【正文】
ns. Near UV CD spectrum 蛋白質(zhì)中芳香氨基酸殘基,如色氨酸 (Trp)、酪氨酸(Tyr)、苯丙氨酸 (Phe)及二硫鍵處于不對(duì)稱微環(huán)境時(shí),在近紫外區(qū) 250~ 320 nm,表現(xiàn)出 CD信號(hào)。二維、多維核磁共振技術(shù)能測(cè)出溶液狀態(tài)下較小蛋白質(zhì)的構(gòu)象,可是對(duì)分子量較大的蛋白質(zhì)的計(jì)算處理非常復(fù)雜。天然有機(jī)化學(xué)與立體有機(jī)化學(xué) , 物理化學(xué) , 生物化學(xué)與宏觀大分子 , 金屬絡(luò)合物 , 聚合物化學(xué)等相關(guān)的科學(xué)研究。圓二色譜 Circular Dichroism (CD) Application 圓二色光譜儀通過測(cè)量生物大分子的圓二色光譜從而得到生物大分子的二級(jí)結(jié)構(gòu)。 可應(yīng)用于:蛋白質(zhì)折疊 ﹑ 蛋白質(zhì)構(gòu)象研究 , DNA/RNA反應(yīng) , 酶動(dòng)力學(xué) , 光學(xué)活性物質(zhì)純度測(cè)量 , 藥物定量分析。 構(gòu) 象 確定蛋白質(zhì)構(gòu)象最準(zhǔn)確的方法是 x射線晶體衍射,但對(duì)結(jié)構(gòu)復(fù)雜、柔性的生物大分子蛋白質(zhì)來說,得到所需的晶體結(jié)構(gòu)較為困難。 圓二色光譜:研究稀溶液中蛋白質(zhì)構(gòu)象,快速、簡(jiǎn)單、較準(zhǔn)確 CD is very useful for looking at membrane proteins ? Membrane proteins are difficult to study. ? Crystallography difficult need to use detergents Often even when structure obtained: Q is it the same as lipid? ? CD ideal can do spectra of protein in lipid vesicles. ? We will look at Staphylococcal ahemolysin as an example 主要內(nèi)容 ?CD原理 ?蛋白質(zhì) CD譜 ?CD實(shí)驗(yàn)要點(diǎn) CD原理 圓二色性 (circular dichroism, CD) 當(dāng)平面偏振光通過具有旋光活性的介質(zhì)時(shí),由于介質(zhì)中同一種旋光活性分子存在手性不同的兩種構(gòu)型,故它們對(duì)平面偏振光所分解成的右旋和左旋圓偏振光吸收不同,從而產(chǎn)生圓二色性. 圓二色性的表示 橢圓度 ?,摩爾 橢圓度 [?] ?=(AL – AR)/4 [?] = 3298(?L ?R)?3300 (?L ?R) 在蛋白質(zhì)研究中, 常用平均殘基摩爾 橢圓度 圓二色儀原理 蛋白質(zhì)的 CD譜 The peptide bond is inherently asymmetric amp。 Phe殘基 : 25 261和 268 nm附近; Tyr殘基 :277 nm左右;而在 27 284和 291 nm是 Trp殘基的信息;二硫鍵的變化信息反映在整個(gè)近紫外 CD譜上。 Near UV CD spectrum of Lysozyme 260 270 280 290 300 3102001000100 ???nmMain CD features of protein 2ndary structures band (nm) + band (nm) αhelix 222 208 192 βsheet 216 195 βturn 220230 (weak) 180190 (strong) 205 polypro II helix 190 210230 weak Random coil 200 212 Far UV CD spectra of polyLLys CD signals for same secondary structure can vary (a bit) with environment Lau, Taneja and Hodges (1984) . 259:1325313261 Ef fect of 50% T FE on a