并行計(jì)算機(jī)與并行計(jì)算-wenkub
2022-10-23 09:51:08 本頁(yè)面
【正文】 ead OpenMP ?消息傳遞 的模型和語(yǔ)言 (適于 MPP, Cluster, COW) MPI (Fortran, C, Gamess, Vasp) PVM (Fortran, C) ?數(shù)據(jù)并行 的模型和語(yǔ)言 (適于在 MPP/Cluster上實(shí)現(xiàn) SPMD應(yīng)用 ) Fortran 90 HPF(High Performance Fortran) 并行模型的分類 Center of Computational Chemistry 基于程序構(gòu)造的模型 ?CSP ?Linda （ Fortran, C, Gaussian） ?Global (Molpro， Columbus) 基于問(wèn)題描述的模型 ?GAMMA ?UNITY 基于并行計(jì)算理論的模型 ?PRAM ?BSP ?LogP Center of Computational Chemistry Yale 大學(xué) Nicholas Carriero 和 David Gelernter 于 1986年基于分散數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和共享存儲(chǔ)系統(tǒng)的并行計(jì)算模型 . Linda模型定義了一個(gè)功能強(qiáng)大的邏輯存儲(chǔ)器 (TS)和在其上的一組核心操作 (in, out, read, eval), 它們能夠方便地嵌入到不同的語(yǔ)言 (如 , C, Fortran)中而構(gòu)成相應(yīng)的并行語(yǔ)言 (CLinda和 FortranLinda等 ) 該模型同時(shí)還支持動(dòng)態(tài)程序設(shè)計(jì)和兩種不同的編程風(fēng)格 (Master/Slaver和 DivideandConquer),為用戶開(kāi)發(fā)不同類型 的應(yīng)用程序提供了靈活的手段 . Linda模型 Center of Computational Chemistry （進(jìn)程從 TS中提取任務(wù)或數(shù)據(jù)進(jìn)行計(jì)算 , 并將結(jié)果或生成的新任務(wù)放入 TS中 . 并行執(zhí)行 的進(jìn)程之間通過(guò) TS進(jìn)行間接的通信和同步 . TS是一個(gè)可被多個(gè)進(jìn)程共享的、能同時(shí)存放 數(shù)據(jù)和任務(wù)的數(shù)據(jù)箱） TS 共享數(shù)據(jù)箱 進(jìn)程 2 進(jìn)程 4 進(jìn)程 3 進(jìn)程 1 Center of Computational Chemistry Linda模型的應(yīng)用 － Linda in Gaussian HF: SP Opt Freq MP2: Sp Opt Freq DFT: SP Opt Freq － 可以將串行代碼改編為并行代碼 支持 C和 Fortran語(yǔ)言 Center of Computational Chemistry MPI已經(jīng)成為一種標(biāo)準(zhǔn)，應(yīng)用越來(lái)越廣泛。Center of Computational Chemistry 并行計(jì)算機(jī)與并行計(jì)算 張?chǎng)? 理論與計(jì)算化學(xué)國(guó)際合作研究中心 分子反應(yīng)動(dòng)力學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 Center of Computational Chemistry 情況介紹 分子反應(yīng)動(dòng)力學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 交叉分子束動(dòng)力學(xué)課題組 理論與計(jì)算化學(xué)國(guó)際合作中心 研究員 2人，其中一位為中國(guó)科學(xué)院院士，高級(jí)訪問(wèn)學(xué)者 1人，博士后研究人員 6人， 博士研究生 18人，碩士研究生 4人 與多個(gè)國(guó)際學(xué)術(shù)團(tuán)隊(duì)有很好的合作，與紐約大學(xué)化學(xué)系張?jiān)鲚x教授合作建立理論與 計(jì)算化學(xué)國(guó)際合作研究中心 Center of Computational Chemistry 主要研究工作 實(shí)驗(yàn)方面： 交叉分子束對(duì)光解，碰撞反應(yīng)，立體化學(xué)動(dòng)力學(xué)的研究 激光誘導(dǎo)熒光方法對(duì)光解，立體化學(xué)動(dòng)力學(xué)的研究 飛秒激光對(duì)超快動(dòng)力學(xué)過(guò)程的研究 理論方面： 準(zhǔn)經(jīng)典軌線方法對(duì)反應(yīng)動(dòng)態(tài)學(xué)的研究 量子力學(xué)方法對(duì)反應(yīng)動(dòng)態(tài)學(xué)的研究 復(fù)雜體系勢(shì)能面的構(gòu)造，擬和 量子化學(xué)及其他方法對(duì)分子結(jié)構(gòu)，物質(zhì)特性，化學(xué)反應(yīng)過(guò)程的研究 19972020年，發(fā)表文章 84篇，其中英文 66篇 Center of Computational Chemistry HPC Server Center of Computational Chemistry 并行計(jì)算機(jī)與并行計(jì)算 1 為什么要建造并行計(jì)算機(jī) 2 并行計(jì)算機(jī)的類型 3 什么是并行計(jì)算，并行進(jìn)程的特性及并行模型的分類 4 工作站集群 (COW)的基本結(jié)構(gòu) 5 中國(guó)科學(xué)院十五計(jì)劃中關(guān)于并行計(jì)算部分 Center of Computational Chemistry 為什么要建造并行計(jì)算機(jī) Center of Computational Chemistry 什么是超級(jí)計(jì)算環(huán)境 超級(jí)計(jì)算（ Superputing）， 從技術(shù)的意義上說(shuō)，是為了在問(wèn)題的求解上具有更快的速度、更高的精度、更大的規(guī)模、更好的性能價(jià)格比而采用的非主流計(jì)算的設(shè)施和方式。而最流行的 MPI工具集當(dāng)屬 mpich〔
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