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用戶手冊 - 武漢理工大學-文庫吧

2025-09-12 12:54 本頁面


【正文】 Insert鍵,便繪出以下結構: F(C H 2 ) 3 PhF 18. 保持 Edit Atom Label按鍵激活狀態(tài),單擊剛才生成的縮寫短式,便再次打開對話框,選擇一個縮寫短式,然后單擊 Expand 按鍵,便得到以下形式: FF 在結構式繪制時,如何插入短式和使用 Expand 選項呢? 要建立結構式 ,按如下進行操作: 1. 轉到結構模式 ,從原子基團表 中選擇環(huán)己烷 ,單擊空白繪圖區(qū)拷貝所選擇模板至繪圖區(qū)。 2. 從原子工具條選擇編輯原子按鍵 后,單擊指 定原子: 3. 在編輯對話框中輸入 (OH)2SCl2 單擊 便可發(fā)現(xiàn)插入到制定位置,并且數(shù)字自動變?yōu)橄聵恕? 4. 選擇改變位置按鍵 Change Position,單擊插入片段以反轉它。 按住 Shift鍵,單擊三次,可以改變片段連接的位置如下: 5. 在結構工具條上選擇設定鍵位垂直按鍵,再單擊箭頭所指鍵位,以改變結構式方向,如下 3. 8 使用繪制鏈工具 使用繪制鏈工具,你可以很容易地用鼠標單擊與拖動繪制短鏈或長鏈。 19. 在結構工具條上單擊繪制鏈 (Draw Chain)按鍵 ,將鼠標指向下圖所示箭頭所指的原子上。 FF 20. 按住鼠標左鍵向左拖動鼠標,便產生一條碳鏈。產生碳鏈的長度(碳原子個數(shù))顯示在鼠標箭頭的左邊。直到顯示 C8,松開鼠標左鍵。 FFCH 3 21. 在繪制鏈工具激活的狀態(tài)下,在原子工具欄上選擇氟原子 ,在最左端碳原子上單擊,生出三個氟原子,再單擊結構工具欄上的“干凈”按鍵 ,便得到如下結構 : FFF FF 3. 9 翻轉結構式 你可以使用一下按鍵翻轉或旋轉所繪結構式: ? 設定鍵位水平 (Set Bond Horizontally) ? 設定鍵位垂直 (Set Bond Vertically) ? 以所選鍵位為軸翻轉( Flip on Bond) ? 上下翻轉 (Flip Top to Bottom) ? 左右翻轉 (Flip Left to Right) 當使用上下翻轉、左右翻轉按鍵時,先選擇所要翻轉的結構式或片段,然后單擊該鍵。 當使用設定鍵位水平、設定鍵位垂直及 以所選鍵位為軸翻轉按鍵時,首先選擇相應按鍵,然后單擊所需翻轉的鍵位。 3. 10 選取,旋轉與 3D旋轉 可以使用兩種方法選擇原子、鍵位與片段: ? 索套選擇工具 ? 矩形選擇工具 一旦選取片段后,有三種方法移動它: ? 移動工具 ? 旋轉,改變大小工具 ? 3D旋轉工具 還可以在其上進行其它一些工具: ? 刪除 ? 3D優(yōu)化工具 ? 2D優(yōu)化工具 3. 11 清除屏幕 若要清屏,按如下任何一個方法操作: ? 選擇 File 菜單的 New命令以打開一個新文件 ? 選擇 New Page 按鍵 打開一頁新頁 ? 從 Edit 菜單中選擇 Select All命令,然后選擇 Delete命令。 ? 在普通工具條中選擇 Delete按鍵 ,選擇所有結構式,然后單擊結構式上的任何位置。 注意: 在結構模式中 ,只有化學結構式可以以以上方法清除 ,要清除圖形對象,轉到繪圖模式。 4. 繪制更復雜的結構 使用原子基團表 原 子基團表包括預先繪制好的氨基酸結構式,保護基團,還包括核苷酸和其它常用原子基團。 22. 應用以上清除屏幕的方法清除屏幕。 23. 