國家人類重大疾病的蛋白質(zhì)組學(xué)研究開發(fā)計(jì)劃-wenkub
2023-05-20 02:51:59 本頁面
【正文】 肝炎 — 肝纖維化 肝硬化 — 肝癌 的蛋白質(zhì)表達(dá)譜變化規(guī)律和蛋白質(zhì)群的相互作用網(wǎng)絡(luò)。 ? 建立造血干 /祖細(xì)胞發(fā)育、分化的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖，并建立相應(yīng)的轉(zhuǎn)錄組 蛋白質(zhì)組聯(lián)合數(shù)據(jù)庫。 承擔(dān)單位： 復(fù)旦大學(xué)，中科院長春應(yīng)用化學(xué)所 課題負(fù)責(zé)人及主要學(xué)術(shù)骨干： 霍克克 、 楊秀榮 、李育陽、 王建國 專題 2: 重 要生理、病理體系的功能蛋白質(zhì)組學(xué)研究 預(yù)期目標(biāo) ：通過對造血系統(tǒng)（如胎肝和 CD34+造血干 /祖細(xì)胞細(xì)胞）表達(dá)譜、蛋白質(zhì)功能連鎖圖、物理連鎖圖和一批新型蛋白的功能研究，揭示重要生理、病理體系的功能蛋白質(zhì)組變化規(guī)律，發(fā)現(xiàn)或確認(rèn)一批（ 500 種以上）人類新型蛋白質(zhì)，加深對生命基本活動的全面認(rèn)識，為重大疾病的比較蛋白質(zhì)組研究以及新型生物制劑開發(fā)奠定基礎(chǔ)。 研究 表面等離子體共振譜、 電化學(xué)發(fā)光 /熒光和生物傳感器的超微量蛋白質(zhì)及其相互作用信息的檢測技術(shù)。 ? 研究和建立以多維多模式 色譜 /電泳 — 生物質(zhì)譜為主的新技術(shù)平臺。 ? 研究和發(fā)展蛋白質(zhì)復(fù)合體 親 和提取或免疫親和沉淀一維凝膠電泳 質(zhì)譜鑒定新方法 。 （具體說明每個課題的主要研究內(nèi)容、目標(biāo)、承擔(dān)單位、課題負(fù)責(zé)人及主要學(xué)術(shù)骨干、經(jīng)費(fèi)比例等） 專題 1: 蛋白質(zhì)組學(xué)支撐技術(shù)體系的研究 預(yù)期目標(biāo)： 建立高通量、規(guī)模化、高靈敏度、高準(zhǔn)確性的蛋白質(zhì)組 組分譜研究的技術(shù)平臺與蛋白質(zhì)組 功能譜研究和功能蛋白質(zhì)篩選的技術(shù) 體系，并應(yīng)用于項(xiàng)目組重大疾病相關(guān)蛋白質(zhì)的研究。 選擇與人類重大疾病和人類重要生命活動緊密相關(guān)的系統(tǒng)、器官、細(xì)胞，如已有轉(zhuǎn)錄組基礎(chǔ)的胎肝和造血 CD34+細(xì)胞體系，研究這 2 種組織和細(xì)胞系的重 要生理 /病理體系或過程的蛋白質(zhì)表達(dá)譜和蛋白質(zhì)連鎖群。應(yīng)用上述平臺支撐人類重大疾病蛋白質(zhì)組研究。 具體的研究內(nèi)容可以概括為：支撐技術(shù)平臺的整合及其規(guī)范化、高通量化，復(fù)雜蛋白質(zhì)組樣品高效分離、規(guī)模鑒定的新技術(shù)與新方法，蛋白質(zhì)相互作用及蛋白質(zhì)功能網(wǎng)絡(luò)的分析技術(shù)體系，蛋白質(zhì)組的生物信息學(xué)研究；造血系統(tǒng)蛋白質(zhì)表達(dá)譜的繪制及其轉(zhuǎn)錄組 蛋白質(zhì)組的比較研究，造血系統(tǒng)重要蛋白質(zhì)復(fù)合體中蛋白質(zhì)的功能連鎖圖和物理連鎖圖繪制，重要蛋白質(zhì)復(fù)合體新型蛋白的規(guī)模化研究；肝臟病毒感染 肝硬變 肝癌發(fā)生發(fā)展相關(guān)的功能蛋白質(zhì)組研究， 腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)的功能蛋白質(zhì)組學(xué)研究， 神經(jīng)系統(tǒng)疾病和損傷修復(fù)的功能蛋白質(zhì)組學(xué)研究， 以及 心血管疾病的蛋白質(zhì)組學(xué)研究。 研究和建立具有國際先進(jìn)水平的高通量、高靈敏度、高準(zhǔn)確性、高穩(wěn)定性的蛋白質(zhì)組學(xué)研究技術(shù)平臺。 研究和建立蛋白質(zhì)組學(xué)的生物信息學(xué)技術(shù)體系、蛋白 質(zhì)組系列數(shù)據(jù)庫、蛋白質(zhì)組功能連鎖群分析的理論模型及相應(yīng)算法 ，包括：通用數(shù)據(jù)庫、結(jié)構(gòu)域數(shù)據(jù)庫、二維電泳圖數(shù)據(jù)庫、翻譯后修飾數(shù)據(jù)庫、三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫、集成基因組數(shù)據(jù)庫、代謝通路數(shù)據(jù)庫、知識庫等。