【正文】 列E. 長(zhǎng)末端重復(fù)序列3. 甲型流感病毒亞型的分型依據(jù)（ ） A. 核衣殼蛋白（nucleocapsid protein，NP）B. 基質(zhì)蛋白（matrix protein，M）C. 血凝素（hemagglutinin，HA）的抗原性D. 神經(jīng)酰胺酶（neuraminidase，NA）的抗原性E. 宿主種屬4. 逆轉(zhuǎn)錄病毒編碼的基本結(jié)構(gòu)基因（ ） A. gag（編碼核心蛋白）。結(jié)構(gòu)基因組學(xué)代表基因組分析的早期階段，通過基因作圖、核苷酸序列分析確定基因組成、基因定位的科學(xué)，包括規(guī)?；販y(cè)定蛋白質(zhì)、RNA及其它生物大分子的三維結(jié)構(gòu)等內(nèi)容,以獲得一幅完整的、能夠在細(xì)胞中定位以及在各種生物學(xué)代謝途徑、生理途徑、信號(hào)傳導(dǎo)途徑中全部蛋白質(zhì)在原子水平的三維結(jié)構(gòu)全息圖。通過研究遺傳多態(tài)性與個(gè)體對(duì)藥物敏感性或耐受性的相關(guān)性, 可以闡明遺傳因素對(duì)藥物效用的影響, 從而對(duì)醫(yī)生針對(duì)性的用藥和藥物的開發(fā)提供指導(dǎo)和依據(jù)。法醫(yī)案例中, 對(duì)于量極少和降解嚴(yán)重的生物檢材, 通過PCR進(jìn)行STR位點(diǎn)擴(kuò)增并將幾個(gè)STR 位點(diǎn)聯(lián)合起來分析, 可得到相當(dāng)高的累積個(gè)體識(shí)別率和父權(quán)排除率。②目的基因篩選和基因診斷。DNA甲基化與基因表達(dá)呈負(fù)相關(guān)，DNA甲基化調(diào)控基因表達(dá)直接的機(jī)制可能是因?yàn)榧谆鶑腄NA分子的大溝中突出，阻止了轉(zhuǎn)錄因子與基因相互作用，還可能直接抑制RNA聚合酶活性而抑制基因的表達(dá)。假基因中大多數(shù)則缺少間隔序列的稱為已加工假基因(processed pseudogene)，主要是轉(zhuǎn)錄過程中mRNA 以cDNA 的方式重新整合進(jìn)入基因組( 很可能發(fā)生在生殖細(xì)胞中)，在長(zhǎng)期進(jìn)化選擇過程中因?yàn)殡S機(jī)突變積累而喪失功能，通常這種假基因無內(nèi)含子，兩邊有小的側(cè)翼定向重復(fù)序列(flanking direct repeat)，339。臨床表現(xiàn)常見為眼瞼下垂、外眼肌麻痹、視神經(jīng)萎縮、神經(jīng)性耳聾、痙攣或驚厥、癡呆、偏頭痛、類卒中樣發(fā)作等。復(fù)制分離即在細(xì)胞分裂的復(fù)制過程中,突變的和野生型的mtDNA 隨機(jī)進(jìn)入子細(xì)胞的過程，復(fù)制分離的結(jié)果使突變mtDNA 雜合體向突變純合或野生純合方向轉(zhuǎn)變,但因突變復(fù)制具有優(yōu)勢(shì),故易產(chǎn)生突變積累，突變積累的程度不同,突變mtDNA 在群體中的多態(tài)性程度也不同。（二）中度重復(fù)序列這類重復(fù)序列主要由比較大的片段（由100bp到幾千bp）串聯(lián)重復(fù)組成，分散在整個(gè)基因組中，重復(fù)頻度不等，如Alu家族、rRNA、tRNA和組蛋白等。： DNA經(jīng)亞硫酸鈉處理后，非甲基化的C轉(zhuǎn)變?yōu)閁，而甲基化的胞嘧啶保持不變，利用兩套不同的引物擴(kuò)增可判斷甲基化是否發(fā)生的一種特異性PCR。：一種由蛋白質(zhì)和RNA兩部分組成的以自身的RNA為模板，可合成端粒重復(fù)序列而延長(zhǎng)端粒的特殊逆轉(zhuǎn)錄酶。