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分子標(biāo)記及其在植物遺傳育種中的應(yīng)用-文庫吧在線文庫

2025-02-16 20:14上一頁面

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【正文】 記的差異性分析,將使得親本選配更為快速、準(zhǔn)確,從而提高育種效率。n 雜種優(yōu)勢表現(xiàn)與單親沉默、雙單親沉默有密切關(guān)系。n 通過 MAS技術(shù),借助于飽和的分子標(biāo)記連鎖圖,對各選擇單株進(jìn)行整個基因組的組成分析,進(jìn)而可以選出帶有多個目標(biāo)性狀而且遺傳背景良好的理想個體。n 通過對 Opaque2基因中開發(fā)的 SSR引物,以及與 Opaque2共分離的RFLP標(biāo)記,我們正在進(jìn)行 QPM分子標(biāo)記輔助育種。n Stuber( 1995) 把產(chǎn)量有關(guān)的 QTLs分別從Tx303和 oh43轉(zhuǎn)移到 B73和 Mo17兩個玉米自交系中,由這兩個改良的自交系組配雜交種,產(chǎn)量比對照雜交種增產(chǎn) 15%以上。 11 三月 20234:37:44 下午 16:37:44三月 21n 1比不了得就不比,得不到的就不要。 16:37:4416:37:4416:37Thursday, March 11, 2023n 1不知香積寺,數(shù)里入云峰。 16:37:4416:37:4416:373/11/2023 4:37:44 PMn 1越是沒有本領(lǐng)的就越加自命不凡。 4:37:44 下午 4:37 下午 16:37:44三月 21MOMODA 三月 21三月 2116:37:4416:37:44March 11, 2023n 1意志堅強(qiáng)的人能把世界放在手中像泥塊一樣任意揉捏。 三月 214:37 下午 三月 2116:37March 11, 2023n 1少年十五二十時,步行奪得胡馬騎。 4:37:44 下午 4:37 下午 16:37:44三月 21n 沒有失敗,只有暫時停止成功!。 16:37:4416:37:4416:373/11/2023 4:37:44 PMn 1以我獨沈久,愧君相見頻。2)由于單個 QTL呈微效作用 ,所以必須同時操作多個 QTL才能使性狀發(fā)生顯著變化 。在傳統(tǒng)育種方法中,要達(dá)到 99%輪回親本比率則需 (Tanksley等 1998)??焖儆行У剡x擇出帶有目標(biāo)基因的單株n 表現(xiàn)在 :n ,在苗期或低世代就可進(jìn)行篩選 。n 結(jié)果:既有相關(guān)性很高的報道,又有完全相反的結(jié)果。研究基因表達(dá)與調(diào)控傳統(tǒng)方法是 利用 cDNA文庫篩選和Northern雜交。比較基因組研究 n 利用相同的 DNA分子標(biāo)記(主要是 cDNA標(biāo)記和基因克?。┰谙嚓P(guān)物種之間進(jìn)行遺傳或物理作圖,比較這些標(biāo)記在不同物種基因組中的分布特點,揭示染色體或染色體片段上的基因及其排列順序的相同或相似性,并由此對相關(guān)物種的基因組結(jié)構(gòu)和起源進(jìn)化進(jìn)行分析。目前已發(fā)展了 QTLs定位 的多種方法。由于分組時僅對目標(biāo)性狀進(jìn)行選擇,因此兩個池之間理論上就應(yīng)主要在目標(biāo)基因區(qū)段存有差異,也稱近等基因池法。植物起源、分類和進(jìn)化研究植物起源、分類和進(jìn)化研究品種的 DNA指紋圖譜 定義:能夠鑒定作物品種之間差異的電泳圖譜。highmeiosismolecular(Expressed Sequence Tags)DNA Databanksn cDNA resourcesn Genbank (NCBI), Nucleotide Sequence Database (EMBL), DDBJ , MGC,…n Genomic DNA resourcesn HTG, dbGSS, GOLD, ERGO,…n EST resourcesn dbEST, UniGene, GIs, STACKS, DOTS,…n Othersn dbSTS, UniSTS, dbSNP, TransFac, ISIS, Repbase, ... ...常用基因組網(wǎng)址:單核苷酸多態(tài) ( SNP single nucleotide polymophism)n SNP是由于單個核苷酸改變而導(dǎo)致的核酸序列多態(tài),即基因中的點突變。