【正文】 immunity） 定義：機(jī)體在生命過(guò)程中接受抗原性異物刺激，如微生物感染或接種疫苗后產(chǎn)生的免疫，又稱獲得性免疫(acquired immunity)。特異性：抗原決定簇完全抗原（免疫原）：具免疫原性和反應(yīng)原性的抗原?？乖鶖y抗原決定簇的數(shù)目稱為抗原價(jià)，一般抗原是多價(jià)的。抗原巨噬細(xì)胞T細(xì)胞細(xì)胞免役B細(xì)胞體液免役? 免疫活性細(xì)胞表面有抗原受體，所以能夠識(shí)別抗原。2） 特異性抗原激活的B細(xì)胞被活化后，轉(zhuǎn)化為漿母細(xì)胞，再增殖、分化為漿細(xì)胞，分泌抗體。1） 胞介導(dǎo)的體液免疫：體液中的抗體與相應(yīng)的抗原進(jìn)行特異性結(jié)合，發(fā)揮免疫效應(yīng)的過(guò)程。 （一） 一般規(guī)律 ：抗原、抗體、環(huán)境因素（電解質(zhì)、溫度、酸堿度、補(bǔ)體、白細(xì)胞等）：a抗原抗體的結(jié)合具有特異性； b抗原與抗體是分子表面結(jié)合，一般較穩(wěn)定，但抗原的性質(zhì)不變。（二） 凝集反應(yīng)定義：顆粒性抗原（細(xì)菌、血細(xì)胞）與相應(yīng)抗體在適量電解質(zhì)環(huán)境中相互作用，經(jīng)過(guò)一段時(shí)間出現(xiàn)肉眼可見的凝集現(xiàn)象，稱為凝集反應(yīng)。5. 機(jī)體可通過(guò)哪些方式獲得免疫力？第十一章 微生物的進(jìn)化、系統(tǒng)發(fā)育和分類鑒定大約46億年前，地球形成；大約35億年前，通過(guò)“前生命的化學(xué)進(jìn)化”過(guò)程地球上開始出現(xiàn)生命，主要是些類似簡(jiǎn)單桿狀細(xì)菌的原始生物。分類(classification)：根據(jù)生物特性的特征的相似程度將其分群歸類。第一節(jié) 進(jìn)化的測(cè)量指征一、對(duì)生物類群間的親緣關(guān)系進(jìn)行判斷的主要依據(jù)七十年代以前:表型特征(形態(tài)結(jié)構(gòu)、生理生化、行為習(xí)性等等)和少量的化石資料。b）如果兩群生物同一來(lái)源的大分子的序列基本相同， 處在同一進(jìn)化水平上。4）分子上序列的改變（突變）頻率應(yīng)與進(jìn)化的測(cè)量尺度相適應(yīng)。二、rRNA和系統(tǒng)發(fā)育樹1. rRNA的順序和進(jìn)化培養(yǎng)微生物 提取并純化rRNA rRNA序列測(cè)定 分析比較 微生物之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系2. 特征序列或序列印記（signature sequence）通過(guò)對(duì)r RNA全序列資料的分析比較（特別是采用計(jì)算機(jī)），發(fā)現(xiàn)的在不同種群水平上的特異特征性寡核苷酸序列，或在某些特定的序列位點(diǎn)上出現(xiàn)的單堿基印記。系統(tǒng)樹可能有時(shí)間比例，或者用兩個(gè)結(jié)之間的分枝長(zhǎng)度變化來(lái)表示分子序列的差異數(shù)值。鑒定(identification或determination)：借助于現(xiàn)有的微生物分類系統(tǒng)，通過(guò)特征測(cè)定，確定未知的、或新發(fā)現(xiàn)的、或未明確分類地位的微生物所應(yīng)歸屬分類群的過(guò)程。2） 菌株(strain)：從自然界中分離得到的任何一種微生物的純培養(yǎng)物都可以稱為微生物的一個(gè)菌株；用實(shí)驗(yàn)方法(如通過(guò)誘變)所獲得的某一菌株的變異型，也可以稱為一個(gè)新的菌株，以便與原來(lái)的菌株相區(qū)別。例如：抗原特征的差異分為不同的血清型；對(duì)噬菌體裂解反應(yīng)的不同分為不同的噬菌型等。第三節(jié) 細(xì)菌分類鑒定的特征和技術(shù)生物分類的傳統(tǒng)指標(biāo)：形態(tài)學(xué)特征；生理學(xué)特征；生態(tài)學(xué)特征。