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正文內(nèi)容

質(zhì)粒dna提取純化與驗證-文庫吧

2025-06-04 05:09 本頁面


【正文】 電泳遷移速度越快,因此,相對分子質(zhì)量越大,選用的凝膠濃度應越低。4)電泳所用電場:低電壓條件下,線性DNA片段的遷移速率與所用電壓成正比,電壓越高,帶電顆粒泳動越快,但隨著電場強度的增加,不同長度DNA泳動的增加程度不同,因此凝膠電泳分離DNA的有效范圍隨著電壓上升而減少。為了獲得DNA片段的最佳分離效果,電場強度應小于5 V/cm。5)緩沖液:緩沖液的組成和離子強度直接影響遷移率。當電泳液為去離子水(如不慎誤用去離子水配制凝膠),溶液的導電性很少,帶電顆粒泳動很慢,DNA幾乎不移動;而在高離子強度下(如錯用10電泳緩沖液),導電性極高,帶電顆粒泳動很快,產(chǎn)生大量的熱,有時甚至熔化凝膠或使DNA變性。電泳時常用的緩沖液有乙酸鹽(TAE)、硼酸鹽(TBE)和磷酸鹽(TPE)幾種不同的緩沖液,通常配制成10或5的濃度母液保存于室溫下,用時稀釋至工作濃度。TAE緩沖液緩沖能力弱,長時間電泳緩沖能力逐漸喪失(陽極變堿性,陰極變酸性),長時間電泳需要更換緩沖液。TAE緩沖液可以分離數(shù)KB長度的DNA,在精致DNA片段以及染色體DNA進行雜交時經(jīng)常使用。 6)溫度:瓊脂糖凝膠電泳時,不同大小DNA片段的相對電泳遷移率在4~30℃內(nèi)無變化,一般瓊脂糖凝膠電泳多在室溫下進行,而當瓊脂糖含量少于0.5%時,凝膠很脆弱,最好在4℃下電泳以增加凝膠強度?!緦嶒瀮x器、材料及試劑】 儀器和材料接種環(huán),培養(yǎng)皿,酒精燈,恒溫振蕩培養(yǎng)箱,高速冷凍離心機,漩渦振蕩器,微量移液器及多型號槍頭,微波爐,電泳儀等菌體: DH5α受體菌,具有Ampr標記的質(zhì)粒pUC19。Maker: λ/Hind III DNA Maker DL2000 DNA Maker 點樣對照組: pUC19/ Hind II雙鏈線性DNA PUC19(商品) λDNA 實驗試劑LB培養(yǎng)基,抗生素(氨芐青霉素),溶液Ⅰ,溶液Ⅱ,溶液Ⅲ,3mol/L NaAc溶液,預冷無水乙醇,70%乙醇溶液,RNase A母液,TE緩沖液,飽和酚,氯仿/異戊醇混合液,酚/氯仿/異戊醇(PCI)混合液,TAE電泳緩沖液(10),溴化乙錠(EB),上樣緩沖液(6)。溶液Ⅰ:50mM葡萄糖,25mM TrisHCl(pH ),10mM EDTA(pH )。(1M TrisHCl, pH ; EDTA 10ml pH ,加ddH2O至500ml。在121℃高壓滅菌15min ,貯存于4℃)。溶液Ⅱ: NaOH,1% SDS。(使用前用10M的NaOH和10%的SDS母液配置,防止NaOH吸收空氣中的H2O和CO2而減弱了堿性)。溶液Ⅲ:5M醋酸鉀(KAc)緩沖液60ml,,溶液中濃度K+3M,Ac5M?!緦嶒灢襟E】擴增質(zhì)粒(菌體培養(yǎng)) 1) DH5α菌,37℃恒溫倒置培養(yǎng)1618hr;之后,挑取單菌落,接種于20ml LB液體培養(yǎng)基(含Ampr80ug/ml)中,37℃,220rpm振蕩培養(yǎng)過夜1214hr;再轉(zhuǎn)接一次,進行50或100倍稀釋,同樣37℃,220rpm振蕩培養(yǎng)46hr。2)對50mL的離心管稱重(記為m1),取菌液30ml配平,6000rpm離心5min,棄去上清液;加入5ml溶液Ⅰ混勻,6000rpm離心5min,棄去上清液。取離心管稱重(記為m2),可測得菌體重量W=m2m1。提取質(zhì)粒 1)向離心管中加入溶液Ⅰ(),漩渦混勻后,冰浴5min; 向離心管中加入溶液Ⅱ(),輕柔顛倒混勻后,冰浴5min; 向離心管中加入溶液Ⅲ(),輕柔顛倒混勻后,冰浴5min;離心管配平,12000rpm離心15min,取上清至新50ml離心管(記體積為v1) 2)加入2v1冰乙醇,顛倒混勻,20℃保存30min,12000rpm離心15min,棄上清液,將離心管倒置于紙巾上,以使所有液體流出。向沉淀中加入5mL70%乙醇進行洗滌,12000rpm離心2min,棄去上清液,重復洗滌一次; 37℃下保存5min,至離心管內(nèi)干燥,加入1mlTE緩沖液溶解,得粗提物,將粗提物轉(zhuǎn)移至新EP管,加入100ugRNase A(10ug/ul),將EP管放置于3
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