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db21t18612-20xx水產(chǎn)生物種質(zhì)檢驗(yàn)技術(shù)規(guī)程擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性法(更新版)

  

【正文】 1 min.72℃(延伸)1 min.72℃(終了延伸)5 min.選擇擴(kuò)增引物序列見(jiàn)附錄C,將預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物稀釋10100倍作為選擴(kuò)增模板,按表5配制選擴(kuò)增體系,按表6進(jìn)行PCR反應(yīng)。L)MseⅠ 接頭(2PM/181。l5181。按表1配制酶切體系,每40181。 DNA濃度檢測(cè)分別于260 nm波長(zhǎng)和280 nm波長(zhǎng)下測(cè)定產(chǎn)物(或產(chǎn)物稀釋液)的紫外吸收值。振蕩均勻后,65℃水浴1h;按GB/T ,用苯酚和氯仿方法抽提DNA;用50 181。樣品標(biāo)注后,活體運(yùn)至實(shí)驗(yàn)室。 測(cè)序凝膠電泳槽。 電子天平( mg)。 銀染液:1g硝酸銀溶于1L超純水中,加入37%。 標(biāo)準(zhǔn)分子量Markers(100bp)。 蛋白酶K(20 mg/mL):生化試劑。5  試劑 三羥甲基氨基甲烷(Tris)飽和酚。多態(tài)性位點(diǎn)百分率 (Percent of Polymaorphic Loci,P) 表示后代所獲得某個(gè)等位標(biāo)記來(lái)自于它的父親(或母親)的同一個(gè)等位標(biāo)記的可能性。凡是注日期的引用文件,僅所注日期的版本適用于本文件。B50DB21遼寧省地方標(biāo)準(zhǔn)DB 21/ ?—2010水產(chǎn)生物種質(zhì)檢驗(yàn)技術(shù)規(guī)程 擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性法AFLP procedure to detect germplasm for aquaculture species2010 12 31發(fā)布2011 02 01實(shí)施遼寧省質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督局發(fā)布DB21/ ?—2010前言本標(biāo)準(zhǔn)按照GB/。2  規(guī)范性引用文件下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。在一個(gè)群體中一個(gè)基因可能有許多等位基因。由于不同來(lái)源DNA的酶切片段存在差異,因而產(chǎn)生了擴(kuò)增產(chǎn)物的多態(tài)。 核糖核酸(RNA)酶:生化試劑。 Taq DNA聚合酶(生化試劑,5 U/mL)。 : 硫代硫酸鈉(Na2S2O3?5H2O)溶于100 ml 超純水中。 單道可調(diào)移液器( mL,10 mL,20 mL,100 mL,200 mL,1000 mL)。 北京六一儀器廠DYYⅢ型電泳儀。隨機(jī)采取正常、健康個(gè)體樣品,數(shù)量不少于30個(gè)/群體。 Ⅱ型樣品取20℃,置于液氮中研成粉末;加DNA提取液(10mmol/L TrisHCl,pH ,75mmol/L NaCl,%SDS,5mmol/L EDTA)。以DNA條帶的分子量及有無(wú)拖尾為標(biāo)準(zhǔn)判斷DNA的質(zhì)量。 AFLP分析 限制性?xún)?nèi)切酶消化本規(guī)程統(tǒng)一采用EcoRⅠ/ MseⅠ雙酶切組合反應(yīng)體系。g/181。L)基因組DNA酶切液EcoRⅠ 接頭(2PM/181。l)dNTPs (5mM)10X PCR緩沖液Taq酶 (5U/181。將梳子背面插入膠液中,吸出多余膠液,室溫下聚合2h。(9)將上述膠板置于凝膠成像儀中,利用相關(guān)圖像采集系統(tǒng)得到清晰的電泳凝膠圖像,用于結(jié)果分析。3180。MseⅠ預(yù)擴(kuò)增引物:518
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