家畜育種學(xué)07種畜的遺傳評(píng)估三blup育種值估計(jì)(完整版)
【正文】 只有一個(gè)記錄 ?有記錄的動(dòng)物不是其它動(dòng)物的雙親 ?雙親無記錄 ?每個(gè)母畜只有一個(gè)后代 ，且外祖母只有一個(gè)女兒 ?母畜在外祖父所有女兒中隨機(jī)抽樣 ， 第五節(jié) 多性狀 BLUP 法的基本原理 ?BLUP原理同樣可使用于對(duì)多個(gè)性狀進(jìn)行育種值估計(jì)。從前面例子我們可以看出，僅僅 5個(gè)個(gè)體兩個(gè)性狀就產(chǎn)生很大的方程組，而對(duì)于豬、雞等畜禽在 BLUP法中所涉及的線性方程組是非常大的，對(duì)一些跨群（場）的遺傳評(píng)定，方程組個(gè)數(shù)可達(dá)幾萬至幾十萬，如此大數(shù)量的方程組用手工計(jì)算是根本不可能的 。 ? GBS是中文 WINDOWS95/WINDOWNT下的管理信息系統(tǒng)。 PEST可以在不同的操作系統(tǒng)下運(yùn)行。 種豬達(dá) 100kg日齡記錄 豬場 個(gè)體 父親 母親 達(dá) 100kg日齡 1 1 — — 140 1 2 — — 152 1 3 1 — 135 2 4 1 2 143 2 5 3 2 160 ?個(gè)體間加性遺傳相關(guān)矩陣的計(jì)算 ?????????????????13 7 3 7 A111 ?a 122 ?a 02112 ?? aa133 ?a 113113 ??? aaa 3255 ??? aa )()( 12131551 ??????? aaaa?個(gè)體間加性遺傳相關(guān)矩陣逆矩陣的計(jì)算 ? 構(gòu)建 ： 111?l 021 ?l 1131 ?? ll 431 23133 ??? ll)( 211141 ??? lll 2242 ?? ll 21)(1 24224144 ???? lllL?????????????????0001000001L?個(gè)體間加性遺傳相關(guān)矩陣逆矩陣的計(jì)算 ? 構(gòu)建對(duì)角矩陣： ? 令： ? ?2,2,34,1,1)( 2 ?? 1Dd ia g2)( 11 DA ?? ???????????????????????????????????202100202110611213211212210132216111A ?構(gòu)建線性模型 ? 根據(jù)資料性質(zhì)，可對(duì)種豬達(dá) 100kg日齡寫出如下動(dòng)物模型： ? 用矩陣形式表示，則對(duì)于該資料有： ijjiij eahy ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????2524131211543212110000010000010000010000011010010101160143135152140eeeeeaaaaahhy ?構(gòu)建混合模型方程組 ? 因此有： ?????????? 2003XX?????????? 1100000111ZX )ZX(XZ ??????????????????????1000001000001000001000001ZZ?????????? 303427yX??????????????????160143135152140yZ 2 2 ????? h hk???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????160143135152140303427???????40220210402210206 6 6 3 3 2215101023 3 3 6 6 110002000111035432121aaaaahh?求解混合模型方程組有： ? ?? ?50 033 2??????? 5432121?????aaaaahh ?兩性狀動(dòng)物模型 BLUP法育種值估計(jì) ? 某種豬場有如下種豬性能測定資料，測定性狀為達(dá) 100 kg日齡和達(dá) 100kg背膘 ，試以兩個(gè)性狀資料進(jìn)行個(gè)體育種值估計(jì)。 第二節(jié) BLUP的基本原理 ? 一般混合模型可表示為： 是所有觀察值構(gòu)成的向量 是所有固定效應(yīng)（包括）構(gòu)成的向量 是固定效應(yīng)的關(guān)聯(lián)矩陣 是所有隨機(jī)效應(yīng)構(gòu)成的向量 是隨機(jī)效應(yīng)的關(guān)聯(lián)矩陣 是隨機(jī)殘差向量 ? 隨機(jī)變量的數(shù)學(xué)期望： ? 方差 協(xié)方差矩陣結(jié)構(gòu)： ybXuZeeZuXby ???bb ?)(E， 0u ?)(E， 0e ?)(E， Xby ?)(E?????????????????R00GeuV ar ?BLUP 的統(tǒng)計(jì)特性 ? 可估函數(shù)： ? 預(yù)測函數(shù)： ? 預(yù)測誤差： BLUP分析的實(shí)質(zhì)是利用觀察值的一個(gè)線性函數(shù)（ ）對(duì)固定效應(yīng)和隨機(jī)效應(yīng)的任意線性可估函數(shù)（ ）進(jìn)行估計(jì)和預(yù)測，要求同時(shí)滿足預(yù)測的無偏性和預(yù)測誤差方差最?。ㄗ罴眩﹥蓚€(gè)條件，由此得到 的 最佳線性無偏估計(jì)值 （ BLUE）， 的 最佳線性無偏預(yù)測值（ BLUP） 。 第一節(jié) 線性模型基礎(chǔ)知識(shí) ? 模型（ Model） 模型是描述觀察值與影響觀察值變異性的各因子之間的關(guān)系的 數(shù)學(xué)方程式 ? 分類 ? 真實(shí)模型 —— 非常準(zhǔn)確地模擬觀察值的變異性，模型中不含有未知成分 ? 理想模型 —— 根據(jù)研究者所掌握的專業(yè)知識(shí)建立的盡可能接近真實(shí)模型的模型 ? 操作模型 —— 用于實(shí)際統(tǒng)計(jì)分析的模型，它通常是理想模型的簡化形式 ? 因子 ? 離散型 ? 通常表現(xiàn)為若干個(gè)有限的等級(jí)或水平
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