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中大理工學(xué)院hpc集群方案-免費閱讀

2024-10-04 13:58 上一頁面

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【正文】 七 綜 述 以上是根據(jù)客戶的初步情況,做出的高性能計算系統(tǒng)方案的初步建議,五舟的 Cluster系統(tǒng)給客戶提供了一個高可管理性、高穩(wěn)定性的高性能計算解決方案。 3. 五舟服務(wù)器硬件部件自購買之日起,在保修期內(nèi)正常使用發(fā)生故障,我公司將選擇編修或更換確有故障或缺陷的部件。 有償服務(wù)收費標準 免費上門服務(wù)期后,如需要工程師到現(xiàn)場提供服務(wù),差旅費用由項目承包商或用戶負擔(住宿標準不低于 200 元 /天),另每次收取服務(wù)費人民幣 元。 濕度 :1095% 非凝固狀態(tài),海拔 : 海平面 10,000 Ft ? 尺寸: (H) x (W) x (D) 型號 S10S磁盤陣列 CPU 64bit RISC CPU CPU主頻 400MHZ RAID支持 基于硬件的 RAID0\1\0+1\3\5\10\30\50\NRAID\JBOD SCSI 接口 SCSI Ultra320 LVD通道 主機通道 1~2個 SCSI Ultra320 LVD通道 磁盤通道 2 ~1個 SCSI Ultra320 LVD通道 數(shù)據(jù)傳輸速率 320MB/S 高速緩存 標配 256MB- 1GB(可擴充) 單個陣列柜最大支持硬盤數(shù)量 10個 支持最大硬盤數(shù)(加擴展柜) 30個 單個陣列柜(標配)最大存儲容量 3000GB(300GB/Disk) 最大存儲容量 9000GB(300GB/Disk,加擴展柜 ) 高速緩存標準 Read Ahead/Write Back Cache 控制器熱插拔 支持 19 / 23 控制器通道擴展 支持 控制器冗余支持 支持 控制器數(shù)量 1個 控制器工作模式 單控制器工作 性能優(yōu)化方式(隨機 /順序) 支持 故障監(jiān)視、報警 (控制器、硬盤、風扇、電源、溫度 ) 有 支持 支持 緩存回寫 支持緩存回寫 冗余配置 冗余電源、冗余風扇、冗余控制器 FAX/自動尋呼 /監(jiān)控報警 有 密碼保護 有 SCSI ID可設(shè)定 有 故障硬盤隔離電路 有 故障硬盤自動重建 有 SNMP協(xié)議支持 (RAID Watch) 有 RAID在線擴容、擴展和遷移 有 壞磁道自動指定 有 熱插拔硬盤架 10個 熱插拔電源 冗余電源,每個電源 400W 電源需求 400W 熱插拔風扇 2個 DB9型 RS232接口 1個 I2C環(huán)境監(jiān)控組件 有 安全鎖 有 蜂鳴報警器 有 供電要求 100~240伏 11A/、 60/50赫茲 工作環(huán)境 濕度: 10%~85% 工作溫度 10℃ ~50℃ 存放溫度 40℃ ~60℃ 認證 FCC, CE ,UL 外型 3U機架 顏色 銀灰色 體積 133(H) * 428 (W) * 552 (D) 重量 (不含硬盤) 參考圖片 20 / 23 報價資料 產(chǎn)品名稱 報價 (人民幣 ) 數(shù)量 合計 (人民幣 ) 主節(jié)點控制服務(wù)器:五舟 HPC520 2顆 插拔 /2*1000M NIC /52X CD / /480W /2U機架 19500 1臺 從節(jié)點服務(wù)器:五舟 HPC510 2 顆 /2*1000M NIC /480W /2U 機架 16500 7臺 網(wǎng)絡(luò)交換機:華為 S1224 24口 1000M交換機 9800 1臺 機柜 YG188942 (42U) 2800 1套 其它耗材 500 若干 系統(tǒng)設(shè)備總額 147700 21 / 23 六 產(chǎn)品的售后服務(wù) 服務(wù)方式及說明 上門服務(wù) 指在廣州地區(qū)內(nèi),自服務(wù)器、存儲陣列及其它產(chǎn)品售出之日起,提供一年以內(nèi)免費上門服務(wù): 1)我公司提供上門服務(wù)的時間:星期一至星期五,上午 9: 00-下午 18: 00 (法定假日除外); 2)我們只提供與本系統(tǒng)故障相關(guān)的上門服務(wù),其它故障不在此服務(wù)范圍之內(nèi); 3)上門服務(wù)人員 如果遇到特殊情況不能當場解決故障,在得到您的同意后,服務(wù)人員將機器帶回我司客服中心維修,維修好后無償將機器送回。 C 至 +70176。BLASBench 有三個主要的測試項目,它們是: AXPY 向量相加評定 GEMV 矩陣與向量相乘評定 GEMM 矩陣與矩陣相乘評定 這些測試都可以選擇使用雙精度或者是單精度數(shù)據(jù)類型,這些都可以在 Makefile 里面定義。 其中前面的 6個測試使用默認的雙精度類型的數(shù)據(jù)作為基本的數(shù)據(jù)類型數(shù)組。 Cache Read/Modify/Write 這個程式也是反映在不同的循環(huán)中我們使用不同向量長度的包讀 / 修改 /寫的數(shù)據(jù)帶寬。 在 LLCBench中它的 Cache測試程序叫做 CacheBench。 Broadcast and Reduce 這個程式使用廣播的方式來工作。 Bidirectional Bandwidth 這個程式用于點對點的帶寬測試。正如拇指規(guī)則,對于最好的性能,此數(shù)一般不高于總內(nèi)存的 80%。 HPL的測試值會受到很多因素的影響,但是主要的有兩個因素,一是網(wǎng)絡(luò)的性能,二是平均每個 CPU獲得的內(nèi)存大小。