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生物化學王鏡巖(第三版)課后習題解答-免費閱讀

2025-07-09 21:14 上一頁面

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【正文】 [肌球蛋白、過氧化氫酶、血清清蛋白、胰凝乳蛋白酶原、肌紅蛋白、細胞色素C],從分子排阻層析柱上洗脫細胞色素C、β乳球蛋白、未知蛋白和血清紅蛋白時,其洗脫體積分別為11537和24ml,問未知蛋白的Mr是多少?假定所有蛋白質(zhì)都是球形的,并且都處于柱的分級分離范圍。%%,問其最低相對分子質(zhì)量是多少?[13110;15870]解:(1)蛋白質(zhì)Mr=247。等電點沉淀、鹽析和有機溶劑分級分離等方法常用于蛋白質(zhì)分離的頭幾步。凝膠過濾是一種簡便的測定蛋白質(zhì)Mr的方法。對某些蛋白質(zhì)說,在某一pH下它所帶的正電荷與負電荷相等,即凈電荷為零,此pH稱為蛋白質(zhì)的等電點。[L] mol/LN105105105104104[(a)第一個方程兩邊各乘(1+Ka [L]),然后兩邊各除以[L],并重排第2個方程;(b)根據(jù)第二方程, N /[L]對N作圖的斜率是Ka,N /[L]=0時的截距給出n。這樣的纖維不能繼續(xù)延長,因為末端的去氧HbA分子缺少“粘性”區(qū)。比較n==。[(a)蛋白質(zhì)B;(b)蛋白質(zhì)A的Ka=106(mol/L)1,蛋白質(zhì)B的Ka=109(mol/L)1?(a);(b)肺中CO2分壓從45torr(屏息)降到15torr(正常);(c)(海平面)(高空)。G肌動蛋白是一種單體,由它聚集成纖維狀的F肌動蛋白,后者是細絲的主體。最豐富的是IgG類,它由4條多肽鏈組成,兩條重鏈,兩條輕鏈,通過二硫鍵連接成Y形結(jié)構(gòu)的分子。地中海貧血是由于缺失一個或多個編碼血紅蛋白鏈的基因造成的。BPG能與去氧血紅蛋白結(jié)合,但不能與氧合血紅蛋白結(jié)合。T態(tài)和R態(tài)之間的構(gòu)象變化是由亞基亞基相互作用所介導的,它導致血紅蛋白出現(xiàn)別構(gòu)現(xiàn)象。血紅蛋白由4個亞基(多肽鏈)組成,每個亞基都有一個血紅素基。多肽鏈中約75%是α螺旋,共分八個螺旋段。肌紅蛋白便于氧在肌肉中轉(zhuǎn)運,并作為氧的可逆性貯庫。穩(wěn)定締合的是哪種類型的相互作用(同種或異種)?(b)假設(shè)四聚體,如血紅蛋白,是由兩個相同的單位(每個單位含α和β兩種鏈)組成的。大的組分占總蛋白質(zhì)的三分之二,具有催化活性。但是在正常情況下A是以單體形式存在的,而B是以四聚體(B4)形式存在的,問A和B的氨基酸組成可能有什么差別。]。ψ=+120176。()[59%]解:一般來講氨基酸的平均分子量為120Da,此蛋白質(zhì)的分子量為240000Da,所以氨基酸殘基數(shù)為240000247。蛋白質(zhì)折疊不是通過隨機搜索找到自由能最低構(gòu)象的。球狀蛋白質(zhì)種類很多,結(jié)構(gòu)也很復雜,各有自己獨特的三維結(jié)構(gòu)。超二級結(jié)構(gòu)有3種基本形式:αα(螺旋束)、βαβ(如Rossman折疊)、ββ(β曲折和希臘鑰匙拓撲結(jié)構(gòu))。彈性蛋白是結(jié)締組織中另一主要的結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)。α角蛋白是毛、發(fā)、甲、蹄中的纖維狀蛋白質(zhì),它幾乎完全由α螺旋構(gòu)成的多肽鏈構(gòu)成。就其主鏈而言,由于肽鏈是由多個相鄰的肽平面構(gòu)成的,主鏈上只有α碳的二平面角Φ和Ψ能自由旋轉(zhuǎn),但也受到很大限制。如果你打算向LysAla加入一個亮氨酸殘基使成三肽,可能會掉進什么樣的“陷坑”?