：存在于常染色體由2～6個(gè)核苷酸長(zhǎng)的重復(fù)序列組成，又稱簡(jiǎn)單串聯(lián)重復(fù)序列，以(CA)n、(GT)n、(CAG)n較常見，重復(fù)次數(shù)多為15～60次，總長(zhǎng)度一般在400 bp以下。6. 簡(jiǎn)述CpG島與DNA甲基化調(diào)控。經(jīng)過轉(zhuǎn)位作用，在這種細(xì)菌內(nèi)產(chǎn)生Amp+及Kan+的質(zhì)粒，經(jīng)過再次接合作用，即可產(chǎn)生含Amp+ Kan+R質(zhì)粒細(xì)菌。6．⑴引起突變　轉(zhuǎn)位可能引起多種基因突變。⑶Mu噬菌體 是一類具有轉(zhuǎn)座功能的溫和性噬菌體。反向重復(fù)序列的對(duì)稱結(jié)構(gòu)使IS可以雙向插入（正向插入或反向插入）靶位點(diǎn)。按質(zhì)粒大小分為：小型質(zhì)粒、大型質(zhì)粒。質(zhì)粒DNA分子通常具有三種不同的構(gòu)型。每個(gè)DNA環(huán)是一個(gè)相對(duì)獨(dú)立的功能區(qū)，可以獨(dú)立完成不同區(qū)域的基因表達(dá)與調(diào)控。原核生物沒有典型的細(xì)胞核結(jié)構(gòu)，基因組DNA位于細(xì)胞中央的核區(qū)，沒有核膜將其與細(xì)胞質(zhì)隔開，但能在蛋白質(zhì)的協(xié)助下，以一定的組織形式盤曲、折疊包裝起來，形成類核（nucleoid）也稱擬核。基因組中編碼區(qū)所占比例為50﹪，不編碼區(qū)中常常含有基因表達(dá)調(diào)控的序列。操縱子結(jié)構(gòu)是原核生物基因組的功能單位，在原核基因調(diào)控中具有普遍的意義。五、問答題：1．在原核生物基因組中只有一個(gè)DNA復(fù)制起點(diǎn)。這種轉(zhuǎn)移可以發(fā)生在同一染色體中也可以發(fā)生在不同染色體之間，被轉(zhuǎn)移的DNA片段稱為轉(zhuǎn)座因子（或轉(zhuǎn)座元件）。4. 試述質(zhì)粒的類型有哪些？5. 簡(jiǎn)述原核生物轉(zhuǎn)座子的類型及特點(diǎn)。蛋白質(zhì)組學(xué)與基因組學(xué)相輔相成，優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)。人類個(gè)體之間DNA序列差異的研究，基因芯片與蛋白質(zhì)芯片技術(shù)及快速測(cè)序技術(shù)等的發(fā)展和普及，將使基因組和蛋白質(zhì)組范圍內(nèi)的快速、準(zhǔn)確的分子診斷成為現(xiàn)實(shí)，人們將因此最大限度地了解自身對(duì)環(huán)境和疾病的易感性，增進(jìn)健康，延長(zhǎng)壽命。而對(duì)于數(shù)量極大的蛋白質(zhì)編碼基因，目前可根據(jù)其特點(diǎn)使用五項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn)來鑒別：①開放閱讀框（open reading frame, ORF）；②序列特征和密碼子偏愛；③序列保守性；④轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物；⑤基因失活。2. 在不同物種的基因中經(jīng)常為某種氨基酸編碼的只是其中的某一特定的密碼子，這種現(xiàn)象稱密碼子偏愛（codon bias）。分子診斷學(xué)習(xí)題 Lucas Gu基因組概論一、 A型題：1. 一個(gè)典型的基因不包括（ ） A. 增強(qiáng)子 B. 5′非編碼區(qū) C. 3′非編碼區(qū) D. 