一、 形態(tài)學(xué)特征微生物分類和鑒定的重要依據(jù)之一：a）易于觀察和比較，尤其是真核微生物和具有特殊形態(tài)結(jié)構(gòu)的細(xì)菌。若二個(gè)在形態(tài)及生理生化特性方面及其相似的菌株，如果其G+C含量的差別大于5%，則肯定不是同一個(gè)種，大于15%則肯定不是同一個(gè)屬。G+C含量的比較主要用于分類鑒定中的否定。思考題1. 為什么在現(xiàn)代微生物分類中，任何能穩(wěn)定地反映微生物種類特征 的資料，都有分類學(xué)意義，都可以作為分類鑒定的依據(jù)？你知道有哪些項(xiàng)目已被用于細(xì)菌學(xué)分類和鑒定？2. 為什么能用生物大分子作為衡量生物進(jìn)化的標(biāo)尺？有哪些選用原則？建立16 S r RNA系統(tǒng)發(fā)育樹的意義何在？3． 細(xì)菌命名采用的是什么方法？試舉例說(shuō)明。3）血清學(xué)試驗(yàn)4）噬菌體分型第二節(jié) 伯杰氏手冊(cè)《伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》(Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology)美國(guó)賓夕法尼亞大學(xué)的細(xì)菌學(xué)教授伯杰()(18601937)1957年第七版后，由于越來(lái)越廣泛地吸收了國(guó)際上細(xì)菌分類學(xué)家參加編寫(如1974年第八版，撰稿人多達(dá)130多位，涉及15個(gè)國(guó)家；現(xiàn)行版本撰稿人多達(dá)300多人，涉及近20個(gè)國(guó)家)，所以它的近代版本反映了出版年代細(xì)菌分類學(xué)的最新成果，因而逐漸確立了在國(guó)際上對(duì)細(xì)菌進(jìn)行全面分類的權(quán)威地位。在疑難菌株鑒定、新種命名、建立一個(gè)新的分類單位時(shí)，G+C含量是一項(xiàng)重要的、必不可少的鑒定指標(biāo)。二、 核酸的堿基組成和分子雜交特點(diǎn)：與形態(tài)及生理生化特性的比較不同，對(duì)DNA的堿基組成的比較和進(jìn)行核酸分子雜交是直接比較不同微生物之間基因組的差異，因此結(jié)果更加可信。從不同層次(細(xì)胞的、分子的)，用不同學(xué)科(化學(xué)、物理學(xué)、遺傳學(xué)、免疫學(xué)、分子生物學(xué)等)的技術(shù)方法來(lái)研究和比較不同微生物的細(xì)胞、細(xì)胞組分或代謝產(chǎn)物，從中發(fā)現(xiàn)的反映微生物類群特征的資料。二、微生物的命名雙名法：由二個(gè)拉丁字或希臘字或拉丁化了的其它文字組成，一般用斜體表示。3） 型(form或type)：常指亞種以下的細(xì)分。常用的細(xì)菌分類學(xué)術(shù)語(yǔ)：1） 培養(yǎng)物(culture)：一定時(shí)間一定空間內(nèi)微生物的細(xì)胞群或生長(zhǎng)物。1） 生命的第三種形式——古生菌2） 建立16 S r RNA系統(tǒng)發(fā)育樹的意義1）生命的第三種形式——古生菌動(dòng)物界和植物界原核生物和真核生物（20世紀(jì)60年代）古細(xì)菌(archaebacteria)真細(xì)菌(Eubacteria)真核生物(Eukaryotes)（1977，Carl Woese）Bacteria(細(xì)菌)Archaea(古生菌)Eukarya(真核生物)（1990，Carl Woese）原核生物界（Kingdom）域（domain）2）建立16 S r RNA系統(tǒng)發(fā)育樹的意義a）使生物進(jìn)化的研究范圍真正覆蓋所有生物類群；傳統(tǒng)的生物進(jìn)化研究，主要基于復(fù)雜的形態(tài)學(xué)和化石記載，因此多限于研究后生生物(metazoa)，而后者僅占整個(gè)生物進(jìn)化歷程的1/5b）提出了一種全新的正確衡量生物間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的方法；c）對(duì)探索生命起源及原始生命的發(fā)育進(jìn)程提供了線索和理論依據(jù)；d）突破了細(xì)菌分類僅靠形態(tài)學(xué)和生理生化特性的限制，建立了全 新的分類理論；e）為微生物生物多樣性和微生物生態(tài)學(xué)研究建立了全新的研究理 論和研究方法，特別是不經(jīng)培養(yǎng)直接對(duì)生態(tài)環(huán)境中的微生物進(jìn) 行研究。