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細(xì)胞識(shí)別統(tǒng)計(jì)系統(tǒng)的開發(fā)畢業(yè)論文-資料下載頁

2025-06-24 01:49本頁面
  

【正文】 (i=1,2...,N)這里可看出,矢量中值濾波是在滑動(dòng)窗口中尋找一個(gè)距離其他像素矢量最近的像素,并以此像素替代原中心像素。如果有多個(gè)矢量都為最小值,則選擇離滑動(dòng)窗的中心最近的矢量。 矢量中值濾波會(huì)對(duì)圖像的邊界有所扭曲。而自適應(yīng)矢量中值濾波改進(jìn)之處就是如何保護(hù)這些圖像的信息【17】。設(shè)計(jì)的濾波器對(duì)有用部分不會(huì)改變,只有噪音點(diǎn)才會(huì)受到影響。這就要求要滿足以下鑒別操作判定準(zhǔn)則: 如果Val≥Tol,那么V(n+1)/2(即模板中點(diǎn))為噪音點(diǎn),否則判為無噪點(diǎn)。其中R代表范數(shù),一般取2范數(shù)。當(dāng)Val值大于等于T01時(shí),就調(diào)用傳統(tǒng)矢量中值濾波(VMF),否則不進(jìn)行任何操作。Tol是一個(gè)閾值,它顯示了對(duì)選取模板大小的標(biāo)準(zhǔn)誤差的依賴程度。按照經(jīng)驗(yàn)來看,一般取60。但從編程效果來看,60顯得比較大,特別是模板數(shù)很小的時(shí)候,60難以進(jìn)行濾波,所以可以適當(dāng)改小。 另外,這種方法不能去除高斯噪音。這是算法自身的問題造成M1。將此算法稍微改進(jìn)一下可以對(duì)高斯噪音進(jìn)行消除:1) 對(duì)所有滑動(dòng)窗內(nèi)的矢量Vi,計(jì)算其二范數(shù)Si2) 對(duì)所有Si,進(jìn)行排序,只取其中中間位置的T個(gè)值,把它們所對(duì)應(yīng)的168。挑出來,組成新的集合T。T的取值根據(jù)噪聲的特性和對(duì)運(yùn)算量的要求可以動(dòng)態(tài)調(diào)整。3) 對(duì)集合,中的所有矢量計(jì)算其各個(gè)分量的加權(quán)平均值,得到加權(quán)平均值量VWQ=(r1,r2,…rm),其中ri是矢量的各個(gè)分量,m為矢量的分量數(shù)。4) 對(duì)集合,中所有矢量計(jì)算其到加權(quán)平均值矢量VWQ的距離,取其中距離最小的P個(gè)矢量,組成一個(gè)新的集合R。5) 對(duì)集合R進(jìn)行傳統(tǒng)的矢量中值濾波,得到最后的濾波結(jié)果Xvm 這種改進(jìn)算法融合了線性均值濾波和非線性矢量中值濾波兩種方法,因而對(duì)高斯噪聲的平滑和脈沖噪聲的濾除以及圖像邊緣信息的保護(hù)都有較好的效果。 圖像分割是圖像分析和圖像理解的第一步,也是圖像處理中最古老和最棘手的問題之一。所謂圖像分割,就是將圖像表示為物理上有意義的連通區(qū)域的集合,這些區(qū)域的灰度或顏色大致相同,或者反照率和紋理屬性相近。目前,大多數(shù)算法都是針對(duì)灰度圖像的,而對(duì)于彩色圖像,由于它含有豐富的顏色和紋理等信息,其分割是一個(gè)很復(fù)雜的問題,很少有自動(dòng)算法能夠取得非常理想的效果。 HSI顏色模型在本系統(tǒng)中的應(yīng)用 在HSI顏色模型中,H表示色調(diào),用來區(qū)分不同的顏色;S表示飽和度,用來表示某種顏色的純度。對(duì)于經(jīng)過染色的細(xì)胞,不同系列不同發(fā)育階段的細(xì)胞其顏色在人眼視覺上的表現(xiàn)是不同的。