動物基因組學(xué)基礎(chǔ)ppt課件-wenkub.com
2025-01-14 16:25 本頁面
【正文】 這一研究領(lǐng)域叫轉(zhuǎn)錄組學(xué)(transcriptomics) 轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究方法－ DNA芯片技術(shù) ? 同時進(jìn)行大量分子雜交，以分析比較不同組織或器官的基因表達(dá)水平，篩選突變基因，從核酸水平分析基因表達(dá)模式 ?面積不大的基片表面分成不同小格 → 有序的點陣排列核苷酸分子 → 將待分析的核苷酸分子標(biāo)記變性成單鏈，與芯片上的核苷酸分子雜交 → 洗掉芯片上序列不同的核苷酸分子 → 利用高精度的激光掃描儀記錄已雜交分子的熒光信號 → 計算機(jī)分析 蛋白質(zhì)組學(xué) (proteomics) ? 蛋白質(zhì)組 (proteom)：一個細(xì)胞內(nèi)的全套蛋白質(zhì)。 QTL定位的策略 （ 1）選擇適宜的遺傳標(biāo)記； （ 2）選擇在所研究數(shù)量性狀上處于分離狀態(tài)的純系或高度近交系； （ 3）進(jìn)行系間雜交獲得分離世代的 F2個體或者進(jìn)行回交獲得 BC個體； （ 4）檢測各世代群個體的標(biāo)記基因型并記錄其數(shù)量性狀表型值； （ 5）分析標(biāo)記基因型與數(shù)量性狀表型值之間是否存在連鎖關(guān)系，確定 QTL連鎖群，估計 QTL效應(yīng)。 控制同一性狀的微效基因可能存在于有限的幾個基因群內(nèi)，而一基因群占據(jù)染色體的一定區(qū)域，稱作 QTL QTL定位的概念 確定一個數(shù)量性狀受到多少個 QTL作用的控制，確定它們在染色體上的位置，并估計出它們對數(shù)量性狀的效應(yīng)大小及其互作效應(yīng)，該過程稱為 QTL定位 (QTL mapping)。 cM值越大，兩者之間距離越遠(yuǎn) （一） 遺傳標(biāo)記 圖譜構(gòu)建中需要可以鑒別的標(biāo)記 (marker) ?遺傳標(biāo)記（ Geic Markers）：是指能夠用以區(qū)別生物個體或群體及其特定基因型，并能穩(wěn)定遺傳的物質(zhì)標(biāo)志 ?基因標(biāo)記： 用基因作為標(biāo)記，分析各基因間的連鎖關(guān)系及遺傳距離，繪制出連鎖遺傳圖譜 ?DNA標(biāo)記： RFLP、 SSLP、 SNPs等 ?包括形態(tài)標(biāo)記、細(xì)胞學(xué)標(biāo)記、生化標(biāo)記、 DNA分子標(biāo)記 形態(tài)標(biāo)記 ? 形態(tài)性狀：株高、顏色、白化癥等 ? 又稱表型標(biāo)記 ? 數(shù)量少 ? 很多突變是致死的 ? 受環(huán)境、生育期等因素的影響 ? 最早建立的果蠅連鎖圖，就是利用控制果蠅眼睛的形狀、顏色，軀體的顏色、翅膀的形狀等形態(tài)性狀作為標(biāo)記，分析它們連鎖關(guān)系及遺傳距離，繪制而成的 ? 控制性狀的其實是基因，所以形態(tài)標(biāo)記實質(zhì)上就是基因標(biāo)記 果蠅連鎖圖 細(xì)胞學(xué)標(biāo)記 ?明確顯示遺傳多態(tài)性的 染色體結(jié)構(gòu)特征和數(shù)量特征 染色體的核型 染色體的帶型 染色體的結(jié)構(gòu)變異 染色體的數(shù)目變異 ?優(yōu)點：不受環(huán)境影響 ?缺點：數(shù)量少、費力、費時、對生物體的生長發(fā)育不利 生化標(biāo)記 ?又稱蛋白質(zhì)標(biāo)記 ，就是利用蛋白質(zhì)的多態(tài)性作為遺傳標(biāo)記 如：同工酶、等位酶 ?優(yōu)點：數(shù)量較多，受環(huán)境影響小 ?缺點：受發(fā)育時間的影響、有組織特異性、只反映基因編碼區(qū)的信息 DNA分子標(biāo)記 簡稱分子標(biāo)記，以 DNA序列的多態(tài)性作為遺傳標(biāo)記 優(yōu)點： ? 不受時間和環(huán)境的限制 ? 遍布整個基因組，數(shù)量無限 ? 不影響性狀表達(dá) ? 自然存在的變異豐富，多態(tài)性好 ? 共顯性，能鑒別純合體和雜合體 理想的分子遺傳標(biāo)記應(yīng)具備的特點 ?遺傳多態(tài)性高 ?檢測手段簡單快捷 ?易于實現(xiàn)自動化 ?遺傳共顯性 第一代 DNA遺傳標(biāo)記 （ restriction fragment length polymorphism， RFLP） ? 最早的 DNA標(biāo)記 ? 限制性酶切位點：被特定的內(nèi)切酶所識別的 4個或更多個堿基組成的特異性序列 ? DNA序列能或不能被某一酶酶切 ， 相當(dāng)于一對等位基因的差異 ? 可將 RFLP作為標(biāo)記 ， 定位在基因組中某一位置上 ? 人類基因組中有 105個 RFLP位點 ， 每一位點只有兩個等位基因 RFLP 分析過程 RFLP 分析結(jié)果 RFLP 標(biāo)記的特點 ? 可靠 —— 重現(xiàn)性好 ? 目的序列已知時才能檢測 ? 操作復(fù)雜 —— 自動化程度低 ? 耗時長 —— 至少需要 2天，通常 37天 ? 多態(tài)信息含量低 PCRRFLP PCR 電 泳 酶 切 基因型 ? 基因組中存在大量重復(fù)序列 ? 重復(fù)單位長度在 1565個核苷酸左右的小衛(wèi)星DNA ? 在酶切片段里邊核心序列重復(fù)次數(shù)不同導(dǎo)致酶切片段長度的差異 ? 又稱為 DNA指紋 ? 與 RFLP 分析方法類似，利用探針雜交檢測 ? 區(qū)別在于酶切位點不在可變重復(fù)區(qū)，而在側(cè)翼區(qū) VNTR 分析過程 VNTR 檢測結(jié)果 VNTR 標(biāo)記的特點 ? 多態(tài)性檢測率高 —— 一個探針可以檢測出十幾個甚至幾十個位點的多態(tài)信息 ? 位點呈共顯性遺傳 ? 個體具有高度特異性 ? 技術(shù)復(fù)雜，實驗成本高 ? 有時譜帶過于復(fù)雜，難于分辨 VNTR 應(yīng)用 ? 計算遺傳距離
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