啟始密碼子E. 終止密碼子2. 基因序列中保守性最高的序列（ ） A. 內(nèi)含子B. 外顯子C. 整個(gè)基因D. 5′非編碼區(qū)E. 3′非編碼區(qū)3. 基因組最大的生物（ ） A. 人 B. 某些藻類 C. 某些細(xì)菌 D. 某些顯花植物和兩棲類動(dòng)物 E. 某些哺乳動(dòng)物4. 基因總數(shù)最多的生物（ ） A. 人 B. 藻類 C. 水稻 D. 顯花植物和兩棲類動(dòng)物 E. 某些哺乳動(dòng)物5. HGP研究的主要內(nèi)容不包括（ ） A. 物理圖B. SNP圖C. 連鎖圖D. 序列圖E. 遺傳圖6. 模式生物基因組計(jì)劃不包括（ ） A. 秀麗線蟲B. 釀酒酵母C. 黑腹果蠅D. 小鼠E. 大鼠7. 后基因組計(jì)劃的主要目標(biāo)（ ）A. 基因功能比較B. 基因功能鑒定C. 基因組測(cè)序D. 基因數(shù)據(jù)分析E. 基因結(jié)構(gòu)二、 X型題：1. 基因編碼的功能產(chǎn)物（ ）A. 多肽B. 蛋白質(zhì)C. tRNAD. rRNAE. 某些小分子RNA2. 基因組學(xué)（Genomics）研究的內(nèi)容包括（ ） A. 基因組作圖B. 核苷酸序列分析C. 基因定位D. 基因功能分析E. 疾病基因定位3. 功能基因組學(xué)的主要特征。參考答案一、A型題： 二、X型題： 三、名詞解釋：1. 開放閱讀框（open reading frame, ORF）是由始于起始密碼子并終于終止密碼子的一串密碼子組成的核苷酸序列。五、問答題：1. 對(duì)于數(shù)量很少的編碼tRNA、rRNA和某些小分子RNA的基因，我們較易通過核酸序列加以判斷。人類基因組中所有基因及其表達(dá)產(chǎn)物種類的確認(rèn)和功能解析，野生型基因或突變型基因及其表達(dá)產(chǎn)物與疾病的關(guān)系的研究，將會(huì)大大加快加深人們對(duì)疾病分子機(jī)理的認(rèn)識(shí)，并描繪出能準(zhǔn)確用于每一種疾病的預(yù)測(cè)、診斷及預(yù)后的基因或蛋白質(zhì)指紋圖譜，將為藥物的研究提供更多更有效的作用靶點(diǎn)。隨著更安全更有效的載體的研制（這只是時(shí)間問題），基因治療終究會(huì)被人們接受并得到普及。3. 描述質(zhì)粒DNA的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。3． 轉(zhuǎn)座：轉(zhuǎn)座（transposition）是指遺傳物質(zhì)被轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象。6．質(zhì)粒的不相容性：同一類群的不同質(zhì)粒通常不能在同一菌株內(nèi)穩(wěn)定共存，當(dāng)細(xì)胞分裂時(shí)就會(huì)分別進(jìn)入不同的子代細(xì)胞，這種現(xiàn)象叫做質(zhì)粒的不相容性（inpatibility）。廣泛存在操縱子結(jié)構(gòu)。具有編碼同工酶的不同基因。2．原核生物與真核生物的主要區(qū)別在細(xì)胞核上。每個(gè)環(huán)形的活結(jié)狀結(jié)構(gòu)代表一個(gè)結(jié)構(gòu)域，在各結(jié)構(gòu)域中DNA呈負(fù)超螺旋狀態(tài)。3．多數(shù)細(xì)菌來源的質(zhì)粒核酸是環(huán)狀雙鏈DNA分子，沒有游離的末端，每條鏈上的核苷酸通過共價(jià)鍵頭尾相連。按轉(zhuǎn)移方式分為：接合型質(zhì)粒、可移動(dòng)型質(zhì)粒、自傳遞型質(zhì)粒。