【正文】 七 綜 述 以上是根據(jù)客戶(hù)的初步情況，做出的高性能計(jì)算系統(tǒng)方案的初步建議，五舟的 Cluster系統(tǒng)給客戶(hù)提供了一個(gè)高可管理性、高穩(wěn)定性的高性能計(jì)算解決方案。 3． 五舟服務(wù)器硬件部件自購(gòu)買(mǎi)之日起，在保修期內(nèi)正常使用發(fā)生故障，我公司將選擇編修或更換確有故障或缺陷的部件。 有償服務(wù)收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn) 免費(fèi)上門(mén)服務(wù)期后，如需要工程師到現(xiàn)場(chǎng)提供服務(wù)，差旅費(fèi)用由項(xiàng)目承包商或用戶(hù)負(fù)擔(dān)（住宿標(biāo)準(zhǔn)不低于 200 元 /天），另每次收取服務(wù)費(fèi)人民幣 元。 濕度 :1095% 非凝固狀態(tài)，海拔 : 海平面 10,000 Ft ? 尺寸： (H) x (W) x (D) 型號(hào) S10S磁盤(pán)陣列 CPU 64bit RISC CPU CPU主頻 400MHZ RAID支持 基于硬件的 RAID0\1\0+1\3\5\10\30\50\NRAID\JBOD SCSI 接口 SCSI Ultra320 LVD通道 主機(jī)通道 1~2個(gè) SCSI Ultra320 LVD通道 磁盤(pán)通道 2 ~1個(gè) SCSI Ultra320 LVD通道 數(shù)據(jù)傳輸速率 320MB/S 高速緩存 標(biāo)配 256MB－ 1GB（可擴(kuò)充） 單個(gè)陣列柜最大支持硬盤(pán)數(shù)量 10個(gè) 支持最大硬盤(pán)數(shù)（加擴(kuò)展柜） 30個(gè) 單個(gè)陣列柜（標(biāo)配）最大存儲(chǔ)容量 3000GB(300GB/Disk) 最大存儲(chǔ)容量 9000GB(300GB/Disk，加擴(kuò)展柜 ) 高速緩存標(biāo)準(zhǔn) Read Ahead/Write Back Cache 控制器熱插拔 支持 19 / 23 控制器通道擴(kuò)展 支持 控制器冗余支持 支持 控制器數(shù)量 1個(gè) 控制器工作模式 單控制器工作 性能優(yōu)化方式（隨機(jī) /順序） 支持 故障監(jiān)視、報(bào)警 (控制器、硬盤(pán)、風(fēng)扇、電源、溫度 ) 有 支持 支持 緩存回寫(xiě) 支持緩存回寫(xiě) 冗余配置 冗余電源、冗余風(fēng)扇、冗余控制器 FAX/自動(dòng)尋呼 /監(jiān)控報(bào)警 有 密碼保護(hù) 有 SCSI ID可設(shè)定 有 故障硬盤(pán)隔離電路 有 故障硬盤(pán)自動(dòng)重建 有 SNMP協(xié)議支持 (RAID Watch) 有 RAID在線擴(kuò)容、擴(kuò)展和遷移 有 壞磁道自動(dòng)指定 有 熱插拔硬盤(pán)架 10個(gè) 熱插拔電源 冗余電源，每個(gè)電源 400W 電源需求 400W 熱插拔風(fēng)扇 2個(gè) DB9型 RS232接口 1個(gè) I2C環(huán)境監(jiān)控組件 有 安全鎖 有 蜂鳴報(bào)警器 有 供電要求 100~240伏 11A/、 60/50赫茲 工作環(huán)境 濕度： 10%~85% 工作溫度 10℃ ~50℃ 存放溫度 40℃ ~60℃ 認(rèn)證 FCC, CE ,UL 外型 3U機(jī)架 顏色 銀灰色 體積 133(H) * 428 (W) * 552 (D) 重量 （不含硬盤(pán)） 參考圖片 20 / 23 報(bào)價(jià)資料 產(chǎn)品名稱(chēng) 報(bào)價(jià) (人民幣 ) 數(shù)量 合計(jì) (人民幣 ) 主節(jié)點(diǎn)控制服務(wù)器：五舟 HPC520 2顆 插拔 /2*1000M NIC /52X CD / /480W /2U機(jī)架 19500 1臺(tái) 從節(jié)點(diǎn)服務(wù)器：五舟 HPC510 2 顆 /2*1000M NIC /480W /2U 機(jī)架 16500 7臺(tái) 網(wǎng)絡(luò)交換機(jī)：華為 S1224 24口 1000M交換機(jī) 9800 1臺(tái) 機(jī)柜 YG188942 (42U) 2800 1套 其它耗材 500 若干 系統(tǒng)設(shè)備總額 147700 21 / 23 六 產(chǎn)品的售后服務(wù) 服務(wù)方式及說(shuō)明 上門(mén)服務(wù) 