3. 系統(tǒng)發(fā)育樹(phylogenetic tree)通過(guò)比較生物大分子序列差異的數(shù)值構(gòu)建的系統(tǒng)樹稱為分子系統(tǒng)樹，其特點(diǎn)是用一種樹狀分枝的圖型來(lái)概括各種(類)生物之間的親緣關(guān)系。RNA作為進(jìn)化的指征16S rRNA被普遍公認(rèn)為是一把好的譜系分析的“分子尺”：1）rRNA具有重要且恒定的生理功能；2）在16SrRNA分子中，既含有高度保守的序列區(qū)域，又有中度保守和高度變化的序列區(qū)域，因而它適用于進(jìn)化距離不同的各類生物親緣關(guān)系的研究；3）16SrRNA分子量大小適中，便于序列分析；4）rRNA在細(xì)胞中含量大(約占細(xì)胞中RNA的90%)，也易于提??；5）16SrRNA普遍存在于真核生物和原核生物中(真核生物中其同源分子是18SrRNA)。2）在所有物種中該分子的功能是相同的。七十年代后：蛋白質(zhì)、DNA和RNA的結(jié)構(gòu)特征分子計(jì)時(shí)器(molecular chronometers)進(jìn)化鐘(evolutionary clock)1. 生物大分子作為進(jìn)化標(biāo)尺依據(jù)蛋白質(zhì)、RNA和DNA序列進(jìn)化變化的顯著特點(diǎn)是進(jìn)化速率相對(duì)恒定，也就是說(shuō)，分子序列進(jìn)化的改變量(氨基酸或核苷酸替換數(shù)或替換百分率)與分子進(jìn)化的時(shí)間成正比。生物分類的二個(gè)基本原則：a） 根據(jù)表型(phenetic)特征的相似程度分群歸類，這種表型分類重在應(yīng)用，不涉及生物進(jìn)化或不以反映生物親緣關(guān)系為目標(biāo)；b） 按照生物系統(tǒng)發(fā)育相關(guān)性水平來(lái)分群歸類，其目標(biāo)是探尋各種生物之間的進(jìn)化關(guān)系，建立反映生物系統(tǒng)發(fā)育的分類系統(tǒng)。今天仍生存在地球上的生物種類，彼此之間都有或遠(yuǎn)或近的歷史淵源?？乖撼恋碓贵w：沉淀素 疫苗：微生物疫苗：活疫苗、死疫苗、類毒素亞單位疫菌：化學(xué)疫苗、基因工程疫苗抗獨(dú)特性疫苗：抗抗體疫苗是抗原特異性免疫與非特異性免疫的關(guān)系非特異性 免疫特異性免疫協(xié)助抗體殺滅病菌補(bǔ)體B細(xì)胞（抗體）調(diào)理作用協(xié)助抗體形成吞噬細(xì)胞T細(xì)胞結(jié)合病菌后激活補(bǔ)體（細(xì)胞因子）調(diào)理作用（致敏T細(xì)胞：細(xì)胞因子；細(xì)胞毒T細(xì)胞）調(diào)理作用協(xié)助T細(xì)胞分化表面屏障干擾素、溶菌酶NK細(xì)胞思考題1. 病原微生物是怎樣侵害機(jī)體的?為什么說(shuō)感染不是疾病的同義詞？2. 對(duì)細(xì)菌內(nèi)毒素和細(xì)菌外毒素的免疫應(yīng)答有何不同？ 3. 補(bǔ)體、抗體的生物學(xué)功能及免疫應(yīng)答的基本過(guò)程。只有當(dāng)兩者的比例合適才能形成大分子集團(tuán)。第四節(jié) 免疫病理一、超敏反應(yīng)（變態(tài)反應(yīng)）青霉素過(guò)敏：I型變態(tài)反應(yīng)二、自身免疫病三、移植免疫四、免疫缺陷如：人類免疫缺陷病毒（HIV）引起的獲得性免疫缺陷綜合癥（AIDS）第五節(jié) 免疫學(xué)的實(shí)際應(yīng)用一、抗原抗體反應(yīng) 血清學(xué)反應(yīng): 指在體外進(jìn)行的抗原抗體的特異性反應(yīng)， 出現(xiàn)凝集、沉淀等現(xiàn)象。