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生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)習(xí)指導(dǎo)與習(xí)題集-文庫吧

2024-12-25 03:06 本頁面


【正文】 級、二級、三級和四級結(jié)構(gòu)等層次。一級結(jié)構(gòu)為線狀結(jié)構(gòu),二、三、四級結(jié)構(gòu)為空間結(jié)構(gòu)。 蛋白 質(zhì)分子的一級結(jié)構(gòu)是形成空間結(jié)構(gòu)的物質(zhì)基礎(chǔ) . 1.一級結(jié)構(gòu) :指多肽鏈中氨基酸的排列順序,其維系鍵是肽鍵。蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)決定其空間結(jié)構(gòu)。 2.二級結(jié)構(gòu) :指多肽鏈主鏈骨架盤繞折疊而形成的構(gòu)象,借氫鍵維系。 二級結(jié)構(gòu)是肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu),它是蛋白質(zhì)復(fù)雜空間結(jié)構(gòu)形成的基礎(chǔ),因此也稱為構(gòu)象單元。 主要有以下幾種類型: ⑴ α 螺旋:其結(jié)構(gòu)特征為: ① 主鏈骨架圍繞中心軸盤繞形成右手螺旋; ② 螺旋每上升一圈是 個氨基酸殘基,螺距為 ; ③ 相鄰螺旋圈之間形成許多氫鍵; ④ 側(cè)鏈基團(tuán)位于螺旋的外側(cè)。 ⑵ β 折疊:其結(jié) 構(gòu)特征為: ① 若干條肽鏈或肽段平行或反平行排列成片; ② 所有肽鍵的C=O和 N— H形成鏈間氫鍵 。 ⑶ 無規(guī)卷曲:主鏈骨架無規(guī)律盤繞的部分。 蛋白質(zhì)的超二級結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域 在蛋白質(zhì)(特別是球狀蛋白)的結(jié)構(gòu)中,經(jīng)常會出現(xiàn)兩個或幾個二級結(jié)構(gòu)單元被連接起來,進(jìn)一步組合成有特殊的幾何排列的局域空間結(jié)構(gòu),這些局域空間結(jié)構(gòu)稱為超二級結(jié)構(gòu)( Supersecondary structure) ,或簡稱模體( Motif)。超二級結(jié)構(gòu)可以視為是處于二級結(jié)構(gòu)與三級結(jié)構(gòu)之間的一個結(jié)構(gòu)層次?,F(xiàn)在已知的超二級結(jié)構(gòu)有 3種基本的組合形式: αα ,βαβ , ββ 。 多肽鏈還會在二級結(jié)構(gòu)或超二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上形成三級結(jié)構(gòu)的局部折疊區(qū),稱為結(jié)構(gòu)域( Structural domain) 。對于一些簡單的球狀蛋白分子來說,它還可能是一個獨立的功能單位或功能域( functional domain) 。 3.三級結(jié)構(gòu): 結(jié)構(gòu)域、二級結(jié)構(gòu)、超二級結(jié)構(gòu)的多肽鏈在空間進(jìn)一步協(xié)同盤曲、折疊,形成包括主鏈、側(cè)鏈在內(nèi)的專一排布,這就是蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)( Tertiary structure) 。對于一些較小的蛋白質(zhì)分子,三級結(jié)構(gòu)就是它的完整三維立體結(jié)構(gòu);而對于大的蛋白質(zhì)分子,則需要通過 三級結(jié)構(gòu)單位的進(jìn)一步組織才能形成完整分子。 其維系鍵主要是非共價鍵(次級鍵):氫鍵、疏水鍵、范德華力、離子鍵等,也可涉及二硫鍵。 4.四級結(jié)構(gòu): 亞基 的概念: 亞基是指參與構(gòu)成蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)的而又具有獨立三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈。 四級結(jié)構(gòu) 的概念:含兩條以上肽鏈的蛋白質(zhì)分子,每條肽鏈彼此以非共價鍵相結(jié)合,這些肽鏈稱為亞基( Subunit)。