為了描述這種視覺上的不同,需要根據(jù)細(xì)胞的顏色特點(diǎn)選擇不同的分割閾值條件,不能對(duì)所有的細(xì)胞都用H分量或S分量作為閾值條件。在血細(xì)胞圖像中,部分細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)的顏色類別明顯不同,使用H分量作為分割閾值條件可以保證細(xì)胞質(zhì)區(qū)域的H值和其他細(xì)胞的H值落在兩個(gè)不相交的區(qū)間,使得對(duì)這類細(xì)胞的分割能夠達(dá)到比較理想的效果【9】。從人眼的視覺感受來說,紅細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)雖然顏色類別大致一樣,但它們之間的顏色純度不同,使用S分量來描述這種現(xiàn)象可以保證同類細(xì)胞的S值落在相同的區(qū)間,而不同類的落在不同區(qū)間。在程序中利用這種S值區(qū)間的不相交性可以得到比使用H分量精確許多的輪廓。為了進(jìn)一步提高分割效果,本文也聯(lián)合使用了H分量和S分量作為閾值條件,這樣就充分利用了像素點(diǎn)的顏色信息。一次判斷使用兩個(gè)值條件提高了分割的限制要求,理論上會(huì)得到更為精確的區(qū)域邊界。但從實(shí)際的分割效果看,會(huì)產(chǎn)生過分割現(xiàn)象并帶來分割區(qū)域的不完整性。產(chǎn)生這種現(xiàn)象的原因和血細(xì)胞的顏色特點(diǎn)有關(guān),染色后的細(xì)胞很少能夠整個(gè)細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)區(qū)域同時(shí)滿足H分量和S分量的閡值要求。兩個(gè)區(qū)域用H值可以區(qū)分時(shí),它們的S值可能是重疊的;用S值可以區(qū)分時(shí),H值可能是重疊的。因此需要根據(jù)細(xì)胞的顏色特點(diǎn)選擇不同的閾值條件,過多的限制不會(huì)產(chǎn)生預(yù)期的效果。 對(duì)于HSI的信息生成,需要依次得到所有像素點(diǎn)的RGB值,并進(jìn)行RGB到HSI的轉(zhuǎn)化,可采用下列公式【8】: HSI分割的算法步驟為:1) 選取一塊特征區(qū)域,記錄下特征顏色區(qū)域的RGB值,將其轉(zhuǎn)化為HSI值。取得所選區(qū)域的平均H、S、I值。2) 為了更加準(zhǔn)確的選中閾值內(nèi)的區(qū)域,適當(dāng)調(diào)節(jié)HSI的選擇范圍,能夠?qū)⒃撻撝堤卣鞯拇笾路秶M(jìn)去。3) 遍歷圖像每個(gè)像素,同時(shí)得到每個(gè)像素的HSI值,存入VECTOR中。當(dāng)像素的H、S、I值在特征區(qū)域的閾值范圍內(nèi),則標(biāo)志該像素。 HSI顏色模型分割結(jié)果 下面的效果圖是根據(jù)下面的范圍得到的: HSI顏色模型分割效果圖 由上效果圖看出,使用HSI閾值分割比直接使用直方圖閾值分割效果好的多。說明HSI顏色模型更加適用于彩色圖像,而直方圖閾值分割更加適用于灰度圖像的分割。 經(jīng)過了平滑、閾值分割、種子孔洞填充、梯度修正、腐蝕、細(xì)化統(tǒng)計(jì)中心點(diǎn)以后,這么多步的結(jié)果可能存在不少的錯(cuò)誤,因此需要進(jìn)行修正。系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)最后的正確統(tǒng)計(jì)需要進(jìn)行的修正應(yīng)該有以下幾個(gè)方面:圖像邊界只顯示了半個(gè)或大半個(gè)細(xì)胞 這是非常常見的情況。