【正文】 保定） Fig 1 Histograms for fiber quality properties in the population of BC1F2 (Baoding) 由圖 1和表 1可得 BC1F2 纖維長度變異范圍是 ~，變異系數(shù)為 %，平均長度 mm；整齊度變異范圍是 %~%，變異系數(shù)為 %，平均值為 %；馬克隆值分布在 ~ 之間，變異系數(shù)是 %，平均值為 ；比強度分布在 ~ cN?tex1 之間，變異系數(shù)是 %，平均值為 cN?tex1；伸長率變異范圍是 %~%，變異系數(shù)是 %，平均值為 %。 FM: 馬克隆值 ?；蚪M DNA 序列的差異是分子 遺傳連鎖 圖譜構(gòu)建的基礎(chǔ)，因此選擇親緣關(guān)系較遠的品種或材料作為分離群體 構(gòu)建 的親本 ，可以獲得較高的多態(tài)性 。自 1994年 Reinisch 等 [16]首次報道四倍體棉花栽培種的 RFLP 圖譜以來，目前國內(nèi)外研究者已構(gòu)建了相對飽和的棉花種間遺傳連鎖圖譜。綜上所述，構(gòu)建遺傳連鎖圖譜過程中 ，選用不同種類標(biāo)記和較多的標(biāo)記數(shù)可避免標(biāo)記在基因組上分布不均勻的現(xiàn)象。在 A 亞組 9 條染色體上分布有 110 個標(biāo)記位點，覆蓋 ，標(biāo)記間平均距離 。王娟等 [30]利用陸地棉遺傳標(biāo)準(zhǔn)系 TM1 和渝棉 1 號，從 5544 對 SSR引物中篩選得到 178 對多態(tài)性引物，多態(tài)性引物比例為 %。 FS: Fiber strength。最長連鎖群為 ，分布有 17 個標(biāo)記位點；最短連鎖群為 ，只有兩個標(biāo)記位點。 表 1 BC1F BC1F2: BC1F2:4 纖維品質(zhì)相關(guān)性狀分析 Table 1 Table1 Analysis of fiber quality in parents and BC1F2 , BC1F2:3 , BC1F2 性狀 Traits 親本 Parents BC1F2 群體 BC1F2Population 中棉所 8 號CRI8 Pima 9053 變異范圍 Range 平均值 Mean 標(biāo)準(zhǔn)差 SD 變異系數(shù) CV (%) 偏度 Skewness 峰度 Kurtosis 纖維長度 Fiber length (mm) 整齊度 Fiber uniformity(%) 馬克隆值 Fiber micronaire 比強度 Fiber strength(cN tex1) 伸長率 Fiber elongation(%) 由表一可得，中棉所 8 號各環(huán)境的纖維上半部平均長度均值 ~ mm，整齊度 %~%，馬克隆值 ~，比強度 ~ cN?tex1，伸長率 %~%。在檢測的過程中，若一對 SSR 引物出現(xiàn)多條差異帶，如果多條帶在 BC1F2 群體中表現(xiàn)一致，則記為一個位點；如果在 BC1F2 群體中表現(xiàn)分離，則記為不同位點，在標(biāo)記名稱后面添加小寫英文字母 a,b,c,...加以 區(qū)分。隨機選取 131 個單株作為圖譜構(gòu)建群體。 Jiang 等[22]利用一個陸、海種間 F2 群體檢測到 14 個與纖維品質(zhì)有關(guān)的 QTL，其中 3 個 QTL與纖維強度有關(guān)，共解釋 31%的表型變異 。 Reinisch 等 [16]在 1994年首次 對 四倍體栽培棉種的 RFLP 圖譜 進行了 報道 ，該圖譜 總長為 4675 cM， 包含705 個標(biāo)記 位點，共 定位在 41 個連鎖群上。 棉花纖維品質(zhì)性狀大多屬于數(shù)量性狀，受多基因控制，最終的表現(xiàn)型是基因型和環(huán)境共同作用的結(jié)果，受環(huán)境條件影響很大。共檢測到 13個與纖維品質(zhì)相關(guān)的 QTL 位點。 論文難度 及工作量 14 難度較大，工作量大。分別位于 、 、 、 、 、 。 審核小組組長：（簽字） 20xx年 6 月 5 日 學(xué)院意見： 院長： 年 月 日 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)本科畢業(yè)論文指導(dǎo)教師評閱書 學(xué) 生姓名 ：唐冰川 學(xué)號： 20xx014010213 專業(yè) 班級：農(nóng)學(xué) 0902 所在學(xué)院：農(nóng)學(xué)院 論文題目： BC1F2 遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和纖維品質(zhì)性狀 QTL 定位 指導(dǎo)教師評語： 該同學(xué)遵守學(xué)校的各項規(guī)章制度，對工作認真負責(zé)，能夠較好的完成各項實習(xí)任務(wù)。 