microrna研究(參考版)
2025-08-08 00:40本頁面
【正文】 Donnell等發(fā)現(xiàn) MYC可以結合到 miR1792簇所在基因C13orf25的第一個內含子上，并誘導 miR1792簇的表達 與 p53相關的 miRNA 20220606 腫瘤有著獨特的 miRNA表達譜 microRNA相關研究 microRNA Expression Analysis microRNA Functional Analysis miRNA Expression Analysis ——Strategy Overview Sample preparation RNA isolation cDNA synthesis Realtime PCR analysis microRNA cDNA synthesis stemloop RT poly(A) tail RT Realtime PCR workflow microRNA realtime PCR SYBR Green Taqman probe miRNA Functional Analysis ——Strategy Overview Cultured cells Increase target protein or reporter expression Introduce precursor miRNAs (PremiRTM) Reduce target protein or reporter expression Target gene ID Gene function Cellular process Phenotype Lossoffunction experiment Introduce miRNA inhibitors (AntimiR) Cultured cells Gainoffunction experiment bin/targets/v5/ microRNA序列數(shù)據(jù)庫 常用 microRNA靶基因預測數(shù)據(jù)庫 Mature miRNA ―seed region‖ How miRNAs find out theis targets? Bases 2~8, numered from the 5’end of miRNA, called miRNA seed, by using seed regionmiRNA can bind to target sequence. miRNA binding to partially plementary sites in mRNA 3’ UTRs is considered to be the halmark of animal miRNA regulation. Cell. 2022 Dec 26。結合后導致靶 mRNA翻譯的抑制 翻譯抑制 5’end of the small RNA,2–8, known as the “seed region” do not have a plex secondary structure and are located in accessible regions of the RNA microRNA識別靶位點 microRNA作用機制 miRNA與 siRNA的聯(lián)系： 均為 Dicer的產物 長度均為 22nt左右， 5‘端是磷酸基， 3‘端是羥基 均需 Argonaute家族蛋白的存在 同為 RISC的組分 二者進化關系上可能的兩種推論： siRNA是 miRNA的補充 miRNA在進化過程中替代了 siRNA 沉默機制有重疊 miRNA的加工成熟過程與 RNAi技術中常用的 siRNA有許多相似之處 ——均經過 Dicer酶 對 雙鏈 RNA的識別加工而形成 單鏈 RNA分子 。 microRNA的加工成熟 microRNA是動、植物自身基因組編碼形成的一類小分子 首先由基因組轉錄形成長鏈 RNA分子 ——primiRNA 約 60%的 microRNA為獨立轉錄表達；約 15%miRNA為成簇存在而共同轉錄；其余還有約 25%的 miRNA定位于功能基因內含子，隨基因轉錄表達。 Easow et al. 2022。 Thai et al. 2022) Viral miRNAs r
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