5．⑴插入序列（insertion sequence,IS）長(zhǎng)度約700bp～2 000bp，由一個(gè)轉(zhuǎn)位酶基因及兩側(cè)的反向重復(fù)序列（16bp～41bp）組成。Tn比IS大，約4500～20000bp，除了攜帶有關(guān)轉(zhuǎn)座的必需基因外，還含有能決定宿主菌遺傳性狀的基因，主要是抗生素和某些藥物的抗性基因，轉(zhuǎn)座子中的轉(zhuǎn)位酶稱為轉(zhuǎn)座酶（transposase），其功能是介導(dǎo)轉(zhuǎn)座子從一個(gè)位點(diǎn)轉(zhuǎn)座到另一個(gè)位點(diǎn)，或從一個(gè)復(fù)制子轉(zhuǎn)座到另一個(gè)復(fù)制子，其轉(zhuǎn)座過程與IS相似。當(dāng)它們感染細(xì)菌后，其溶源性整合和裂解周期的復(fù)制均以轉(zhuǎn)座方式進(jìn)行，但轉(zhuǎn)座位點(diǎn)是隨機(jī)的。若將帶有Amp+R質(zhì)粒的細(xì)菌與不含R質(zhì)粒的帶有Kan+轉(zhuǎn)座子的細(xì)菌進(jìn)行接合，結(jié)果產(chǎn)生了Amp+ Kan+的細(xì)菌，并且能夠在含有氨芐青霉素及卡那霉素的培養(yǎng)板上生長(zhǎng)。5. 假基因的分類及其發(fā)生機(jī)理。: 真核生物中每一個(gè)基因單獨(dú)構(gòu)成一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位轉(zhuǎn)錄而產(chǎn)生的mRNA，僅編碼一種蛋白質(zhì)。:基因家族中一類與具正常功能的基因序列相似，但無轉(zhuǎn)錄功能或轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物無功能的基因稱為假基因。：因單個(gè)堿基的變異（主要是置換，也有缺失和插入）引起的DNA序列多態(tài)性，在特定核苷酸位置上存在兩種不同的堿基，其中最少一種在群體中的頻率不小于1%。根據(jù)衛(wèi)星DNA的長(zhǎng)度，又可分成3種：衛(wèi)星DNA、小衛(wèi)星DNA、微衛(wèi)星DNA。（三）異質(zhì)性和復(fù)制分離 異質(zhì)性即突變mtDNA與野生型mtDNA 以不同的比例共存于一個(gè)細(xì)胞內(nèi)的現(xiàn)象。4答案：線粒體?。╩itochondriopathy）是指由于線粒體呼吸鏈功能不良所導(dǎo)致的臨床表現(xiàn)多樣化的一組疾病。根據(jù)是否保留相應(yīng)功能基因的間隔序列(如內(nèi)含子) , 假基因分兩大類:一類保留了間隔序列，稱為非加工假基因(nonprocessed pseudogene)，通常因基因的復(fù)制修飾,如點(diǎn)突變、插入、缺失和移碼突變而導(dǎo)致復(fù)制后的基因在轉(zhuǎn)錄和翻譯時(shí)出現(xiàn)異常,喪失正常功能，它與功能基因一般在同一染色體上, 也稱復(fù)制型假基因( duplicated pseudogene)。在正常組織，除印記基因和失活的X染色體外，包括啟動(dòng)子區(qū)在內(nèi)的基因5′端CpG 島大部分是非甲基化的。 7 答案：主要用途①人類基因遺傳圖譜的制作。③法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別和親權(quán)鑒定。指導(dǎo)用藥和藥物設(shè)計(jì)：SNP多態(tài)性能充分反映個(gè)體間的遺傳差異。