【正文】 物：能在高鹽環(huán)境中生活，也能在低鹽環(huán)境下生活的微生物。 嗜壓微生物必須生活在高靜水壓環(huán)境中的微生物。均為原核生物。三十二、微生物與環(huán)境（1） 污水凈化活性污泥：污水處理中由細菌、原生動物和其他微生物群聚集而成的一種絮狀團，具有很強的吸附、分解有機物和毒物的能力（2） 污染環(huán)境的生物修復(fù) 生物修復(fù)：微生物降解環(huán)境中有機污染物，轉(zhuǎn)化其他污染物從而消除污染的一個受控或自發(fā)的過程。 生物修復(fù)技術(shù)：在人為參與條件下工程化的生物修復(fù)。（3） 環(huán)境污染的微生物檢測大腸菌群：一群來自溫血動物腸道的革蘭氏陰性無芽孢桿菌，兼性厭氧、3537℃下生長，可發(fā)酵乳糖產(chǎn)酸產(chǎn)氣，在伊紅美蘭平板上可形成典型菌落。三十三、微生物的分類和鑒定 種：是一大群表性特征高度相似、親緣關(guān)系極其接近、與同屬的其它物種有著明顯差異的菌株的總稱。 亞種：指除某一明確而穩(wěn)定的特征外，其余鑒定特征與模式種相同的種。 菌株：任何一個獨立分離的單細胞（或單個病毒粒子）繁殖而成的純遺傳型群體極其后代。菌株的理論意義：（1）為一個物種內(nèi)遺傳多樣性的體現(xiàn)。（2）每一菌株為一遺傳型純譜系（3）菌株為克隆產(chǎn)生（4）可有微小性狀的差異（5）菌株發(fā)生變異后應(yīng)以新菌株命名 微生物鑒定的經(jīng)典指標（1）形態(tài)：個體形態(tài)和群體形態(tài)（2）生理生化反應(yīng)：營養(yǎng)要求、酶、代謝產(chǎn)物、對藥物的敏感性（3）生態(tài)特性：生長溫度、與氧的關(guān)系、pH等（4）生活史和有性生活情況（5）血清學(xué)反應(yīng)和對噬菌體的敏感性 微生物分類中的現(xiàn)代方法1）DNA堿基比例的測定、2）核酸分子雜交3）rRNA寡核苷酸編目分析4）微生物全基因組的測序 三域1）細菌域：包括除古生菌以外的所有原核生物。2）古生菌域：包括嗜熱菌、嗜熱嗜酸菌、嗜鹽菌、嗜壓菌、產(chǎn)甲烷菌。3）真核生物域：真核微生物、植物和動物。三十四、感染與免疫（1） 感染 感染（傳染）：指外源或內(nèi)源性病原體突破宿主的免疫防線，在其特定的部位定植、生長繁殖和產(chǎn)生酶及毒素，從而引起一系列病理的過程。 傳染?。阂活愑苫畈≡w的大量繁殖所引起，可從某一宿主個體直接或間接傳播到同種或異種宿主的另一些個體的疾病。 毒力1） 侵染力：病原菌所具有的突破宿主防御功能，并能在其中生長繁殖和蔓延擴散的能力。2） 包括三方面：吸附和侵入的能力、繁殖和擴散的能力、抵抗宿主防御功能的能力。 毒素1） 外毒素：某些病原菌在其生長過程中向其細胞外分泌的一種毒性蛋白2） 類毒素：%%的甲醛滅活后，失去毒性，保留抗原性的生物制品。3） 內(nèi)毒素：革蘭氏陰性菌細胞壁外層的脂多糖。 病毒的致病性1） 病毒的殺細胞感染：造成宿主組織細胞裂解死亡 。2） 穩(wěn)定狀態(tài)感染：與宿主細胞保持平衡狀態(tài)，增殖可造成細胞成分改變，發(fā)生自身免疫病。3） 整合感染：整合在宿主細胞基因上，可導(dǎo)致細胞突變。 （2） 免疫 概念：機體識別和排除抗原性異物的一種保護性功能 非特異性免疫（天然免疫）：動物機體在長期進化過程中形成的，與生俱來的對抗外來微生物和異物侵入的能力。非特異免疫細胞血液中：嗜中性粒細胞；嗜酸性粒細胞；嗜堿性粒細胞；單核細胞；NK細胞（淋巴細胞）；K細胞（淋巴細胞）組織間：巨噬細胞、NK細胞1) 表皮與屏障2) 吞噬細胞：中性粒細胞、巨噬細胞巨噬細胞作用：（1）吞噬和殺菌作用（2）抗原呈遞作用（3）免疫調(diào)節(jié)作用（4）抗癌作用3) 正常體液中的抗菌物質(zhì)（1） 補體（2） 干擾素（3） 溶菌酶4) 炎癥反應(yīng)（3） 特異性免疫 TD與TI1） TD胸腺依賴抗原：需要抗原呈遞細胞處理和提呈，促使T淋巴細胞活化，進而誘導(dǎo)特異性細胞免疫和體液免疫的一類抗原。2） TI胸腺非依賴抗原：不需要T細胞的輔助，直接誘導(dǎo)特異性體液免疫的一類抗原。一般只引起初次免疫應(yīng)答。 免疫細胞1） T細胞一種參與特異性免疫應(yīng)答的小淋巴細胞，具有重要的免疫學(xué)功能。（1）調(diào)節(jié)T細胞，包括：輔助T細胞TH；抑制T細胞Ts（2）效應(yīng)T細胞，包括：遲發(fā)型超敏反應(yīng)T細胞（TD）；細胞毒T細胞（TC殺傷T細胞）2） B細胞一種在其細胞表面帶有免疫球蛋白的淋巴細胞。功能：產(chǎn)生抗體，呈遞抗原3） 第三淋巴細胞NK細胞：自然殺傷細胞，起源于骨髓干細胞，分布于脾臟，起直接殺傷作用。K細胞：抗體依賴性殺傷細胞，可殺傷與抗體結(jié)合的抗原。 免疫器官 免疫分子1） 膜表面抗原受體2） 主要組織相容抗原復(fù)合物3） 白細胞分化抗原4） 粘附分子5） 抗體6） 補體7） 細胞因子8） 抗原（4） 抗原 定義：一類能誘導(dǎo)機體發(fā)生特異性體液和細胞免疫應(yīng)答，并能與抗體和致敏淋巴細胞在體內(nèi)和體外特異性結(jié)合的大分子物質(zhì)。 特性（1）免疫原性（抗原性） 能刺激機體產(chǎn)生免疫應(yīng)答的能力。（2）免疫反應(yīng)性 能與免疫應(yīng)答的產(chǎn)物發(fā)生特異性反應(yīng)的能力。 抗原決定簇：位于抗原表面可決定抗原特異性的特定化學(xué)基團。 細菌抗原：（1）表面抗原（2）菌體抗原（3）鞭毛抗原（4）菌毛抗原（5）外毒素和類毒素（5） 抗體 定義：高等動物在抗原刺激下，由漿細胞產(chǎn)生的一類能與相應(yīng)抗原在體內(nèi)外發(fā)生特異性結(jié)合的免疫球蛋白。 特點：（1）高等動物（脊椎動物）才能產(chǎn)生；（2）必須由抗原刺激免疫細胞后才能產(chǎn)生；（3）與抗原特異的、非共價和可逆的結(jié)合；（4）為一種球蛋白；（5）抗體對異種或異體也是抗原。 參與抗體形成的三種細胞：抗原呈遞細胞；T細胞；B細胞。巨噬細胞呈遞抗原—TH細胞與抗原接合—釋放細胞因子—激發(fā)B細胞相應(yīng)克隆分裂—轉(zhuǎn)化為漿細胞—分泌抗體 單克隆抗體由一純系B細胞克隆經(jīng)分化增殖之后的漿細胞所產(chǎn)生的單一成分、單一特異性的免疫球蛋白分子。（6） 抗病毒感染免疫機制： 體液免疫主要起中和病毒作用，阻止病毒的吸附、侵入；對細胞內(nèi)病毒則通過補體等溶解靶細胞；阻止病毒侵入粘膜和血液播散。 