原核生物的轉(zhuǎn)錄及調(diào)控-wenkub
2023-01-28 14:43:06 本頁(yè)面
【正文】 力（ 20220倍 ）； ? 增強(qiáng) 全酶與啟動(dòng)子 R site、 B site的 專一性 結(jié)合力 （ 100倍 ）； ? 導(dǎo)致 RNA鏈的延伸緩慢 Promoter與 σ factor 間的結(jié)合專效性 ● 決定了 strong promoter amp。 +1 10 +10 upstream start point downstream 一、轉(zhuǎn)錄的起始 ? 關(guān)鍵：全酶能以 很高的親和性 結(jié)合在 啟動(dòng)子 promoter ； ? 啟動(dòng)子 ： RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合并起始轉(zhuǎn)錄的一段 DNA序列。 不同原核生物具有 基本相同的核心酶 ，但 σ亞基有所差別 ，決定了原核生物基因的選擇性表達(dá)。 ?下游序列 downstream： 轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)的后面的序列 ，用正數(shù)碼（＋）表示。 第一節(jié) 轉(zhuǎn)錄概述 一、基因的編碼鏈和有意義鏈 ? 模板鏈： 用于轉(zhuǎn)錄 RNA的鏈稱為模板鏈，或負(fù)（－）鏈，又稱無義鏈。原核生物的轉(zhuǎn)錄 及其調(diào)控 RNA transcription and regulation in prokaryotes ? 轉(zhuǎn)錄： 在 DNA指導(dǎo)的 RNA聚合酶催化下，以 DNA鏈的一條鏈為模板，按照堿基配對(duì)原則合成 RNA鏈的過程 。 ? 編碼鏈 ：與模板鏈互補(bǔ)的 DNA鏈稱為編碼鏈，或正（＋）鏈，又稱有義鏈。 ?沒有編號(hào)為○的堿基。 原核生物 RNA聚合酶抑制劑 ： ? 利福平（ Rifampin） ：與細(xì)菌 RNA pol β亞基結(jié)合，阻礙轉(zhuǎn)錄的 起始 作用； ? 利鏈菌素 （ streptolydigin） ： 與細(xì)菌RNA pol β亞基結(jié)合，抑制轉(zhuǎn)錄的 延伸 。 promoter 由兩個(gè)重要部分組成 （一）原核啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu) ● 70 ~ 40 ： up element（ 上游元件） CAPcAMP binding site ● 35 ~ 10： core promoter（ 核心啟動(dòng)子） RNA pol. binding site 基因表達(dá)調(diào)控的正控制位點(diǎn) CAP： Catabolite gene Activator Protein cAMP Acceptor Protein （ cAMP受體蛋白 ） （ 分解代謝基因激活蛋白 ） 核心啟動(dòng)子： Sextama Box： （ R site） TTGAC（ Sextama Box） 35 site。 weak promoter； ★ 35 box, 10 box的差異影響啟動(dòng)子與 RNA pol 中 σ因子的 結(jié)合能力 ； ★ 不同啟動(dòng)子的 35， 10 box間存在較為 保守的標(biāo)準(zhǔn)序列（標(biāo)準(zhǔn)啟動(dòng)子） ； ★ σ factor is responsible for recognition of consensus sequence of promoter and only required for initiation. RNA pol與啟動(dòng)子的結(jié)合 ? σ因子識(shí)別啟動(dòng)子上結(jié)合位點(diǎn)。 ? mRNA的起始位點(diǎn)多為 G， 其次為 A ， 很少為 U, 起始點(diǎn)核苷酸的兩側(cè)分別為 C 和 T。 Model of the interaction between E. coil RNA polymerase holoenzyme and a promoter DNA Incorporating the first few Nt 二、原核生物轉(zhuǎn)錄的延伸 ? RNA pol沿著模板鏈移動(dòng)， RNA鏈不斷延伸，并保持三元復(fù)合物的結(jié)構(gòu)； ? 轉(zhuǎn)錄泡中的 DNA螺旋前開、后合， RNA延長(zhǎng)，不斷脫離 DNA； ? RNA鏈的延伸速度不是恒定的，在模板富含GC的區(qū)域，轉(zhuǎn)錄就會(huì)減慢 /停頓。 NusA protein ： ★ 69 Kd, acid protein ★ RNApolattaching factor ★ Impel RNApol. pausing in terminator for 1’15’ and waiting for Rho factor t
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