【正文】
作用機(jī)制 ④ 分類 ① 定義 指位于離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)較遠(yuǎn)位置上,具有參與激活和增強(qiáng)起始功能的序列元件。 三種可能的作用方式: 1 可影響模板附近的 DNA雙螺旋結(jié)構(gòu); 2 將模板固定在細(xì)胞核內(nèi)特定位置; 3 增強(qiáng)子區(qū)可以作為反式作用因子或 RNA聚合酶 Ⅱ 進(jìn)入染色質(zhì)特定結(jié)構(gòu)的入口。 反式作用因子 基本概念 轉(zhuǎn)錄因子的類型 轉(zhuǎn)錄因子活性調(diào)節(jié)的主要方式 反式作用因子的 DNA識(shí)別或結(jié)合域 反式作用因子中的轉(zhuǎn)錄激活域 反式作用因子 (transacting factor) 一種基因的 RNA或蛋白質(zhì)產(chǎn)物,能影響位于基因組另一條染色體上的(或基因組別處的)另一個(gè)基因的活性。通過增加基本轉(zhuǎn)錄復(fù)合體 (basal apparatus) 結(jié)合于啟動(dòng)子的效率而起作用; ( 3)輔激活劑 (coactivator) 連接了激活劑和基本轉(zhuǎn)錄復(fù)合體; ( 4)一些調(diào)節(jié)因子 (Some regulators) 可使染色質(zhì)結(jié)構(gòu)改變。 真核和原核轉(zhuǎn)錄因子起作用的差異 反式作用因子的 DNA識(shí)別或結(jié)合域 ( 1) 螺旋 轉(zhuǎn)折 螺旋 ( 2) 鋅指結(jié)構(gòu) ( 3) 堿性 亮氨酸拉鏈 ( 4) 螺旋 環(huán) 螺旋 ( 1)螺旋 轉(zhuǎn)折 螺旋( helixturnhelix) 現(xiàn)廣泛分布在從酵母到人類的各種真核生物中,雖彼此在氨基酸的順序上差別很大,但高級(jí)結(jié)構(gòu)高度保守,如同源域蛋白。 含同源域的蛋白質(zhì)可能是轉(zhuǎn)錄的激活劑或阻抑物 (activators or repressors) 。 ② 類固醇受體 ① 典型的“鋅指”蛋白質(zhì) 典型“鋅指蛋白” (typic zinic fingers)含一連串鋅指。其 DNA結(jié)合域是一類鋅指 : CysX2CysX13CysX2Cys 被稱為 Cys2/ Cys2鋅指 。配體結(jié)合于受體的 C端結(jié)構(gòu)域,提高了 DNA結(jié)合域?qū)?DNA特異靶位點(diǎn)的親和力。 又因這類蛋白質(zhì)都以 二聚體形式與 DNA結(jié)合 , 兩個(gè)蛋白質(zhì) α螺旋上的亮氨酸靠近而形成拉鏈樣結(jié)構(gòu) 。 An HLH dimer in which both subunits are of the bHLH type can bind DNA, but a dimer in which one subunit lacks the basic region cannot bind DNA. An HLH dimer in which both subunits are of the bHLH type can bind DNA, but a dimer in which one subunit lacks the basic region cannot bind DNA. 反式作用因子中的轉(zhuǎn)錄激活域 (Transcriptional activation domain) ( 1) 酸性激活域 ( 2) 富含谷氨酰胺的激活域 ( 3) 富含脯氨酸的激活域 (1)酸性激活域 acidic activation domain 共同點(diǎn): 它們之間并不存在較為明顯的氨基酸序列的同源性,但卻都含有高比例的酸性氨基酸,產(chǎn)生出很強(qiáng)的凈負(fù)電荷。 如原癌基因蛋白質(zhì)產(chǎn)物 Jun和 AP2以及 Oct2中,都鑒定出了富含脯氨酸的激活域。 initiation occurs a fixed distance (~55 bp) upstream of the promoter. So the promoter for 5S RNA transcription lies between positions +55 and +80 within the gene. +55 +80 +1 Promoters for RNA polymerase III may consist of bipartite sequences downstream of the startpoint, with boxA separated from either boxC or boxB. Or they may consist of separated sequences upstream of the startpoint (Oct, PSE, TATA). Only in 5S RNA Only in snRNA Internal type 1 pol III promoters use the assembly factors TFIIIA and TFIIIC, at boxA and boxC, to recruit the positioning factor TFIIIB, which recruits RNA polymerase III. Only in 5S RNA TBP TBP TBP Internal type 2 pol III promoters use binding of TFIIIC to boxA and boxB sequences to recruit the positioning factor TFIIIB, which recruits RNA polymerase III. TBP TBP TBP RNA聚合酶 Ⅱ 的啟動(dòng)子和轉(zhuǎn)錄因子 RNA聚合酶 Ⅱ 的啟動(dòng)子結(jié)構(gòu)復(fù)雜,且序列變化很大,與轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)有關(guān)的位點(diǎn)包括 4個(gè)部位: ⑴ 帽子位點(diǎn)(轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)),其堿基大多為 A; ⑵ 25附近的 TATA框; ⑶ 75附近的 CAAT框; ⑷ 100以上的遠(yuǎn)上游序列,即增強(qiáng)子