解:(1)用BOC保護Ala氨基端,然后將其羧基掛接在樹脂上;(2)除去N端保護,將用BOC保護的Arg用縮合劑DDC與Ala相連;(3)將把樹脂懸浮在無水三氟乙酸中,通人干燥的HBr,使肽與樹脂脫離,同時保護基也被切除。一個十肽的氨基酸分析表明其水解液中存在下列產(chǎn)物:NH4+ Asp Glu Tyr ArgMet Pro Lys Ser Phe并觀察下列事實:(1)用羧肽酶A和B處理該十肽無效;(2)胰蛋白酶處理產(chǎn)生兩個四肽和游離的Lys;(3)梭菌蛋白酶處理產(chǎn)生一個四肽和一個六肽;(4)溴化氫處理產(chǎn)生一個八肽和一個二肽,用單字母符號表示其序列為NP;(5)胰凝乳蛋白酶處理產(chǎn)生兩個三肽和一個四肽,N末端的胰凝乳蛋白酶水解肽段在中性pH時攜帶1凈電荷,在pH12時攜帶3凈電荷;(6)一輪Edman降解給出下面的PTH衍生物:寫出該十肽的氨基酸序列。經(jīng)糜蛋白酶作用后,此肽斷裂城兩個肽段,其氨基酸組成分別為Ala、Tyr、Ser和Pro、Phe、Lys、Arg。當A肽與FDNB試劑反應后得DNPAsp;當用羧肽酶處理后得游離纈氨酸。在生物體內(nèi)有些蛋白質(zhì)常以前體形試合成,只有按一定方式裂解除去部分肽鏈之后才出現(xiàn)生物活性,這一現(xiàn)象稱蛋白質(zhì)的激活。除部分水解可以產(chǎn)生小肽之外,生物界還存在許多游離的小肽,如谷胱甘肽等。根據(jù)分子形狀可分為纖維狀蛋白質(zhì)、球狀蛋白質(zhì)和膜蛋白質(zhì)。 (4)Pro, Val (5)Glu, Asp。[His2+104,His+,104]解:由pH=pK1+lg(His2+/)=pKr+lg(His+/His2+)=pK2+lg(His0/ His+)得His2+104,His+,104說明用含一個結(jié)晶水的固體組氨酸鹽酸鹽(相對分子質(zhì)量=;咪唑基pKa=)和1mol/L [(),加入352ml 1mol/L KOH,用水稀釋至1L]為什么氨基酸的茚三酮反應液能用測壓法定量氨基酸?解:茚三酮在弱酸性溶液中與α氨基酸共熱,引起氨基酸氧化脫氨脫羧反映,(其反應化學式見P139),其中,定量釋放的CO2可用測壓法測量,從而計算出參加反應的氨基酸量。習題:精氨酸、天冬氨酸、谷氨酰氨、谷氨酸、苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸。半胱氨酸的SH基在空氣中氧化則成二硫鍵。除參與蛋白質(zhì)組成的氨基酸外,還有很多種其他氨基酸存在與各種組織和細胞中,有的是β、γ或δ氨基酸,有些是D型氨基酸。13., g/cm3, g/cm3。(d)神經(jīng)節(jié)苷脂。(c)在中性pH時,凈電荷為零的甘油磷脂。OH、H2OˉO2 (單線態(tài)氧)等統(tǒng)稱為活性氧。4.從植物種子中提取出1g油脂,把它等分為兩份,分別用于測定該油脂的皂化值和碘值。單個的脂質(zhì)可根據(jù)其層析行為,對專一性酶水解的敏感性或質(zhì)譜分析加以鑒定。植物固醇如谷固醇、豆固醇,它們自身不易被腸粘膜吸收并能抑制膽固醇吸收。萜的結(jié)構(gòu)有線形的,也有環(huán)狀的。鞘氨醇是種長鏈的氨基醇?;钚匝?O測定天然油脂的皂化值、碘值、酸值和乙酰化值,可確定所給油脂的特性。脂肪酸的物理性質(zhì)主要決定于其烴鏈的長度與不飽和程度。19.舉例說明內(nèi)切糖苷酶和外切糖苷酶在聚糖鏈結(jié)構(gòu)測定中的作用。[如果糖蛋白的這個三糖單位在細胞相互作用中是關(guān)鍵的,則此三糖本身應是細胞粘著的競爭性抑制劑]14.糖蛋白中N連接的聚糖鏈有哪些類型?它們在結(jié)構(gòu)上有什么共同點和不同點?答:(1)復雜型( plex type)這類N糖鏈,除三甘露糖基核心外,不含其他甘露糖殘基。L古洛糖;D果糖]10.寫出麥芽糖(α型)、纖維二糖(β型)、龍膽糖和水蘇糖的正規(guī)(系統(tǒng))名稱的簡單形式,并指出其中哪些(個)是還原糖,哪些(個)是非還原糖。 (b)%]解:(a)Mr=(106)= 106 (b)347106163/=%7. D葡萄糖在31℃水中平衡時, %%。當αD吡喃葡糖晶體樣品溶于水時,比旋將由+176。 寡糖鏈結(jié)構(gòu)分析的一般步驟是:分離提純待測定的完整糖鏈,對獲得的均一樣品用GLC法測定單糖組成,根據(jù)高碘酸氧化或甲基化分析確定糖苷鍵的位置,用專一性糖苷酶確定糖苷鍵的構(gòu)型。此家族中已知有L、E、P三種選擇蛋白,它們通過細胞粘著產(chǎn)生多種生物學效應,如免疫應答、炎癥反應、腫瘤轉(zhuǎn)移等。一個寡糖鏈中單糖種類、連接位置、異頭碳構(gòu)型和糖環(huán)類型的可能排列組合數(shù)目是一個天文數(shù)字。它可看成由一種稱胞壁肽的基本結(jié)構(gòu)單位重復排列構(gòu)成。環(huán)糊精由環(huán)糊精葡糖基轉(zhuǎn)移酶作用于直鏈淀粉生成含6,7或8個葡萄糖殘基,通過α1,4糖苷鍵連接成環(huán),屬非還原糖,由于它的特殊結(jié)構(gòu)被用作穩(wěn)定劑、抗氧化劑和增溶劑等。在標準定位的Hsworth式中D單糖異頭碳的羥基在氧環(huán)面下方的為α異頭物,上方的為β異頭物,實際上不像Haworth式所示的那樣氧環(huán)面上的所有原子都處在同一個平面,吡喃糖環(huán)一般采取椅式構(gòu)象,呋喃糖環(huán)采取信封式構(gòu)象。糖類與蛋白質(zhì)或脂質(zhì)共價結(jié)合形成的結(jié)合物稱復合糖或糖復合物。 多數(shù)糖類具有(CH2O)n的實驗式,其化學本質(zhì)是多羥醛、多羥酮及其衍生物。許多單糖在水溶液中有變旋現(xiàn)象,這是因為開漣的單糖分子內(nèi)醇基與醛基或酮基發(fā)生可逆親核加成形成環(huán)狀半縮醛或半縮酮的緣故。 蔗糖、乳糖和麥芽糖是常見的二糖。直鏈淀粉分子只有α1,4連鍵,支鏈淀粉和糖原除α1,4連鍵外尚有α1,6連鍵形成分支,糖原的分支程度比支鏈淀粉高。糖蛋白是一類復合糖或一類綴合蛋白質(zhì)。 凝集素是一類非抗體的能與糖類專一結(jié)合的蛋白質(zhì)或糖蛋白,伴刀豆凝集素A(ConA),花生凝集素等屬植物凝集素。蛋白聚糖是一類特殊的糖蛋白,由一條或 多條糖胺聚糖鏈和一個核心蛋白共價連接而成。3.寫出βD脫氧核糖、αD半乳糖、β L山梨糖和βDN乙酰神經(jīng)氨酸(唾液酸)的Fischer投影式,Haworth式和構(gòu)象式。6.將500 mg糖原樣品用放射性氰化鉀(K14CN)處理,被結(jié)合的14CN—,另一500 mg同一糖原樣品,用含3% HCl的無水甲醇處理,使之形成還原末端的甲基葡糖苷。 nm。兩種糖肽鍵有區(qū)別:肽聚糖中為NAM的C3羥基與DAla羧基相連;糖蛋白中是糖的C1羥基與多肽Asnγ氨基N或Thr/Ser/Hyl/Hyp羥基O相連。答:(1)糖鏈在糖蛋白新生肽鏈折疊和締合中的作用; (2)糖鏈影響糖蛋白的分泌和穩(wěn)定性。天然脂肪酸通常具有偶數(shù)碳原子,鏈長一般為1222碳。天然油脂是簡單和混合三酰甘油的混合物。蠟還有其他的生物功能如防水、防侵襲等。甘油磷脂是由sn甘油3磷酸衍生而來,最簡單的甘油磷脂是3sn磷脂酸,它是其他甘油磷脂的母體。重要的鞘糖脂有腦苷脂和神經(jīng)節(jié)苷脂,后者含有唾液酸。膽固醇是最常見的一種動物固醇,參與動物細胞膜的組成。血漿脂蛋白都是球形顆粒,有一個由三酰甘油和膽固醇脂組成的疏水核心和一個由磷脂、膽固醇和載脂蛋白參與的極性外殼。(b) 10種]解:(a) 33=27種。[2個]解:100g油脂的物質(zhì)的量=(210100)/(3561000)=平均雙鍵數(shù)=(68/254)/≈2個6. (a)解釋與脂質(zhì)過氧化育關(guān)的幾個術(shù)語:自由基、活性氧、自由基鏈反應和抗氧化劑。試以磷酸甘油為例說明此命名原則。(c)糖,長鏈醇]10.指出下列膜脂的親水成分和疏水成分:(a) 磷脂酰乙醇胺。 (b)動物中從膽固醇衍生來的類固醇包括5類激素:雄激素、雌激素、孕酮、糖皮質(zhì)激素和鹽皮質(zhì)激素,維生素D和膽汁酸。