當(dāng)再次受到同種抗原刺激時(shí)，能迅速分化增殖成大量致敏淋巴細(xì)胞和漿細(xì)胞，分別產(chǎn)生大量淋巴因子及抗體，這類免疫細(xì)胞稱為記憶細(xì)胞。2. 反應(yīng)階段：淋巴細(xì)胞識(shí)別抗原后，即被活化進(jìn)行增殖、分化?？贵w是由B細(xì)胞合成并分泌的。 1）抗原免疫原性的物質(zhì)基礎(chǔ)：異物性； 分子量大??； 化學(xué)結(jié)構(gòu)與組成；2）抗原決定簇（antign determinant），或表位（epitope）：抗原物質(zhì)上能夠刺激淋巴細(xì)胞產(chǎn)生應(yīng)答并與其產(chǎn)物特異反應(yīng)的化學(xué)基團(tuán)。特性：免疫原性：抗原在體內(nèi)激活免疫系統(tǒng)，使其產(chǎn)生抗體和特異效應(yīng)細(xì)胞的特性。四、炎癥（inflammatory）定義：炎癥是機(jī)體受到有害刺激時(shí)所表現(xiàn)的一系列局部和全身性防御應(yīng)答，可以看作是非特異性免疫的綜合作用結(jié)果。 吞噬細(xì)胞種類：大吞噬細(xì)胞（單核吞噬細(xì)胞系統(tǒng)）：?jiǎn)魏思?xì)胞（血液中；吞噬作用和形成巨噬細(xì)胞）；巨噬細(xì)胞（組織中；吞噬作用）； 小吞噬細(xì)胞：（嗜）中性粒細(xì)胞（多形核白細(xì)胞）（骨髓、血液中；吞噬作用）：功能：吞噬并銷毀外來(lái)微生物和其他顆粒；巨噬細(xì)胞可分泌多種可溶性因子，不但有加強(qiáng)殺菌促進(jìn)炎癥的作用，還具有免疫調(diào)節(jié)等重要功能；作為抗原提呈細(xì)胞，是特異性免疫的重要組成部分。干擾素誘生機(jī)理干擾素的作用機(jī)制 溶菌酶（lysozyme），主要來(lái)源于吞噬細(xì)胞并可分泌到血清及各種分泌液中，能水解革蘭氏陽(yáng)性菌胞壁肽聚糖而使細(xì)胞裂解。(1)補(bǔ)體激活及激活途徑: 經(jīng)典途徑、替代途徑。 共生菌群：競(jìng)爭(zhēng)必要的營(yíng)養(yǎng)物；產(chǎn)生如象大腸桿菌素、酸類、脂類等抑制物，而抑制多數(shù)具有疾病潛能的細(xì)菌或真菌生長(zhǎng)。第一節(jié) 宿主的非特異性免疫非特異性免疫 non specific immunity（天然免疫 innate immunity）：指機(jī)體對(duì)病原微生物的一般生理防衛(wèi)功能，是在種系發(fā)育過(guò)程中形成的。2）按發(fā)病時(shí)間的長(zhǎng)短分為急性傳染和慢性傳染。帶菌狀態(tài)：如果病原體與宿主雙方都有一定的優(yōu)勢(shì)，但病原體僅被限制于某一局部且無(wú)法大量繁殖，二者長(zhǎng)期處于僵持狀態(tài)，就稱為帶菌狀態(tài)。(4)真菌性中毒：有些真菌在糧食上生長(zhǎng)，人及動(dòng)物食后可因真菌本身或真菌產(chǎn)生的毒素而中毒。（二） 病毒的致病性病毒感染的特點(diǎn)：活細(xì)胞中寄生；基因水平感染。（2）內(nèi)毒素（endotoxin）：革蘭氏陰性細(xì)菌的細(xì)胞壁物質(zhì)，主要成分是脂多糖(LPS)，于菌體裂解時(shí)釋放。特點(diǎn)：是蛋白質(zhì)；抗原性強(qiáng)；具有選擇性，可選擇作用于各自特定的組織器官；毒性作用強(qiáng)，但毒性不穩(wěn)定，對(duì)熱和某些化學(xué)物質(zhì)敏感；不同病原菌產(chǎn)生的外毒素不同，所引起的癥狀也不同。 4）侵襲酶：通過(guò)水解性酶類，使組織疏松、通透性增加，有利于病原菌擴(kuò)散。1 .侵襲力(invasiveness)：病原菌突破宿主防線，并能于宿主體內(nèi)定居、繁殖、擴(kuò)散的能力，稱為侵襲力。專性細(xì)胞內(nèi)感染：所有的病毒、立克次氏體、