+kj遺傳距離的計算:Rogers( 1972)RogersW ( Rogers distance as modified by Wright ( 1978)兩個 隨機(jī)群體 j 、 k間的遺傳距離( Nei 1972): Xij 為 X群體第 i個位點第 j個等位基因頻率 Yij為 Y群體第 i個位點第 j個位點基因頻率 n 在種質(zhì)資源研究中,大多數(shù)采用羅杰斯距離( RD)和改良的羅杰斯距離( MRD)(Rogers, 1972; Goodman Stuber, 1983)。Li為什么用雙酶解 ?適合 PCR擴(kuò)增效率與變性膠的分辨率減少 PCR擴(kuò)增的片段 ,從而減少使用選擇性堿基的數(shù)目使標(biāo)記單鏈成為可能增加 PCR擴(kuò)增的靈活性增加使用引物的靈活性為什么要預(yù)擴(kuò)增 ?減少選擇性堿基的錯配減輕背景提供足量模板 DNA降低模板濃度的影響目的:分子標(biāo)記輔助選擇 (MAS)篩選 BAC文庫,進(jìn)行圖位克?。?mapbased gene cloning)AFLP SCARPIC/Simpson遺傳多樣性系數(shù) = 1 ? Pi 2等位基因數(shù)目 A A = 4PIC = 1 – SUM ()2 + ()2 + ()2 + ()2 = SSR資料:遺傳相似系數(shù) Gower (1985): a + da + b + c + d簡單匹配系數(shù)( SM)(Simple2. AFLP反應(yīng)對模板 DNA濃度不是很敏感,在50pg50ng時,均可以觀察到多態(tài)性帶,但為了實驗的準(zhǔn)確性, DNA濃度不能太低。cycles12循環(huán)l) 72℃ Step5 GOTO30秒Step1 95℃ Bufferl) PstⅠ 接頭( 50( 7)銀染技術(shù)具有快速、方便的特點,在 12天內(nèi)可以得到指紋。GACTGCGTACATCGAGNNN3‘ AFLP技術(shù)的特點( 1)由于內(nèi)切酶及選擇性堿基組合數(shù)和種類很多,產(chǎn)生標(biāo)記數(shù)無限,可覆蓋整個基因組。GATGAGTCCTGAGTAA339。不等。l) dNTP( 25mM) 加水至 20181。 基因重組的熱點,是基因變異的來源;216。l通過對 54個植物種核 DNA和 28個植物種細(xì)胞器DNA SSR(14bp)的搜索 ,發(fā)現(xiàn):l (AT)n 最豐富 ,然后依次是 : (A)n、 (T)n、 (AG)n、(CT)n、 (AAT)n、 (ATT)n、 (AAC)n、 (GTT)n、 (AGC)n、 (GCT)n、 (AAG)n、 (CTT) n、 (AATT)n、 (TTAA)n、(AAAT)n、 (ATTT)n及 (AC)n、 (GT)n。ISSRl 共同優(yōu)點: 在不需要知道所擴(kuò)增 DNA序列情況下,產(chǎn)生 DNA片段的指紋; 需 DNA量少,產(chǎn)生多態(tài)性豐富。15秒Step3Mg2+( 25mM) Taq酶( 5U/181。DNA( 20ng/181。339。Klenow酶n 加水至 50ul, 37℃ 溫箱中標(biāo)記 2小時RFLP標(biāo)記 特點l共顯性,可以區(qū)別純合和雜合基因型l穩(wěn)定、重復(fù)性強(qiáng)l某些植物中開發(fā)探針已遍及整個基因組l缺點: DNA需要量較大,技術(shù)復(fù)雜; 用于做圖較費時,難以分析大量樣品 ; 在基因組較大、嚴(yán)格自花授粉作物上多態(tài)性很低,使遺傳圖飽和度低。使用磷屏儀,操作更方便。封好雜交盒后,置65℃ 溫箱中振蕩過夜。HCl—SimpleLength 分子標(biāo)記及其在植物遺傳育種中的應(yīng)用遺傳標(biāo)記( geic marker)具有多型性易于鑒別與目標(biāo)基因緊密連鎖 ? 性狀標(biāo)記 色澤, 形態(tài) …? 細(xì)胞學(xué)標(biāo)記 倒位,易位, G/N/C帶 …? 生化標(biāo)記 同功酶 …? 分子標(biāo)記 RFLP、 RAPD、 SSR、 AFLP、 SNP… …基礎(chǔ)基礎(chǔ) 基因表達(dá)基因表達(dá)結(jié)果結(jié)果表現(xiàn)型表現(xiàn)型DNA堿基堿基序列變異序列變異形態(tài)標(biāo)記n 遺傳學(xué)上穩(wěn)定、可見的外部特征遺傳與環(huán)境、結(jié)構(gòu)基因與調(diào)控基因綜
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