生物信息學(xué)軟件介紹-文庫吧在線文庫
【正文】 南芥數(shù)據(jù)庫（ AtDB） ? 醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫（ OMIM） ? 線蟲數(shù)據(jù)庫（ ACEDB） 四 . 生物信息學(xué)服務(wù) 服務(wù)內(nèi)容 1. PCR引物 、 測序引物及雜交探針的設(shè)計及評價 2. DNA， 蛋白質(zhì)序列同源分析及進(jìn)化樹構(gòu)建 3. 生物大分子二級結(jié)構(gòu)模擬顯示及基本序列分析 4. 有關(guān)蛋白質(zhì)親疏水性 ， 等電點 ， 抗原性 ，跨膜蛋白 ， 信號肽等分析以及 Dot Plot服務(wù) 5. 質(zhì)粒載體構(gòu)建及克隆策略 6. 小型數(shù)據(jù)庫建設(shè)及協(xié)助實驗室進(jìn)行數(shù)據(jù)管理維護(hù) 四 . 生物信息學(xué)服務(wù) 服務(wù)內(nèi)容 7. 醫(yī)學(xué)相關(guān)的圖像 、 病例統(tǒng)計 、 分析及小型數(shù)據(jù)庫建設(shè) 8. 網(wǎng)上數(shù)據(jù)庫應(yīng)用輔助：包括序列拉長（ 擴(kuò)大實驗成果 ） ， Blastn/Blastp，NCBI Entrez查詢 (多維查詢 )， 新序列 、snip等申報 9. 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)初步預(yù)測（此為生物信息學(xué)目前研發(fā)的焦點，正在探索中，結(jié)果可能不十分準(zhǔn)確或者不能出結(jié)果） 服務(wù)內(nèi)容 。 引物設(shè)計要點 ? ΔG值反映了引物與模板結(jié)合的強弱程度 ， 也是一個重要的引物評價指標(biāo) ， 一般情況下 ， 在Oligo ΔG值窗口中 ， 引物的 ΔG值最好呈正弦曲線形狀 ， 即 5’端和中間部分 ΔG值較高 ，而 3’端 ΔG值相對較低 ， 且不要超過 9（ ΔG值為負(fù)值 ， 這里取絕對值 ） ， 如此則有利于正確引發(fā)反應(yīng)而可防止錯誤引發(fā) 。 對計算機(jī)要求很高 。給信號序列各個位置每種可能出現(xiàn)的核苷酸分配一個分?jǐn)?shù)，將各位置分?jǐn)?shù)相加后得出該序列作為潛在作用位點的分?jǐn)?shù)。 Winplas 質(zhì)粒構(gòu)建 Atheprot 預(yù)測蛋白跨膜區(qū)域 Antheprot 預(yù)測信號肽斷裂點 功能 3. 用計算機(jī)管理實驗室數(shù)據(jù)及文獻(xiàn)資料 ? 實驗室結(jié)果的儲存、管理和申報工作 ? 從網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫獲得的序列文件（由 ENTREZ集成檢索系統(tǒng)所得的數(shù)據(jù)文件可以進(jìn)入EndNote 或者 Reference Manager 儲存管理）或資料文獻(xiàn)的管理 ?軟件 : EndNote， Reference Manager Reference Manager 9 界面 功能 4. 用計算機(jī)預(yù)測新
環(huán)評公示相關(guān)推薦
鄂ICP備17016276號-1