通過非共價鍵形成大分子體系時,亞基間的組合方式稱為蛋白質(zhì)分子的四級結(jié)構(gòu)( Quaternary structury)。 其維系鍵為非共價鍵。 一般來說,單獨存在的亞基并沒有完整的生物 活性,只有具有完整的四級結(jié)構(gòu)的寡聚體才具有生物活性。 維持蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的作用力 維持蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的作用力主要是弱的相互作用稱非共價鍵或次級鍵,包括氫鍵、范德華力、靜電作用、疏水作用等。其中以氫鍵和疏水作用是維持蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的最重要因素。 三 、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的測定: 蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的測定 多肽鏈蛋白質(zhì) 一級結(jié)構(gòu)的測定 以胰島素為例 s A鏈 s s B鏈 測定步驟: ( 1) 測定蛋白質(zhì)分子中多 肽鏈的數(shù)目 ( 2) 多肽鏈的分離 及 降解 ( 3) 肽段的分離和順序分析 ( 4) 二硫鍵 - S- S-定位 。 單 肽鏈蛋白質(zhì)的氨基酸順序分析,即蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的測定,主要有以下幾個步驟: ( 1) 分離純化蛋白質(zhì),得到一定量的蛋白質(zhì)純品; ( 2) 完全水解,測定蛋白質(zhì)的氨基酸組成; ( 3) 分析蛋白質(zhì)的 N端和 C端氨基酸; ( 4) 將蛋白質(zhì)處理為若干條肽段 ,采用特異性的酶(如胰凝乳蛋白酶)或化學(xué)試劑(如溴化氰); (5) 分離純化單一肽段; (6) 測定各條肽段的氨基酸順序。一般采用 Edman降解法,用異硫氰酸苯酯進(jìn)行反應(yīng),將氨基酸 降解后,逐一進(jìn)行測定; (7) 至少用兩種不同的方法處理蛋白質(zhì),分別得到其肽段的氨基酸順序; (8) 將兩套不同肽段的氨基酸順序進(jìn)行比較,以獲得完整的蛋白質(zhì)分子的氨基酸順序。 四 、 蛋白質(zhì)的理化性質(zhì): 1.蛋白質(zhì)的變性 :蛋白質(zhì)在某些理化因素的作用下,其特定的空間結(jié)構(gòu)被破壞而導(dǎo)致其理化性質(zhì)改變及生物活性喪失,這種現(xiàn)象稱為蛋白質(zhì)的變性。引起蛋白質(zhì)變性的因素有:高溫、高壓、電離輻射、超聲波、紫外線及有機溶劑、重金屬鹽、強酸強堿等。絕大多數(shù)蛋白質(zhì)分子的變性是不可逆的。 復(fù) 性 (renaturation): 當(dāng)無活 性 的伸展的蛋白質(zhì)進(jìn)入有利于 折疊 的最適環(huán)境里,則伸展的肽 鏈就會自動折疊成天然的 折疊肽, 并恢復(fù)全部的活性,稱為復(fù)性。 2.兩性解離與等電點:蛋白質(zhì)分子中仍然存在游離的氨基和游離的羧基,因此蛋白質(zhì)與氨基酸一樣具有兩性解離的性質(zhì)。蛋白質(zhì)分子所帶正、負(fù)電荷相等時溶液的 pH 值稱為蛋白質(zhì)的等電點。 3.蛋白質(zhì)的紫外吸收 :蛋白質(zhì)分子中的色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸殘基對紫外光有吸收,以色氨酸吸收最強,最大吸收峰為 280nm。 4.蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì):蛋白質(zhì)具有親水溶膠的性質(zhì)。蛋白質(zhì)分子表面的水化膜和表面電荷是穩(wěn)定蛋白 質(zhì)親水溶膠的兩個重要因素。 第 一 章 蛋白質(zhì) [習(xí)題 ] √ 一、名詞解釋 肽鍵 (peptide bond) 蛋白質(zhì)的等電點 (isoelectric point of protein): 蛋白質(zhì)的變性 (denaturation of protein) 亞基 (subunit) 鹽析 離子交換層析 凝膠 過濾 層析 親和層析 電泳 氨基酸 1 蛋白質(zhì)的紫外吸收 1 氨基酸的茚三酮反應(yīng) √ 二、填空題 組成蛋白質(zhì)的元素有 _______、 ______、 ______、 ______。