由 Jack Dongarra 編寫的 Linpack是在高性能計算領(lǐng)域最出名和廣泛使用的基準測試。我們對集群測試大多使用一些很流行的基準測試軟件,這些軟件是得到大家公認的。服務(wù)器端采用無人值守的安裝方式,在完成安裝后,計算節(jié)點全部通過 PXE網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)從主節(jié)點下載文件并自動完成所有的安裝與設(shè)置。英特爾最新推出的 64位雙核至強 5160處理器,系統(tǒng)外頻 1333MHz,主頻高達 3GHz,其理論浮點性達到 12GFlops;內(nèi)存方面采用帶奇偶校驗功能的 INTEL 新型串行 DDR2 667內(nèi)存( FREE BUFFER DIMM或簡稱 FBD),單機容量最大可支持 816GB;集成雙 1000M 網(wǎng)絡(luò)接口,可實現(xiàn)負載均衡或是冗余保護功能;機型采用 2U機架式設(shè) 計,確保機器連續(xù)運行時具有很好的散熱性能,同時最大限度的利用機柜空間。 豐富的應(yīng)用軟件 ROCKS CLUSTERS 的優(yōu)秀也體現(xiàn)在有強大的第三方的軟件支持。 中山大學(xué)物理系理工學(xué)院集群軟件介紹 基于分布式運算的觀點,在此方案中我們推薦使用 ROCKS CLUSTERS,一個 NPACI(美國高級計算基礎(chǔ)設(shè)施合作委員會 )負責開發(fā)的集群系統(tǒng)。同時采用高質(zhì)量的交換機及雙絞電纜,以保證數(shù)據(jù)交換的低延時和穩(wěn)定性。 任用 INTEL的 MPI及 MKL庫。主要用于以下 3個方面的計算: 粒子物理及規(guī)范場方面的大規(guī)模計算。 可使用成熟通用的 LINUX操作系統(tǒng)作為軟件平臺。另一方面,它的可拓展性相對較差,一般如果處理器的數(shù)量超過四個,那它的制造成本就會變得相當可觀。 5 / 23 影響高性能計算機系統(tǒng)分類的因素有很多,所以從不 同的分類標準得出的高性能集群計算機的系統(tǒng)架構(gòu)也各不相同。圖 1顯示了這 種 情況。直到 Linux集群的出現(xiàn),集群的概念才得以廣為傳播。 存儲產(chǎn)品有基于 DAS、 NAS、 SAN等不同的技術(shù)的產(chǎn)品線,如磁盤陣列柜、基于 Lunix技術(shù)的 NAS、光纖存儲網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)的 SAN。目前正特科技已發(fā)展為華南地區(qū)知名的服務(wù)器和存儲解決方案供應(yīng)商之一,擁有自主品牌的“五舟”服務(wù)器和存儲產(chǎn)品。 專業(yè)的產(chǎn)品結(jié)構(gòu) 正特科技專注于服務(wù)器和存儲業(yè)務(wù),為客戶提供最高性價比的服務(wù)器和存儲整體解決方案。并且集群系統(tǒng)的管理員可以隨意增加和刪改集群系統(tǒng)的節(jié)點。但是當 CPU 的個數(shù)超過某一閾值,象 SMP這些多處理機系統(tǒng)的可擴展性就變 得 極差。 高性能計算機集群簡介 簡單的說,高性能計算 (HighPerformance Computing)是計算機科學(xué)的一個分支,它致力于開發(fā)超級計算機,研究并行算法和開發(fā)相關(guān)軟件。在這個系統(tǒng)中,處理器是以系統(tǒng)總線、交叉開關(guān)或其它專有網(wǎng)絡(luò)與內(nèi)存連接在一起。在這里我們叫它作節(jié)點,這些節(jié)點均使用它的網(wǎng)絡(luò)接口連接到互連網(wǎng) 絡(luò),并通過網(wǎng)絡(luò)通信。這種混合編程模式充分利用了內(nèi)存共享和信息傳遞機制的特點,被公認為是最有效的編程模式。 交換能力達到 1Gbps的以太網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)。整個運算過程中,主控節(jié)點控制整個系統(tǒng),負責分派任務(wù),為從節(jié)點機提供文件服務(wù)和對外的網(wǎng)絡(luò)連接;同時也是計算節(jié)點。 7 / 23 其次,方案中整體的散熱系統(tǒng)的考慮。 ROCKS CLUSTERS 對于故障節(jié)點的管理思想是,在硬件修復(fù)完成后,此節(jié)點只需接入集群網(wǎng)絡(luò)即會自動完成文件的下載與安裝,無需人為干預(yù)。 龐大的的開發(fā)團隊 ROCKS CLUSTERS 龐大的開發(fā)團隊包括 NPACI 自身、 San Diego Superputer Center,UCSD(加 8 / 23 利福尼亞圣迭戈分校超級計算機中心 )、 Millennium Group at UC Berkeley(位于加利福尼亞伯克利大學(xué)的開發(fā)團隊 )、 Scalable SystemsPte Ltd in Singapore(新加坡可升級系統(tǒng)有限公司以及 OpenSCE in Thailand(泰國開放式可升級集群開發(fā)環(huán)境 )等。在版本方面,視不同的硬件有 i38 X8664及 IA64三個版本;目前總版本號為 VERSION 。那我們可能以通過指令 clusterfork ps – U$USER 完成,系統(tǒng)會在當前節(jié)點順序列出每一個節(jié)點的節(jié)點名稱及工作狀況。一般來說比較合理的實際峰值都只有理論
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