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生化試驗講義理論(完整版)

2025-02-13 10:10上一頁面

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【正文】 的試管,保持實驗臺面和實驗柜內(nèi)的整潔。 ⑺ 配制和使用洗液必須極為小心,強(qiáng)酸強(qiáng)堿必須倒入廢液缶或沖稀后排放。 實驗室規(guī)則 ⑴ 實驗前必須認(rèn)真預(yù)習(xí)實驗內(nèi)容,明確本次實驗的目的和要求,掌握實驗原理,寫好實驗預(yù)習(xí)報告,否則,不能進(jìn)行實驗。 1989 年,美國科學(xué)家 Altman 和 Cech 由于發(fā)現(xiàn)某些 RNA 具有酶的功能(稱為核酶)而共享諾貝爾化學(xué)獎。 英國生物化學(xué)家 Sanger 還于 1953 年確定了牛胰島素中氨基酸的精確順序而獲得 1958 年的諾貝爾化學(xué)獎。他們 3 人在 DNA 重組和 RNA 結(jié)構(gòu)研究方面都作出了杰出的貢獻(xiàn)。 1962 年,美國科學(xué)家 Watson 和英國科學(xué)家 Crick 因為在 1953 年提出的 DNA 分子反向平行雙螺旋模型而與英國科學(xué)家 Wilkins 分享了當(dāng)年的諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎,后者通過對 DNA 分子的 X射線衍射研究證實了 Watson 和 Crick 的 DNA模型,他們的研究成果開創(chuàng)了生物科學(xué)的歷史新紀(jì)元。 30 年代 : 電子顯微鏡技術(shù)打開了微觀世界,使我們能夠看到細(xì)胞內(nèi)的結(jié)構(gòu)和生物大分子的內(nèi)部結(jié)構(gòu)。 同學(xué)們通過生物化學(xué)實 驗應(yīng)該做到: ⑴ 學(xué)習(xí)設(shè)計一個實驗的基本思路,掌握各個實驗的基本原理,學(xué)會嚴(yán)密地組織自己的實驗,合理地安排實驗步驟和時間。 1 〔Ⅰ〕 理論部分 1. 緒論 歡迎同學(xué)們到生物化學(xué)實驗室來!對于大多數(shù)學(xué)生來說,這不是第一次做化學(xué)實驗,但是我們相信,生物化學(xué)實驗一定是大家最感興趣、最激動人心的實驗,當(dāng)然也是花費(fèi)最大、最辛苦的實驗。 ⑵ 訓(xùn)練實驗的動手能力,學(xué)會熟練地使用各種生物化學(xué)實驗儀器,包括各種天平、各種分光光度計、各種離心機(jī)、自動部分收集器、恒流泵、核酸蛋白檢測儀、冰凍干燥機(jī)、酸度計、電導(dǎo)率儀、高速分散器、各種電泳裝置和搖床等等。 40 年代 : 層析技術(shù)大發(fā)展,兩位英國科學(xué)家 Martin 和 Synge 發(fā)明了分配色譜(層析),他們獲得了 1952 年的諾貝爾化學(xué)獎。在 X射線衍射技術(shù)方面,英國物理學(xué)家 Perutz 對血紅蛋白的結(jié)構(gòu)進(jìn)行 X射線結(jié)構(gòu)分析 , Kendrew 測定了肌紅蛋白的結(jié)構(gòu),成為研究生物大分子空間立體結(jié)構(gòu)的先驅(qū),他們同獲 1962年諾貝爾化學(xué)獎。 