含量恒定的元素是 ______,其平均含量為 ______。 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的基本單位是 ______, 結(jié)構(gòu)通式 為 ______ 。 肽是氨基酸與氨基酸之間通過 ______ 相連的化合物。 蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)形式有 ______、 ______、 ______、 ______。 維持蛋白質(zhì)空間構(gòu)象的非共價鍵有 ______、 ______、 ______、 ______。 氨基酸在等電點 (PI)時,以 ______離子形式存在,在 PHPI 時以 ______離子存在,在PHPI時,以 ______離子形式存在 。 氨基酸與茚三酮的反應(yīng),除脯氨酸和羥脯氨酸顯黃色外,其它氨基酸都顯 ______。在生化中是特別重要的,因為它能用來定量測定 ______。 酸性氨基酸基酸有 ______、 ______;堿性氨基酸有 ______、 ______、 ______。 含巰基的氨基酸是 ______。 √ 三、單項選擇題 1.有一混合蛋白質(zhì)溶液,各種蛋白質(zhì)的 pI 分別為 、 、 、 、 。電泳時欲使其中 4種泳向正極,緩沖液的 pH 應(yīng)該是 ( ) A. B. C. D. E. 2.蛋白質(zhì)分子引起 280nm光吸收的最主要成分是 ( ) A.肽鍵 B.半胱氨酸的 SH 基 C.苯丙氨酸的苯環(huán) D.色氨酸的吲哚環(huán) E.組氨酸的咪唑環(huán) 3.含芳香環(huán)的氨基酸是 ( ) A. Lys B. Tyr C. Val D. Ile E. Asp 4.變性蛋白質(zhì)的特點是 ( ) A.黏度下降 B.喪失原有的生物活性 C.顏色反應(yīng)減弱 D.溶解度增加 E.不易被胃蛋白酶水解 5.蛋白質(zhì)變性是由于 ( ) A.蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)改變 B.蛋白質(zhì)空 間構(gòu)象的改變 C.輔基的脫落 D.蛋白質(zhì)水解 E.以上都不是 6.以下哪一種氨基酸不具備不對稱碳原子 ( ) A.甘氨酸 B.絲氨酸 C.半胱氨酸 D.蘇氨酸 E.丙氨酸 7.下列有關(guān)蛋白質(zhì)β折疊結(jié)構(gòu)的敘述正確的是( ) A.β折疊結(jié)構(gòu)為二級結(jié)構(gòu) B.肽單元折疊成鋸齒狀 C.β折疊結(jié)構(gòu)的肽鏈較伸展 D.若干肽鏈骨架平行或反平行排列,鏈間靠氫鍵維系 E.以上都正確 8.可用于蛋白質(zhì)定量的測定方法有( ) A.鹽析法 B.紫外吸收法 C.層析法 D.透析法 E.以上都可以 9.維 系蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的化學(xué)鍵是( ) A.氫鍵 B.肽鍵 C.鹽鍵 D.疏水鍵 E.范德華力 10.天然蛋白質(zhì)中不存在的氨基酸是( ) A.半胱氨酸 B.瓜氨酸 C.羥脯氨酸 D.蛋氨酸 E.絲氨酸 11.蛋白質(zhì)多肽鏈書寫方向是( ) A.從 3 端到 5 端 B.從 5 端到 3 端 C.從 C端到 N 端 D.從 N端到 C端 E.以上都不是 12.血漿蛋白質(zhì)的 pI 大多為 pH5~ 6,它們在血液中的主要存在形式是( ) A.兼性離子 B.帶負(fù)電荷 C.帶正電荷 D.非極性分子 E.疏水分子 13.蛋白質(zhì)分子中的α螺旋和β片層都屬于( ) A.一級結(jié)構(gòu) B.二級結(jié)構(gòu) C.三級結(jié)構(gòu) D.域結(jié)構(gòu) E.四級結(jié)構(gòu) 14.α螺旋每上升一圈相當(dāng)于氨基酸殘基的個數(shù)是( ) A. B. C. D. E. 15.下列含有兩個羧基的氨基酸是( ) A.纈氨酸 B.色氨酸 C.賴氨酸 D.甘氨酸 E.谷氨酸 16.組成蛋白質(zhì)的基本單位是( ) A. Lα 氨基酸 B. Dα 氨基酸 C. L,β 氨基酸 D. L, Dα氨基酸 E. Dβ 氨基酸 17.