蛋白質(zhì)組學(xué)ppt課件(已修改)
2025-05-15 06:01 本頁面
【正文】 蛋白質(zhì)組學(xué) Proteomics 劉清梅 陜西師范大學(xué)生命科學(xué)院 參考書目 ? 蛋白質(zhì)組學(xué)：理論與方法，錢小紅、賀福初主編，科學(xué)出版社 ? 蛋白質(zhì)組學(xué)：從序列到功能，錢小紅主編，科學(xué)出版社 ? 蛋白質(zhì)化學(xué)與蛋白質(zhì)組學(xué)，夏其昌等主編，科學(xué)出版社 ? 蛋白質(zhì)芯片， Mark Schena著，科學(xué)出版社 教學(xué)內(nèi)容 第一章 序論 第二章 蛋白質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)和功能 第三章 蛋白質(zhì)組研究方法 第四章 蛋白質(zhì)組學(xué)研究工具 —一維和二維電泳 第五章 蛋白質(zhì)組學(xué)研究工具 —生物質(zhì)譜技術(shù) 第六章 蛋白質(zhì)翻譯后修飾的鑒定 第七章 定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究技術(shù) 第八章 蛋白質(zhì)組研究中的生物信息學(xué) 第九章 細(xì)胞器與蛋白質(zhì)復(fù)合體組成分析 第十章 蛋白質(zhì)間連鎖圖的建立 第一章 序論 CHAPTER 1 Introduction 功能基因組與蛋白質(zhì)組 ? 基因研究是 20世紀(jì)生命科學(xué)的主線 20世紀(jì)上半葉， DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的提出； 20世紀(jì)下半葉， “ 中心法則 ” 的問世； 20世紀(jì) 90年代，全球性基因組計(jì)劃尤其是人類基因組計(jì)劃（ HGP）的推進(jìn)。 ? “ 后基因組時(shí)代 ” （ postgenome era） 功能基因組學(xué) （ functional genomics)成為研究的重心， 蛋白質(zhì)組學(xué) （ proteomics）則是其“ 中流砥柱 ” And now for the proteome (Nature 409:747, 2022) Proteomics in genomeland (Science 291:1221, 2022) 第一節(jié) 人類基因組計(jì)劃 與蛋白質(zhì)組研究的歷史背景 一、基因組計(jì)劃的成就 ? 人類基因組計(jì)劃（ HGP）： “ 生命登月計(jì)劃 ” ? 、 16日，國(guó)際人類基因組計(jì)劃與美國(guó)Celera公司分別在 Nature、 Science上公布人類基因組草圖 ? 截至 2022年初，已有至少 75種生物的基因組全序列測(cè)定完成 ? 基因序列數(shù)據(jù)為生命科學(xué)多層次、多分支的研究提供了豐富的寶藏 二、基因組計(jì)劃的局限 ? 基因組計(jì)劃： 遺傳圖、物理圖、全序列圖 ? 真核生物：基因結(jié)構(gòu)復(fù)雜；現(xiàn)有基因識(shí)別理論與技術(shù)發(fā)展的嚴(yán)重不足（ ORF的確定等） ? 基因調(diào)控：時(shí)空特異性 ? 基因與其編碼的蛋白的線性對(duì)應(yīng)關(guān)系只存在于新生肽鏈而不是最終的功能蛋白中 ? 基因是遺傳信息的源頭，但功能性蛋白才是基因功能的執(zhí)行體 三、蛋白質(zhì)研究技術(shù)方法的突破 ? 二維電泳（ 2DE）：大規(guī)模蛋白質(zhì)的分離 ? 大型圖像分析系統(tǒng)與軟件的發(fā)展 ? 大規(guī)模樣品處理系統(tǒng) ? 高壓液相色譜分析（ HPLC） ? 激光解吸質(zhì)譜（ LIDMS) ? 電噴霧質(zhì)譜（ ESIMS） ? 肽質(zhì)量指紋圖譜 (PMF)與肽序列標(biāo)簽技術(shù)(PST)：準(zhǔn)確、快速、自動(dòng)化、大規(guī)模 第二節(jié) 蛋白質(zhì)組研究 的開端及其含義 一、蛋白質(zhì)組研究的開端 二、蛋白質(zhì)組的含義 ? MR: PROTEOME—“PROTEin”與“ genOME ”的雜合，意旨“一種基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì)” ? “ proteome”代表一完整生物的全套蛋白質(zhì) ? P認(rèn)為“ proteome”反映不同細(xì)胞的不同蛋白質(zhì)組合 ? “ proteome” 三種不同的含義：一個(gè)基因組、一種生物或一種細(xì)胞 /組織所表達(dá)的全套蛋白質(zhì) 三、蛋白質(zhì)研究技術(shù)與基本路線 ? 蛋白質(zhì)組研究的宗旨－－將組織或細(xì)胞所有蛋白質(zhì)（至少是大部分）分離與鑒定 ? 雙向電泳（ 2－ DE）： IPGDALT等 ? 圖像分析系統(tǒng)： ELSIE 4amp。 gellab I amp。II等
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