總之 ,遺傳連鎖圖譜是棉花遺傳改良的重要工具 ,利用標(biāo)記輔助育種與其它技術(shù)的結(jié)合 ,可以有效、顯著地提高棉花的產(chǎn)量、抗蟲性、抗病性。 Wang 等利用 XZM2 8891 的重組自交系群體和SSR為主體的標(biāo)記資料構(gòu)建遺傳圖譜 ,132 個位點分布于 26 個染色體 ,覆蓋 ,標(biāo)記間平均距離為 [25]。 Han 等在該工作基礎(chǔ)上加進 364個 ESTSSR標(biāo)記位點 ,將此圖譜發(fā)展為 30個連鎖群 ,包含 1052個位點 ,圖距總長 6321cM,標(biāo)記間平均距離為 [18]。 棉花種間分子遺傳圖譜構(gòu)建 Reinisch 等利用陸地棉野 生種系 Palmeri 和海島棉野生種系 K101 雜交的含 57 個單株的 F2 群體 ,首次構(gòu)建了一個較為完整的棉花海陸種間 RFLP 遺傳框架圖譜 ,該圖譜包括750個位點 ,分布在 41個連鎖群上 , 覆蓋基因組 4675cM[ 11]。(2)分子標(biāo)記分離數(shù)據(jù)的收集與處理 (3)標(biāo)記位點的連鎖測驗 。 作圖群體的大小 作圖群體的大小很大程度上決定了遺傳圖譜的分辯率和精度。 ② 盡量選用純度高的材料作為親本 理論上，用于遺傳作圖的親本應(yīng)當(dāng)是高度純合的，并在配置雜交之前進一步通過自交選擇以保證親本的純度，以保證在任何一個基因座位都不是雜合的。 遺傳圖譜構(gòu)建 遺傳圖譜是利用各種標(biāo) 記構(gòu)建的標(biāo)記連鎖圖。 1987 年， DonisKener 等發(fā)表了第一張人類的 RFLPs 連鎖圖，其飽和度遠遠超過了經(jīng)典的圖譜。因此可以根據(jù)他們后代性狀的分離可以判斷他們的 交換率 ，也就可以判斷他們在遺傳圖譜上的相對距離。其原因主要有兩方面：一是棉花的 DNA 標(biāo)記的多態(tài)性低；二是早期棉花分子生物學(xué)研究中存在一系列的技術(shù)難關(guān)，尤其是棉花高質(zhì) DNA 的快速提取。 棉花隸屬于被子植物中的錦葵目（ Malvales）、錦葵科 (Malvaceac)、棉屬 (Gossypium)。棉花纖維品質(zhì)性狀大多屬于數(shù)量性狀，受多基因控制，最終的表現(xiàn)型是基因型和環(huán)境共同作用的結(jié)果，受環(huán)境條件影響很大。 實驗設(shè)計合理、方案可行、 QTL 的定位結(jié)果對后期進行分子標(biāo)記輔助選擇有重要意義。 實驗室成員在連鎖圖譜構(gòu)建、 QTL 分析方面具有豐富的經(jīng)驗。 編號 NO： 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)本科 畢業(yè)論文 論文題目 BC1F2遺傳連鎖圖譜和纖維品質(zhì)性狀 QTL 定位 學(xué)生姓名 唐冰川 學(xué)號 20xx014010213 成績 學(xué)院 農(nóng)學(xué)院 專業(yè)班級 農(nóng)學(xué) 0902 指導(dǎo)教師姓名 張艷 指導(dǎo)教師職稱 講師 材料目錄： 任務(wù)書 （ 1） 份 開題報告 （含 文獻綜述） （ 1）份 指導(dǎo)教師評閱書 （ 1）份 答辯記錄表 （ 1）份 論文正文 （ 1）份 其它材料 河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 本科畢業(yè)論文任務(wù)書 學(xué) 院： 農(nóng)學(xué)院 教師姓名： 張艷 職 稱： 講師 20xx 年 5 月 4 日 專業(yè)名稱 農(nóng)學(xué) 論文 題目 BC1F2 遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和纖維品質(zhì)性狀 QTL 定位 題目 來源 科研課題項目 目的意義： 提高棉花纖維品質(zhì)是棉花育種工作者集中關(guān)注的問題。 所在作物遺傳育種實驗室具備良好的實驗室條件和試驗所需的儀器設(shè)備條件：如高速冷凍離心機， PCR 儀，電泳儀等能確保本試驗有序進行。 專家簽字： 年 月 日 學(xué)院意見 : 院長： 年 月 日 農(nóng) 學(xué)院 農(nóng)學(xué) 專業(yè) 唐冰川 學(xué)生： 現(xiàn)把 20xx20xx 學(xué)年，第 二 學(xué)期的畢業(yè)論文安排下達給你，你本學(xué)期承擔(dān)的畢業(yè)論文任務(wù)如下： 依據(jù)本任務(wù)書中論文題目、目的意義、可行性分析的內(nèi)容完成開題報告。