維持蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的主要化學(xué)鍵是( ) A.疏水鍵 B.鹽鍵 C.肽鍵 D.氫鍵 E.二硫鍵 18.蛋白質(zhì)分子的β轉(zhuǎn)角屬于蛋白質(zhì)的( ) A.一級結(jié)構(gòu) B.二級結(jié)構(gòu) C.結(jié)構(gòu)域 D.三級結(jié)構(gòu) E.四級結(jié)構(gòu) 19.關(guān)于蛋白質(zhì)分子三級結(jié)構(gòu)的描述 錯誤 的是( ) A.具有三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈都具有生物學(xué)活性 B.天然蛋白質(zhì)分子均有這種結(jié)構(gòu) C.三級結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性主要由次級鍵維系 D.親水基團(tuán)多聚集在三級結(jié)構(gòu)的表面 E.決定盤曲折疊的因素是 氨基酸序列 20.有關(guān)血紅蛋白 (Hb)的敘述 正確 的是( ) A.可以與氧結(jié)合 B.含鐵 C.含輔基的結(jié)合蛋白 D.具有四級結(jié)構(gòu)形式 E.以上都正確 21.具有四級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)特征是( ) A.分子中必定含有輔基 B.四級結(jié)構(gòu)在三級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,多肽鏈進(jìn)一步折疊、盤曲形成 C.依賴肽鍵維系四級結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性 D.每條多肽鏈都具有獨立的生物學(xué)活性 E.由兩條或兩條以上的多肽鏈組成 22.關(guān)于蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)正確的是( ) A.一定有多個不同的亞基 B.一定有多個相同的亞基 C.一定有種類相同,而數(shù)目不同的亞基數(shù) D.一定有種類不同,而數(shù)目相同的亞基 E.亞基的種類,數(shù)目都不一定相同 23.蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)及高級結(jié)構(gòu)決定于( ) A. 亞基 B.分子中鹽鍵 C.氨基酸組成和順序 D.分子內(nèi)部疏水鍵 E.分子中氫 24.蛋白質(zhì)的等電點是( ) A.蛋白質(zhì)溶液的 pH等于 7時溶液的 pH B.蛋白質(zhì)溶液的 PH等于 pH C.蛋白質(zhì)分子呈負(fù)離子狀態(tài)時溶液的 pH D.蛋白質(zhì)分子呈正離子狀態(tài)時溶液的 pH E.蛋白質(zhì)的正電荷與負(fù)電荷相等時溶液的 pH 25.蛋白質(zhì)溶液的主要穩(wěn)定 因素是( ) A.蛋白質(zhì)溶液的黏度大 B.蛋白質(zhì)在溶液中有“布朗運動” C.蛋白質(zhì)分子表面帶有水化膜和同種電荷 D.蛋白質(zhì)溶液有分子擴散現(xiàn)象 E.蛋白質(zhì)分子帶有電荷 26.血清在飽和硫酸銨狀態(tài)下析出的蛋白質(zhì)是( ) A.纖維蛋白原 B.球蛋白 C.?dāng)M球蛋白 D.清蛋白 E.β球蛋白 27. 胰島素分子 A鏈與 B鏈交聯(lián)是靠( ) A.疏水鍵 B.鹽鍵 C.氫鍵 D.二硫鍵 E.范德華力 √ 四、多項選擇題 1.關(guān)于蛋白質(zhì)的組成正確的有( ) A.由 C, H, O, N等多種 元素組成 B.含氮量約為 16% C.可水解成肽或氨基酸 D.由α 氨基酸組成 E.含磷量約為 10% 2.蛋白質(zhì)在 280nm波長處的最大光吸收是由下列哪些結(jié)構(gòu)引起的( ) A.半胱氨酸的巰基 B.酪氨酸的酚基 C.色氨酸的吲哚基 D.組氨酸的異吡唑基 E.精氨酸的胍基 3.關(guān)于蛋白質(zhì)中的肽鍵哪些敘述是正確的( ) A.比一般 C— N單鍵短 B.具有部分雙鍵性質(zhì) C.與肽鍵相連的氫原子和氧原子呈反式結(jié)構(gòu) D.肽鍵可自由旋轉(zhuǎn)
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