闡明胎肝、造血系統(tǒng)基因轉(zhuǎn)錄和翻譯調(diào)控的規(guī)律及其生理意義，發(fā)現(xiàn)并確認(rèn)一批人源新基因，建立功能蛋白質(zhì)群及其蛋白質(zhì)功能連鎖圖和物理連鎖圖，并揭示其對造血系統(tǒng)功能的影響。 課題 1. 支撐技術(shù)平臺的整合及其規(guī)范化、高通量化 研究和建立與質(zhì)譜相匹配的高靈敏銀染方法，提高 二維凝膠電泳分離與鑒定的效率 ；建立功能蛋白質(zhì)翻譯后修飾分析鑒定的新方法； 研究蛋白質(zhì)樣品的 全息制備和展現(xiàn)技術(shù)、 預(yù)處理與分離富集技術(shù)。 ? 發(fā)展和應(yīng)用多維色譜 質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)。 ? 重點(diǎn)研究和建立多維共柱色譜 電噴霧質(zhì)譜混合蛋白酶解肽的二維分離鑒定、毛細(xì)管等電聚焦 電噴霧質(zhì)譜蛋白二維分離鑒定和多維多模式色譜 /電泳 /激光熒光與電噴霧質(zhì)譜的蛋白二維分離鑒定平臺。 ? 發(fā)展以高通量酵母雙雜交為主的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)分析技術(shù)平臺。 課題 4. 胎肝及造血干 /祖細(xì)胞的發(fā)育、分化調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的建立 通過高分辨的蛋白質(zhì)分離、純化和鑒定技術(shù)，高通量酵母雙雜交、生物傳感器、生物信息學(xué)等手段研究肝臟、造血系統(tǒng)內(nèi) 重要蛋白質(zhì)復(fù)合體中蛋白質(zhì)的相互關(guān)系，繪制出功能連鎖圖和物理連鎖圖，并研究其蛋白質(zhì)相互作用在一些重要生理活動（如系統(tǒng)遷移、定居等）中的功能。 ? 發(fā)現(xiàn)一批具有醫(yī)學(xué)價值的重要新型蛋白質(zhì)。 ? 鑒定導(dǎo)致肝細(xì)胞從肝炎病毒感染經(jīng) 肝纖維化、 肝硬化進(jìn)展為肝癌的重要蛋白質(zhì)群，系統(tǒng)認(rèn)識該疾病過程中蛋白質(zhì)組演變的內(nèi)在規(guī)律。以一種全新的脊髓組分損傷模型為基礎(chǔ)，探討脊髓損傷、修復(fù)的分子機(jī)理；通過誘導(dǎo)成熟神經(jīng)元分裂的比較蛋白質(zhì)組學(xué)分析，初步闡明誘導(dǎo)神經(jīng)元分裂的蛋白質(zhì)組機(jī)制。 ? 利用已建立的中國人心血管健康資源庫及心血管病病人的樣品庫，分析其在不同健康狀況下的蛋白質(zhì)譜。 ? 應(yīng)用我國特色的人源腫瘤（如白血病，鼻咽癌），發(fā)現(xiàn)腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)的蛋白質(zhì)群及其相互作用網(wǎng)絡(luò)； ? 比較不同時程、不同狀 態(tài)腫瘤病人血樣、尿樣的蛋白質(zhì)組規(guī)律性變化，發(fā)現(xiàn)可用于惡性腫瘤預(yù)警、早期診斷、治療靶標(biāo)的標(biāo)志蛋白； 承擔(dān)單位： 湖南師范大學(xué) 課題負(fù)責(zé)人及主要學(xué)術(shù)骨干： 梁宋平 、黃秋花、丁彥青 專題 4: 蛋白質(zhì)組的生物信息學(xué)研究 預(yù)期目標(biāo)： 研發(fā)大規(guī)模、高通量的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)自動化注釋系統(tǒng)， 建立與蛋白質(zhì)組學(xué)研究相關(guān)并與國際相關(guān)數(shù)據(jù)庫接軌的數(shù)據(jù)庫及其服 務(wù)體系。 ? 蛋白質(zhì)組系列 數(shù)據(jù)庫與服務(wù)系統(tǒng) 的 建立 。 ? 大規(guī)模、高通量的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)自動化注釋系統(tǒng)研發(fā)。闡明胎肝、造血系統(tǒng)基因轉(zhuǎn)錄和翻譯調(diào)控的規(guī)律及其生理意義，發(fā)現(xiàn)并確認(rèn)一批人源
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