1981 年由 Jenson 和 Lukacs 首先提出的高效毛細(xì)管電泳技術(shù)( HPCE) ,由于其高效、快速、經(jīng)濟(jì),尤其適用于生物大分子的分析,因此受到生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)和化學(xué)等學(xué)科的科學(xué)工作者的極大重視,發(fā)展極為迅速,是生化實驗技 3 術(shù)和儀器分析領(lǐng)域的重大突破,意義深遠(yuǎn)。 1959年,美藉西班牙裔科學(xué)家 Uchoa發(fā)現(xiàn)了細(xì)菌的多核苷酸磷酸化酶,研究并重建了將基因內(nèi)的遺傳信息通過 RNA中間體翻譯成蛋白質(zhì)的過程。 1993 年,美國科學(xué)家 Roberts 和 Sharp 由于在斷裂基因方面的工作而榮獲諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎。 ⑵ 實驗時自覺遵守實驗室紀(jì)律,保持室內(nèi)安靜,不大聲說笑和喧嘩。電泳后的凝膠和各種廢物不得倒入水池,只能倒入廢物桶。 ⑾ 每組的儀器和玻璃器皿要用油漆編號,嚴(yán)禁抄拿 他組儀器,不得將器皿遺棄在分光光度計內(nèi)和其他實驗臺面上,打破了玻璃儀器要及時向教師報告,并自覺登記,學(xué)期結(jié)束時按規(guī)定進(jìn)行處理。 ※※ 自燃點:液體蒸汽在空氣中自燃時的溫度。 滅火方法: 實驗室中一旦發(fā)生火災(zāi)切不可驚慌失措,要保持鎮(zhèn)靜,根據(jù)具體情況正確地進(jìn)行滅火或立即報火警(火警電話 119)。生物化學(xué)實驗室常用的易燃物蒸汽在空氣中的爆炸極限(體積%)見 表 1— 2。 劇毒物有:氰化物、砷化物 、乙腈 、甲醇、氯化氫、汞及其化合物等。③ 砷和汞中毒者應(yīng)立即送醫(yī)院急救。 ⑶割傷: 這是生物化 學(xué)實驗室常見的傷害,要特別注意予防,尤其是在向橡皮塞中插入溫度計、玻璃管時一定要用水或甘油潤滑,用布包住玻璃管輕輕旋入,切不可用力過猛,若發(fā)生嚴(yán)重割傷時要立即包扎止血,就醫(yī)時務(wù)必檢查傷部神經(jīng)是否被切斷。⑤儀器使用前要先檢查外殼是否帶電。 實驗記錄與實驗報告 實驗記錄 詳細(xì)、準(zhǔn)確、如實地作好實驗記錄是極為重要的,記錄如果有誤,會使整個實驗失敗,這也是培養(yǎng)學(xué)生實驗?zāi)芰蛧?yán)謹(jǐn)?shù)目茖W(xué)作風(fēng)的一個重要方面。 ⑷ 實驗中要記錄的各種數(shù)據(jù),都應(yīng)事先在記錄本上設(shè)計好各種記錄格式和表格,以免實驗中由于忙亂而遺漏測量和記 錄,造成不可挽回的損失。實驗報告必須獨立完成,嚴(yán)禁抄襲。有時也可用兩端有小橫線的垂直線段來表示實驗點,其線段的長度與實驗誤差相符。②生物化學(xué)實驗對許多常見的污染雜質(zhì)十分敏感,如金屬離子(鈣、鎂離子等)、去污劑和有機(jī)物殘基等,因此玻璃儀器(包括離心管等塑料器皿)是否徹底清洗凈就是非常重要的。 洗液的配制 因己確定鉻有致癌作用,因此 配制和使用洗液時要極為小心,常用兩種配制方法如下: ⑴ 取 100mL 工業(yè)濃硫酸置于燒杯內(nèi),小心加熱,然后慢慢加入 5g 重鉻酸鉀粉末,邊加邊攪拌,待全部溶解并緩慢冷卻后,貯存在磨口玻璃塞的細(xì)口瓶內(nèi)。 ⑹ 尿素洗滌液:為蛋白質(zhì)的良好溶劑,適用于洗滌盛過蛋白質(zhì)制劑及血樣的容器。 ⑴ 滴管(圖 1- 1 中 (E)) 使用方便,可用于半定量移液,其移液量為 1mL— 5mL,常用 2mL,可換不同大小的滴頭(圖 1- 1 中 (A))。 