指在廣州地區(qū)內(nèi)，自服務(wù)器、存儲(chǔ)陣列及其它產(chǎn)品售出之日起，提供一年以?xún)?nèi)免費(fèi)上門(mén)服務(wù)： 1）我公司提供上門(mén)服務(wù)的時(shí)間：星期一至星期五，上午 9： 00－下午 18： 00 （法定假日除外）； 2）我們只提供與本系統(tǒng)故障相關(guān)的上門(mén)服務(wù)，其它故障不在此服務(wù)范圍之內(nèi)； 3）上門(mén)服務(wù)人員 如果遇到特殊情況不能當(dāng)場(chǎng)解決故障，在得到您的同意后，服務(wù)人員將機(jī)器帶回我司客服中心維修，維修好后無(wú)償將機(jī)器送回。 C 至 +70176。BLASBench 有三個(gè)主要的測(cè)試項(xiàng)目，它們是： AXPY 向量相加評(píng)定 GEMV 矩陣與向量相乘評(píng)定 GEMM 矩陣與矩陣相乘評(píng)定 這些測(cè)試都可以選擇使用雙精度或者是單精度數(shù)據(jù)類(lèi)型，這些都可以在 Makefile 里面定義。 其中前面的 6個(gè)測(cè)試使用默認(rèn)的雙精度類(lèi)型的數(shù)據(jù)作為基本的數(shù)據(jù)類(lèi)型數(shù)組。 Cache Read/Modify/Write 這個(gè)程式也是反映在不同的循環(huán)中我們使用不同向量長(zhǎng)度的包讀 / 修改 /寫(xiě)的數(shù)據(jù)帶寬。 在 LLCBench中它的 Cache測(cè)試程序叫做 CacheBench。 Broadcast and Reduce 這個(gè)程式使用廣播的方式來(lái)工作。 Bidirectional Bandwidth 這個(gè)程式用于點(diǎn)對(duì)點(diǎn)的帶寬測(cè)試。正如拇指規(guī)則，對(duì)于最好的性能，此數(shù)一般不高于總內(nèi)存的 80%。 HPL的測(cè)試值會(huì)受到很多因素的影響，但是主要的有兩個(gè)因素，一是網(wǎng)絡(luò)的性能，二是平均每個(gè) CPU獲得的內(nèi)存大小。由 Jack Dongarra 編寫(xiě)的 Linpack是在高性能計(jì)算領(lǐng)域最出名和廣泛使用的基準(zhǔn)測(cè)試。我們對(duì)集群測(cè)試大多使用一些很流行的基準(zhǔn)測(cè)試軟件，這些軟件是得到大家公認(rèn)的。服務(wù)器端采用無(wú)人值守的安裝方式，在完成安裝后，計(jì)算節(jié)點(diǎn)全部通過(guò) PXE網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)從主節(jié)點(diǎn)下載文件并自動(dòng)完成所有的安裝與設(shè)置。英特爾最新推出的 64位雙核至強(qiáng) 5160處理器，系統(tǒng)外頻 1333MHz，主頻高達(dá) 3GHz，其理論浮點(diǎn)性達(dá)到 12GFlops；內(nèi)存方面采用帶奇偶校驗(yàn)功能的 INTEL 新型串行 DDR2 667內(nèi)存（ FREE BUFFER DIMM或簡(jiǎn)稱(chēng) FBD），單機(jī)容量最大可支持 816GB；集成雙 1000M 網(wǎng)絡(luò)接口，可實(shí)現(xiàn)負(fù)載均衡或是冗余保護(hù)功能；機(jī)型采用 2U機(jī)架式設(shè) 計(jì)，確保機(jī)器連續(xù)運(yùn)行時(shí)具有很好的散熱性能，同時(shí)最大限度的利用機(jī)柜空間。 豐富的應(yīng)用軟件 ROCKS CLUSTERS 的優(yōu)秀也體現(xiàn)在有強(qiáng)大的第三方的軟件支持。 中山大學(xué)物理系理工學(xué)院集群軟件介紹 基于分布式運(yùn)算的觀點(diǎn)，在此方案中我們推薦使用 ROCKS CLUSTERS，一個(gè) NPACI(美國(guó)高級(jí)計(jì)算基礎(chǔ)設(shè)施合作委員會(huì) )負(fù)責(zé)開(kāi)發(fā)的集群系統(tǒng)。同時(shí)采用高質(zhì)量的交換機(jī)及雙絞電纜，以保證數(shù)據(jù)交換的低延時(shí)和穩(wěn)定性。 任用 INTEL的 MPI及 MKL庫(kù)。主要用于以下 3個(gè)方面的計(jì)算： 粒子物理及規(guī)范場(chǎng)方面的大規(guī)模計(jì)算。 可使用成熟通用的 LINUX操作系統(tǒng)作為軟件平臺(tái)。另一方面，它的可拓展性相對(duì)較差，一般如果處理器的數(shù)量超過(guò)四個(gè)，那它的制造成本就會(huì)變得相當(dāng)可觀。 