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市場(chǎng)營(yíng)銷第二章基因工程第一節(jié)(2)基因與基因組(已改無(wú)錯(cuò)字)

2023-01-29 04:27:17 本頁(yè)面
  

【正文】 組中成串排列在一個(gè)區(qū)域,大多數(shù)與單拷貝基因間隔排列。n 多為 編碼功能的序列3)中度重復(fù)序列 (moderate repetitive sequences)n 基因組中重復(fù)數(shù)十至數(shù)萬(wàn)( 105)次的重復(fù)順序,n 復(fù)性速度快于單拷貝順序,慢于高度重復(fù)順序。n 多與單拷貝基因間隔排列。n 多為非編碼序列 ,如 Alu序列n 也有編碼基因 產(chǎn)物的,如 rDNA、 tDNA、組蛋白基因 家族 ,一般往往以基因家族的形式組織。rDNA gene family海膽 450copies煙草 750copies果蠅 100copiesHistone gene family??? 組蛋白基因家族TS:可轉(zhuǎn)錄的間隔序列NTS:不轉(zhuǎn)錄的間隔序列NTS NTS真核生物的 Alu family300,000copies廣泛分布于非重復(fù)序列間300bp 300bp 300bp6000bp 6000bp 6000bp 6000bp4)高度重復(fù)序列 (highlyrepetitivesequences)n 在基因組中重復(fù)頻率高,可達(dá)百萬(wàn) (106)以上,n 復(fù)性速度很快。n 序列一般較短,長(zhǎng) 10300bp,n 如真核生物的 衛(wèi)星 DNA。衛(wèi)星 DNA序列螃蟹 2 ATATAT…..果蠅 5 ATAATATAAT…..老鼠 9 GAAAAATGAGAAAAATGA重復(fù)堿基數(shù) 序列 不同生物的非重復(fù)基因占基因組的比例差別很大;原核生物無(wú)重復(fù)序列 低等真核生物 1020%repetitivesequence高等植物 80%高等動(dòng)物 50%、 1DNA的復(fù)性動(dòng)力學(xué)2重復(fù)序列3真核生物的 DNA序列真核生物的重復(fù)序列第五節(jié) 真核生物 DNA序列組織 真核生物的單一序列n 單拷貝順序在基因組占 5080%,n 平均長(zhǎng)度為 13000bpn 單拷貝順序儲(chǔ)存了巨大的遺傳信息。n 只有一小部分單拷貝序列編碼蛋白質(zhì)。真核生物的重復(fù)序列n 基因家族 (有編碼功能 )n 基因外的重復(fù) DNA序列 (無(wú)編碼功能 )基因家族1) 基因家族( genefamily) :真核生物基因組中來(lái)源相同,結(jié)構(gòu)和功能相關(guān)的基因聚集在一起形成基因家族。根據(jù)分布形式分 基因簇和散布的基因家族:A基因簇( genecluster)n 基因家族的各個(gè)成員 緊密成簇排列 成大段的 串聯(lián)重復(fù) 單位,分布在某一條染色體的特殊區(qū)域;n 它們可同時(shí)發(fā)揮作用,合成某些蛋白質(zhì)。n 如 組蛋白基因家族聚集在第 7號(hào)染色體長(zhǎng)臂 3區(qū)內(nèi)。Histone gene family??? 組蛋白基因家族n 假基因( pseudogene): 具有與功能基因相似的序列,但由于有許多突變以致失去了原有的功能,所以假基因是沒(méi)有功能的基因,用 ψ表示。n 來(lái)源: 一般認(rèn)為是由 mRNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,然后整合在基因組中,n 假基因不含內(nèi)含子。B散布的基因家族( interspersedgenefamily)n 概念: 一個(gè)基因家族的不同成員成簇地分布不同染色體上,各成員在序列上有明顯差異。n 這些不同成員編碼一組 功能上緊密相關(guān)的蛋白質(zhì),如 珠蛋白基因家族。兩種亞基的編碼基因分別形成兩個(gè)不同的基因簇,并存在于不同的染色體上 .人類珠蛋白基因家族---典型的血紅蛋白珠蛋白血紅素α2β2 不同的亞基由各自 的基因編碼2)廣義的基因家族根據(jù)基因家族成員序列的相似程度分類:A經(jīng)典的基因家族 ,家族成員序列有高度的同源性,序列一致,拷貝數(shù)高,非轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)短而一致。B基因家族各成員的編碼產(chǎn)物保守( 大段的高度保守 氨基酸序列);只是 DNA序列的相似性低。C基因家族各成員的編碼產(chǎn)物之間只有 很短的保守氨基酸 序列, DNA序列的相似性更低。D超基因家族 ,各基因序列之間 無(wú)同源性 ,但其基因產(chǎn)物的功能相似。編碼產(chǎn)物之間也無(wú)明顯的保守氨基酸序列,但也有一些共同特征。1DNA的復(fù)性動(dòng)力學(xué)2重復(fù)序列3真核生物的 DNA序列真核生物的重復(fù)序列基因家族 (有編碼功能 )基因外的重復(fù) DNA序列 (無(wú)編碼功能 )第五節(jié) 真核生物 DNA序列組織基因外的重復(fù)序列n 即為無(wú)編碼功能的重復(fù)序列1)串聯(lián)重復(fù) DNA衛(wèi)星 DNA(高度重復(fù)序列 )2)散布的重復(fù) DNA1)衛(wèi)星 DNA(satelliteDNA)特點(diǎn):n 高度重復(fù)序列 ,n 重復(fù)單位由 210bp組成,n 成串排列, 重復(fù)數(shù)以百萬(wàn)次 106。衛(wèi)星 DNA序列螃蟹 2 ATATAT…..果蠅 5 ATAATATAAT…..老鼠 9 GAAAAATGAGAAAAATGA重復(fù)堿基數(shù) 序列 衛(wèi)星 DNA: 這類高度重復(fù)序列的堿基組成不同與其他部分,浮力密度也不同,用等密度梯度離心法可將其與主體 DNA分開(kāi) 等密度梯度離心法 浮力密度 衛(wèi)星 DNA的分類(1)衛(wèi)星 DNA: 長(zhǎng)串聯(lián)重復(fù)序列,位于染色體上的異染色區(qū)域。(2)小衛(wèi)星 DNA重復(fù)序列 (minisatellite):中等大小的串聯(lián)重復(fù)序列,位于染色體末端,或其他部位。n高變小衛(wèi)星 DNA: 重復(fù)單位之間的序列差異大,但是有一個(gè)核心序列 GGGCAGGAXG,近端粒部位;n端粒 DNA: 主要有六個(gè)串聯(lián)重復(fù)單位組成 TTAGGG衛(wèi)星 DNA的分類(3)微衛(wèi)星 (microsatellite,MS)或?yàn)楹?jiǎn)短串聯(lián)重復(fù)(STR,shorttandemrepeats)
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