 鏈霉菌啟動(dòng)子的多樣性 具有典型原核生物啟動(dòng)子 10區(qū) 和 35區(qū) 特征的啟動(dòng)子,僅占 21% 具有典型原核生物啟動(dòng)子 10區(qū) 而無(wú)保守的 35區(qū) 的啟動(dòng)子 既無(wú)典型原核生物啟動(dòng)子 10區(qū) 又無(wú)保守的 35區(qū) 的啟動(dòng)子 1A 原核生物基因表達(dá)的啟動(dòng)開(kāi)關(guān) 天藍(lán)色鏈霉菌 ( Streptomyces coelicolor) 的全基因組中存在多達(dá) 65種不同的 s因 c 鏈霉菌啟動(dòng)子的多樣性 s66( hrdB) 鏈霉菌最重要的 s因子 , hrdB突變是致死性的 。前一基因編碼后一 基因表達(dá)所需的 s因子。 RNA聚合酶核心酶對(duì) DNA鏈具有非特異性的親和力 ( 堿性蛋白與酸性 DNA之間的靜電引力 ) , 但 s因子增強(qiáng)了 RNA聚合酶與啟動(dòng)子區(qū)域的 特異性 結(jié)合 。 s因子幫助 RNA a 大腸桿菌啟動(dòng)子的多樣性 聚合酶識(shí)別啟動(dòng)子,同時(shí)啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄。 枯草桿菌的孢子生成過(guò)程 枯草桿菌在對(duì)數(shù)生長(zhǎng)階段結(jié)束后 , 培養(yǎng)基中營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)耗盡 , 這時(shí)便啟動(dòng)孢子生成過(guò)程:先是 DNA復(fù)制 , 隔膜形成 , 孢衣合成 , 母體裂解 , 孢子釋放 。 hrdB基因全程 表達(dá),稱為 看家基因 。所有三種 RNA聚合酶均由 814個(gè)亞基組成, 500kD, 但它們并不能單獨(dú)啟動(dòng)基因的轉(zhuǎn)錄。 RNA聚合酶 II 與轉(zhuǎn)錄因子復(fù)合物 裝配因子 TF II A B E F H J RNA聚合酶 II 本身由十個(gè)以上的亞基組成 , 這些亞基具有類 似 于 原核細(xì)菌 RNA聚合酶中的 a、 b、 b ’ 亞基功能 , 但同樣不能識(shí) 別啟動(dòng)子 。 這些因子將正轉(zhuǎn)錄延伸因子 b( PTEFb)招募至 RNA聚合酶 II 處 , 并使NELF磷酸化 。 介導(dǎo)轉(zhuǎn)錄順式終止的內(nèi)源性終止子 內(nèi)源性終止子結(jié)構(gòu)的組成為富含 GC堿基的發(fā)夾結(jié)構(gòu)以及下游的寡聚 U鏈 ( 通常是 6個(gè) U) 。 但 若在 Rho因子與 RNA聚合酶之間存在 著核糖體 , 則 Rho因子不能終止轉(zhuǎn)錄 1C 原核生物的 RNA結(jié)構(gòu)調(diào)控 b RNA轉(zhuǎn)錄的抗終止作用 在某些特殊條件下 , 由 RNA聚合酶引導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄并不能在終止子處順利終止 , 這種現(xiàn)象稱為 “ 轉(zhuǎn)錄過(guò)頭 ” , 其發(fā)生 RNA的結(jié)構(gòu)調(diào)控是一種轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)后的基因表達(dá)調(diào)控方式,其主要形式表現(xiàn)為轉(zhuǎn)錄的 終止 與 抗終止 作用。 噬菌體抗終止因子依賴性的轉(zhuǎn)錄抗終止作用 大腸桿菌 l 噬菌體 早早期基因和早期基因的表達(dá)產(chǎn)物往往是晚期 基因表達(dá)的調(diào)控因子 。 甚至在某些細(xì)胞內(nèi) , 這些由于剪切多樣性而產(chǎn)生的不同蛋白質(zhì)會(huì)同時(shí)出現(xiàn) , 并且均為細(xì)胞正 正常生物功能所必需。 tra 基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的多樣性剪切導(dǎo)致雌性細(xì)胞產(chǎn)生 Tra蛋白 tra基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的異樣性剪切由 Sxl蛋白 控制 , 表達(dá)出的 Tra蛋白 又調(diào)控 tra2基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的異常剪切 , 形成 Tra2蛋白 。 1E 原核生物反義 RNA的調(diào)控 a 反義 RNA抑制 DNA復(fù)制 直接抑制機(jī)理: 反義 RNA直接與 DNA的復(fù)制起始位點(diǎn)結(jié)合 , 阻 間接抑制機(jī)理: 反義 RNA與 RNA引物結(jié)合 , 使之不能與 DNA復(fù)制模板互補(bǔ) , 從而間接影響 DNA的復(fù)制 。 