9答案：人類基因組研究主要包括兩方面的內(nèi)容：以全基因組測(cè)序?yàn)槟繕?biāo)的結(jié)構(gòu)基因組學(xué)和以基因功能鑒定為目標(biāo)的功能基因組學(xué)，又稱后基因組研究。病毒基因組十、 A型題：1. 只含小分子量RNA而不含蛋白質(zhì)的病毒稱（ ） A. 類病毒（Viroids）B. 衛(wèi)星（Satellites）C. 類病毒（viroid） D. 朊病毒（Prions）E. 擬病毒（virusoid）2. 只含蛋白質(zhì)而不含核酸的的病毒稱（ ） A. 類病毒（Viroids）B. 衛(wèi)星（Satellites）C. 類病毒（viroid） D. 朊病毒（Prions）E. 擬病毒（virusoid）3. RNA病毒基因組的帽子結(jié)構(gòu)與第二個(gè)核苷酸相連的化學(xué)鍵（ ） A. 5＇，5＇三磷酸二酯鍵 B. 3＇，3＇三磷酸二酯鍵 C. 5＇，5＇磷酸二酯鍵 D. 3＇，5＇磷酸二酯鍵 E. 以上都不是4. HBV基因組是（ ） A. 完全雙鏈DNA分子B. 不完全雙鏈DNA分子C. 完全雙鏈RNA分子D. 不完全雙鏈RNA分子E. 單鏈DNA分子5. 具mRNA模板活性的病毒基因組是（ ） A. 正鏈DNA病毒B. 負(fù)鏈DNA病毒C. 負(fù)鏈RNA病毒D. 逆轉(zhuǎn)錄科的正鏈RNA病毒E. 正鏈RNA病毒（逆轉(zhuǎn)錄科的正鏈RNA病毒除外）6. 關(guān)于逆轉(zhuǎn)錄病毒敘述不正確的是（ ） A. 迄今發(fā)現(xiàn)的RNA腫瘤病毒均屬RNA逆轉(zhuǎn)錄病毒B. 嗜肝DNA病毒科屬DNA逆轉(zhuǎn)錄病毒。分段基因組多見于正鏈RNA病毒、負(fù)鏈RNA病毒及雙鏈RNA病毒。②由病毒基因組編碼的衣殼蛋白組成的衣殼。根據(jù)病毒的基因組組成及復(fù)制方式，可將病毒分為如下幾類：DNA病毒（DNA Viruses） 第一組：雙鏈DNA病毒（Group I: dsDNA Viruses）第二組：?jiǎn)捂淒NA病毒（Group II: ssDNA Viruses）RNA病毒（RNA viruses）第三組：雙鏈RNA病毒（Group III: dsRNA Viruses）第四組：正鏈RNA病毒（Group IV: (+)ssRNA Viruses）第五組：負(fù)鏈RNA病毒（Group V: ()ssRNA Viruses）DNA與RNA逆轉(zhuǎn)錄病毒（DNA and RNA Reverse Transcribing Viruses） 第六組：RNA逆轉(zhuǎn)錄病毒（Group VI: RNA Reverse Transcribing Viruses）第七組：DNA逆轉(zhuǎn)錄病毒（Group VII: DNA Reverse Transcribing Viruses）亞病毒因子（Subviral Agents） 衛(wèi)星（Satellites）類病毒（Viroids）朊病毒（Prions）3. 逆轉(zhuǎn)錄病毒基因組RNA在逆轉(zhuǎn)錄后生成的雙鏈DNA中，兩端有長(zhǎng)末端重復(fù)序列（long terminal repeat，LTR）結(jié)構(gòu)。另外，逆轉(zhuǎn)錄病毒基因組利用LTR中的重復(fù)序列形成環(huán)狀結(jié)構(gòu)，在整合酶作用下整合入宿主細(xì)胞基因組內(nèi)。A 分子量和分子構(gòu)像 B 分子量和電荷 C 電荷和分子構(gòu)像 D 分子量4．質(zhì)譜分析技術(shù)主要是用來檢測(cè)蛋白質(zhì)的_______。A 分子和亞基的聚合 B 分子識(shí)別 C 分子自我裝配 D 多酶復(fù)合體 E 分子雜交名詞解釋1． 蛋白質(zhì)組2