當(dāng)圖像邊界存在閾值范圍內(nèi)被標(biāo)志的細(xì)胞,且剛好不是全部都在圖片內(nèi),而是一部分或者一大部分顯示在圖片內(nèi),那么非常有必要判斷此細(xì)胞該不該在統(tǒng)計(jì)范圍之內(nèi)。 我們知道,當(dāng)腐蝕細(xì)化過程以后,每一塊獨(dú)立的標(biāo)志訪問區(qū)域都將產(chǎn)生一個(gè)中心點(diǎn),根據(jù)中心點(diǎn),我們可以確定細(xì)胞的圓心。此后,根據(jù)細(xì)化的次數(shù)得到半徑。而在這里,由于有一部分細(xì)胞未被顯示,邊界處的細(xì)胞將會(huì)使用更少的細(xì)化次數(shù)找到中心點(diǎn),因此就會(huì)得到更小的半徑值。平均半徑值是根據(jù)每個(gè)中心點(diǎn)對(duì)應(yīng)的細(xì)化次數(shù)累加得到總的半徑值除以中心點(diǎn)個(gè)數(shù)得到。因此當(dāng)只有顯示了半個(gè)或者大半個(gè)細(xì)胞的邊界細(xì)胞,如果其半徑值達(dá)到平均半徑值的一半的話,即認(rèn)為此為一個(gè)閾值內(nèi)細(xì)胞,應(yīng)該統(tǒng)計(jì)在內(nèi),其大小按照分割后提取的邊界畫出,半徑統(tǒng)計(jì)為平均半徑值;對(duì)于其他在圖片內(nèi)的上述情況,同樣按照實(shí)際情況畫出,但是只能認(rèn)為這個(gè)細(xì)胞大小與普通的存在一定差異:對(duì)于其他所有細(xì)胞,那此細(xì)胞按本身統(tǒng)計(jì)的半徑值畫出。去掉所有內(nèi)部包含另外一個(gè)圓的大圓 一個(gè)圓內(nèi)還包含著另外一個(gè)圓,即一個(gè)細(xì)胞完全包含了另外一個(gè),這顯然是錯(cuò)誤的情況。因?yàn)樵谶@種情況下,表現(xiàn)在圖像上應(yīng)該是一個(gè)細(xì)胞被另外一個(gè)細(xì)胞完全覆蓋。這是連人眼都無法辨別出來的,通過程序就更無法辨別出來了。這種情況很可能是由于細(xì)化算法的誤差造成的。如果不去掉其中的一個(gè)圓,那么在計(jì)數(shù)的時(shí)候就多出了一個(gè)細(xì)胞。去掉同時(shí)和多個(gè)圓相交,且不相交部分占圓總面積很小的圓 同兩個(gè)或者兩個(gè)以上的圓相交,并且不相交的部分面積占本身圓的面積的比例過小。這種情況也是比較容易出現(xiàn)的,一般可能是重疊部分太大出現(xiàn)的情況,也是細(xì)化算法不精確導(dǎo)致的問題。 相交部分多余圓的修正 ,3個(gè)圓相接觸或者稍微相交的情況下,初次判斷會(huì)在中間多出一個(gè)圓,但是很明顯,多出來的是背景圓,是錯(cuò)誤判斷的結(jié)果,所以經(jīng)過修正,多余的圓將被除去。 本章主要對(duì)細(xì)胞統(tǒng)計(jì)識(shí)別系統(tǒng)的一般方法進(jìn)行了部分改進(jìn),以期得到更好的統(tǒng)計(jì)效果。 本章的改進(jìn)方法主要針對(duì)圖像的噪聲處理,彩色圖像的閾值選取處理以及細(xì)化取得中心點(diǎn)后的細(xì)胞判斷修正。對(duì)于這三項(xiàng)的改進(jìn)都得到了不錯(cuò)的效果,大大的改進(jìn)了統(tǒng)計(jì)結(jié)果,減小了誤差。對(duì)于最終結(jié)果的統(tǒng)計(jì),在下一章將進(jìn)行介紹。4 識(shí)別統(tǒng)計(jì)系統(tǒng)最優(yōu)化討論 通過前面的介紹,可以看到通過了很多步驟的操作,能最終得到結(jié)果。在這個(gè)過程中,特別是彩色圖像,由于閾值的選取的不同會(huì)造成種子填充以及腐蝕細(xì)化的許多變化,結(jié)果也會(huì)出現(xiàn)很大偏差。同樣會(huì)造成結(jié)果偏差的還有腐蝕的次數(shù)。