分子生物學(xué)ppt課件(2)(參考版)
2025-05-05 12:08本頁(yè)面
【正文】 把這種現(xiàn)象稱為一級(jí)結(jié)構(gòu)決定高級(jí)結(jié)構(gòu)。 γ 貫穿 αβ復(fù)合體 . 每個(gè) β有一個(gè) ATP合成催化位點(diǎn) F0 ： 3種亞基組成，嵌入內(nèi)膜 12個(gè) c亞基 組成一個(gè)環(huán)形結(jié)構(gòu)，具有質(zhì)子通道，可使質(zhì)子由膜間隙流回基質(zhì)。 this is called a lockandkey mechanism（鎖鑰機(jī)理） . Substract reaction causes change of active site structure. 56 / 45 ?3?3??? F1 F0 ?ATP synthetase / ATP合成酶 F1： 5種 (9個(gè) )亞基， ?3?3???。但氫鍵的鍵能較 低 (~12kJ/mol)，易被破壞。 35 / 45 Please note here, if a protein has only one polypeptide chain, the highest level it can have is when a protein has more than one polypeptide chain, can it have quaternary structure. tertiary 肌紅蛋白 36 / 45 let’s examine what physical interactions happen in the process of protein folding. Chemical and Physical Basis for Protein Folding 1) Covalent bonding 2) Hydrogen bonding 3) Ionic bonding 4) Van der Waals forces 5) Hydrophobic interaction 37 / 45 1) Covalent bond / 共價(jià)鍵 Shared electrons H－ H H +1 H +1 +1 +1 Covalent bond ?The strongest bond that joins atoms. ? A pair of electrons is shared between two atoms. ? Two electrons from two hydrogen atoms are shared between these two atoms. A single covalent bond is formed. 38 / 45 Covalent bond / 共價(jià)鍵 AGILMFWNP VSTQCYDE RHKGIKAFWEICovalent bond The peptide bonds are covalent bonds. The bonds within amino acids are also covalent bonds. 39 / 45 Covalent bond disulfide bond ?Covalent bonds can form between amino acids that are not adjacent in polypeptide. ?Each cysteine has a sulfhydryl group (─SH). ?Two sulfhydryl groups can react to form a disulfide bond(二硫鍵 ). It hold distant parts of the protein together very tightly. 40 / 45 2) Hydrogen bond / 氫鍵 δ+HOHδ+δδ+HOHδ+δδ+HOHδ+δHydrogen bond Hydrogen bond is result of interactions between partial negative charges and partial positive charges. ?Oxygen atom brings partial negative charge. ? Hydrogen atoms bring partial positive charge. ?Interaction between oxygen and hydrogen atoms forms the hydrogen bond. 41 / 45 ?氫鍵（ hydrogen bond） 的形成常見于連接在一 電負(fù)性 很強(qiáng)的原子上的 氫原子 ，與另一電負(fù)性很強(qiáng)的 原子之間， 如 C=O ┅┅ HN。 ?Each subunit has own tertiary structure. ?multiple subunits 34 / 45 ?亞基（ subunit） 就是指參與構(gòu)成蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)、 每條 具有三級(jí)結(jié)構(gòu) 的多肽鏈。 ? 模體或基序（ motif）是結(jié)構(gòu)域的亞單位，通常由 2～ 3二級(jí)結(jié)構(gòu)單位組成，一般為 α螺旋、 β折疊和環(huán)（ loop）。 ? 多數(shù)情況下只有非極性殘基側(cè)鏈參與這些相互作用 ,而親水側(cè)鏈多在分子的外表面 31 / 45 結(jié)構(gòu)域 ? 結(jié)構(gòu)域（ domain） ? 結(jié)構(gòu)域是在二級(jí)結(jié)構(gòu)或超二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上形成三級(jí)結(jié)構(gòu)的局部折疊區(qū)，相鄰的域常被一個(gè)或兩個(gè)多肽片段連結(jié)。具有明確而穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)，幫助蛋白質(zhì)形成三維空間上每維都具周期性結(jié)構(gòu)。 28 / 45 ? （ 4） β 凸起： 在 β 折疊的一條多肽鏈中插入額外的殘基所形成的結(jié)構(gòu)。 ? 在回折部分，涉及 四個(gè) 氨基酸殘基 。 27 / 45 β turn的特征： ?主鏈骨架本身以大約 180176。 26 / 45 （ 3） 蛋白質(zhì)的 β 轉(zhuǎn)角 (βturn) ?蛋白質(zhì)分子的多肽鏈上常出現(xiàn) 180176。 側(cè)鏈 (CαC鍵 )幾乎垂直于折疊片平面。它 只涉及肽 鏈主鏈的構(gòu)象及鏈內(nèi)或鏈間形成的氫鍵 。 其旋轉(zhuǎn)角分別為 φ 和 ψ ，可描述多肽鏈的所有可能構(gòu)象。 (2)、一般的 CN單鍵 肽鍵 CN 一般的 C=N雙鍵 （鍵長(zhǎng) 197。 R基團(tuán)有 極性 但一般不解離。 4 / 45 紅細(xì)胞含有大量攜氧的血紅蛋白 螢火蟲的熒光素酶消耗 ATP催化底物發(fā)光 犀牛是唯一的一種具有完全由角蛋白組成角的動(dòng)物。它們?yōu)樯锾峁┝送庑魏土α?，以及運(yùn)動(dòng)功能。1 / 45 Chapter 1 Amino Acids to Proteins 從氨基酸到蛋白質(zhì) 2 / 45 Chapter 1 Amino Acids to Proteins Protein Composition Protein Co
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