包含飛生物醫(yī)學(xué)知識(shí)整合論(參考版)
2025-04-10 03:18本頁面
【正文】 （待續(xù)）參考文獻(xiàn)1. 包含飛：生物醫(yī)學(xué)知識(shí)整合論(一)，《醫(yī)學(xué)信息》雜志，16（6）：174279，2003：生物醫(yī)學(xué)知識(shí)整合論(二)，《醫(yī)學(xué)信息》雜志，16（8）：410415，2003：生物醫(yī)學(xué)知識(shí)整合論(三)，《醫(yī)學(xué)信息》雜志，16（11）:602605, 2003：生物醫(yī)學(xué)知識(shí)整合論(四)，《醫(yī)學(xué)信息》雜志，16（12）：666670，2003５. Bao .: The Theory of Biomedical Knowledge Integration(Ⅰ), Chinese Journal of Medical Treatment, 2(13): 16, 2003６. Bao .:The Theory of Biomedical Knowledge Integration(Ⅱ), Chinese Journal of Medical Treatment, 2(21), 16, 2003７．包含飛：生物醫(yī)學(xué)知識(shí)整合科學(xué)思維的成分異源性（I），《計(jì)算機(jī)應(yīng)用與軟件》：上海信息技術(shù)應(yīng)用文集，20（增刊）：171173，2003，８．Mark A. Musen :Medical Informatics: Searching for Underlying Components,9．蘭紀(jì)正、朱恩寬譯：《幾何原本》第I卷，臺(tái)灣：九章出版社，1992：從畢氏學(xué)派到歐氏學(xué)派的誕生，11. 默克診療手冊(cè)：：13..JH van Bemmel, MA Musen主編，包含飛，鄭學(xué)侃主譯：《醫(yī)學(xué)信息學(xué)》，上海：上?？萍汲霭嫔?，2002：Visual Basic 中文版基礎(chǔ)培訓(xùn)教程，北京：人民郵電出版社，200315 / 15。圖5以“肝內(nèi)膽汁淤積的發(fā)病機(jī)制”為例說明之。從臨床醫(yī)學(xué)的功利目標(biāo)來講，致病、致殘、致死機(jī)制均屬“底層背景空間”，組成“底層背景空間”的是量子性因子和量子性規(guī)則，其余則以與“底層背景空間”的距離遠(yuǎn)近分層。由于毛細(xì)膽管內(nèi)膽紅素濃度很高，故膽紅素由肝細(xì)胞內(nèi)分泌入毛細(xì)膽管是一個(gè)較復(fù)雜的—耗能—過程。故稱這種膽紅素為結(jié)合膽紅素，也稱直應(yīng)膽紅素。結(jié)合膽紅素主要的是膽紅素雙葡萄糖醛酸酯，另外有一部分結(jié)合膽紅素為膽紅素硫酸酯。(2) “直接操作子或規(guī)則不完全間接操作子或規(guī)則不完全關(guān)系類型明確”知識(shí)描述：以下以“肝細(xì)胞對(duì)膽紅素的處理” 三個(gè)過程[12]為例說明之（其中黑體斜體字為關(guān)系動(dòng)詞，黑體字與關(guān)系動(dòng)詞發(fā)生直接相關(guān)的一些因子和規(guī)則）：攝?。何唇Y(jié)合膽紅素隨血—流—至肝臟，很快就被肝細(xì)胞—攝取，與肝細(xì)胞載體蛋白－Y蛋白和Z蛋白—結(jié)合（這兩種載體蛋白，以Y蛋白為主，能夠特異地結(jié)合包括膽紅素在內(nèi)的有機(jī)陰離子）被動(dòng)—送—至滑面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。（3）細(xì)胞生物學(xué)規(guī)則：微絨毛在膽汁分泌中的重要作用?！薄笆懰岬牧u基少，極性低，與膽紅素和膽固醇形成的乳粒親水性差，在毛細(xì)膽管微絨毛內(nèi)發(fā)生淤積，滲透活性降低，從而使膽鹽依賴性膽流減少，引起肝內(nèi)膽汁淤積。” [12]知識(shí)背景3：包括：（1）膠體物理規(guī)則；（2）生物膜規(guī)則；（3）細(xì)胞生物學(xué)（微絨毛）規(guī)則。”[11]知識(shí)背景2：對(duì)于防病治病功利目標(biāo)來說，其基本作用規(guī)則至少包括：(1)一般流體力學(xué)規(guī)則,包括管徑，壓力梯度，液體黏度；（2）生物化學(xué)規(guī)則：包括膽結(jié)石形成機(jī)理和堵塞等。知識(shí)舉例2：“膽道始于相鄰肝細(xì)胞形成的膽小管,這些膽小管逐漸匯集成匯管,小葉間膽管及較大的肝管出肝門后,肝總管與膽囊管合成膽總管并開口于十二指腸。知識(shí)背景1：包括：（1）“肝細(xì)胞主動(dòng)分泌膽汁酸鹽”由細(xì)胞生理學(xué)規(guī)則決定；(2)“毛細(xì)膽管內(nèi)滲透壓升高，使水和電解質(zhì)進(jìn)入毛細(xì)膽管”為非生理膠體物理學(xué)規(guī)則決定。