溶菌酶的作用機制(4)-在線瀏覽
2025-02-25 02:15本頁面
【正文】 NAM不能占據(jù)部位 C時也就不能占據(jù)部位 E。 用 X射線晶體結(jié)構(gòu)分析法研究了競爭性抑制劑 （ NAG） 3僅僅占據(jù)了大約半個裂縫 。 實驗中用 （ NAG） 6為底物 ， 確實能被酶迅速水解 。 因此糖苷鍵的穩(wěn)定性減低 ， 鍵就容易從這里斷裂 。 分析 DE鍵周圍的微環(huán)境 ， 最活潑的基團顯然是 Asp52和Glu35， 它們分別位于糖苷鍵兩側(cè) 。 這兩個酸性側(cè)鏈具有明顯不同的微環(huán)境 。 相反 ， Glu35位于非極性區(qū) 。Asp52側(cè)鏈羧基為解離的 COO形式 ，而 Glu35 則 為 質(zhì) 子 化 未 電 離 的COOH形式 。 Phillips等人根據(jù)上述研究資料提出溶菌酶的催化作用機制，要點如下： （ 1） Glu35的 — COOH提供一個 H+到 D環(huán)和 E環(huán)間的糖苷鍵 O原子上 。 （ 2） 含有 E及 F殘基的 NAG二聚體離開酶分子 。 Glu35質(zhì)子化 ， 由A、 B、 C和 D殘基組成的 NAG四聚體通過擴散離開酶分子 ， 然后溶菌酶為新一輪催化過程做好了準備 。 （ 2） 正碳離子中間產(chǎn)物的形成與穩(wěn)定 ， 一方面由于 Asp52帶有負電荷的羧酸基通過靜電相互作用穩(wěn)定 D環(huán)中 C1的正電荷；另一方面由于 D環(huán)的形變 ， 由椅式構(gòu)象變?yōu)榘胍问?， 使 D環(huán)上 C CC5和 O都在一個平面上 ， 氧原子的負電性可以使正碳離子穩(wěn)定 。 隨著 DNA技術(shù)的新技術(shù)的發(fā)展，使以前被分解的基因的任何多肽的中間缺失、添加或替換成為了可能。蛋白質(zhì)中的任何氨基酸可以被替代，并且調(diào)查者能確定所有蛋白質(zhì)分子產(chǎn)生的持續(xù)的變更。在論文中， Asp52和 Glu35都被作為對象研究，研究是測試那些氨基酸殘余被代替的突變蛋白質(zhì)的活性。 Phillips根據(jù)晶體學(xué)研究提出的底物結(jié)合方式和催化作用機制 ， 曾在各種化學(xué)實驗中受到檢驗 。 我們可以下結(jié)論的是三十多年前 Phillips所提出的反應(yīng)過程是經(jīng)得起時間的考驗 。wz1D4G7JbMePhTkWoZr$u( x+A2E5H9KcNfRiU lXpsamp。v)z0C3F7IaLdPgSkVnYq$t*wA1D5G8JbNeQhTl WoZr%u( y+ B2E6H 9KcOfRjU mXp!samp。w)z1C 4F7JaMdPhSkVnZq$u*xA2D5G8KbNfQiTl Xor%v( y0B3E6I9LcOgRjVmYp!tamp。wz1C4G7JbMePhTkWnZr$u( x+ A2E5H 8KcNfR iUlXps%v) y0C3F6IaLdOgSjVnYq!t*wz1D4G7JbMeQhTkWoZr$u( x+ B2E5H 9KcNfRiU mXtamp。v) y0C3F7IaLdPgSjVnYq$t*wA1D4G8JbNeQhTl WoZr%u( x+B2E6H9KcOfRiU mXp!samp。w)z0C4F7JaMdPhSkVnZq$t*xA2D5G8KbNeQiTlXor%v( y+B3E6I9LcOgRjU mYp!tamp。wz1C4G7JaMePhTkWnZr$u*x+A2E5H8KcN fQiUlXps%v) y0B3F6IaLdOgSjVmYq!t*wz1D4G7JbMeQhTkWoZr$u( x+A2E5H9KcNfRiUl Xpsamp。v)z0C 3F7IaLdPgSkVnYq$t*wA1D 5G8JbNeQhTl Wor%u( y+B2E6H9LcOfRj U mXp!samp。w) z1C4F7JaMdPhSkWnZq$u*xA2D5H8KbN fQiTlXos%v( y0B3E6I9LdOgRjVmYp!tamp。wz1D 4G7JbMePhTkWoZr$u( x+A2E5H9KcNfRi UlXps%v) y0C3F6IaLdOgSjVnYq!t*wz1D 4G8JbMeQhTkWoZr %u( x+ B2E5H 9KcOfRiU mXpsamp。v) z0C3F7IaLdPgSjVnYq$t*w
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