怎樣才能在針對(duì)不同圖片,使用不同方法,得到理想的數(shù)據(jù),這就需要對(duì)這些處理進(jìn)行最優(yōu)化的討論,以期找到最合適的值。由于灰度圖的閾值很容易選定,所以本章所討論的主題是圍繞彩色圖像。 本文采用的是選取一塊特征區(qū)域,再將選定的區(qū)域的RGB值轉(zhuǎn)換成HSI值,并取得平均值。因?yàn)閳D像本身,就算是特征區(qū)域,其自身的HSI值都有所不同,所以選擇不同的區(qū)域,最終的結(jié)果都會(huì)有所不同。為了便于以后比較,針對(duì)每張圖片所選取的區(qū)域都將統(tǒng)一在一個(gè)相同的位置。對(duì)于所得區(qū)域的HSI值的閎值范圍,由于我們所得圖片的亮度一般來說變化不大,而不同細(xì)胞之間的H和S變化尤為明顯,所以應(yīng)該著重調(diào)整H和S。選擇不同的范圍(盡量不要將背景色選入造成誤差),將得到不同的閾值范圍。 前面已經(jīng)講過,在細(xì)化得到中心點(diǎn)坐標(biāo)之前,必須對(duì)已經(jīng)劃分了閾值的圖像進(jìn)行腐蝕,目的是去掉小且無意義的點(diǎn)與可能錯(cuò)誤劃分的小的標(biāo)志區(qū)域,這些都是背景噪聲,應(yīng)該去掉。但是,要使用幾次腐蝕才能達(dá)到目標(biāo),這樣不僅能夠去掉噪聲,也能很好的保留圖像原有的信息,保證細(xì)胞的統(tǒng)計(jì)半徑不會(huì)有太大的變化。 實(shí)例飽和度的變化因?yàn)榇藞DR,G,B三色各自的直方圖比較均衡,圖像各區(qū)域亮度變化不大,所以這里只針對(duì)色調(diào)和飽和度的變化進(jìn)行討論。其中,細(xì)胞總數(shù)為220,亮度選取范圍為5%,腐蝕次數(shù)定為2次。其余的算法操作都采用一樣的步驟,共進(jìn)行6次比較: 色調(diào)、飽和度變化表 變量 次數(shù)色調(diào)(H)%飽和度(S)%亮度(I)%腐蝕次數(shù)半徑統(tǒng)計(jì)量誤差12%4%5%210207%23%5%5%211205%34%6%5%212205%45%7%5%212203%56%8%5%213212%67%9%5%212223% 從表中可以看到,其他的變量確定后,隨著色調(diào)和飽和度的加大,統(tǒng)計(jì)的效果也越來越好,而且,當(dāng)采用第五種數(shù)值時(shí),識(shí)別的細(xì)胞大小失真也相當(dāng)小。當(dāng)H,S范圍繼續(xù)擴(kuò)大時(shí),所選取的背景噪音會(huì)加大,誤選的細(xì)胞增多,同時(shí)很多應(yīng)該選取區(qū)域因?yàn)榉秶募哟螅渲苓厖^(qū)域與細(xì)胞連接區(qū)域都被選上,且不是閉合區(qū)域,在腐蝕細(xì)化后往往會(huì)多出一些非特征區(qū)域細(xì)胞,造成結(jié)果的難以正確統(tǒng)計(jì)。雖然從結(jié)果上,第六種情況誤差最小,但是是由于加大選取范圍造成大量特征區(qū)域外細(xì)胞被選取。所以這里選用第五種情況采用的范圍。這里只針對(duì)腐蝕次數(shù)的變化進(jìn)行討論。其中,細(xì)胞總數(shù)為220,色調(diào)選取范圍為6%,飽和度選取范圍為8%,亮度選取范圍為5%。其余的算法操作都采用一樣的步驟 腐蝕次數(shù)變化表 變量 次數(shù)色調(diào)(H)%飽和度(S)%亮度(I)%腐蝕次數(shù)半徑統(tǒng)計(jì)量誤差16%8%5%113226%26%8%5%213213%36%8%5%312209%46%8%5%411203%56%8%5%510196% ,隨著腐蝕次數(shù)從小變大,統(tǒng)計(jì)量也是從多變少,說明噪聲信號(hào)的減少,使得噪聲被選中的區(qū)域越來越少:同時(shí),腐蝕次數(shù)過多的話,會(huì)造成特征區(qū)域被嚴(yán)重腐蝕而可能有些區(qū)域反而不會(huì)入選。 