分類與鑒定ppt課件(存儲版)
【正文】 （ 3） rRNA序列同源性分析 三種方法： rRNADNA雜交、 rRNA寡核苷酸編目分析 rRNA基因序列分析（系統(tǒng)發(fā)育樹狀圖）。 1957年第七版后 ，吸收了 國際上細菌分類學家 參加編寫，它的近代版本反映了出版年代細菌分類學的最新成果，因而逐漸確立了在 國際上對細菌進行全面分類的權威地位 ?？赏ㄟ^比較不同類群的生物大分子序列的改變量來確定它們彼此系統(tǒng)發(fā)育的相關性或進化距離。 若二個在形態(tài)及生理生化特性方面及其相似的 菌株，如果其 GC%含量的差別大于 5%，則肯定 不是同一個種，大于 15%則肯定不是同一個屬。 步驟 : (1) 收集菌株，選擇性狀 (2) 性狀編碼 (3) 相似性計算 : 計算相關系數(shù) Ssm或 Sj： Ssm=（ a+c） /(a+b+c) 正負 反應性狀 Sj=a/(a+b+c) 正 反應性狀 Sj 80~85% 種 Sj 65% 屬 (4)系統(tǒng)聚類 (5)聚類結果的表示 1. 數(shù)值分類法（統(tǒng)計分類法） （二） 現(xiàn)代分類鑒定方法 2. 微生物遺傳型的鑒定 特點： 與形態(tài)及生理生化特性的比較不同，對DNA的堿基組成 的比較和進行 核酸分子雜交是直接比較不同微生物之間 基因組的差異 ，因此 結果更加可信 。 4）培養(yǎng)物： 一定時間一定空間內(nèi)微生物的細胞群或生長物，如微生物的斜面培養(yǎng)物、搖瓶培養(yǎng)物。 Woese 1993） 種是生物分類中 基本的分類單元 和分類等級。 分類 (classification)： 根據(jù)一定的原則 (表型特征相似性或系統(tǒng)發(fā)育相關性 )對微生物進行 分群歸類 ，根據(jù)相似性或相關性水平 排列成系統(tǒng) ，并對各個分類群的特征進行描述， 以便查考和對未被分類的微生物進行鑒定 。 亞屬 和 屬 指定 模式種（ type species） ； 屬以上至目 級分類單元指定 模式屬（ type genus） . 1）亞種 (subspecies)和變種 (variety)：種內(nèi)的不同菌株存在少數(shù)明顯而穩(wěn)定遺傳的變異特征 ，這種差異又不足以區(qū)分成新種時，可以細分成亞種或變種。如大腸菌群。 a） 每個生物種都有特定的 GC%范圍，因此后者可以 作為分類鑒定的指標 。 分析不同微生物 16SrRNA或 18SrRNA寡核苷酸序列的同源性程度，以確定不同生物間的親緣關系和進化譜系。 四 . 分類系統(tǒng) 1. 原核生
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