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生物芯片技術(shù)-在線瀏覽

2024-09-26 00:04本頁面
  

【正文】 iochip或 Bioarray) 是指包被在固相載體上的高密度 DNA、 抗原 、 抗體 、 細胞或組織的微點陣 (microarray) 。 第十章 生物芯片技術(shù) ? 生物芯片的主要特點: –高通量、微型化和自動化 ? 常用的生物芯片的分類: 基因芯片、蛋白質(zhì)芯片及芯片實驗室 特點 ? 高度并行性:提高實驗進程、利于顯示圖譜的快速對照和閱讀。 ? 微型化:減少試劑用量和反應(yīng)液體積,提高樣品濃度和反應(yīng)速率。 第十章 生物芯片技術(shù) 1. 基因芯片( Genechip) 又稱 DNA芯片 ,是根據(jù)核酸雜交的原理,將大 量探針分子固定于支持物上,然后與標記的樣品 進行雜交,通過檢測雜交信號的強度及分布來進 行分析。 第十章 生物芯片技術(shù) (labsonchip) ? 高度集成化的集樣品制備、基因擴增、核酸標記及檢測為一體的便攜式生物分析系統(tǒng)。 ? 芯片實驗室是生物芯片技術(shù)發(fā)展的最終目標。成本較高,設(shè)計和制造較煩瑣費時。芯片的載體需表面緊質(zhì)、光滑的固體,如硅,陶,玻璃等, DNA微矩陣芯片常用玻片為載體。 ? 全部或部分 cDNA:約 500?5000個核苷酸堿基,通常用于兩種或以上樣本的相關(guān)基因表達分析。 ? 結(jié)果 第一節(jié) DNA芯片 第一節(jié) DNA芯片 二、樣品的制備 三、雜交與結(jié)果分析 四、基因芯片技術(shù)在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用 一、芯片制備 一、芯片制備 基因芯片制備主要包括兩個方面 ? 探針的設(shè)計:根據(jù)應(yīng)用目的不同,設(shè)計不同的固定于芯片上的探針。 一、芯片制備 (二) DNA芯片的制備 (一)探針的設(shè)計 (一)探針的設(shè)計 1. 表達型芯片探針的設(shè)計 不需要知道待測樣品中靶基因的精確細節(jié) 序列的特異性應(yīng)放在首要位置 2. 單核苷酸多態(tài)性檢測芯片探針的設(shè)計 等長移位設(shè)計法 3. 特定突變位點探針的設(shè)計 疊瓦式策略 一、芯片制備 一、芯片制備 圖 10- 2 (二) DNA芯片的制備 1.載體選擇與預(yù)處理 ? 載體:用于連接、吸附或包埋各種生物分子并使其以固相化狀態(tài)進行反應(yīng)的固相材料。 ? 載體的化學(xué)處理:活化劑 ——多聚賴氨酸 氨基硅烷偶聯(lián)劑 一、芯片制備 2.基因芯片制備 ( 1)原位合成( in situ synthesis) ① 光導(dǎo)原位合成法 ②原位噴印合成 ③分子印章多次壓印合成 ( 2)點樣法 芯片制備 ? 原位合成法( in situ synthesis):又 可分為原位光控合成法和原位標準試劑合成法。是目前制造高密度寡核苷酸最為成功的方法。主要用于診斷、檢測病原體及其他特殊要求的中、低密度芯片的制備。中、低密度,樣品浪費較多且制備前需儲存 大量樣品。制備細胞、組織或整個器官樣本應(yīng)特別小心。 ? 用于基因類型分析的樣本是 DNA,用于表達研究的樣本是 cDNA。 三、雜交與結(jié)果分析 (一)雜交反應(yīng):與傳統(tǒng)的雜交方法類似 (二)雜交信號的檢測:最常用熒光法 (三)數(shù)據(jù)分析:芯片雜交圖譜的處理與存儲由專 門設(shè)計的軟件來完成。 – 選擇雜交條件時,必須滿足檢測時的靈敏度和特異性。 – 合適長度的 DNA有利于與探針雜交。 – 最好在封閉循環(huán)條件下雜交,雜交爐。 ? 質(zhì)譜法:快速、精確,可準確判斷是否存在基因突變和精確判斷突變基因的序列位置。 ? 化學(xué)發(fā)光、光導(dǎo)纖維、二極管方陣檢測、直接電荷變化檢測等。 ? 根據(jù)激光光源,可分為激光型和非激光。 圖象分析 ? 復(fù)雜的雜交圖譜一般需由圖象分析軟件來完成。 ? 圖象處理軟件必須具備提取基因庫和數(shù)據(jù)庫的能力。
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