11 圖 1- 1 生化實驗中常用的移液器具 圖 1- 1 (H)為血清吸管,其刻度一直刻到管端出口處,由于沒有管尖,不會殘留液體 ,但需在液體流完后仃留 15~20 秒,常用于吸取血清等粘度大的液體。 2) 10?L~ 100?L 有存液微量進(jìn)樣器: 不銹鋼的針尖管部分是空管,進(jìn)樣器的柱塞不能到達(dá),因而管內(nèi)會存有空氣或液體,其使用注意事項是:① 不可吸取濃堿溶液,以免腐蝕玻璃和不銹鋼零件。 (%~ % ),移液的精密度(即重復(fù)性誤差)更小些,為 ≤ %。 13 圖 1- 2 自動取液器示 意圖 緩沖溶液與 pH 測定 緩沖溶液是一類能夠抵制外界加入少量酸和堿的影響,仍能維持 pH 值基本不變的溶液。 1923 年由丹麥化學(xué)家 和英國化學(xué)家 同時提出了酸堿質(zhì)子學(xué)說,發(fā)展了酸堿理論,被后人稱為酸堿質(zhì)子理論或 Br246。該方程表示了溶液 pH 與溶質(zhì)中可解離基團(tuán) pKa 之間的關(guān)系。 用鉀鹽比鈉鹽好,因為低溫時鈉鹽難溶,鉀鹽易溶,但若配制 SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳的緩沖液時,只能用磷酸 16鈉而不能用磷酸鉀,因為 SDS(十二烷基硫酸鈉)會與鉀鹽生成難溶的十二烷基硫酸鉀。 ③易吸收空氣中的 CO2,所以配制的緩沖液要蓋嚴(yán)密封。 ⑸ 氨基酸緩沖液 此緩沖液使用的范圍寬,可用于 pH=~ ,例如最常用的有: 甘氨酸 — HCl 緩沖液: pH=~ , 甘氨酸 — NaOH 緩沖液: pH=~ , 甘氨酸 — Tris 緩沖液: pH=~ ,(此緩沖液用于廣泛使用的 SDS— 聚丙烯酰胺凝膠電泳的電極緩沖液), 組氨酸緩沖液: pH=~ , 甘氨酰胺( glycine amide)緩沖液: pH=~ , 甘氨酰甘氨酸( glycylglycine)緩沖液: pH=~ 。 pH 值的測定 測定溶液 pH 值通常有兩種 方法,最簡便但較粗略的方法是用 pH 試紙,分為廣泛和精密 pH 試紙兩種。過去是使用兩個電極,即玻璃電極和參比電極(甘汞或銀 — 氯化銀電極),現(xiàn)在它們已淘汰,被兩種電極合一的復(fù)合電極所代替。 (A) 玻璃電極 (B) 復(fù)合電極 (C) 參比電極(銀-氯化銀電極) 圖 1- 3 pH 電極示意圖 測定 pH 值時,玻璃電極和參比電極同時浸入溶液中,構(gòu)成一個“全電池”,如下圖所示: pH 計 19 Ag/AgCl HCl( ) 樣品 4mol/L KCl 或 Ag/AgCl 或 溶液 飽和 KCl Hg/HgCl 玻璃電極 參比電極 使用時應(yīng)注意: ⑴經(jīng)常檢查電極內(nèi)的 4mol/L KCl 溶液的液面,如液面過低則應(yīng)補(bǔ)充 4mol/L KCl 溶液。 ⑹電極的玻璃泡容易被污染。生化實驗中經(jīng)常配制比使用濃度高十倍的“貯液”,使用時再稀釋到所需濃度,由于濃度變化很大,溶液 pH 會 有變化,因而稀釋后仍需對其 pH 進(jìn)行調(diào)整。生化實驗對所用水的純度是要求比較高的,通常可以認(rèn)為,水的質(zhì)量越高,實驗的結(jié)果就越真實可靠和準(zhǔn)確,為此必須保證實驗用水的質(zhì)量。不含金屬離子的水,需用亞沸蒸餾水,即用石英亞沸蒸餾器進(jìn)行蒸餾,其特點是在液面上方加熱,但水并不沸騰,只是液面處于亞沸狀 態(tài),可將水蒸氣帶出的雜質(zhì)減至最低,但制水量較小,每小時約 1~ 4 升。 ⑵ 液體體積度量系統(tǒng):常用的有各種量筒、移液管、容量并、微量進(jìn)樣器和各種自動取液器等。 層析裝置 層析又稱為色譜,是分離各種生物大分子的主要手段之一,因而各種層析系統(tǒng)和核酸蛋白檢測器就是生化實驗室最常用的儀器設(shè)備。該反應(yīng)是 用 DNA 聚合酶在體外大量擴(kuò)增 DNA 片段的一種方法。 ⑸廢物處理器:使用同位素應(yīng)有能夠安全地存放和處理同位素廢物的場所,否則嚴(yán)禁使用同位素。 基因?qū)雰x 用于向 受體生物細(xì)胞中導(dǎo)入基因。 ⑶組織打碎機(jī)和勻漿器:用于各種生物材料、動植物組織和細(xì)胞的破碎。 由上述內(nèi)容可見,生化實驗室所需裝備的各種儀器設(shè)備和設(shè)施是多種多樣的,因而要求每一位生物化學(xué)工作者和學(xué)生都必須非常重視這些儀器設(shè)備和設(shè)施的使用和維護(hù),必須具有較強(qiáng)的實驗動手能力。 ⑵許多生物大分子在生物材料中的含量極微,只有萬分之一、幾十萬分之一,甚至幾百萬分之一。②建立相應(yīng)的可靠的分析測定方法,這是制備生物大分子的關(guān)鍵,因為它是整個分離純化過程的“眼睛”。④生物材料的破碎和預(yù)處理。例如由腦垂體組織取得某些激素的釋放因子,要用幾噸甚至幾十噸的生物材料,才能提取出幾毫克的樣品。 2. 生物大分子的制備 概述 生物大分子主要是指蛋白質(zhì)、酶(也是一種蛋白質(zhì))和核酸,這三類物質(zhì)是生命活動的物質(zhì)基礎(chǔ)。 ⑸制冰機(jī):為實驗室提供足夠的碎冰塊。 高效液相色譜儀和毛細(xì)管電泳儀 用于各種生物大分子的分析與鑒定。生物材料的培養(yǎng)有微生物培養(yǎng)、植物細(xì)胞及組織培養(yǎng)、動物細(xì)胞及動物培養(yǎng)等。 22 同位素實驗設(shè)施 生物化學(xué)許多實驗都要用到放射性同位素,如:生物體分子示蹤、分子雜交、放射性檢測等,因此實驗室必須有安全的同位素實驗設(shè)施。 光密度儀 激光光密度儀是適用于多種電泳結(jié)果分析的儀器。 ⑷ 液體溶質(zhì)定量系統(tǒng):此系統(tǒng)主要是根據(jù)液體溶質(zhì)的某些理化特性而設(shè)計的,不同的物質(zhì)在一定的條件下有特定的吸收光譜,其吸收值的大小與其在溶液中的濃度有一定的關(guān)系,可以通 過測定某物質(zhì)在溶液中的吸收光譜來計算出該物質(zhì)的濃度,因而分光光度計就是生化實驗室必備的儀器分析手段。 所有的各種純水,在貯存中都會被污染:塑料容器會產(chǎn)生有紫外吸收的有機(jī)物;玻璃和金屬容器會產(chǎn)生金屬離子的污染;長時間放置更會使水長菌,空氣中的二氧化碳會溶入水中,所以貯存高純水一定要隔絕空氣,密封蓋嚴(yán),必要時貯存 在冰箱的冷藏室中。在超純分析和特殊 的生化實驗中要求更高的水質(zhì),如 15~ 18 MΩ cm 高純無離子水、無熱源高純水、無菌水、亞沸蒸餾水、無二氧化碳蒸餾水等。 生化實驗室的基本設(shè)施與裝備 溫度與環(huán)境設(shè)施 20 許多生化實驗都要求在一定的溫度和濕度下進(jìn)行操作,因此,一個正規(guī)的生化實驗室必須能夠保持恒溫、恒濕的環(huán)境。若被油脂污染,可用丙酮浸泡。 ⑶復(fù)合電極長期不用
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