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正文內(nèi)容

分子遺傳學(xué)復(fù)習(xí)題-wenkub

2023-05-26 23:51:35 本頁(yè)面
 

【正文】 小體中,阻斷了轉(zhuǎn)錄因子等與DNA 的接觸機(jī)會(huì),核小體起基因轉(zhuǎn)錄抑制子的作用;而核小體之間的自由區(qū)域更有利于這些蛋白因子與其識(shí)別位點(diǎn)的結(jié)合;此外,核小體定位在染色質(zhì)重塑過程中發(fā)生變化,從而明顯地影響基因的表達(dá)水平。 組蛋白修飾(histone modification) :是指染色質(zhì)上的組蛋白被甲基化、乙?;蛄姿峄倪^程。甚至遠(yuǎn)離靶基因達(dá)幾千kb也仍有增強(qiáng)作用。染色質(zhì)重塑因子(chromatin remodeling factor): 依靠水解ATP提供能量來完成染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的改變。密碼子使用的偏好(relative synonymous codon usage,RSCU):編碼同一氨基酸的各個(gè)密碼子的使用頻率在不同生物中并不相同,也不與該氨基酸在整個(gè)蛋白質(zhì)中的頻率成正比,這也就是密碼子使用的偏好現(xiàn)象,該現(xiàn)象可影響基因表達(dá)的效率。焦磷酸化編輯(pyrophosphorolytic editing):RNA聚合酶通過PPi的摻入(聚合反應(yīng)的逆反應(yīng))去除錯(cuò)誤加入的核苷酸,然后加入正常的核苷酸,雖然這種編輯不能區(qū)分正常和錯(cuò)誤的核苷酸,但由于轉(zhuǎn)錄在錯(cuò)誤加入核苷酸后停留時(shí)間過長(zhǎng),而對(duì)其有優(yōu)先校正功能?;瘜W(xué)基因組學(xué)(chemogenomics):它是作為后基因組時(shí)代的新技術(shù),是聯(lián)系基因組和新藥研究的橋梁和紐帶。 反轉(zhuǎn)座子(retroposon)或“反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子(retrotransposon)”:先轉(zhuǎn)錄為RNA再反轉(zhuǎn)錄成DNA而進(jìn)行轉(zhuǎn)座的遺傳元件。特點(diǎn)很象增強(qiáng)子,但不增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄,而是減弱轉(zhuǎn)錄,故稱負(fù)增強(qiáng)子。 比較基因組學(xué)(parative genomics):是一門通過運(yùn)用數(shù)理理論和相應(yīng)計(jì)算機(jī)程序,對(duì)不同物種的基因組進(jìn)行比較分析來研究基因組大小和基因數(shù)量、基因排列順序、編碼序列與非編碼序列的長(zhǎng)度、數(shù)量及特征以及物種進(jìn)化關(guān)系等生物學(xué)問題的學(xué)科。RNA編輯(RNA editing) :是指通過堿基修飾、核苷酸插入或刪除以及核苷酸替換等方式改變RNA的堿基序列的轉(zhuǎn)錄后修飾方式。gRNA (guide RNA):既指導(dǎo)”RNA(gRNA,guide RNA),能通過正常的堿基配對(duì)途徑,或通過G—U配對(duì)方式與mRNA上的互補(bǔ)序列配對(duì),指導(dǎo)編輯的進(jìn)行。分子遺傳學(xué)復(fù)習(xí)題名詞解釋:DNA甲基化(DNA methylation):是指由DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶介導(dǎo),催化甲基基團(tuán)從S腺苷甲硫氨酸向胞嘧啶的C5位點(diǎn)轉(zhuǎn)移的過程。GTAG規(guī)律(GTAG rule):真核生物所有編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因,其RNA前體在內(nèi)含子和外顯子交界處有兩個(gè)較短的保守序列,內(nèi)含子的左端均為GT,右端均為AG,此規(guī)律稱GTAG規(guī)律。RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合體(RNA Induced Silencing Complex,RISC):與siRNA結(jié)合后可識(shí)別并切斷mRNA。表觀遺傳變異(epigenetic variation):基因的堿基序列未發(fā)生改變,而是由于DNA甲基化,組蛋白的乙?;蚏NA編輯等修飾導(dǎo)致基因活性發(fā)生了變化,使基因決定的表型發(fā)生變化,且可遺傳少數(shù)世代,但這種變化是可逆的。 代謝組學(xué)(metabolomics):是對(duì)某一生物或細(xì)胞在一特定生理時(shí)期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物同時(shí)進(jìn)行定性和定量分析的一門新學(xué)科。