蛋白質(zhì)工具rasmol使用簡(jiǎn)介-預(yù)覽頁
【正文】 Atom’是color的對(duì)象，那么(n224。,Colour,Syntax: colour {} color {} ,按需要上不同(b249。最小值是10： zoom 200,Ribbon,Strand,Cartoon,球棍,Stick,backbone,第十二頁，共三十三頁。n)恢復(fù)到初始狀態(tài),第十一頁，共三十三頁。,Background Syntax: background ,第九頁，共三十三頁。u)的距離數(shù)值不帶小數(shù)點(diǎn)的話，默認(rèn)它是用的RasMoL單位。),第七頁，共三十三頁。,Rasmol Windows,有兩個(gè)窗口： 主要(zhǔy224。)也是80個(gè)字符 第一到六列是記錄類型標(biāo)志符 第7到70列存放數(shù)據(jù),第三頁，共三十三頁。g242。PDB 文件(w233。,3/2/2022 63776個(gè)結(jié)構(gòu)(ji233。l249。,PDB File ATOM,HETATM,第五頁，共三十三頁。ngzh236。 如果RasMol接受(jiēsh242。.,第八頁，共三十三頁。mi224。nɡ)大小為缺省的百分比。)氫鍵,hbonds on|off hbond 40 color hbond green color hbond type,第十四頁，共三十三頁。i yǒu)寫明{}的時(shí)候，命令給選定的原子上色,Object 可以(kěyǐ)是: atoms bonds backbone ribbons labels dots hbonds ssbonds,第十五頁，共三十三頁。is232。)方案,第十八頁，共三十三頁。,Colour Schemes,第二十頁，共三十三頁。)PDB文件時(shí)，缺省選定的是PDB文件中的全部原子 所以上色命令作用在所有的原子上。,根本表達(dá)式: 1.殘基編號(hào)或者用殘基的編號(hào)范圍 例如: select 5,6,7,8 select 58 2.三字符氨基酸名{殘基編號(hào)}{肽鏈編號(hào)}{.原子名} 例如: SER70A SER70:1 SER70.CA 肽鏈編號(hào)如果也是數(shù)字的話，要用:隔開(ɡ233。)集,核酸(h233。,Within(距離, 原子表達(dá)式) 如果“距離〞使整數(shù)(zhěngsh249。,例子(l236。,Label,The RasMol 39。script39。echo39。write rasmol39。script39。ng)總結(jié),PDB 文件和 Rasmol。ngx249。1.殘基編號(hào)或者用殘基的編號(hào)范
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