（?。┥镝t(yī)學(xué)知識(shí)背景空間的學(xué)科異質(zhì)性知識(shí)舉例1：“肝細(xì)胞主動(dòng)分泌膽汁酸鹽，使毛細(xì)膽管內(nèi)滲透壓升高，使水和電解質(zhì)進(jìn)入毛細(xì)膽管，因此膽汁酸鹽是決定毛細(xì)膽管膽汁流量的重要因素，這部分膽汁稱為‘膽鹽依賴性膽流’（Bile salt dependent bile flow, BSDF）。限于篇幅，本文只涉其一二。生物醫(yī)學(xué)系統(tǒng)以其令人敬畏的、神秘莫測(cè)的物理性傲慢地嘲弄著人類思維、理性和數(shù)學(xué)。 各級(jí)因子集合和規(guī)則集合組成的背景空間的層次結(jié)構(gòu)如圖3。（ⅶ）程序：為子程序，函數(shù)，變量，表達(dá)式等的復(fù)合。 子過程總體規(guī)則包括代碼編寫機(jī)制：組織，編輯和格式化代碼規(guī)則，語句執(zhí)行順序規(guī)定和控制等。子過程為完成一些經(jīng)常重復(fù)或共享任務(wù)的代碼體。執(zhí)行語句規(guī)則還包括賦值，注釋，程序退出或暫停，錯(cuò)誤處理，跳轉(zhuǎn)，判斷，循環(huán)語句，語句的嵌套結(jié)構(gòu)等。（ⅴ）基本語句：包括執(zhí)行語句，非執(zhí)行語句?；颈磉_(dá)式類型包括算術(shù)、關(guān)系、字符串、邏輯表達(dá)式。運(yùn)算符規(guī)則包括：運(yùn)算功能，操作數(shù)要求，表達(dá)式組成規(guī)則，結(jié)果值類型規(guī)定，精度不同的混合類操作數(shù)的精度轉(zhuǎn)換規(guī)定，違規(guī)處理（如超出精度的正確范圍）等。數(shù)組為批量對(duì)象的數(shù)據(jù)變量。為數(shù)據(jù)的抽象體系?，F(xiàn)以Visual Basic語言為例說明如下 [14]。任何計(jì)算機(jī)程序的基礎(chǔ)是編程語言。面對(duì)現(xiàn)象和物理結(jié)構(gòu)主宰一切的生物醫(yī)學(xué)世界，我們就更有理由借鑒這些科學(xué)巨擘做法而無須顧慮來自理性世界苛求和責(zé)難：（1） 確定要建立問題解決的功利目標(biāo)；（2） 在物理和意識(shí)的兩可領(lǐng)域獲得我們的學(xué)術(shù)背景空間基石（充分假借經(jīng)驗(yàn)的或?qū)嶒?yàn)的即物理的事實(shí)）；（3） 在此基礎(chǔ)上建立相應(yīng)的生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)。他的著名的不完備性定理更反映了意識(shí)系統(tǒng)對(duì)物理世界的依賴性。據(jù)說哥德爾也認(rèn)為， 數(shù)學(xué)家應(yīng)該不斷從現(xiàn)實(shí)世界中發(fā)現(xiàn)新的數(shù)學(xué)問題,然后在此基礎(chǔ)上構(gòu)筑新的數(shù)學(xué)體系。他以此告訴人們，不用無窮無盡地問下去，否則將自進(jìn)“地獄”；（2）他雖然確立了無高、無長(zhǎng)、無寬的“三無”意識(shí)之點(diǎn)，但沒有理會(huì)“沒有長(zhǎng)度之點(diǎn)怎么能累積成具有長(zhǎng)度的線”的責(zé)難，因?yàn)槲锢砜臻g的點(diǎn)都可均勻累積成線。阿基里斯“一不小心”就可趕上和超過烏龜，但從“嚴(yán)格的理性思維”來說他永遠(yuǎn)無法超越。也許歐氏清楚，在這個(gè)問題上意識(shí)世界和物理世界是無法調(diào)和的。但對(duì)人們用嚴(yán)格理性審查的眼光加以批評(píng)的老問題“沒有長(zhǎng)度之點(diǎn)怎么能累積成具有長(zhǎng)度的線”，歐氏卻不予理睬。所以從某種意義可以說由嚴(yán)密推理建立起來的 “純理性”的歐幾里得幾何的基礎(chǔ)卻是“非理性”的經(jīng)驗(yàn)和物理。鑒于畢氏學(xué)派的教訓(xùn)，歐幾里得巧妙地在意識(shí)世界和物理世界容易達(dá)到“共識(shí)”的區(qū)域借助或物理的“直觀自明”或理性的常識(shí)概念的一套公設(shè)，公理和定義作為量子因子和量子規(guī)則，來演繹他的幾何體系。當(dāng)畢氏的學(xué)生希伯斯發(fā)現(xiàn)邊長(zhǎng)為1的正方形的對(duì)角線的長(zhǎng)度不是既約分?jǐn)?shù)，并用√2表示對(duì)角線的長(zhǎng)度，因此標(biāo)志了無理數(shù)概念的誕生時(shí)，畢氏學(xué)派非常
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