【正文】 物：能在高鹽環(huán)境中生活，也能在低鹽環(huán)境下生活的微生物。 嗜壓微生物必須生活在高靜水壓環(huán)境中的微生物。均為原核生物。三十二、微生物與環(huán)境（1） 污水凈化活性污泥：污水處理中由細(xì)菌、原生動(dòng)物和其他微生物群聚集而成的一種絮狀團(tuán)，具有很強(qiáng)的吸附、分解有機(jī)物和毒物的能力（2） 污染環(huán)境的生物修復(fù) 生物修復(fù)：微生物降解環(huán)境中有機(jī)污染物，轉(zhuǎn)化其他污染物從而消除污染的一個(gè)受控或自發(fā)的過(guò)程。 生物修復(fù)技術(shù)：在人為參與條件下工程化的生物修復(fù)。（3） 環(huán)境污染的微生物檢測(cè)大腸菌群：一群來(lái)自溫血?jiǎng)游锬c道的革蘭氏陰性無(wú)芽孢桿菌，兼性厭氧、3537℃下生長(zhǎng)，可發(fā)酵乳糖產(chǎn)酸產(chǎn)氣，在伊紅美蘭平板上可形成典型菌落。三十三、微生物的分類和鑒定 種：是一大群表性特征高度相似、親緣關(guān)系極其接近、與同屬的其它物種有著明顯差異的菌株的總稱。 亞種：指除某一明確而穩(wěn)定的特征外，其余鑒定特征與模式種相同的種。 菌株：任何一個(gè)獨(dú)立分離的單細(xì)胞（或單個(gè)病毒粒子）繁殖而成的純遺傳型群體極其后代。菌株的理論意義：（1）為一個(gè)物種內(nèi)遺傳多樣性的體現(xiàn)。（2）每一菌株為一遺傳型純譜系（3）菌株為克隆產(chǎn)生（4）可有微小性狀的差異（5）菌株發(fā)生變異后應(yīng)以新菌株命名 微生物鑒定的經(jīng)典指標(biāo)（1）形態(tài)：個(gè)體形態(tài)和群體形態(tài)（2）生理生化反應(yīng)：營(yíng)養(yǎng)要求、酶、代謝產(chǎn)物、對(duì)藥物的敏感性（3）生態(tài)特性：生長(zhǎng)溫度、與氧的關(guān)系、pH等（4）生活史和有性生活情況（5）血清學(xué)反應(yīng)和對(duì)噬菌體的敏感性 微生物分類中的現(xiàn)代方法1）DNA堿基比例的測(cè)定、2）核酸分子雜交3）rRNA寡核苷酸編目分析4）微生物全基因組的測(cè)序 三域1）細(xì)菌域：包括除古生菌以外的所有原核生物。2）古生菌域：包括嗜熱菌、嗜熱嗜酸菌、嗜鹽菌、嗜壓菌、產(chǎn)甲烷菌。3）真核生物域：真核微生物、植物和動(dòng)物。三十四、感染與免疫（1） 感染 感染（傳染）：指外源或內(nèi)源性病原體突破宿主的免疫防線，在其特定的部位定植、生長(zhǎng)繁殖和產(chǎn)生酶及毒素，從而引起一系列病理的過(guò)程。 傳染?。阂活愑苫畈≡w的大量繁殖所引起，可從某一宿主個(gè)體直接或間接傳播到同種或異種宿主的另一些個(gè)體的疾病。 毒力1） 侵染力：病原菌所具有的突破宿主防御功能，并能在其中生長(zhǎng)繁殖和蔓延擴(kuò)散的能力。2） 包括三方面：吸附和侵入的能力、繁殖和擴(kuò)散的能力、抵抗宿主防御功能的能力。 毒素1） 外毒素：某些病原菌在其生長(zhǎng)過(guò)程中向其細(xì)胞外分泌的一種毒性蛋白2） 類毒素：%%的甲醛滅活后，失去毒性，保留抗原性的生物制品。3） 內(nèi)毒素：革蘭氏陰性菌細(xì)胞壁外層的脂多糖。 病毒的致病性1） 病毒的殺細(xì)胞感染：造成宿主組織細(xì)胞裂解死亡 。2） 穩(wěn)定狀態(tài)感染：與宿主細(xì)胞保持平衡狀態(tài)，增殖可造成細(xì)胞成分改變，發(fā)生自身免疫病。3） 整合感染：整合在宿主細(xì)胞基因上，可導(dǎo)致細(xì)胞突變。 （2） 免疫 概念：機(jī)體識(shí)別和排除抗原性異物的一種保護(hù)性功能 非特異性免疫（天然免疫）：動(dòng)物機(jī)體在長(zhǎng)期進(jìn)化過(guò)程中形成的，與生俱來(lái)的對(duì)抗外來(lái)微生物和異物侵入的能力。