5 / 23 影響高性能計(jì)算機(jī)系統(tǒng)分類(lèi)的因素有很多，所以從不 同的分類(lèi)標(biāo)準(zhǔn)得出的高性能集群計(jì)算機(jī)的系統(tǒng)架構(gòu)也各不相同。圖 1顯示了這 種 情況。直到 Linux集群的出現(xiàn)，集群的概念才得以廣為傳播。 存儲(chǔ)產(chǎn)品有基于 DAS、 NAS、 SAN等不同的技術(shù)的產(chǎn)品線，如磁盤(pán)陣列柜、基于 Lunix技術(shù)的 NAS、光纖存儲(chǔ)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)的 SAN。目前正特科技已發(fā)展為華南地區(qū)知名的服務(wù)器和存儲(chǔ)解決方案供應(yīng)商之一，擁有自主品牌的“五舟”服務(wù)器和存儲(chǔ)產(chǎn)品。 專(zhuān)業(yè)的產(chǎn)品結(jié)構(gòu) 正特科技專(zhuān)注于服務(wù)器和存儲(chǔ)業(yè)務(wù)，為客戶(hù)提供最高性?xún)r(jià)比的服務(wù)器和存儲(chǔ)整體解決方案。并且集群系統(tǒng)的管理員可以隨意增加和刪改集群系統(tǒng)的節(jié)點(diǎn)。但是當(dāng) CPU 的個(gè)數(shù)超過(guò)某一閾值，象 SMP這些多處理機(jī)系統(tǒng)的可擴(kuò)展性就變 得 極差。 高性能計(jì)算機(jī)集群簡(jiǎn)介 簡(jiǎn)單的說(shuō)，高性能計(jì)算 (HighPerformance Computing)是計(jì)算機(jī)科學(xué)的一個(gè)分支，它致力于開(kāi)發(fā)超級(jí)計(jì)算機(jī)，研究并行算法和開(kāi)發(fā)相關(guān)軟件。在這個(gè)系統(tǒng)中，處理器是以系統(tǒng)總線、交叉開(kāi)關(guān)或其它專(zhuān)有網(wǎng)絡(luò)與內(nèi)存連接在一起。在這里我們叫它作節(jié)點(diǎn)，這些節(jié)點(diǎn)均使用它的網(wǎng)絡(luò)接口連接到互連網(wǎng) 絡(luò)，并通過(guò)網(wǎng)絡(luò)通信。這種混合編程模式充分利用了內(nèi)存共享和信息傳遞機(jī)制的特點(diǎn)，被公認(rèn)為是最有效的編程模式。 交換能力達(dá)到 1Gbps的以太網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)。整個(gè)運(yùn)算過(guò)程中，主控節(jié)點(diǎn)控制整個(gè)系統(tǒng)，負(fù)責(zé)分派任務(wù)，為從節(jié)點(diǎn)機(jī)提供文件服務(wù)和對(duì)外的網(wǎng)絡(luò)連接；同時(shí)也是計(jì)算節(jié)點(diǎn)。 7 / 23 其次，方案中整體的散熱系統(tǒng)的考慮。 ROCKS CLUSTERS 對(duì)于故障節(jié)點(diǎn)的管理思想是，在硬件修復(fù)完成后，此節(jié)點(diǎn)只需接入集群網(wǎng)絡(luò)即會(huì)自動(dòng)完成文件的下載與安裝，無(wú)需人為干預(yù)。 龐大的的開(kāi)發(fā)團(tuán)隊(duì) ROCKS CLUSTERS 龐大的開(kāi)發(fā)團(tuán)隊(duì)包括 NPACI 自身、 San Diego Superputer Center,UCSD(加 8 / 23 利福尼亞圣迭戈分校超級(jí)計(jì)算機(jī)中心 )、 Millennium Group at UC Berkeley(位于加利福尼亞伯克利大學(xué)的開(kāi)發(fā)團(tuán)隊(duì) )、 Scalable SystemsPte Ltd in Singapore(新加坡可升級(jí)系統(tǒng)有限公司以及 OpenSCE in Thailand(泰國(guó)開(kāi)放式可升級(jí)集群開(kāi)發(fā)環(huán)境 )等。在版本方面，視不同的硬件有 i38 X8664及 IA64三個(gè)版本；目前總版本號(hào)為 VERSION 。那我們可能以通過(guò)指令 clusterfork ps – U$USER 完成，系統(tǒng)會(huì)在當(dāng)前節(jié)點(diǎn)順序列出每一個(gè)節(jié)點(diǎn)的節(jié)點(diǎn)名稱(chēng)及工作狀況。一般來(lái)說(shuō)比較合理的實(shí)際峰值都只有理論