應(yīng)用現(xiàn)代育種技術(shù)將海島棉控制優(yōu)良性狀的基因或片段向陸地棉轉(zhuǎn)移，被視為快速改良陸地棉纖維品質(zhì)的方法之一。生產(chǎn)上種植的主要為 四倍體 的 陸地棉 (Gosspium hirsutum L.)和 海島棉 (Gossypium barbadense L.)， 二者 分別占世界棉花總產(chǎn)量的 90%和 8%[34]。 [6]Reinisch 等 [7]1994 年首次 對 四倍體栽培棉種的 RFLP圖譜 進行了 報道 ，該圖譜 總長為 4675 cM， 包含 705 個標(biāo)記 位點，共 定位在 41 個連鎖群上。標(biāo)記位點之間的重組交換率是標(biāo)記間的遺傳距離的依據(jù)。植物可方便地建立和維持較大的分離群體，分子連鎖圖構(gòu)建工作的發(fā)展速度超過了動物的同類研究，業(yè)已建圖的植物已博上學(xué)位論文異源四倍體棉花遺傳圖譜的構(gòu)建與分子細胞遺傳學(xué)研究多達幾十種，其中包括了所有重要的農(nóng)作物。圖譜構(gòu)建包括以下幾個基本步驟 :根據(jù)遺傳材料之間的 DNA 多態(tài)性，選擇用于建立作圖群體的親本組合 。 ③ 雜交后代的可育性 如果雜交后代不育，造成嚴(yán)重的偏分離現(xiàn)象，從而影響分離群體的構(gòu)建，降低所建圖譜的可信度。作圖群體大小還取決于所用群體的類型。(4)估算位點間的重組頻率和圖距 (5)多點分析與基因的直線排序 。隨后 ,Rong等用 20xx個 STS 探針對此圖譜進行加密 ,構(gòu)建了一個含 2584個位點 ,全長 ,平均距離為 cM 的遺傳圖譜 [12]。 Guo 等利用 ESTSSR 標(biāo)記將此圖譜進一步加密 ,構(gòu)建了一個富含基因信息的新圖譜 [19]。王娟等利用 TM1 Yumian1 的 F2 群體構(gòu)建了包含 138 個標(biāo)記位點 32 個連鎖群、標(biāo)記間平均距離為 的遺傳圖譜 [26]。分子生物學(xué)的發(fā)展，與 PCR分子標(biāo)記技術(shù)的完善 ,以及高密度、飽和的異源四倍體栽培棉種分子連鎖圖譜的構(gòu)建 ,使對棉花基因組進行深入研究即將成為現(xiàn)實。學(xué)習(xí)態(tài)度端正，具有較為扎實的生物科學(xué)基礎(chǔ)理論和專業(yè)知識。其中纖維長度相關(guān) QTL 1 個，解釋表型變異率 %；整齊度相關(guān) QTL 2 個，分別解釋表型變異率 %和 %；馬克隆值相關(guān) QTL 6 個，可解釋表型變異率為%~%；比強度相關(guān) QTL 3 個，解釋表型變異 的 %~%；伸長率相關(guān) QTL 1 個，可解釋表型變異率 %。 論文成果 的創(chuàng)新性 12 有獨到見解，有較大的創(chuàng)新性成果。其中纖維長度相關(guān) QTL 1 個；整齊度相關(guān) QTL 2個；馬克隆值相關(guān) QTL 6 個；比強度相關(guān) QTL 3 個；伸長率相關(guān) QTL 1 個。同時， 棉花 傳統(tǒng)育種方法主要 通過雜交、回交和互交，育種周期長、 成本高、選擇效率低 [511]。在此基礎(chǔ)上， Shappley 等 [17] 對HS46 MAR、 HS46 PD5363 的 F2 群體進行了 RFLP 分析，用不同的探針 /酶組合建立了具有 10 個多態(tài)位點的 4 個連鎖群和 32 個多態(tài)位點的 5 個連鎖群 。 國內(nèi)外對棉花纖維品質(zhì)相關(guān)性狀的 QTL 研究歷程較久，但由于 QTL 受環(huán)境影響大且各研究者所用材料不同，導(dǎo)致不同研究成果之間不便相互印證，對 QTL 定位結(jié)果的有效利用產(chǎn)生影響。 實驗方法： 對兩親本和 F1 進行多態(tài)性驗證，隨后 選 用在親本間具多態(tài)性的引物對作圖群體BC1F2 中的單株進行分子標(biāo)記基因型檢測。 數(shù)據(jù)處理 使用作圖軟件 Mapmaker/Exp(ver )，通過 Kosambi 函數(shù)構(gòu)建遺傳連鎖圖譜，最大遺傳距離為 50cM ， LOD≥ 。 Pima9053 各環(huán)境的纖維上半部平均長度均值 ~ mm，整齊度 %~%，馬克隆值 ~，比強度 ~ cN?tex1，伸長率 %~%。其中 26 個連鎖群通過錨定引物定位到 16 條染色體上，分別是 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 、 和 ，另有 4 個連鎖群未能定位到染色體上，以 LG01~LG04 命名（表 圖 2）。 FE: Fiber elongation. 纖維品質(zhì)相關(guān)性狀的 QTL 分析 利用已構(gòu)建的遺傳連