當(dāng)環(huán)境滲透壓增加時(shí) , 膜蛋白 EnvE激活胞內(nèi)的 OmpR蛋白 , 后者誘導(dǎo) ompC和 micF兩個(gè)基因轉(zhuǎn)錄 。 這種戰(zhàn)略缺點(diǎn)在于:反義 RNA分子量大 , 容易引起體內(nèi)免疫攻擊另外 , 核酸酶也 的反義 RNA。OP ONNON NNNNH2ANNONH2C539。隨后大量的研究發(fā)現(xiàn) , RNAi 現(xiàn)象廣泛存在于線蟲(chóng) 、 果蠅 、 斑馬魚(yú) 、 真菌 、 植物等生物體內(nèi) , 它們借助于 RNAi 抵御病毒的感染 , 阻斷轉(zhuǎn)座子 的轉(zhuǎn)座作用 , 以維持其基因組的相對(duì)穩(wěn)定性 。 進(jìn)一步的探索發(fā)現(xiàn): 在動(dòng)物 、 植物 、 真菌的細(xì)胞核內(nèi) , 從結(jié)構(gòu)致密的 異染色質(zhì) 中心粒區(qū)域的 DNA重復(fù)序列上會(huì)轉(zhuǎn)錄出一些特殊的 RNA前體大分子 , 它們同樣在類似蛋白因子的作用下 , 形成長(zhǎng)度為 2123個(gè)堿基的單鏈 sRNA分子 , 并發(fā)揮特殊的生物學(xué)功能 。 1F 真核生物 sRNA介導(dǎo)的 RNA干擾 d RNA干預(yù)原理的應(yīng)用 上述 RNA干擾原理在分子生物學(xué)研究領(lǐng)域中的用途包括: 通過(guò)基因表達(dá)的特異性阻斷作用,確定基因的功能 通過(guò)基因表達(dá)的特異性阻斷作用,實(shí)施基因治療 然而,如何將特定的雙鏈 RNA分子高效導(dǎo)入活細(xì)胞、活組織、活生物個(gè)體中,并維持其穩(wěn)定性,目前還是一個(gè)技術(shù)難題。 成套表達(dá)的 TFs及 miRNAs分別構(gòu)成 TF調(diào)控 密碼 ( TF code) 及 miRNA調(diào)控 密碼 ( miRNA code) , 共同 精確 決定 了單個(gè)細(xì) 胞的類型 。那么細(xì)胞內(nèi)是否也存在著固有的 RNA類似物呢? miRNA的形成 首先從異染色質(zhì)中心粒區(qū)域的 DNA重復(fù)序列上轉(zhuǎn)錄出大分子的非編碼型 RNA前體 ( primiRNA) , 后者在核內(nèi)被 微加工器復(fù)合物 ( 由 RNaseIII組成 ) 先切成大約 70個(gè)核苷酸的莖環(huán)結(jié)構(gòu) ( premiRNA) ,然后再被運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞質(zhì)中由 Dicer進(jìn)一步裁剪 , 形成成熟的 miRNA分子 , 最后再由幾種因子裝配而成 。 反義抑制過(guò)程并不涉及 mRNA的催化降解 , 只是單鏈反義 RNA物理上與 mRNA結(jié)合并阻斷其翻譯 。 近年來(lái)一連串的發(fā)現(xiàn)表明 , 一類被稱為 小分子 RNA( small RNAs) 的物質(zhì)操縱著很多生命過(guò)程 。539。 因調(diào)節(jié)細(xì)胞的滲透壓 UUUUUU CUUUAUCCCCAUUUGUCUGUAAGUCUUUACUUACUGCAUUAUUUAUUACU GACGGGCAGUGGCAGGUGUCAUAAA AUGAGGUAAUAAAUAAUGA U U GACAGAACUUA A C A C A A A U U A A G C G C C G U G U A A U C G G C G C U U U U C A GAGG: SD序列 A AUG:起始密碼子 EnvZ OmpR micF ompF ompF mRNA micF RNA 大腸桿菌利用反義 基 大腸桿菌的 R1質(zhì)粒上含有hok和 sok基因 。 制 、金黃色葡萄球 pT181質(zhì)粒的復(fù)制均采用這種機(jī)制。 dsx 基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的多樣性剪切導(dǎo)致細(xì)胞產(chǎn)生 Dsx兩性蛋白 dsx 是一個(gè)兩性基因 , Tra2蛋白 促進(jìn)其正常剪切 , 表達(dá)出雌性發(fā)育控制蛋白因子 ; 在 Tra2蛋白不存在的細(xì)胞中 , dsx發(fā)生 異常剪切 , 表 dsx 基因 雌性特異性蛋白 雄性特異性蛋白 E1 E5 E4 E2 E3 E6 達(dá)出雄性發(fā)育控制蛋白因子。 E1A 基因 1 2 3 4 外顯子 289 aa 243 aa 55 aa 1D 真核生物的 RNA剪切調(diào)控 b SV40病毒大小抗原與 剪切多樣性的關(guān)系
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