綜合上面的比較可以得出,在選取的特征區(qū)域一定,H、S、I范圍分別為6%、8%、5%,腐蝕次數(shù)在2次的時(shí)候,能得到最好的統(tǒng)計(jì)效果,且細(xì)胞大小的識(shí)別正確率也最高。 實(shí)例2 三原色直方圖 這是另一副人體細(xì)胞的圖片,圖中細(xì)胞多呈長條形,與血細(xì)胞的原形有一定區(qū)別。為了驗(yàn)證系統(tǒng)的通用性而作為綜合實(shí)例。、飽和度的變化由于此圖除了紅色以外,在顏色上比較豐富,總體亮度比較暗,所以相對(duì)來說,H和I的選取是比較重要的因素,而S可以暫時(shí)設(shè)定為固定值5%。由于存在的一些噪聲區(qū)域比較大,故采用3次腐蝕。圖中共有48個(gè)細(xì)胞。 色調(diào)、亮度變化表 變量 次數(shù)色調(diào)(H)%飽和度(S)%亮度(I)%腐蝕次數(shù)半徑統(tǒng)計(jì)量誤差12%5%2%31239%23%5%4%31651%34%5%6%31547%45%5%8%31651%56%5%10%31650%67%5%12%31655% 綜合上面的結(jié)果,雖然2,3種情況看結(jié)果還不錯(cuò),但是由于對(duì)比較長的細(xì)胞判斷錯(cuò)誤將一個(gè)細(xì)胞判為2個(gè)細(xì)胞,并且因?yàn)榉秶x取的不夠,使得很多特征區(qū)域沒有入選,從統(tǒng)計(jì)的準(zhǔn)確性來說是不夠的。情況5雖然也有判為2個(gè)細(xì)胞情況,但是較前幾種情況為好。所以選定第五種情況的H,I,S值。 因?yàn)榧?xì)胞太長,特征區(qū)域邊緣可能不夠光滑,造成細(xì)化時(shí)候出現(xiàn)2個(gè)中心點(diǎn)。這是本系統(tǒng)存在的問題之一。 本章是基于整個(gè)系統(tǒng)搭建完成的情況下,根據(jù)產(chǎn)生結(jié)果的幾個(gè)影響因素來討論,希望能夠找到一個(gè)最優(yōu)化的取值方式來得到的好的結(jié)果。本章采用了2張具有代表性的圖片來進(jìn)行討論。第一張的R,G,B值比較均衡,亮度影響因素較小,細(xì)胞眾多,所以考慮的H和S因素較多。且噪音范圍較小,所以腐蝕次數(shù)取得不大。第二張是細(xì)胞較少、較大,顏色偏暗,此時(shí)H影響不明顯,而I的作用變大,并且噪音較大,所以選用腐蝕次數(shù)較多。在實(shí)際應(yīng)用中,應(yīng)該根據(jù)每張圖片的情況選用不同方式進(jìn)行統(tǒng)計(jì),才能取得較理想的效果。 5 總結(jié) 本文系統(tǒng)地闡述了對(duì)于細(xì)胞圖片(灰度,彩色)的識(shí)別統(tǒng)計(jì)方法,并建立了一個(gè)能夠很好的識(shí)別統(tǒng)計(jì)細(xì)胞的系統(tǒng)。其達(dá)到了用戶要求的技術(shù)要求,并且針對(duì)不同的圖片情況給出了最優(yōu)化參數(shù)設(shè)置的方案,能讓操作者根據(jù)不同類型圖片快速準(zhǔn)確的得到較好的結(jié)果。本系統(tǒng)的優(yōu)點(diǎn)如下:1) 適用面廣,對(duì)于灰度圖或者24位彩色圖均可適用。且對(duì)于圖片源的質(zhì)量有很強(qiáng)的適應(yīng)性,能夠?qū)D片的各種嗓音很好地除去。對(duì)于給出的
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