[計(jì)算機(jī)軟件及應(yīng)用]蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析(編輯修改稿)
2025-04-18 02:03 本頁面
【文章內(nèi)容簡介】 選擇數(shù)據(jù)庫 數(shù)據(jù)檢索輸出閾值 二級(jí)譜中片段離子理論與實(shí)際差異最大允許值 一級(jí)譜中片段離子理論與實(shí)際差異最大允許值 搜索的離子為 b離子與 y離子 (|Ｍ－Ｍ 0|/M0)X10６ (ppm) Ｍ為離子質(zhì)量的實(shí)測值； Ｍ０為離子質(zhì)量的理論值； 氨基酸殘基的修飾 完全修飾 潛在的修飾 氧化 ,磷酸化等等 快速搜索可能的修飾 點(diǎn)擊運(yùn)行 運(yùn)行界面 4. 查看結(jié)果 結(jié)果可靠性的統(tǒng)計(jì)指標(biāo)以及強(qiáng)度 蛋白的覆蓋率 蛋白檢索號(hào) 對(duì)應(yīng)肽斷總數(shù) 蛋白分子質(zhì)量 唯一對(duì)應(yīng)肽斷數(shù) 查看檢索參數(shù)，可保存為 excel 將結(jié)果保存為 excel 下載蛋白數(shù)據(jù)庫存放到本文件夾 (所使用 fasta數(shù)據(jù)庫為所研究種屬的蛋白數(shù)據(jù)庫，可從到 ) 用記事本打開，編輯文件 在 GPM界面，數(shù)據(jù)庫的下拉菜單中添加一個(gè)名為 mydatabase的選項(xiàng) 將新數(shù)據(jù)庫的 GPM中， 保存文件，重新選擇數(shù)據(jù)庫運(yùn)行程序。 參考文獻(xiàn)： 蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析軟件 TransProteomics Pipeline (TPP) TransProteomic Pipeline (TPP)是用于LC/MS/MS蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析的軟件 . TPP包含一系列蛋白質(zhì)鑒定和定量分析的模塊 , 能夠?qū)?jīng) Sequest數(shù)據(jù)庫搜索引擎得到的結(jié)果進(jìn)行篩選過濾 ,從而達(dá)到蛋白質(zhì)鑒定和測序的目的 . 蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析軟件 TransProteomic Pipeline 蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析軟件 蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析軟件 sp|P02754|LACB_BOVIN BETALACTOGLOBULIN PRECURSOR (BETALG) (ALLERGEN BOS D 5) Bos taurus (Bovine). MKCLLLALALTCGAQALIVTQTMKGLDIQKVAGTWYSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGDLEILLQKWENGECAQKKIIAEKTKIPAVFKIDALNENKLVLDTD
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