非特異免疫細(xì)胞血液中：嗜中性粒細(xì)胞；嗜酸性粒細(xì)胞；嗜堿性粒細(xì)胞；單核細(xì)胞；NK細(xì)胞（淋巴細(xì)胞）；K細(xì)胞（淋巴細(xì)胞）組織間：巨噬細(xì)胞、NK細(xì)胞1) 表皮與屏障2) 吞噬細(xì)胞：中性粒細(xì)胞、巨噬細(xì)胞巨噬細(xì)胞作用：（1）吞噬和殺菌作用（2）抗原呈遞作用（3）免疫調(diào)節(jié)作用（4）抗癌作用3) 正常體液中的抗菌物質(zhì)（1） 補(bǔ)體（2） 干擾素（3） 溶菌酶4) 炎癥反應(yīng)（3） 特異性免疫 TD與TI1） TD胸腺依賴抗原：需要抗原呈遞細(xì)胞處理和提呈，促使T淋巴細(xì)胞活化，進(jìn)而誘導(dǎo)特異性細(xì)胞免疫和體液免疫的一類抗原。2） TI胸腺非依賴抗原：不需要T細(xì)胞的輔助，直接誘導(dǎo)特異性體液免疫的一類抗原。一般只引起初次免疫應(yīng)答。 免疫細(xì)胞1） T細(xì)胞一種參與特異性免疫應(yīng)答的小淋巴細(xì)胞，具有重要的免疫學(xué)功能。（1）調(diào)節(jié)T細(xì)胞，包括：輔助T細(xì)胞TH；抑制T細(xì)胞Ts（2）效應(yīng)T細(xì)胞，包括：遲發(fā)型超敏反應(yīng)T細(xì)胞（TD）；細(xì)胞毒T細(xì)胞（TC殺傷T細(xì)胞）2） B細(xì)胞一種在其細(xì)胞表面帶有免疫球蛋白的淋巴細(xì)胞。功能：產(chǎn)生抗體，呈遞抗原3） 第三淋巴細(xì)胞NK細(xì)胞：自然殺傷細(xì)胞，起源于骨髓干細(xì)胞，分布于脾臟，起直接殺傷作用。K細(xì)胞：抗體依賴性殺傷細(xì)胞，可殺傷與抗體結(jié)合的抗原。 免疫器官 免疫分子1） 膜表面抗原受體2） 主要組織相容抗原復(fù)合物3） 白細(xì)胞分化抗原4） 粘附分子5） 抗體6） 補(bǔ)體7） 細(xì)胞因子8） 抗原（4） 抗原 定義：一類能誘導(dǎo)機(jī)體發(fā)生特異性體液和細(xì)胞免疫應(yīng)答，并能與抗體和致敏淋巴細(xì)胞在體內(nèi)和體外特異性結(jié)合的大分子物質(zhì)。 特性（1）免疫原性（抗原性） 能刺激機(jī)體產(chǎn)生免疫應(yīng)答的能力。（2）免疫反應(yīng)性 能與免疫應(yīng)答的產(chǎn)物發(fā)生特異性反應(yīng)的能力。 抗原決定簇：位于抗原表面可決定抗原特異性的特定化學(xué)基團(tuán)。 細(xì)菌抗原：（1）表面抗原（2）菌體抗原（3）鞭毛抗原（4）菌毛抗原（5）外毒素和類毒素（5） 抗體 定義：高等動(dòng)物在抗原刺激下，由漿細(xì)胞產(chǎn)生的一類能與相應(yīng)抗原在體內(nèi)外發(fā)生特異性結(jié)合的免疫球蛋白。 特點(diǎn)：（1）高等動(dòng)物（脊椎動(dòng)物）才能產(chǎn)生；（2）必須由抗原刺激免疫細(xì)胞后才能產(chǎn)生；（3）與抗原特異的、非共價(jià)和可逆的結(jié)合；（4）為一種球蛋白；（5）抗體對(duì)異種或異體也是抗原。 參與抗體形成的三種細(xì)胞：抗原呈遞細(xì)胞；T細(xì)胞；B細(xì)胞。巨噬細(xì)胞呈遞抗原—TH細(xì)胞與抗原接合—釋放細(xì)胞因子—激發(fā)B細(xì)胞相應(yīng)克隆分裂—轉(zhuǎn)化為漿細(xì)胞—分泌抗體 單克隆抗體由一純系B細(xì)胞克隆經(jīng)分化增殖之后的漿細(xì)胞所產(chǎn)生的單一成分、單一特異性的免疫球蛋白分子。（6） 抗病毒感染免疫機(jī)制： 體液免疫主要起中和病毒作用，阻止病毒的吸附、侵入；對(duì)細(xì)胞內(nèi)病毒則通過(guò)補(bǔ)體等溶解靶細(xì)胞；阻止病毒侵入粘膜和血液播散。 