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家畜育種學(xué)07種畜的遺傳評(píng)估三blup育種值估計(jì)(參考版)

2025-05-19 02:06本頁(yè)面
  

【正文】 另一個(gè)在豬場(chǎng),各種豬場(chǎng)用于進(jìn)行場(chǎng)內(nèi)遺傳評(píng)估,以解決場(chǎng)內(nèi)選種與遺傳評(píng)估中心發(fā)布遺傳評(píng)估結(jié)果的時(shí)間差問(wèn)題,為選種作一定參考 Add your pany slogan 。 ? GBS是中文 WINDOWS95/WINDOWNT下的管理信息系統(tǒng)。 PEST可以在不同的操作系統(tǒng)下運(yùn)行。 ? 根據(jù)性能測(cè)定和生產(chǎn)數(shù)據(jù), PEST提供了基于 30多種數(shù)學(xué)模型的單性狀或多性狀 BLUP育種值的計(jì)算,包括固定模型、個(gè)體動(dòng)物模型、公畜模型、公畜 — 母畜模型和外祖父模型等 。下面對(duì)一些常用的遺傳評(píng)估軟件進(jìn)行介紹。從前面例子我們可以看出,僅僅 5個(gè)個(gè)體兩個(gè)性狀就產(chǎn)生很大的方程組,而對(duì)于豬、雞等畜禽在 BLUP法中所涉及的線性方程組是非常大的,對(duì)一些跨群(場(chǎng))的遺傳評(píng)定,方程組個(gè)數(shù)可達(dá)幾萬(wàn)至幾十萬(wàn),如此大數(shù)量的方程組用手工計(jì)算是根本不可能的 。 種豬達(dá) 100kg日齡記錄 豬場(chǎng) 個(gè)體 父親 母親 達(dá) 100kg日齡 1 1 — — 140 1 2 — — 152 1 3 1 — 135 2 4 1 2 143 2 5 3 2 160 ?個(gè)體間加性遺傳相關(guān)矩陣的計(jì)算 ?????????????????13 7 3 7 A111 ?a 122 ?a 02112 ?? aa133 ?a 113113 ??? aaa 3255 ??? aa )()( 12131551 ??????? aaaa?個(gè)體間加性遺傳相關(guān)矩陣逆矩陣的計(jì)算 ? 構(gòu)建 : 111?l 021 ?l 1131 ?? ll 431 23133 ??? ll)( 211141 ??? lll 2242 ?? ll 21)(1 24224144 ???? lllL?????????????????0001000001L?個(gè)體間加性遺傳相關(guān)矩陣逆矩陣的計(jì)算 ? 構(gòu)建對(duì)角矩陣: ? 令: ? ?2,2,34,1,1)( 2 ?? 1Dd ia g2)( 11 DA ?? ???????????????????????????????????202100202110611213211212210132216111A ?構(gòu)建線性模型 ? 根據(jù)資料性質(zhì),可對(duì)種豬達(dá) 100kg日齡寫出如下動(dòng)物模型: ? 用矩陣形式表示,則對(duì)于該資料有: ijjiij eahy ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????2524131211543212110000010000010000010000011010010101160143135152140eeeeeaaaaahhy ?構(gòu)建混合模型方程組 ? 因此有: ?????????? 2003XX?????????? 1100000111ZX )ZX(XZ ??????????????????????1000001000001000001000001ZZ?????????? 303427yX??????????????????160143135152140yZ 2 2 ????? h hk???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????160143135152140303427???????40220210402210206 6 6 3 3 2215101023 3 3 6 6 110002000111035432121aaaaahh?求解混合模型方程組有: ? ?? ?50 033 2??????? 5432121?????aaaaahh ?兩性狀動(dòng)物模型 BLUP法育種值估計(jì) ? 某種豬場(chǎng)有如下種豬性能測(cè)定資料,測(cè)定性狀為達(dá) 100 kg日齡和達(dá) 100kg背膘 ,試以兩個(gè)性狀資料進(jìn)行個(gè)體育種值估計(jì)。 ?兩性狀線性模型 ?合并的矩陣形式: ?????????222222111111euZbXyeuZbXy??????????????????????????????????????????212121212121eeeuuaZ00ZZbbbX00XXyyy ,eZuXby ???0u ?)(E 0e ?)(E Xby ?)(E ???????????????????IR00AGeu00V ar?????????22211211gggg0G ?????????22211211rrrr0R ?令 ?兩性狀混合模型方程組的簡(jiǎn)化形式 : ?獲得綜合育種值 ? 得到各個(gè)個(gè)體兩個(gè)性狀的估計(jì)育種值后,可用性狀經(jīng)濟(jì)重要性進(jìn)行加權(quán)計(jì)算綜合育種值,或者將估計(jì)育種值轉(zhuǎn)化為標(biāo)準(zhǔn)化的估計(jì)育種值,然后再加權(quán)計(jì)算綜合育種值。 ?另一種方法可以 利用一個(gè)多性狀模型對(duì)多個(gè)性狀同時(shí)進(jìn)行估計(jì) 。 ?公畜 — 母畜模型 ( siredam model ) ? 數(shù)學(xué)方程式: ? 期望和方差: ? 混合模型方程組:
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