單擊參考工具條上的原子基團表 Table of Radicals 按鍵 顯示原子基團表如下: 24. 在原子基團表上單擊環(huán)己烷按鍵 。 環(huán)己烷按鍵便出現(xiàn)在屏幕右側的參考工具條上。 25. 再單擊環(huán)戊烷按鍵 。 注意: 當從原子基團表中選擇新的原子基團時,相應的按鍵便自動加入到參考工具條中。要從參考工具條中移去這些按鍵,雙擊它們中的任何一個按鍵或參考工具條,然后選擇 YES。 。 5. 在屏幕右側的 參考工具條中選擇環(huán)戊烷按鍵 ,在繪圖區(qū)的空白處單擊,生成一個五元環(huán)。 6. 在同一個工具條中,選擇 按鍵,然后將鼠標箭頭指向所指的鍵 單擊產生以下結構。 7. 重復這個過程產生以下結構。 8. 單擊設定鍵位垂直鍵 Set Bond Vertically ,然后單擊所指鍵位以旋轉結構,生成以下結構: 9. 單擊參考工具條中的原子基團表 Table of Radical 10. 在原子基團表 Table of Radical中單擊按鍵選擇羧基 11. 單擊下圖所指的原子 以在其上建立羧基OHOOHOOH OOHOO HOO HO 刪除原子與片段 要 刪 除 下 圖 所 指 的 原 子OO HOO HOOHOOHOOHOOH,以繪出OCH 3C H 3C H 3C H 3C H 3 可以分別刪除或同時刪除這些原子 分別刪除這些原子: 12. 單擊刪除 Delete按鍵 13. 單擊你想刪除的原子。 同時刪除這些原子 14. 單擊結構工具條中的索套開關 Lasso On/Off按鍵 ,以使索套選擇模式打開 ,注意 Select/Move工具是激活的。 15. 拖動鼠標以使所有指定的原子圈入索套線中。OO HOO HOOHOOHOOHOOH 16. 在普通工具條中單擊刪除鍵 17. 單擊任何一個選中的原子以刪除所有選中原子。 注意: 你可以使用索套工具 或矩形選取工具選擇原子 ,鍵位及片段,若取消選擇,單擊任何一個空白區(qū)即可。 替換原子 替換下圖所指的原子 OCH 3C H 3C H 3C H 3C H 3 為 N HNNHN HNNOOHO HO HN H 2N H 2 18. 單擊原子工具條中氮原子按鍵 ,然后單擊以上結構中所有開口箭頭所指的碳 原子 19. 單擊原子工具條中氧原子按鍵 ,然后單擊以上結構中所有實體箭頭所指的碳原子 注意: 不能替換用連續(xù)繪制工具繪出的結構。 設定雙鍵或三鍵外觀 20. 將以下結構中箭頭所指的單鍵N HNNHN HNNOOHO HO HN H 2N H 2設定為雙鍵NN +NHNNNOOHO HO HN H 2N H 2。 21. 使用改變氫原子位置或改變雙鍵外觀按鍵 ,可以很容易地調節(jié)結構式外觀,單擊此鍵,單擊箭頭所指的氫原子與雙鍵,注意氮原子與氧原子周圍氫原子的移動及雙鍵形狀的變化。NN+ NNHN N H 2N H 2OOHO HO H 注意: 你可 以反復單擊一個鍵位以設定其為單鍵、雙鍵或三鍵。當一個原子的鍵位數(shù)為不可能時,一個相應的電荷號出現(xiàn)在其上面,并且其上用紅差注明: 如果想關閉此功能,選擇 Tools 菜單中的 Structure Properties 項,去掉Cross Out Invalid Atom中的選項。 設定電荷 在箭頭所指的氧原子上設定負電荷:NN +NHNNNOOHO HO HN H 2N H 2 22. 單擊在原子工具條上的減少電荷按鈕 ,然后單擊所指氧原子。NN +NHNNNOOHO O
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