細(xì)胞免疫主要針對(duì)細(xì)胞內(nèi)的病毒，由NK細(xì)胞、殺傷T細(xì)胞對(duì)帶病毒靶細(xì)胞進(jìn)行攻擊，結(jié)合抗體、干擾素及多種細(xì)胞因子的作用清除病毒。（7） 細(xì)菌感染的3種類型 局部感染產(chǎn)生外毒素引起全身癥狀 細(xì)胞外感染：局部組織感染，細(xì)菌代謝產(chǎn)物、內(nèi)毒素等造成炎癥、毒血癥或敗血癥。 細(xì)胞內(nèi)感染：細(xì)菌感染后，巨噬細(xì)胞吞噬但未完全消化，并且增殖，隨巨噬細(xì)胞播散到各器官。 抗細(xì)菌感染免疫（1）產(chǎn)外毒素細(xì)菌的感染主要引起體液免疫，中和毒素；（2）細(xì)胞外感染由非特異免疫細(xì)胞的吞噬，補(bǔ)體、抗體和細(xì)胞因子的免疫炎癥反應(yīng)；（3）抗細(xì)胞內(nèi)感染主要由細(xì)胞免疫參與。三十五、微生物的分類和鑒定（一）根據(jù)16SrRNA（原核生物）和18SrRNA（真核生物）的寡核苷酸序列，比較其同源性將整個(gè)生物界分為三域（也稱三原界）。（1）三域包括（細(xì)菌域）、（真菌域）、（古生菌域）（2）（一）微生物分類鑒定的特征及技術(shù) 形態(tài)學(xué)和生理生化特征一、分類鑒定特征形態(tài)學(xué)特征（主要包括） 培養(yǎng)特征（菌落特征） 細(xì)胞特征（形態(tài)、大小、排列） 特殊結(jié)構(gòu)（鞭毛、芽孢、糖被等） 細(xì)胞內(nèi)含物 染色反應(yīng) 運(yùn)動(dòng)性生理生化特征 營(yíng)養(yǎng)類型 碳源利用性 氮源利用性 生長(zhǎng)因子需要 與氧的關(guān)系 生長(zhǎng)特性（pH、溫度、鹽度等） 對(duì)抗生素等的敏感性 特殊代謝產(chǎn)物 與宿主的關(guān)系（2） 微生物分類鑒定的主要步驟 （1）獲得微生物的純培養(yǎng)物 （2）測(cè)定必要的鑒定指標(biāo) （3）查找權(quán)威菌種鑒定手冊(cè)（三）微生物鑒定的經(jīng)典指標(biāo) （1）形態(tài) 個(gè)體形態(tài)和群體形態(tài) （2）生理生化反應(yīng)：營(yíng)養(yǎng)要求、酶、代謝產(chǎn)物、對(duì)藥物的敏感性 （3）生態(tài)特性 生長(zhǎng)溫度、與氧的關(guān)系、pH等 （4）生活史和有性生活情況 （5）血清學(xué)反應(yīng)和對(duì)噬菌體的敏感性（4） 微生物分類中的現(xiàn)代方法 G+Cmol%值，差別5%可認(rèn)為不 同種，10%可認(rèn)為不同屬。 測(cè)定方法包括： （1）熱變性溫度法 （2）浮力密度法 （3）高效液相色譜法2. 核酸分子雜交（1）DNADNA分子雜交 將兩種菌株的DNA分子解鏈，然后將單鏈在合適的條件下混合，復(fù)性并形成雜交的dsDNA，再測(cè)定雜交百分率。 DNADNA 雜交同源性60%的菌株可認(rèn)為同一個(gè)種，同源性70%為同一亞種，同源性在20%60%為同一個(gè)屬。2）DNArRNA分子雜交 用于親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的菌株（DNADNA分子非配對(duì)堿基超過(guò)10% ～20%，屬或?qū)僖陨系姆诸悾┲g的鑒定。（3）核酸探針定義：能識(shí)別特異核苷酸序列的，帶標(biāo)記的一段單鏈DNA或RNA分子。 核算探針可用于細(xì)菌型、種、屬等的檢驗(yàn)，包括基因組DNA探針、cDNA探針、RNA探針和人工合成寡核苷酸探針。（1）通過(guò)電泳測(cè)定rRNA寡核苷酸序列，然后與rRNA寡核苷酸的指紋圖譜比對(duì)，計(jì)算和分析，確定被測(cè)菌株的親緣關(guān)系。（2）測(cè)定16ｓrRNA的DNA序列，輸入genbank比對(duì)菌株的同源性，構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。