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2024-12-30 03:23 本頁(yè)面
【正文】 可以用 的方式傳遞載體圖。所看即所得 (What You See Is What You Get)的編輯環(huán)境使得你的打印結(jié)果和你在屏幕上看到的保持一致。自動(dòng)識(shí)別和解析序列文件。 Digest ? DIGEST 能夠掃描 DNA序列并查找限制性內(nèi)切酶位點(diǎn) .它支持使用者限定搜索特定的酶 ,如果此酶在限制性酶切酶庫(kù)文件 ,它會(huì)列出酶切位置并對(duì)酶切片段按長(zhǎng)度排序 .它使用 Don Gilbert的讀序模塊 UREADSEQ,所以讀出大部分的序列文件格式。 同類軟件： molmol pdb等格式的蛋白文件通過(guò)轉(zhuǎn)換，存成普通的圖形文件。 1 電泳圖譜分析 ? 推薦軟件： band leader 提供處理 DNA或蛋白分子凝膠電泳圖象和從凝膠電泳圖象獲得相關(guān)數(shù)據(jù)的工具。 格式轉(zhuǎn)換 ? 各種軟件為了自己軟件的需要有不同的格式，對(duì)我們使用數(shù)據(jù)帶來(lái)了困難；格式轉(zhuǎn)換軟件能幫助用戶解決這一問(wèn)題。 Cn3D ?是由 NCBI開發(fā)的用于觀看蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的軟件，其設(shè)計(jì)的主要目的是為 NCBI在其站點(diǎn)中的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù) MMDB提供專業(yè)的結(jié)構(gòu)觀察軟件，其主要的操作界面分為兩個(gè)窗口，如右圖所示，一個(gè)為結(jié)構(gòu)窗口，另一個(gè)為序列窗口。而且它程序短小，功能強(qiáng)大。 三維結(jié)構(gòu)顯示 ?通過(guò)各種方法計(jì)算出來(lái)的各種三維結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)，只要在三維結(jié)構(gòu)瀏覽軟件的幫助下，才能顯示出來(lái)；從而使用戶形象地看到生物大分子的三維立體結(jié)構(gòu)。 蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)分析 ? 推薦軟件： Antheprot 蛋白序列分析軟件包 ANTHEPROT 于法國(guó)的蛋白質(zhì)生物與化學(xué)研究院（ Institute of Biology and Chemistry of Proteins）用十多年時(shí)間開發(fā)出的蛋白質(zhì)研究軟件包。 3. RNA文庫(kù)（ RNA Library）用一種容易操作的方式來(lái)組織你所有的 RNA數(shù)據(jù)文件。 RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) ? RNAdraw 是一個(gè)進(jìn)行 RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)計(jì)算的軟件。其主要界面分為序列編輯窗口（ Geank），質(zhì)粒作圖窗口（ Plasmid Design），酶切分析窗口（ Restriction Sites）和紋基分析窗口（ Motif）。與大多數(shù)分析的軟件不同，它制作并顯示克隆策略中的分子構(gòu)建過(guò)程；包括質(zhì)粒構(gòu)建，模擬電泳條帶；當(dāng)然還可以質(zhì)粒作圖（有無(wú)序列均可）。這正是 MACAW所要解決的問(wèn)題。 ? 2. 應(yīng)用一個(gè)最近發(fā)展的數(shù)學(xué)原理計(jì)算 block類似性的統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性。選擇項(xiàng)多，可以達(dá)到所需的要求。 ? 可簡(jiǎn)單地通過(guò)手動(dòng)拖動(dòng)鼠標(biāo)以擴(kuò)增出相應(yīng)片段所需的引物，而在手動(dòng)的任何時(shí)候，顯示各種參數(shù)的改變和可能的二聚體、異二聚體、發(fā)夾結(jié)構(gòu)等。 ? 另外 DNAssist在輸出上非常完美，除了圖形、線性顯示外，還有類似 DNASIS的列表方式，列出有的位點(diǎn)（按酶排列，按堿基順序排列）。這樣就可以用自定義的標(biāo)題識(shí)別序列，而不必通過(guò)它們的文件名。當(dāng)程序不能辨別序列的格式時(shí)（通過(guò)尋找常用序列格式的特征），會(huì)顯示這個(gè)文
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