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遺傳信息傳遞的整體性-展示頁

2025-05-22 05:09本頁面
  

【正文】 性 片 段 長 度 多 態(tài) 性 ( restriction fragment length polymorphism, RFLP) ? ② 可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列 ( variable number of tandem repeat, VNTR) ? ③ 單 核 苷 酸 多 態(tài) 性 ( single nucleotide polymorphism, SNP) 目 錄 ? ① 限制性片段長度多態(tài)性( RFLP): 利用特定的限制性內(nèi)切酶識別并切割基因組 DNA,得到大小不等的 DNA片段,所產(chǎn)生的DNA數(shù)目和各個片段的長度反映了 DNA分子上不同酶切位點的分布情況。 目 錄 遺傳作圖 ( geic mapping) : 就是確定連鎖的遺傳標(biāo)志位點在一條染色體上的排列順序及它們之間的相對遺傳距離 , 用厘摩爾根 ( centiMan, cM) 表示 , 當(dāng)兩個遺傳標(biāo)記之間的重組值為 1%時 , 圖距即為 1 cM。 目 錄 三、結(jié)構(gòu)基因組學(xué)的主要任務(wù)是基因組作圖和大規(guī)模測序 通過基因作圖、構(gòu)建連續(xù)克隆系及大規(guī)模測序等方法,結(jié)合主要模式生物已知基因組 DNA序列,輔以生物信息學(xué)和計算生物學(xué)技術(shù),解密人類基因組 DNA序列和結(jié)構(gòu)。 功能基因組學(xué)( functional genomics) :分析鑒定基因組功能。 * 基因組 ( genome) 目 錄 二、基因組學(xué)包括結(jié)構(gòu)基因組學(xué)、功能基因組學(xué)和比較基因組學(xué) 1. 基因組學(xué)( genomics) 是闡明整個基因組的結(jié)構(gòu)、結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系以及基因之間相互作用的科學(xué)。 細(xì)菌基因組包含了擬核和質(zhì)粒中的 DNA序列 。目 錄 第十九章 遺傳信息傳遞的整體性 Integration of expression and transmission of geic information 目 錄 第一節(jié) 基因組學(xué) Genomics 目 錄 一、基因組就是一種生物擁有的所有遺傳信息的總合 是一個細(xì)胞 ( 或病毒 ) 所載的全部遺傳信息 , 它代表了一種生物所具有的全部遺傳信息 。 真核生物基因組是指一套完整單倍體 DNA( 染色體DNA) 及線粒體或葉綠體 DNA的全部序列 , 既有編碼序列 ,也有大量存在的非編碼序列 。 病毒基因組有的為 DNA( DNA病毒 ) , 有的則為 RNA( RNA病毒 ) 。 2. 研究內(nèi)容 結(jié)構(gòu)基因組學(xué)( structural genomics) : 遺傳圖譜、 物理圖譜、序列圖譜以及轉(zhuǎn)錄圖譜和大規(guī)模 DNA測序。 比較基因組學(xué)( parative genomics): 基因組之間比較鑒定,研究生物進(jìn)化,預(yù)測新基因。 人類基因組計劃( Human Genome Project, HGP): 目 錄 1.遺傳作圖 2.物理作圖 (一)遺傳作圖和物理作圖是繪制人類基因組草圖的重要策略 染色體 DNA很長,不能直接進(jìn)行測序,必須先將基因組 DNA進(jìn)行分解、標(biāo)記,使之成為可操作的較小結(jié)構(gòu)區(qū)域,這一過程稱為作圖。 1.遺傳作圖就是繪制連鎖圖 遺傳圖 (geic map)又稱連鎖圖 (linkage map)。 目 錄 ? ② 可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列( VNTR): 又稱微衛(wèi)星 DNA( minisatellite DNA),是一種重復(fù) DNA短序列。 目 錄 ? ③ 單核苷酸多態(tài)性( SNP): SNP不以“長度”的差異作為檢測手段,而是直接以序列的變異作為標(biāo)記。 SNP是人類可遺傳的變異中最常見的一種,也是基因組中最為穩(wěn)定的變異。 目 錄 物理作圖( physical mapping)是在遺傳作圖基礎(chǔ)上制作的更詳細(xì)的人類基因組圖譜。 ②限制性酶切圖( restriction map): 將限制性酶切位點標(biāo)定在 DNA分子的相對位臵。 目 錄 * STS( sequence tagged site,基因組序列標(biāo)簽位點): 是指染色體定位明確,并且可用 PCR擴(kuò)增的單拷貝序列,每隔 100 kb距離就有一個標(biāo)志。 目 錄 (二)通過 BAC克隆系、鳥槍法等完成大規(guī)模DNA測序 1. BAC克隆系的構(gòu)建是大規(guī)模 DNA測序的基礎(chǔ) YAC載體裝載量偏大( 1?2 Mb),自身穩(wěn)定性不夠。 目 錄 2.鳥槍法是大規(guī)模 DNA測序的重要方法 ? 全基因組鳥槍法測序 ( shotgun sequencing) 直接將整個基因組打成不同大小的 DNA片段,構(gòu)建 BAC文庫,然后對文庫進(jìn)行隨機(jī)測序,最后運用生物信息學(xué)方法將測序片段拼接成全基因組序列。 ② 高效、大規(guī)模的克隆雙向測序。 ④ 缺口填補(bǔ)。這種高通量測序一次實驗可以讀取幾十萬到幾百萬 DNA片段的序列,極大加速了基因組測序。 ? 主要的生物信息中心 ? 美國國家生物技術(shù)信息中心( NCBI, ? 歐洲生物信息研究所( EBI, ? 日本 DNA數(shù)據(jù)庫( DDBJ, ? GenBank( 目 錄 四、功能基因組學(xué)系統(tǒng)探討基因的 活動規(guī)律 ? 功能基因組學(xué): 從整體水平上研究一種組織或細(xì)胞在同一時間或同一條件下
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