并行計算機與并行計算-預(yù)覽頁
【正文】 H i t ac hi S R 80 00 F1 / 10 0 91 7. 2 H i gh E n ergy A cce l erat or R es ea r ch O r ga n i z at i on / K E K , T su k ub a Ja p an 2020 R es ea r ch 100 9 C r ay I nc . T3 E 12 00 89 1. 5 G ov ernm en t U S A 1998 C l as si f i ed 1084 10 C r ay I nc . T3 E 12 00 89 1. 5 U S A r m y H P C R es e arch C e nt er at N C S Min ne ap ol i s U S A 2020 R es ea r ch 1084 Center of Computational Chemistry IBM Builds World39。 在當前所有的消息傳遞軟件中 , 最重要最流行的是 MPI, 它能運行在所有的并行平臺上 , 包括 SMP和 PVP. 二者已經(jīng)在 Windows NT 和Windows 95這樣的非 Unix平臺上實現(xiàn) . 程序設(shè)計語言支持 C, Fortran和 、銀河和曙光上都實現(xiàn)了對 MPI和支持 . MPI(Message Passing Interface) MPI模型 目標 : 是提供一個實際可用的、可移植的、高效的和靈活的消息傳遞 接口標準 . MPI以語言獨立的形式來定義這個接口庫 , 并提供了與 C、 Fortran和 Java語言的綁定 . 這個定義不包含任何專用于某個特別的 制造商、操作系統(tǒng)或硬件的特性 . 由于這個原因 , MPI在并行計算界 被廣泛地接受 . Center of Computational Chemistry MPI并行程序設(shè)計平臺由 標準消息傳遞函數(shù)及相關(guān)輔助函數(shù)構(gòu)成，多個進程通過調(diào)用這些函數(shù)（類似調(diào)用子程序），進行通信； 一個程序同時啟動多份 ， 形成多個獨立的進程 ， 在不同的處理機上運行 ， 擁有獨立的內(nèi)存空間 ， 進程間通信通過調(diào)用 MPI函數(shù)來實現(xiàn)；每個進程 開始執(zhí)行時 ， 將獲得一個唯一的序號 （ rank） 。 軟件配置 ： 操作系統(tǒng) ：每一個節(jié)點都裝有多用戶，多任務(wù)的 RH linux() 網(wǎng)絡(luò)文件系統(tǒng)： NFS， MFS 網(wǎng)絡(luò)信息系統(tǒng) ： NIS 編譯器 ： GNU C, GNU Fortran 77, Absoft F95 F90 F77, PGI F90 F77 C C++ 并行開發(fā)環(huán)境 ： LINDA, MPI 負載均衡 ： Mosix 數(shù)據(jù)并行語言高性能編譯器和運行庫 ： HF77, PGI HPF， Free Scalapack 計算軟件 ： Parallelized Gaussian 98 (with Linda support), Gamess, Molpro,各種自編程序和交流程序 HPC Server Center of Computational Chemistry 中國科學(xué)院十五計劃中 關(guān)于并行計算部分 Center of Computational Chemistry 中國科學(xué)院網(wǎng)絡(luò)信息中心高性能計算研究室 現(xiàn)有計算設(shè)備 ： － Power Challenge XL 并行對稱多處理系統(tǒng) －日立 SR2201超級計算并行機系統(tǒng) －曙光 2020II超級服務(wù)器 詳細配置可以查詢： Center of Computational Chemistry 預(yù)備引進 ： －聯(lián)想 iCluster1800高性能機群服務(wù)器（已由數(shù)學(xué)研究院引進，正在試運行） －超過 2萬億次的超級計算機（預(yù)計 2020年 9月到位） 目前正在征求意見，建立用戶資料庫 Center of Computational Chemistry ？ 一般來說，計算量極大而使 PC不能滿足要求或者根本不能計算的任務(wù)是適合在 超級計算環(huán)境中運行的。 Center of Computational Chemistry 我們所的使用 量子化學(xué)和化學(xué)動力學(xué)涉及的相關(guān)課題 生物分子、藥物分子的設(shè)計、模擬及結(jié)構(gòu)特性 基元化學(xué)反應(yīng)的量子化學(xué)研究 材料科學(xué)和表面科學(xué) 物理有機化學(xué)及催化過程的研究 催化反應(yīng)動力學(xué)及其表征 量子動力學(xué)研究分子的動態(tài)過程 PEMFC內(nèi)流體流動與傳遞現(xiàn)象研究 流場理論計算及多維物理場耦合計算 Center of Computational Chemistry 謝謝！
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