北京大學(xué)理論生物學(xué)中心及分子設(shè)計(jì)課題組介紹(存儲版)
【正文】 全新設(shè)計(jì)、基因識別、基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)等方面已取得一些 成果。 北京大學(xué)理論生物學(xué)中心于 2023年 9月 17日在北京大學(xué)正式成立。已取得一些成果。 生物信息學(xué) 蛋白質(zhì)晶體學(xué) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測 蛋白質(zhì)全新設(shè)計(jì) 分子識別的 理論模型 分子識別的 熱力學(xué)及動力學(xué) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能關(guān)系 生物分子間相互作用及識別 蛋白質(zhì)分子設(shè)計(jì) 藥物分子設(shè)計(jì) 我們所關(guān)注的問題 蛋白質(zhì)序列與結(jié)構(gòu)、結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系 蛋白質(zhì)與其它分子的識別機(jī)制 具有全新結(jié)構(gòu)或功能蛋白質(zhì)的設(shè)計(jì) 基于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì) 蛋白質(zhì)調(diào)控及代謝網(wǎng)絡(luò)研究 發(fā)展了進(jìn)行蛋白質(zhì)表面環(huán)區(qū)構(gòu)象模擬的計(jì)算方法， Proteins 2023, JMM2023。 實(shí)驗(yàn) K i ( μ m ol ) DOCK 能量打分 ( kcal/mo l ) SCORE 預(yù)測 K d ( μ m ol ) 1 2 3 4 5 蛋白質(zhì)與配體作用研究 LigBuilder: A software package for de novo ligand buildingup POCKET LINK GROW Pharmacophore Target Protein Ligands 注冊用戶 313家 蛋白質(zhì)與配體作用研究 POCKET: Deriving the pharmacophore A B C D LigBuilder 成為藥物設(shè)計(jì)中的常用工具而出現(xiàn)在關(guān)鍵詞中。 2023。湯超與歐陽頎合作開展了酵母細(xì)胞周期研究，發(fā)現(xiàn)生物學(xué)途徑對應(yīng)于穩(wěn)定流型，提出了蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)動力學(xué)性質(zhì)決定網(wǎng)絡(luò)功能的觀點(diǎn)。每年招生 10名左右的跨學(xué)科研究生。 目前中心校 內(nèi)成員 12人，國內(nèi)兼職教授 30人，國外特聘教授 8人 。 以北京大學(xué)理論生物學(xué)中心名義申報(bào)，聯(lián)合北京大學(xué)生物信息中心、清華大學(xué)生物系生物信息研究組、中國科學(xué)院生物物理所生物信息研究組、軍事醫(yī)學(xué)院放射醫(yī)學(xué)研究所、上海生物信息技術(shù)中心的 “基因功能預(yù)測的生物信息學(xué)理論與應(yīng)用” 973項(xiàng)目 獲得批準(zhǔn)，首席科學(xué)家由來魯華教授擔(dān)任。 蛋白質(zhì)側(cè)鏈安裝算法， Proteins 2023. 蛋白質(zhì) 蛋白質(zhì)相互作用的平均勢計(jì)算方法， JBC, Proteins 2023. 蛋白質(zhì)構(gòu)象多樣性研究 Correlation between the calculated logP values and the experimental values of 1831 anic pounds , ? 計(jì)算有機(jī)化合物脂水分配系數(shù)的新方法 : . 1997, 37, 615621 : Perspectives in Drug Discovery 2023,19,4766 ? ???i jjjii bmanPlogUsing 80 atom types (C, H, O, N
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