核酶(ribozyme):具有催化活性的RNA, 即化學(xué)本質(zhì)是核糖核酸(RNA), 卻具有酶的催化功能。它指的是使用對(duì)確定的靶標(biāo)蛋白高度專一的小分子化合物來進(jìn)行基因功能分析和發(fā)現(xiàn)新的藥物先導(dǎo)化合物。酵母雙雜交(yeast twohybrid):利用雜交基因通過激活報(bào)道基因的表達(dá)探測(cè)蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)間的相互作用。母系印跡(maternal imprinting) :來自母本的等位基因(母源等位基因)不表達(dá),而父源等位基因表達(dá)的現(xiàn)象。染色質(zhì)重塑因子在組成及功能上不同,但都包含類Snf2超家族的ATP酶亞基 增強(qiáng)子(enhancer):該DNA序列可增加與其連鎖基因轉(zhuǎn)錄的頻率。轉(zhuǎn)座子沉默(transposon silencing):宿主積累了轉(zhuǎn)座子的多個(gè)拷貝,從而阻遏轉(zhuǎn)座發(fā)生。中心法則(central dogma),指出遺傳信息從DNA傳遞至RNA,再傳遞至多肽。2. 原核生物與真核生物的啟動(dòng)子結(jié)構(gòu)有什么差別?答:原核生物的啟動(dòng)子特點(diǎn):① Pribnow框:TATAAT,位于10左右,是 RNA聚合酶的牢固結(jié)合位點(diǎn)② Sextama框:TTGACA,位于35附近,是 RNA聚合酶的初始結(jié)合位點(diǎn)③ 上述二者及之間的距離決定轉(zhuǎn)錄效率,一般距離17bp左右④ CAP位點(diǎn)是cAMP受體蛋白復(fù)合物在啟動(dòng)子上的的結(jié)合位點(diǎn)真核生物有三類RNA聚合酶,與此對(duì)應(yīng),有三類不同的啟動(dòng)子:① RNA聚合酶Ⅰ識(shí)別的啟動(dòng)子,由起始位點(diǎn)的核心啟動(dòng)子和其上游控制元件兩部分組成。另一種啟動(dòng)子是與常見的啟動(dòng)子相似,又稱上游啟動(dòng)子(upstream promoter)。絕大多數(shù)Ⅱ型轉(zhuǎn)錄酶啟動(dòng)子均含有TATA盒,一致性序列為TATAAAA,常在起始點(diǎn)上游25bp — 30bp區(qū),TATA盒對(duì)有些Ⅱ型轉(zhuǎn)錄酶啟動(dòng)子的功能是十分重要。可極大的提高轉(zhuǎn)錄的效率,但對(duì)其起點(diǎn)、特異性等無(wú)影響。大量的實(shí)驗(yàn)證明這兩大功能域是分開的,但不同轉(zhuǎn)錄因子的活性域其激活方式可能不同。反向平行的β折疊區(qū)含有2個(gè)半胱氨酸,與其后α螺旋中的2個(gè)組氨酸一起與鋅原子結(jié)合,而由鋅原子穩(wěn)定了整個(gè)鋅指結(jié)構(gòu)。多數(shù)HLH附近有一強(qiáng)堿性的氨基酸區(qū)是DNA的識(shí)別和結(jié)合所必需的5 亮氨酸拉鏈的結(jié)構(gòu)域,亮氨酸拉鏈(leucine zipper,ZIP)的雙親α螺旋其疏水面亮氨酸突出,并與另一個(gè)平行的亮氨酸拉鏈蛋白的亮氨酸突出交錯(cuò)排列,盤繞成卷,兩個(gè)右手螺旋互相纏繞,每7個(gè)殘基構(gòu)成一個(gè)完整的重復(fù)單位,因此亮氨酸在拉鏈區(qū)每隔6個(gè)氨基酸殘基重復(fù)出現(xiàn)一次,兩個(gè)蛋白形成同源二聚體或異源二聚體。但也存在轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控,例如反義RNA的調(diào)控,翻譯的調(diào)控,RNA開關(guān)等。5. 轉(zhuǎn)座子的遺傳學(xué)效應(yīng)與應(yīng)用答:① 改變?nèi)旧w結(jié)構(gòu),引起的染色體DNA缺失或倒位;② 誘發(fā)基因突變;③ 調(diào)節(jié)基因表達(dá),很多轉(zhuǎn)座子帶有增強(qiáng)子,有的還含有啟動(dòng)子,能促進(jìn)基因的轉(zhuǎn)錄活性;轉(zhuǎn)座子插入某個(gè)基因的內(nèi)含子或外顯子中而影響該基因表達(dá);④產(chǎn)生新的變異;⑤應(yīng)用轉(zhuǎn)座子標(biāo)記技術(shù),克隆目的基因;⑥以轉(zhuǎn)座因子作為基因工程載體,進(jìn)行轉(zhuǎn)基因等遺傳操作。染色質(zhì)的重塑因子通過利用ATP水解釋放的能量,引起特定核小體位置的改變(滑動(dòng)),或核小體三維結(jié)構(gòu)的改變, 或二者兼有,將核小體重新排布,從高度致密的染色質(zhì)上解開,從而使啟動(dòng)子區(qū)中的順式作用元件得以暴露, 為反式作用因子(轉(zhuǎn)錄因子)與之結(jié)合提供了空間接觸的可能。細(xì)胞中存在著各種不同的染色質(zhì)重塑因子復(fù)合物激活或者沉默基因的表達(dá)。(2)基因打靶是指通過轉(zhuǎn)染的DNA序列與細(xì)胞內(nèi)同源的基因組序列(靶序列)之間進(jìn)行同源重組,以改變靶序列來研究其結(jié)構(gòu)和功能
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