細胞免疫主要針對細胞內(nèi)的病毒，由NK細胞、殺傷T細胞對帶病毒靶細胞進行攻擊，結(jié)合抗體、干擾素及多種細胞因子的作用清除病毒。（7） 細菌感染的3種類型 局部感染產(chǎn)生外毒素引起全身癥狀 細胞外感染：局部組織感染，細菌代謝產(chǎn)物、內(nèi)毒素等造成炎癥、毒血癥或敗血癥。 細胞內(nèi)感染：細菌感染后，巨噬細胞吞噬但未完全消化，并且增殖，隨巨噬細胞播散到各器官。 抗細菌感染免疫（1）產(chǎn)外毒素細菌的感染主要引起體液免疫，中和毒素；（2）細胞外感染由非特異免疫細胞的吞噬，補體、抗體和細胞因子的免疫炎癥反應(yīng)；（3）抗細胞內(nèi)感染主要由細胞免疫參與。三十五、微生物的分類和鑒定（一）根據(jù)16SrRNA（原核生物）和18SrRNA（真核生物）的寡核苷酸序列，比較其同源性將整個生物界分為三域（也稱三原界）。（1）三域包括（細菌域）、（真菌域）、（古生菌域）（2）（一）微生物分類鑒定的特征及技術(shù) 形態(tài)學(xué)和生理生化特征一、分類鑒定特征形態(tài)學(xué)特征（主要包括） 培養(yǎng)特征（菌落特征） 細胞特征（形態(tài)、大小、排列） 特殊結(jié)構(gòu)（鞭毛、芽孢、糖被等） 細胞內(nèi)含物 染色反應(yīng) 運動性生理生化特征 營養(yǎng)類型 碳源利用性 氮源利用性 生長因子需要 與氧的關(guān)系 生長特性（pH、溫度、鹽度等） 對抗生素等的敏感性 特殊代謝產(chǎn)物 與宿主的關(guān)系（2） 微生物分類鑒定的主要步驟 （1）獲得微生物的純培養(yǎng)物 （2）測定必要的鑒定指標 （3）查找權(quán)威菌種鑒定手冊（三）微生物鑒定的經(jīng)典指標 （1）形態(tài) 個體形態(tài)和群體形態(tài) （2）生理生化反應(yīng)：營養(yǎng)要求、酶、代謝產(chǎn)物、對藥物的敏感性 （3）生態(tài)特性 生長溫度、與氧的關(guān)系、pH等 （4）生活史和有性生活情況 （5）血清學(xué)反應(yīng)和對噬菌體的敏感性（4） 微生物分類中的現(xiàn)代方法 G+Cmol%值，差別5%可認為不 同種，10%可認為不同屬。 測定方法包括： （1）熱變性溫度法 （2）浮力密度法 （3）高效液相色譜法2. 核酸分子雜交（1）DNADNA分子雜交 將兩種菌株的DNA分子解鏈，然后將單鏈在合適的條件下混合，復(fù)性并形成雜交的dsDNA，再測定雜交百分率。 DNADNA 雜交同源性60%的菌株可認為同一個種，同源性70%為同一亞種，同源性在20%60%為同一個屬。2）DNArRNA分子雜交 用于親緣關(guān)系較遠的菌株（DNADNA分子非配對堿基超過10% ～20%，屬或?qū)僖陨系姆诸悾┲g的鑒定。（3）核酸探針定義：能識別特異核苷酸序列的，帶標記的一段單鏈DNA或RNA分子。 核算探針可用于細菌型、種、屬等的檢驗，包括基因組DNA探針、cDNA探針、RNA探針和人工合成寡核苷酸探針。（1）通過電泳測定rRNA寡核苷酸序列，然后與rRNA寡核苷酸的指紋圖譜比對，計算和分析，確定被測菌株的親緣關(guān)系。（2）測定16ｓrRNA的DNA序列，輸入genbank比對菌株的同源性，構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。