蛋白質(zhì)4生物化學(xué)復(fù)習(xí)資料(已修改)
2025-01-06 19:38 本頁(yè)面
【正文】 2 蛋白質(zhì)化學(xué) ? 一級(jí)結(jié)構(gòu) (ρ41） : 氨基酸序列和二硫鍵的位置 ? 二級(jí)結(jié)構(gòu) (ρ57） ：主鏈規(guī)律的空間排列 (α 螺旋 , β 折疊 ) 超二級(jí)結(jié)構(gòu) 結(jié)構(gòu)域（ domain） ? 三級(jí)結(jié)構(gòu) (ρ70） ：所有原子空間位置 ? 四級(jí)結(jié)構(gòu) (ρ83） ：多肽鏈間的相互關(guān)系 ? 維持蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的因素 上節(jié)回顧 氨基酸 肽 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的關(guān)系 蛋白質(zhì)的重要性質(zhì) 蛋白質(zhì)的分類(lèi) 蛋白質(zhì)的分離與鑒定 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與 功能的關(guān)系 一、一級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系 (ρ49) 二、空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系 一級(jí)結(jié)構(gòu)的種屬差異與分子進(jìn)化 一級(jí)結(jié)構(gòu)的變異與分子病 核糖核酸酶 肌紅蛋白和血紅蛋白的結(jié)構(gòu)與功能 瘋牛病 一級(jí)結(jié)構(gòu)的種屬差異與分子進(jìn)化 細(xì)胞色素 c是一種進(jìn)化上高度保守的蛋白質(zhì)，在植物、動(dòng)物和許多單細(xì)胞生物中存在。 同源蛋白質(zhì) (homologous proteins)：來(lái)自不同種類(lèi)生物、而序列和功能類(lèi)似的蛋白質(zhì)。 馬 不變殘基：對(duì)于同源蛋白的功能是必需的 可變殘基：變換不影響蛋白質(zhì)的功能 黑猩猩 響尾蛇 鯉魚(yú) 蝸牛 酵母 蛾 花椰菜 羊 進(jìn)化距離越遠(yuǎn)，同源蛋白質(zhì)的殘基差異數(shù)越多。 歐洲防風(fēng) 根據(jù)細(xì)胞色素 C的順序種屬差異建立起來(lái)的進(jìn)化樹(shù) 序列比較提供蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的信息 BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)程序： 程序 數(shù)據(jù)庫(kù) 查詢(xún) 內(nèi)容 Blastp 蛋白質(zhì) 蛋白質(zhì) 使用取代矩陣尋找較遠(yuǎn)的關(guān)系：可以進(jìn)行 SEG過(guò)濾。 Blastn 核苷酸 核苷酸 尋找較高分值的匹配，對(duì)較遠(yuǎn)關(guān)系不太適用。 Blastx 核苷酸 (翻譯 ) 蛋白質(zhì) 對(duì)于新的 DNA序列和 ESTs的分析極為有用。 Tblastn 蛋白質(zhì) 核苷酸 (翻譯 ) 對(duì)于尋找數(shù)據(jù)庫(kù)中沒(méi)有標(biāo)注的編碼區(qū)極為有用。 tblastx 核苷酸 (翻譯 ) 核苷酸 (翻譯 ) 對(duì)于分析 EST極為有用。 blastp:將待查詢(xún)的蛋白質(zhì)序列及其互補(bǔ)序列一起對(duì)蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行查詢(xún)； blastn:將待查詢(xún)的核酸序列及其互補(bǔ)序列一起對(duì)核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行查詢(xún)； blastx:先將待查詢(xún)的核酸序列按 6種可讀框架 (逐個(gè)向前 3個(gè)堿基和逐個(gè)向后 3個(gè)堿基讀碼 )翻譯成蛋白質(zhì)序列，然后將翻譯結(jié)果對(duì)蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行查詢(xún)； tblastn:先將核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)中的核酸序列按 6種可讀框架翻譯成蛋白質(zhì)序列，然后將待查詢(xún)的蛋白質(zhì)序
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