微生物分類-文庫吧
2024-12-17 14:50 本頁面
【正文】 70年代以后 ， 對細(xì)菌進(jìn)行全面分類的 、 影響最大的是 《 伯杰氏手冊 》 。 所以該書目前已成為對細(xì)菌進(jìn)行分類鑒定的主要參考書 。 根據(jù)現(xiàn)代生物進(jìn)化論觀點(diǎn) ： 進(jìn)化（ evolution） 是生物與其生存環(huán)境相互作用過程中，其遺傳系統(tǒng)隨時(shí)間發(fā)生一系列不可逆的改變，在大多數(shù)情況下，導(dǎo)致生物表型改變和對生存環(huán)境的相對適應(yīng)。 ? 系統(tǒng)發(fā)育 （ phylogeny） 就指的是研究各類微生物進(jìn)化的歷史 。 ? 對生物進(jìn)行分類存在兩種基本的、截然不同的 分類原則： ? 一是根據(jù)表型 (pheic)特征的相似 分群歸類，這種表型分類重在應(yīng)用，不涉及生物進(jìn)化或不以反映生物親緣關(guān)系為目標(biāo)； ? 第二種分類原則是要按照生物系統(tǒng)發(fā)育相關(guān)性水平來分群歸類，其目標(biāo)是探尋各種生物之間的進(jìn)化關(guān)系，建立反映生物系統(tǒng)發(fā)育的分類系統(tǒng)。 因此，以進(jìn)化論為指導(dǎo)思想的分類學(xué)(taxonomy)，其目的已經(jīng)不僅僅是物種的識(shí)別和歸類，其主要目標(biāo)是通過追溯系統(tǒng)發(fā)育，推斷進(jìn)化譜系，這樣的分類學(xué)也稱之為 生物系統(tǒng)學(xué) (syatematics)。 分子生物學(xué)的發(fā)展 ， 使我們不僅可以根據(jù) 表型特征 ， 而且可以從 分子水平 上 ， 通過研究和比較微生物乃至整個(gè)生物界的 基因型特征來探討 生物的進(jìn)化 、 系統(tǒng)發(fā)育 和 進(jìn)行分類鑒定 。 進(jìn)化的測量指征 ? 20世紀(jì) 70年代以前，生物類群間的親緣關(guān)系主要是根據(jù) 形態(tài)結(jié)構(gòu)、生理生化、行為習(xí)性 等表型特征以及少量的化石資料來判斷它們之間的親緣關(guān)系。 根據(jù)形態(tài)學(xué)特征推斷生物之間的親緣關(guān)系存在兩個(gè)突出問題： ? 一是由于微生物可利用的形態(tài)特征少，很難把所有生物放在同一水平上進(jìn)行比較； ? 二是形態(tài)特征在不同類群眾中進(jìn)化速度差異很大，僅根據(jù)形態(tài)推斷進(jìn)化關(guān)系往往不準(zhǔn)確。 20世紀(jì) 70年代以后研究為生物的系統(tǒng)發(fā)育 ， 主要是分析和比較生物大分子的結(jié)構(gòu)特征 ，特別是 蛋白質(zhì) 、 RNA和 DNA這些反映生物基因組特征的分子序列 ， 作為判斷各類微生物乃至所有生物進(jìn)化關(guān)系的主要特征 。 ? rRNA作為進(jìn)化的指征 大量的實(shí)驗(yàn)研究表明：在眾多的生物大分子中，最適合于揭示各類生物親緣關(guān)系的是rRNA,尤其是 16SrRNA。 16SrRNA所以被普遍公認(rèn)是一把好的譜系分析的“分子尺”， 這是因?yàn)椋? ? ① rRNA參與生物蛋白質(zhì)的合成過程，其功能是任何生物都必不可少的，而且在生物進(jìn)化的漫長歷程中，其功能保持不變； ? ②在 16SrRNA分子中，即含有高度保守的序列區(qū)域，又有中度保守和高度變化的序列區(qū)域，因而它適用于進(jìn)化距離不同的各類生物親緣關(guān)系的研究； ? ③ 16SrRNA相對分子質(zhì)量大小適中，便于序列分析； ? ④ 16SrRNA普遍存在于真核生物和原核生物中（真核生物中其同源分子是 18SrRNA）。 rRNA的順序和進(jìn)化 rRNA序列測定和分析方法分兩類：寡核苷酸編目法和全序列分析法 。 1. 寡核苷酸編目分析法 20世紀(jì) 80年代以前的研究 ,主要是采用寡核苷酸編目分析法 。 但只獲得了 16SrRNA
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