但堿水解得到的氨基酸是D型和L型的消旋混合物。所有的α氨基酸都能與茚三酮發(fā)生顏色反應。核磁共振(NMR)波譜技術(shù)在氨基酸和蛋白質(zhì)的化學表征方面起重要作用。[pI:。利用在溶劑A和B之間的逆流分溶方法將甘氨酸和苯丙氨酸分開。多肽鏈是由氨基酸通過肽鍵共價連接而成的,各種多肽鏈都有自己特定的氨基酸序列。蛋白質(zhì)的生物功能決定于它的高級結(jié)構(gòu),高級結(jié)構(gòu)是由一級結(jié)構(gòu)即氨基酸序列決定的,二氨基酸序列是由遺傳物質(zhì)DNA的核苷酸序列規(guī)定的。同源蛋白質(zhì)具有明顯的序列相似性(稱序列同源),兩個物種的同源蛋白質(zhì),其序列間的氨基酸差異數(shù)目與這些物種間的系統(tǒng)發(fā)生差異是成比例的。近二、三十年發(fā)展起來的固相肽合成是控制合成技術(shù)上的一個巨大進步,它對分子生物學和基因工程也就具有重要影響和意義。由題,得到的一條肽(Asp、Ala、Tyr)結(jié)合(3)、(4)可得該肽的氨基酸序列為:AsnAlaTyrGluLysHisGlnVal某多肽的氨基酸序列如下:GluValLysAsnCysPheArgTrpAspLeuGlySerLeuGlu AlaThrCysArgHisMetAspGlnCysTyrProGlyGlu_GluLys。試指出在該天然多肽中二硫鍵的位置。蜂毒明肽(apamin)是存在蜜蜂毒液中的一個十八肽,其序列為CNCKAPETALCARRCH,已知蜂毒明肽形成二硫鍵,不與碘乙酸發(fā)生反應,(1)問此肽中存在多少個二硫鍵?(2)請設(shè)計確定這些(個)二硫鍵位置的策略。穩(wěn)定蛋白質(zhì)構(gòu)像的作用有氫鍵、范德華力、疏水相互作用和離子鍵。α螺旋是蛋白質(zhì)中最典型、含量最豐富的二級結(jié)構(gòu)。蠶絲心蛋白幾乎完全由扭曲的反平行β折疊片構(gòu)成。細分時可在二、三級和四級結(jié)構(gòu)。球狀蛋白質(zhì)有些是單亞基的,稱單體蛋白質(zhì),有些是多亞基的,稱寡聚或多聚蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)變性和復性實驗表明,一級結(jié)構(gòu)規(guī)定它的三維結(jié)構(gòu)。(2)此多肽的α螺旋完全伸展時多長?[;]解:(1),故該α螺旋的軸長為:78(2) ,故此時長為: 78=,其他區(qū)段均為β折疊片構(gòu)象。[在伸展的蛋白質(zhì)中大多數(shù)氫鍵的供體和接納體都與水形成氫鍵。,而且還取決于肽鏈的氨基酸側(cè)鏈的性質(zhì)。mol)(c)ΔH折疊100(5 kj/mol)=500 kj/mol;注意,這里我們沒有考慮在螺旋末端處某些氫鍵不能形成這一事實,但考慮與否差別很小。殘基2023很可能形成β轉(zhuǎn)角],完全暴露在水環(huán)境中和完全埋藏在蛋白質(zhì)分子非極性內(nèi)部的兩種多肽片段,哪一種更容易形成α螺旋?為什么?[埋藏在蛋白質(zhì)的非極性內(nèi)部時更容易形成α螺旋。關(guān)于此蛋白的結(jié)構(gòu),你能做出什么結(jié)論?[該毒素蛋白由兩條不同的多肽鏈通過鏈間二硫鍵交聯(lián)而成,每條多肽鏈的相對分子質(zhì)量各在13000左右。[(1)有缺陷復合物的平均頻率是6000108=6105][(2)由于有缺陷的二聚體可被剔除,因此有缺陷復合物的平均率只是最后階段的操作次數(shù)(5次操作裝配6個亞基)乘以錯誤頻率,即:5108。紅血素中的鐵原子還能結(jié)合其他小分子如CO、NO等。在此附近的遠側(cè)His(E7)降低在氧結(jié)合部位上CO的結(jié)合,并抑制血紅素氧化或高鐵態(tài)。無氧結(jié)合時達到最穩(wěn)定。相反的,O2促
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